HOXC6 식별자 에일리어스 HOXC6 , CP25, HHO.C8, HOX3, HOX3C, 홈박스 C6외부 ID OMIM : 142972 MGI: 96197 HomoloGene : 19533 GenCard : HOXC6 유전자 존재론 분자 함수 GO:0001131, GO:000115, GO:0001130, GO:0001204 DNA결합전사인자액티비티 배열특이적 DNA결합 DNA결합 GO:0001106 전사 코어프레서 액티비티 GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA결합전사인자활성, RNA중합효소II 특이적 GO:0000980 RNA중합효소II 시스조절영역배열특이적 DNA결합 GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA결합전사활성화제, RNA중합효소II 특이적 전사인자활성, RNA중합효소II 원위증강제배열특이결합 셀룰러 컴포넌트 생물학적 과정 출처: 아미고 / QuickGO
맞춤법 종. 인간 마우스 엔트레즈 앙상블 유니프로트 RefSeq(mRNA) RefSeq(단백질) 장소(UCSC) Chr 12: 53.99 ~54.03 Mb Chr 15: 102.91 ~102.92 Mb PubMed 검색[3] [4] 위키데이터
호메오박스 단백질 Hox-C6 는 인간의 HOXC6 [5] [6] [7] 유전자에 의해 암호화되는 단백질 이다.Hox-C6 발현은 나팔관과 [8] 난소에서 가장 높다. HoxC6는 전립선암,[9] 유방암, 식도 편평상피암을 포함한 많은 종류의 암에서 많이 발현되어 왔다.
기능. 이 유전자는 호메오박스 계열에 속하며, 호메오박스 계열의 구성원들은 모든 다세포 유기체의 형태 형성에 중요한 역할을 하는 고도로 보존된 전사 인자 계열을 암호화합니다. 포유류는 서로 다른 염색체 위에 위치하고 함께 배열된 9개에서 11개의 유전자로 구성된 HOXA, HOXB, HOXD라는 네 개의 유사한 호메오박스 유전자 클러스터를 가지고 있다. HOXC6라는 이 유전자는 12번 염색체의 클러스터에 위치한 여러 HOXC 유전자 중 하나입니다. HOXC5, HOXC4, HOXC6의 세 가지 유전자는 5' 비코드 엑손(exon)을 공유한다. 전사물은 유전자 특이적 엑손과 결합되는 공유 엑손을 포함할 수도 있고 유전자 특이적 엑손만을 포함할 수도 있다. HOXC6에 대해 다른 아이소폼을 코드하는 대체적으로 스플라이스된 전사변형이 식별되었다. 전사변형 2는 공유 엑손, 전사변형 1은 유전자 특이 [7] 엑손만을 포함한다. HOXC6는 림프종에서 역할을 한다. HOXC6 아이소폼, HOXC6-2는 위암에 대한 활성 발암물질이다. 그것은 종양 유전자의 역할을 함으로써 위암 세포의 증식을 촉진한다. 이 유전자의 아이소폼의 하향조절은 잠재적으로 특정 암세포의 증식을 줄일 수 있다. HOXC6-1 동위원소 형태에서는 다운 [10] 레귤레이션 시 이행, 침입, 아포토시스 또는 증식에 통계적으로 유의한 영향은 없었다. Cancer Cell International의 연구에 따르면 HOXC6 유전자의 억제는 TGF-β/SMAD 캐스케이드를 차단하는 역할을 한다. 이는 자궁경부암에 [11] 대한 상피에서 간엽 전이 약화로 이어진다.
녹아웃 모델 작은 간섭 RNA를 사용한 녹아웃 모델은 HOXC6의 녹아웃이 아포토시스와 관련이 있음을 보여주었다. 또한 HOXC6의 존재는 파클리탁셀 유도 아포토시스의 억제와 관련되었다. 따라서 HOXC6는 증식 [12] 활성을 유도하는 것으로 입증되었다.
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PDB 갤러리
1ahd : 안테나 호메오도메인-DNA 복합체의 NMR 용액 구조 결정
1HM : 1H 핵자기공명분광법에 의한 용액 중 드로소필라로부터의 안테나 호메오도메인의 3차원 구조 결정
1산 : DES(1-6) Antennapedia 호메오도메인: NMR 용액 구조와 온전한 안테나호메인과의 DNA 결합 친화성 비교
2hoa : 다이애나, 캘리바, HABAS 및 GLOMSA 프로그램을 이용한 구조 계산을 위한 참신한 전략을 이용한 용액 중의 핵자기공명 데이터로부터 ANTP(C39->S) 호메오도메인의 구조 결정
(1) 기본 도메인
(1.1 ) 베이직 류신 지퍼(bZIP )(1.2) 기본나선-루프-나선 (bHLH )
그룹 A 그룹 B 그룹 C bHLH-PAS 그룹 D 그룹 E 그룹 F bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) 기본나선경간나선(bHSH)
(2.1) 핵수용체 (CYS4 )
서브패밀리 1 서브패밀리 2 서브 패밀리 3 서브패밀리 4 서브패밀리 5 서브패밀리 6 서브패밀리 0
(2.2) 기타 CY4 (2.3) Cys2 His2 (2.4) Cys6 (2.5) 교대 조성 (2.6) WRKY
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