퍼브메드 센트럴

PubMed Central
퍼브메드 센트럴
프로듀서미국 국립 의학 도서관(미국)
역사2000년 현재
접근
비용무료
커버리지
규율
기록 깊이색인, 추상 및 전체 텍스트
서식 적용 범위저널 기사
링크
웹사이트https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/
제목 목록https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/journals/

PMC(PubMed Central, PMC)는 그동안 바이오의학과 생명과학 저널에 게재된 전체 텍스트 학술기사 열람을 보관하는 무료 디지털 저장소다.국립생명공학정보센터(NCBI)가 개발한 주요 연구 데이터베이스 중 하나로 PubMed Central은 문서 저장소 이상의 역할을 하고 있다.PMC에 대한 제출은 향상된 메타데이터, 의료용 온톨로지, 그리고 각 기사의 XML 구조 데이터를 풍부하게 하는 고유한 식별자를 위해 색인화 및 포맷된다.[1]PMC 내의 콘텐츠는 다른 NCBI 데이터베이스와 연결될 수 있고 엔트레즈 검색 및 검색 시스템을 통해 접속할 수 있으며, 이를 통해 생물 의학 지식을 발견하고, 읽고, 축적할 수 있는 대중들의 능력을 더욱 향상시킨다.[2]

PubMed Central은 PubMed와는 구별된다.[3]PubMed Central은 웹 브라우저를 통해 어디서든 누구나 액세스할 수 있는 전체 기사를 디지털 방식으로 무료로 보관하는 기능이다(재사용을 위한 다양한 제공).반대로 PubMed는 생물학적 인용과 추상체의 검색 가능한 데이터베이스임에도 불구하고 전체 텍스트 기사는 다른 곳(인쇄 또는 온라인, 무료 또는 가입자 지불벽 뒤)에 상주한다.

2018년 12월 현재 PMC 아카이브에는 520만 건이 넘는 기사가 수록되어 있으며,[4] NIH 공공 접근 정책에 따라 출판사 또는 저자가 원고를 저장소에 기증하는 기고문이 있다.앞선 자료에 따르면 2013년 1월부터 2014년 1월까지 12개월 동안 저자발 예금이 10만3000장을 넘어섰다.[5]PMC는 출판된 컨텐츠를 PMC 저장소에 보관할 수 있는 능력에 참여하는 약 4,000개의 저널을 식별한다.[6]일부 출판사는 "엠바고 시대"로 일컬어지는 PubMed Central에 대한 기사 출시를 일정 기간 연기하기도 하는데, 저널에 따라 몇 개월에서 몇 년까지이다. (6개월에서 12개월의 엠바고가 가장 흔하다.)퍼브메드 센트럴은 여전히 많은 출판사의 기고자 협약에 의해 금지되고 있는 '제3자에 의한 체계적 외부 유통'[7]의 핵심 사례다.

입양

2000년 2월 출범한 국립보건원(NIH)이 후원하는 모든 연구를 누구나 자유롭게 접할 수 있도록 하기 위한 NIH 공공접근정책으로 많은 출판사들이 NIH와 협업해 작품을 무료로 접할 수 있도록 하는 등 저장소가 급성장하고 있다.2007년 말, 2008년 통합 세출법(H.R. 2764)이 법으로 체결되었고, NIH가 자체 정책을 수정하고 NIH가 후원하는 연구와 연구 결과의 완전한 전자 사본에 포함하도록 요구하는 조항을 포함시켰다.이 조항들은 발행 후 12개월 이내에 포함되어야 한다.미국 정부가 연구기관에 연구에 대한 개방적 접근을 요구하는 것은 이번이 처음이며 NIH가 연구자들에게 자발적으로 PubMed Central에 연구를 추가하도록 요구한 2005년 정책에서 진화한 것이다.[8]

영국판 PubMed Central 시스템인 UK PubMed Central(UKPMC)웰컴 트러스트와 영국 도서관(British Library)에 의해 9명의 영국 연구 기금 지원자의 일부로 개발되었다.이 시스템은 2007년 1월에 가동되었다.2012년 11월 1일 유럽 퍼브메드 센트럴이 되었다.PubMed Central International 네트워크인 PubMed Central Canada의 캐나다 회원은 2009년 10월에 출범했다.

국립중앙의학도서관 'NLM 저널 퍼블리싱 태그세트' 저널 기사 마크업 언어는 무료로 이용할 수 있다.[9]학회 전문사회출판사협회는 "서적과 학술지 모두의 학술콘텐츠 작성 기준이 될 것 같다"고 논평한다.[10]관련 DTD는 책으로도 이용할 수 있다.[11]의회 도서관과 대영 도서관은 NLM DTD에 대한 지원을 발표했다.[12]그것은 또한 저널 서비스 제공자들에게도 인기가 있다.[13]

NIH를 넘어 많은 기관에 대한 공공 접속 계획이 발표되면서 PMC는 보다 다양한 기사의 보고가 되는 과정에 있다.[14]여기에는 NASA 콘텐츠가 포함되며, 인터페이스는 "PubSpace"[15][16]로 낙인찍혔다.

