PHF8

PHF8
PHF8
Protein PHF8 PDB 2WWU.png
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스PHF8, JHDM1F, MRXSSD, ZNF422, PHD 핑거 단백질 8, KDM7B
외부 IDOMIM: 300560 MGI: 2444341 HomoloGene: 49405 GenCards: PHF8
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

23133

320595

앙상블

ENSG00000172943

ENSMUSG000041229

유니프로트

문제 9UP1

Q80TJ7

RefSeq(mRNA)

NM_001184896
NM_001184897
NM_001184898
NM_015107

NM_001113354
NM_177201

RefSeq(단백질)

NP_001171825
NP_001171826
NP_001171827
NP_055922

NP_001106825
NP_796175

장소(UCSC)Chr X: 53.94 ~54.05 MbChr X: 150.3 ~150.42 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

PHD 핑거 단백질 8은 PHF8 [5]유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 단백질이다.

기능.

PHF8은 철 및 α-케토글루타르산수산화효소 슈퍼패밀리에 속하며, 디앤드모노메틸 [7]상태에 대한 선택성을 가진 히스톤리신탈메틸라아제로서 활성화된다.[6]PHF8은 주요 EMT 전사인자 SNAI1 및 ZEB1을 상향 조정함으로써 EMT(상피에서 간엽으로의 이행)와 같은 과정을 유도한다.

분화 중 규제

PHF8은 내피 분화 중에 발현 증가, 쥐배아줄기세포의 [8]심장 분화 중에 현저하게 감소하는 것으로 확인되었다.

임상적 의의

PHF8의 돌연변이는 Siderius Type X-Linked Intelligent Disability(XLR; X-Linked Intelligent Disability)를 일으킨다(OMIM: 300263)[9][10][11]중간 정도의 지적 장애 외에도, 시데리우스-하멜 증후군의 특징은 안면 이상, 구순열 및/또는 구개열, 그리고 어떤 경우에는 소두증을 [12][13][14]포함한다.Siderius형 XLR과 구순열 [15]구개열 외에 자폐 스펙트럼 장애를 가진 두 형제에서 모든 PHF8 및 FAM120C 유전자와 WNK3 유전자의 일부를 포함하는 Xp11.22 염색체 미세결손이 보고되었다.

이러한 촉매 활성은 임상적으로 알려진 PHF8에 대한 돌연변이에 의해 중단되며, PHF8의 촉매 JmjC 도메인에서 클러스터로 확인되었다.가벼운 지적 장애, 안면 이상, 구순/[14]구개열을 가진 핀란드 형제 2명에게 발견된 PHF8의 F279S 돌연변이는 인간 [7]세포에서 과도하게 발현된 PHF8의 핵 국재화를 추가로 방지하는 것으로 밝혀졌다.

