호모 사피엔스 종의 단백질 코드 유전자
IRF5 식별자 에일리어스 IRF5 , SLEB10, 간섭계수 5외부 ID OMIM : 607218 MGI : 1350924 HomoloGene : 8088 GeneCard: IRF5 유전자 존재론 분자 함수 DNA결합 GO:0001131, GO:000115, GO:0001130, GO:0001204 DNA결합전사인자액티비티 GO:0001948 단백질 결합 GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA결합전사활성화제, RNA중합효소II 특이적 배열특이적 DNA결합 동일단백질결합 GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA결합전사인자활성, RNA중합효소II 특이적 셀룰러 컴포넌트 생물학적 과정 출처: 아미고 / QuickGO
맞춤법 종. 인간 마우스 엔트레즈 앙상블 유니프로트 RefSeq(mRNA) RefSeq(단백질) 장소(UCSC) Chr 7: 128.94 ~128.95 Mb Chr 6: 29.53 ~29.54 Mb PubMed 검색[3] [4] 위키데이터
인터페론 조절인자 5는 IRF5 [5] 유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 단백질 이다.IRF 패밀리는 특정 세포 [6] 기능의 조절과 함께 포유류의 바이러스 반응 신호 전달에 관여하는 전사 인자의 그룹입니다.
기능. IRF5는 인터페론의 바이러스 매개 활성화, 세포 성장, 분화, 아포토시스 및 면역계 활성을 포함한 다양한 역할을 하는 전사 인자의 그룹인 인터페론 조절 인자(IRF) 패밀리의 구성원이다. IRF 패밀리 구성원은 트립토판 (W) 반복을 포함한 보존 된 N말단 DNA 결합 도메인을 특징으로 한다. 서로 다른 Isoform을 코드하는 대체 스플라이스 변형이 존재합니다.[5] IRF 패밀리의 규제 및 억제 영역은 주로 IRF의 [7] C 터미널에 있습니다.
2020년 연구에서는 TASL이라는 어댑터 단백질이 pLxIS [8] 모티브에서 인산화됨으로써 IRF5 활성화에 중요한 조절 역할을 하는 것으로 나타났으며, 어댑터 단백질 MAVS, STING 및 [9] TRIP를 통한 IRF3 활성화 경로와 유사한 유사성을 이끌어냈다.
임상적 의의 IRF5는 대식세포 가 염증을 촉진할지 또는 억제할지를 제어하는 분자 스위치 역할을 한다. 대식세포에서 IRF5의 생성을 차단하는 것은 광범위한 자가면역질환을 치료하는데 도움을 줄 수 있고, IRF5 수치를 높이는 것은 면역체계가 약하거나, 약하거나, 손상된 사람들을 치료하는데 도움을 줄 수 있다. IRF5는 "DNA와 직접 상호작용을 하거나 스스로 어떤 유전자가 [10] 켜지는지를 제어하는 다른 단백질과 상호작용을 함으로써" 효과가 있는 것으로 보인다.
시그널링 IRF 패밀리는 바이러스 [6] 감염에 대한 간섭 (IFN) 반응에 대한 유전자 발현을 조절합니다. IRF5는 인터페론 시그널링에 대한 직접 변환기이며 인산화 [11] 과정을 통해 활성화된다. IRF 패밀리는 또한 [12] JAK를 활성화하는 막 통과 수용체에 결합함으로써 JAK/STAT 신호 경로를 시작할 수 있다. IRF, IFN 및 JAK/STAT 신호 경로는 특정 신호를 [13] 통해 포유류의 바이러스 감염과 싸우기 위해 함께 작동합니다.
「 」를 참조해 주세요.