기술

기사는 다양한 기사 DTD를 사용하여 XML 또는 SGML로 출판사에 의해 PubMed Central로 보내진다.더 나이든 대형 출판사는 사내 DTD를 독자적으로 설립할 수도 있지만, 많은 출판사는 NLM 저널 퍼블리싱 DTD(위 참조)를 사용한다.

수령된 물품은 XSLT를 통해 매우 유사한 NLM 아카이빙 및 Interchange DTD로 변환된다.이 과정은 수정을 위해 출판사에 보고된 오류를 드러낼 수 있다.그래픽도 표준 형식과 크기로 변환된다.원본과 변환된 양식을 보관한다.변환된 양식은 그래픽, 멀티미디어 또는 기타 관련 데이터에 대한 관련 파일과 함께 관계형 데이터베이스로 이동된다.많은 출판사들도 그들의 기사를 PDF로 제공하고 있으며, 이것들은 변경 없이 이용할 수 있게 되어 있다.[17]

서지학 인용문은 구문 분석되며 PubMed의 관련 추상화, PubMed Central의 기사 및 출판사 웹사이트의 자료와 자동으로 연결된다.PubMed 링크도 PubMed Central로 이어진다.이러한 출처 중 하나에서 아직 구할 수 없는 저널이나 특정 기사와 같이 확인할 수 없는 참조는 데이터베이스에서 추적되며, 자원을 사용할 수 있게 되면 자동으로 "실행"된다.

사내 인덱싱 시스템은 검색 기능을 제공하며, 일반 약물 이름 대 독점 약물 이름 및 유기체, 질병 및 해부학적 부분의 대체 이름과 같은 생물학적 및 의학 용어를 알고 있다.

사용자가 저널 이슈에 접속하면 해당 이슈에 대한 모든 기사, 편지, 사설 등을 검색해 목차가 자동으로 생성된다.기사 등의 실제 항목에 도달하면 PubMed Central은 NLM 마크업을 HTML로 변환하여 전달하며, 관련 데이터 객체에 대한 링크를 제공한다.이는 다양한 수신 데이터가 표준 DTD와 그래픽 형식으로 먼저 변환되었기 때문에 실현 가능하다.

별도의 제출 스트림에서, NIH가 후원하는 저자는 NIH 원고 제출(NIHMS)을 이용하여 PubMed Central에 기사를 보관할 수 있다.따라서 제출된 물품은 일반적으로 NLM DTD로 변환하기 위해 XML 마크업을 거친다.

리셉션

학구적인 출판계의 PubMed Central에 대한 반응은 일부 사람들의 진정한 열정과 다른 사람들의 신중한 관심사 사이에 있다.[18][19]

PMC가 바이오의학 지식의 발견과 보급을 증대시키는 능력에 있어서 접속 출판사를 개방하는 것은 환영할 만한 파트너지만, 같은 진실은 다른 사람들로 하여금 출판된 기록에서 트래픽이 전용되는 것을 걱정하게 하고, 독자 수가 줄어들게 하는 경제적 결과뿐만 아니라, 스콜라 커뮤니티 유지에 미치는 영향도 걱정하게 한다.학회 내의 rs.[20][21]2013년 분석 결과, 공개된 기사의 공공 저장소가 '저널 웹사이트에서 상당한 수의 독자를 끌어낸' 책임이 있고, 'PMC의 효과는 시간이 지날수록 커지고 있다'는 강력한 증거를 발견했다.[22]

도서관, 대학, 오픈 액세스 서포터즈, 소비자 건강 옹호 단체, 환자 권리 단체들은 PubMed Central에 찬사를 보냈으며, 납세자 지원의 결과인 연구 간행물을 자유롭게 공유할 수 있도록 다른 연방 기금 기관에서 개발한 유사한 공공 액세스 저장소를 보기를 희망한다.[23]

개방형 접속 출판의 앤텔만 연구는 철학, 정치학, 전기 및 전자 공학, 수학에서 개방형 접속 논문이 더 큰 연구 영향을 미친다는 것을 발견했다.[24]무작위 재판에서는 공개 액세스 논문의 컨텐츠 다운로드가 증가했으며, 발행 1년 후 구독 액세스에 비해 인용 우위가 없었다.[25]

NIH 정책과 개방형 액세스 저장소 작업은 다른 연방 기관에서도 조치를 촉발시킨 2013년 대통령 지시에 영감을 주었다.

2020년 3월 펍메드 센트럴은 코로나바이러스 관련 출판 전문에 대한 입금 절차를 가속화했다.NLM은 과학자, 의료 사업자, 데이터 마이닝 혁신자, AI 헬스케어 연구원, 일반 대중의 접근성을 개선해 달라는 백악관 과학기술정책국과 국제 과학자들의 요청에 따라 이같이 했다.[26]

PMCID

PMC 참조 번호로도 알려진 PMCID(Pubmed Central 식별자)는 PMID가 PubMed 데이터베이스의 참고문헌 식별자처럼 PubMed Central 개방형 액세스 데이터베이스의 참고문헌 식별자다.그러나 두 개의 식별자는 구별된다.그것은 "PMC"와 그 다음에 7개의 숫자로 된 로 구성되어 있다.형식:[27]

  • PMCID: PMC185221

NIH 상을 신청하는 저자는 신청서에 PMCID를 포함해야 한다.