PHF8의 촉매 활성은 분자 [7]산소에 의존하며,[16] 이는 임신 중 저산소증에 노출된 생쥐에서 구순/구개열 발생률 증가에 대한 보고와 관련하여 중요하게 간주되는 사실이다.사람의 경우, 태아 구순열과 다른 선천성 이상도 모성 흡연,[17] 과음주 또는 모성 고혈압 [18]치료 등에 의해 야기되는 모성 저산소증과 관련이 있다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000172943 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000041229 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: PHF8 PHD finger protein 8".
  6. ^ Loenarz C, Schofield CJ (Mar 2008). "Expanding chemical biology of 2-oxoglutarate oxygenases". Nature Chemical Biology. 4 (3): 152–6. doi:10.1038/nchembio0308-152. PMID 18277970.
  7. ^ a b c Loenarz C, Ge W, Coleman ML, Rose NR, Cooper CD, Klose RJ, Ratcliffe PJ, Schofield CJ (Jan 2010). "PHF8, a gene associated with cleft lip/palate and mental retardation, encodes for an Nepsilon-dimethyl lysine demethylase". Human Molecular Genetics. 19 (2): 217–22. doi:10.1093/hmg/ddp480. PMC 4673897. PMID 19843542.
  8. ^ Boeckel, Jes-Niels; Derlet, Anja; Glaser, Simone F.; Luczak, Annika; Lucas, Tina; Heumüller, Andreas W.; Krüger, Marcus; Zehendner, Christoph M.; Kaluza, David (July 2016). "JMJD8 Regulates Angiogenic Sprouting and Cellular Metabolism by Interacting With Pyruvate Kinase M2 in Endothelial Cells". Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. 36 (7): 1425–1433. doi:10.1161/ATVBAHA.116.307695. ISSN 1524-4636. PMID 27199445.
  9. ^ Siderius LE, Hamel BC, van Bokhoven H, de Jager F, van den Helm B, Kremer H, Heineman-de Boer JA, Ropers HH, Mariman EC (Jul 1999). "X-linked mental retardation associated with cleft lip/palate maps to Xp11.3-q21.3". American Journal of Medical Genetics. 85 (3): 216–20. doi:10.1002/(SICI)1096-8628(19990730)85:3<216::AID-AJMG6>3.0.CO;2-X. PMID 10398231.
  10. ^ "OMIM: Siderius X-linked mental retardation syndrome". Retrieved 2009-10-21.
  11. ^ "OMIM: PHD finger protein 8; PHF8". Retrieved 2009-10-21.
  12. ^ Abidi F, Miano M, Murray J, Schwartz C (Jul 2007). "A novel mutation in the PHF8 gene is associated with X-linked mental retardation with cleft lip/cleft palate". Clinical Genetics. 72 (1): 19–22. doi:10.1111/j.1399-0004.2007.00817.x. PMC 2570350. PMID 17594395.
  13. ^ Laumonnier F, Holbert S, Ronce N, Faravelli F, Lenzner S, Schwartz CE, Lespinasse J, Van Esch H, Lacombe D, Goizet C, Phan-Dinh Tuy F, van Bokhoven H, Fryns JP, Chelly J, Ropers HH, Moraine C, Hamel BC, Briault S (Oct 2005). "Mutations in PHF8 are associated with X linked mental retardation and cleft lip/cleft palate". Journal of Medical Genetics. 42 (10): 780–6. doi:10.1136/jmg.2004.029439. PMC 1735927. PMID 16199551.
  14. ^ a b Koivisto AM, Ala-Mello S, Lemmelä S, Komu HA, Rautio J, Järvelä I (Aug 2007). "Screening of mutations in the PHF8 gene and identification of a novel mutation in a Finnish family with XLMR and cleft lip/cleft palate". Clinical Genetics. 72 (2): 145–9. doi:10.1111/j.1399-0004.2007.00836.x. PMID 17661819. S2CID 23326755.
  15. ^ Qiao Y, Liu X, Harvard C, Hildebrand MJ, Rajcan-Separovic E, Holden JJ, Lewis ME (Aug 2008). "Autism-associated familial microdeletion of Xp11.22". Clinical Genetics. 74 (2): 134–44. doi:10.1111/j.1399-0004.2008.01028.x. PMID 18498374. S2CID 22008997.
  16. ^ Millicovsky G, Johnston MC (Sep 1981). "Hyperoxia and hypoxia in pregnancy: simple experimental manipulation alters the incidence of cleft lip and palate in CL/Fr mice". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 78 (9): 5722–3. doi:10.1073/pnas.78.9.5722. PMC 348841. PMID 6946511.
  17. ^ Shi M, Wehby GL, Murray JC (Mar 2008). "Review on genetic variants and maternal smoking in the etiology of oral clefts and other birth defects". Birth Defects Research. Part C, Embryo Today. 84 (1): 16–29. doi:10.1002/bdrc.20117. PMC 2570345. PMID 18383123.
  18. ^ Hurst JA, Houlston RS, Roberts A, Gould SJ, Tingey WG (Oct 1995). "Transverse limb deficiency, facial clefting and hypoxic renal damage: an association with treatment of maternal hypertension?". Clinical Dysmorphology. 4 (4): 359–63. doi:10.1097/00019605-199510000-00013. PMID 8574428. S2CID 6330050.

외부 링크

이 기사에는 미국 국립 의학 도서관(미국 국립 의학 도서관)의 공공 도메인 텍스트가 포함되어 있습니다.