레퍼런스 ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000128604 - 앙상블 , 2017년 5월 ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000029771 - 앙상블 , 2017년 5월 ^ "Human PubMed Reference:" . National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine . ^ "Mouse PubMed Reference:" . National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine . ^ a b "Entrez Gene: IRF5 interferon regulatory factor 5" . ^ a b Negishi, Hideo; Taniguchi, Tadatsugu; Yanai, Hideyuki (2018-11-01). "The Interferon (IFN) Class of Cytokines and the IFN Regulatory Factor (IRF) Transcription Factor Family" . Cold Spring Harbor Perspectives in Biology . 10 (11): a028423. doi :10.1101/cshperspect.a028423 . ISSN 1943-0264 . PMC 6211389 . PMID 28963109 . ^ Chistiakov, Dimitry A.; Myasoedova, Veronika A.; Revin, Victor V.; Orekhov, Alexander N.; Bobryshev, Yuri V. (2018-01-01). "The impact of interferon-regulatory factors to macrophage differentiation and polarization into M1 and M2" . Immunobiology . 223 (1): 101–111. doi :10.1016/j.imbio.2017.10.005 . ISSN 0171-2985 . PMID 29032836 . ^ Heinz, Leonhard X.; Lee, JangEun; Kapoor, Utkarsh; Kartnig, Felix; Sedlyarov, Vitaly; Papakostas, Konstantinos; César-Razquin, Adrian; Essletzbichler, Patrick; Goldmann, Ulrich; Stefanovic, Adrijana; Bigenzahn, Johannes W.; Scorzoni, Stefania; Pizzagalli, Mattia D.; Bensimon, Ariel; Müller, André C.; King, F. James; Li, Jun; Girardi, Enrico; Mbow, M. Lamine; Whitehurst, Charles E.; Rebsamen, Manuele; Superti-Furga, Giulio (13 May 2020). "TASL is the SLC15A4-associated adaptor for IRF5 activation by TLR7–9" . Nature . 581 (7808): 316–322. Bibcode :2020Natur.581..316H . doi :10.1038/s41586-020-2282-0 . PMC 7610944 . PMID 32433612 . S2CID 218625265 . ^ Liu S, Cai X, Wu J, Cong Q, Chen X, Li T, Du F, Ren J, Wu Y, Grishin N, and Chen ZJ (Mar 13, 2015). "Phosphorylation of innate immune adaptor proteins MAVS, STING, and TRIF induces IRF3 activation" . Science . 347 (6227): aaa2630. doi :10.1126/science.aaa2630 . PMID 25636800 . ^ Krausgruber T, Blazek K, Smallie T, Alzabin S, Lockstone H, Sahgal N, Hussell T, Feldmann M, Udalova IA (January 2011). "IRF5 promotes inflammatory macrophage polarization and T(H)1-T(H)17 responses". Nat Immunol . 12 (3): 231–238. doi :10.1038/ni.1990 . PMID 21240265 . S2CID 13730047 . ^ Barnes, Betsy; Lubyova, Barbora; Pitha, Paula M. (January 2002). "Review: On the Role of IRF in Host Defense" . Journal of Interferon & Cytokine Research . 22 (1): 59–71. doi :10.1089/107999002753452665 . ISSN 1079-9907 . PMID 11846976 . ^ Bousoik, Emira; Montazeri Aliabadi, Hamidreza (2018). " "Do We Know Jack" About JAK? A Closer Look at JAK/STAT Signaling Pathway" . Frontiers in Oncology . 8 : 287. doi :10.3389/fonc.2018.00287 . ISSN 2234-943X . PMC 6079274 . PMID 30109213 . ^ Chiang, Hao-Sen; Liu, Helene Minyi (2019). "The Molecular Basis of Viral Inhibition of IRF- and STAT-Dependent Immune Responses" . Frontiers in Immunology . 9 : 3086. doi :10.3389/fimmu.2018.03086 . ISSN 1664-3224 . PMC 6332930 . PMID 30671058 .