참고 항목

참조

  1. ^ Beck J (2010). "Report from the Field: PubMed Central, an XML-based Archive of Life Sciences Journal Articles". Proceedings of the International Symposium on XML for the Long Haul: Issues in the Long-term Preservation of XML. 6. doi:10.4242/BalisageVol6.Beck01. ISBN 978-1-935958-02-4.
  2. ^ Maloney C, Sequeira E, Kelly C, Orris R, Beck J (5 December 2013). PubMed Central. National Center for Biotechnology Information (US).
  3. ^ "MEDLINE, PubMed, and PMC (PubMed Central): How are they different?". www.nlm.nih.gov. 9 September 2019.
  4. ^ "2017년 1월 16일 Inside High Ed, "기본에 의한 열기"
  5. ^ "NIHMS Statistics". nihms.nih.gov.
  6. ^ "Home - PMC - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov.
  7. ^ Ouerfelli N. "Author rights: what's it all about" (PDF).
  8. ^ "Public access to NIH research made law". Science Codex. 2007. Archived from the original on 4 March 2016. Retrieved 6 November 2013.
  9. ^ "Journal Publishing Tag Set". National Center for Biotechnology Information. Retrieved 6 November 2013.
  10. ^ French D (4 August 2006). "ALPSP Technology Update: A Standard XML Document Format: The case for the adoption of NLM DTD". ALPSP. Retrieved 6 November 2013.
  11. ^ "NCBI Book Tag Set". dtd.nlm.nih.gov.
  12. ^ "News from the Library of Congress". Library of Congress. 19 April 2006. Retrieved 6 November 2013.
  13. ^ "Inera Inc. - NLM DTD Resources". 19 February 2013. Archived from the original on 2013-02-19.
  14. ^ "Public Access Plans of U.S. Federal Agencies". cendi.gov. Archived from the original on 2020-10-18. Retrieved 2016-08-19.
  15. ^ Kovo Y (22 July 2016). "Public Access to Results of NASA-Funded Research". nasa.gov. Archived from the original on 19 August 2016.
  16. ^ "NASA in PMC". preview.ncbi.nlm.nih.gov.
  17. ^ NLM Journal Archiving and Interchange Tag Suite, 국립 바이오테크닉 정보 센터, 국립 의학 라이브러리
  18. ^ "PLOS Applauds Congress for Action on Open Access". Archived from the original on 2016-05-07. Retrieved 2014-02-07.
  19. ^ "ACS Submission to the Office of Science and Technology Policy Request for Information on Public Access to Peer-Reviewed Scholarly Publications Resulting from Federally Funded Research" (PDF). Office of Science and Technology Policy. Retrieved 2014-02-07 – via National Archives.
  20. ^ Davis PM (October 2012). "The effect of public deposit of scientific articles on readership". The Physiologist. 55 (5): 161, 163–5. PMID 23155924.
  21. ^ Davis PM (July 2013). "Public accessibility of biomedical articles from PubMed Central reduces journal readership--retrospective cohort analysis". FASEB Journal. 27 (7): 2536–41. doi:10.1096/fj.13-229922. PMC 3688741. PMID 23554455.
  22. ^ Davis PM (July 2013). "Public accessibility of biomedical articles from PubMed Central reduces journal readership--retrospective cohort analysis". FASEB Journal. 27 (7): 2536–41. doi:10.1096/fj.13-229922. PMC 3688741. PMID 23554455.
  23. ^ "Autism Speaks Announces New Policy to Give Families Easy, Free Access to Key Research Findings - Press Release - Autism Speaks". www.autismspeaks.org. 25 July 2012.
  24. ^ Antelman, 크리스틴(2004년)."Open-Access조의 대동아 연구 영향 본 적이 있니?".대학 &, 연구 도서관. 65(5):372–382. doi:10.5860/crl.65.5.372., Stemper J-윌리엄스 K(2006년)에 의해 요약했다."Scholarly 통신:opportunity" 위기 끄는 것.대학 &, 연구 도서관 뉴스입니다. 67(11):692–696. doi:10.5860/crln.67.11.7720.
  25. ^ Davis PM, Lewenstein BV, Simon DH, Booth JG, Connolly MJ (July 2008). "Open access publishing, article downloads, and citations: randomised controlled trial". BMJ. 337: a568. doi:10.1136/bmj.a568. PMC 2492576. PMID 18669565.
  26. ^ "The National Library of Medicine expands access to coronavirus literature through PubMed Central". National Institutes of Health (NIH). 2020-03-25. Retrieved 2020-03-31. To support this initiative, NLM is adapting its standard procedures for depositing articles into PMC to provide greater flexibility that will ensure coronavirus research is readily available.
  27. ^ "Include PMCID in Citations publicaccess.nih.gov". publicaccess.nih.gov. Retrieved 2017-07-01.

외부 링크