추가 정보 Pitha PM, Au WC, Lowther W, et al. (1999). "Role of the interferon regulatory factors (IRFs) in virus-mediated signaling and regulation of cell growth". Biochimie . 80 (8–9): 651–8. doi :10.1016/S0300-9084(99)80018-2 . PMID 9865487 . Barnes B, Lubyova B, Pitha PM (2002). "On the role of IRF in host defense". J. Interferon Cytokine Res . 22 (1): 59–71. doi :10.1089/107999002753452665 . PMID 11846976 . Barnes BJ, Moore PA, Pitha PM (2001). "Virus-specific activation of a novel interferon regulatory factor, IRF-5, results in the induction of distinct interferon alpha genes" . J. Biol. Chem . 276 (26): 23382–90. doi :10.1074/jbc.M101216200 . PMID 11303025 . Nehyba J, Hrdlicková R, Burnside J, Bose HR (2002). "A novel interferon regulatory factor (IRF), IRF-10, has a unique role in immune defense and is induced by the v-Rel oncoprotein" . Mol. Cell. Biol . 22 (11): 3942–57. doi :10.1128/MCB.22.11.3942-3957.2002 . PMC 133824 . PMID 11997525 . Barnes BJ, Kellum MJ, Field AE, Pitha PM (2002). "Multiple regulatory domains of IRF-5 control activation, cellular localization, and induction of chemokines that mediate recruitment of T lymphocytes" . Mol. Cell. Biol . 22 (16): 5721–40. doi :10.1128/MCB.22.16.5721-5740.2002 . PMC 133975 . PMID 12138184 . Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences" . Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 99 (26): 16899–903. Bibcode :2002PNAS...9916899M . doi :10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 . Barnes BJ, Field AE, Pitha-Rowe PM (2003). "Virus-induced heterodimer formation between IRF-5 and IRF-7 modulates assembly of the IFNA enhanceosome in vivo and transcriptional activity of IFNA genes" . J. Biol. Chem . 278 (19): 16630–41. doi :10.1074/jbc.M212609200 . PMID 12600985 . Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR, et al. (2003). "Human chromosome 7: DNA sequence and biology" . Science . 300 (5620): 767–72. Bibcode :2003Sci...300..767S . doi :10.1126/science.1083423 . PMC 2882961 . PMID 12690205 . Barnes BJ, Kellum MJ, Pinder KE, et al. (2003). "Interferon regulatory factor 5, a novel mediator of cell cycle arrest and cell death". Cancer Res . 63 (19): 6424–31. PMID 14559832 . Barnes BJ, Richards J, Mancl M, et al. (2004). "Global and distinct targets of IRF-5 and IRF-7 during innate response to viral infection" . J. Biol. Chem . 279 (43): 45194–207. doi :10.1074/jbc.M400726200 . PMID 15308637 . Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 . Lin R, Yang L, Arguello M, et al. (2005). "A CRM1-dependent nuclear export pathway is involved in the regulation of IRF-5 subcellular localization" . J. Biol. Chem . 280 (4): 3088–95. doi :10.1074/jbc.M408452200 . PMID 15556946 . Sigurdsson S, Nordmark G, Göring HH, et al. (2005). "Polymorphisms in the tyrosine kinase 2 and interferon regulatory factor 5 genes are associated with systemic lupus erythematosus" . Am. J. Hum. Genet . 76 (3): 528–37. doi :10.1086/428480 . PMC 1196404 . PMID 15657875 . Takaoka A, Yanai H, Kondo S, et al. (2005). "Integral role of IRF-5 in the gene induction programme activated by Toll-like receptors". Nature . 434 (7030): 243–9. Bibcode :2005Natur.434..243T . doi :10.1038/nature03308 . PMID 15665823 . S2CID 667829 . Schoenemeyer A, Barnes BJ, Mancl ME, et al. (2005). "The interferon regulatory factor, IRF5, is a central mediator of toll-like receptor 7 signaling" . J. Biol. Chem . 280 (17): 17005–12. doi :10.1074/jbc.M412584200 . PMID 15695821 . Mancl ME, Hu G, Sangster-Guity N, Olshalsky SL, Hoops K, Fitzgerald-Bocarsly P, Pitha PM, Pinder K, Barnes BJ (June 2005). "Two discrete promoters regulate the alternatively spliced human interferon regulatory factor-5 isoforms. Multiple isoforms with distinct cell type-specific expression, localization, regulation, and function" . J. Biol. Chem . 280 (22): 21078–90. doi :10.1074/jbc.M500543200 . PMID 15805103 . Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature . 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R . doi :10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 . Graham RR, Kozyrev SV, Baechler EC, et al. (2006). "A common haplotype of interferon regulatory factor 5 (IRF5) regulates splicing and expression and is associated with increased risk of systemic lupus erythematosus". Nat. Genet . 38 (5): 550–5. doi :10.1038/ng1782 . PMID 16642019 . S2CID 21426281 .
외부 링크 이 기사에는 미국 국립 의학 도서관 (미국 국립 의학 도서관 )의 공공 도메인 텍스트가 포함되어 있습니다.
(1) 기본 도메인
(1.1 ) 베이직 류신 지퍼(bZIP )(1.2) 기본나선-루프-나선 (bHLH )
그룹 A 그룹 B 그룹 C bHLH-PAS 그룹 D 그룹 E 그룹 F bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) 기본나선경간나선(bHSH)
(2.1) 핵수용체 (CYS4 )
서브패밀리 1 서브패밀리 2 서브 패밀리 3 서브패밀리 4 서브패밀리 5 서브패밀리 6 서브패밀리 0
(2.2) 기타 CY4 (2.3) Cys2 His2 (2.4) Cys6 (2.5) 교대 조성 (2.6) WRKY