IRF6

IRF6
IRF6
식별자
에일리어스IRF6, LPS, OFC6, PIT, PPS, PPS1, VWS, VWS1, 간섭계수 6
외부 IDOMIM : 607199 MGI : 1859211 HomoloGene : 4479 GenCard : IRF6
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

3664

54139

앙상블

ENSG00000117595

ENSMUSG000026638

유니프로트

O14896

P97431

RefSeq(mRNA)

NM_006147
NM_001206696

NM_016851
NM_178083

RefSeq(단백질)

NP_001193625
NP_006138

NP_058547

장소(UCSC)Chr 1 : 209.79 ~209.81 MbChr 1: 192.84 ~192.85 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

IRF6라고도 알려진 간섭계 조절인자 6은 IRF6 유전자에 [5]의해 인간에게 암호화되는 단백질이다.

기능.

이 유전자는 인터페론 조절 전사 인자(IRF) 패밀리의 일원을 암호화합니다.가족 구성원은 고도로 보존된 N 말단 나선-턴-나선 DNA 결합 도메인과 보존되지 않은 C 말단 단백질 결합 [6]도메인을 공유한다.IRF6의 기능은 예를 들어 [7]입천장의 결합조직 형성과 관련이 있다.이 유전자는 인터페론 조절 전사 인자(IRF) 패밀리의 일원을 암호화합니다.또한 IRF6 유전자는 프로모터 메틸화에 [8]의해 후생적으로 조절되는 것이 관찰되었다.

병리학

IRF6 유전자의 돌연변이는 상염색체 우성 반 데르 바우드 증후군(VWS) 또는 관련 슬립 익상 증후군(PPS)[10]으로 이어질 수 있다.Van der Woude 증후군은 치아 이상과 입술 누공과 함께 구순열과 구개열을 포함할 수 있다.또한 IRF6의 일반 대립 유전자는 게놈 전체의 연관 연구 및 많은 후보 유전자 [11]연구를 통해 구순열 및/또는 구개열 비동음성 사례와도 관련되어 있다.이러한 장애는 IRF6 유전자의 돌연변이에 의해 발생하며 표현형 이질성의 일부는 다른 유형의 IRF6 [5]돌연변이에 기인한다.신드롬 간의 이러한 표현형 변이에 대한 한 가지 설명은 이합체 변이 단백질 구조에 대한 차이적 영향에 기초한다.VWS 돌연변이는 선천적으로 [12]지배적인 음성인 반면 부실을 초래하는 것으로 보인다.최근 VWS와 PPS의 돌연변이 스펙트럼이 [13]요약되었다.IRF6는 각질세포 [14][15]발달에 중요한 역할을 하는 것으로 나타났다.구순열과 입천장의 일반적인 형태에서 IRF6의 역할도 입증되었으며[16] 구순열 사례의 약 20%를 설명할 [17]수 있다.IRF6의 변형은 여러 연구에서 신드롬성 구개열 및/또는 입천장과 관련된 일관된 증거를 산출했다.2009년 Birnbaum과 동료들의 연구는 이 유전자가 구순열 및/또는 구순열 병인에 미치는 영향을 확인하였고, 여러 모집단의 가족을 연구한 GENEVA Cleft Consortium 연구는 IRF6 돌연변이가 구순열 및/또는 구순열과 강하게 관련되어 있다는 발견을 재확인하였다.IRF6 돌연변이 생쥐의 분석에 의해 구순열 및/또는 구개열을 일으키는 IRF6의 역할이 더욱 뒷받침되며, IRF6 돌연변이 생쥐는 말단 분화에 실패하여 구강을 폐색시켜 구개열을 일으킬 수 있는 다발성 상피 유착을 일으킨다.동물 모델에 대한 연구는 IRF6가 각질세포의 증식을 결정하며 또한 구강주엽의 형성에 중요한 역할을 한다는 것을 보여준다.최근에는 마우스 유전학, 유전자 발현 분석, 염색질 면역침강 연구 및 루시페라아제 리포터 분석의 활용을 통해 IRF6가 p63의 직접적인 표적이 되고 있으며, 이는 구개 특징을 포함한 여러 기형 신드롬의 기초가 되며, p63은 IRF6 인핸서 요소를 통해 IRF6 전사를 활성화한다.인핸서 요소의 변화는 입술의 구분에 대한 민감성을 증가시킨다.구개열을 포함하거나 포함하지 않는 구순열과 구개열만의 특징은 IRF6 돌연변이를 가진 가족에서 모두 발견되었다.또, 다른 타입의 균열이 같은 [11]패밀리로 분류될 수 있습니다.

후생유전학

IRF6 이상 프로모터 DNA 과메틸화는 암 발병/진행과 관련하여 관찰되었다.실제로, 이러한 부적절한 후생유전 현상은 벌버 이끼 [18]강막에서 발생한 벌버 편평세포암에 감염된 여성들에게서 관찰되었다.IRF6 프로모터의 메틸화는 이 [8]질환에 감염된 환자의 발암 위험의 지표가 될 수 있다.

암

IRF6 유전자는 다양한 악성 [19]종양 수준에서 자궁경부 전립선암 병변에서 파생된 인간 유두종 바이러스 양성 신생물 각화세포에서 점진적으로 하향 조절되는 것이 관찰되었다.이러한 이유로, 이 유전자는 종양 발생과 관련될 가능성이 높고 자궁 경부 전형성 병변 [19]진행에 대한 잠재적 예후 지표가 될 수 있다.마찬가지로 IRF6는 벌바암에서 [8]유전적으로 후생적으로 규제되지 않는 것으로 밝혀졌다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000117595 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000026638 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b Kondo S, Schutte BC, Richardson RJ, Bjork BC, Knight AS, Watanabe Y, Howard E, de Lima RL, Daack-Hirsch S, Sander A, McDonald-McGinn DM, Zackai EH, Lammer EJ, Aylsworth AS, Ardinger HH, Lidral AC, Pober BR, Moreno L, Arcos-Burgos M, Valencia C, Houdayer C, Bahuau M, Moretti-Ferreira D, Richieri-Costa A, Dixon MJ, Murray JC (October 2002). "Mutations in IRF6 cause Van der Woude and popliteal pterygium syndromes". Nat. Genet. 32 (2): 285–9. doi:10.1038/ng985. PMC 3169431. PMID 12219090.
  6. ^ "Entrez Gene: IRF6".
  7. ^ Blanton SH, Cortez A, Stal S, Mulliken JB, Finnell RH, Hecht JT (September 2005). "Variation in IRF6 contributes to nonsyndromic cleft lip and palate". Am. J. Med. Genet. A. 137A (3): 259–62. doi:10.1002/ajmg.a.30887. PMID 16096995. S2CID 25084563.
  8. ^ a b c Rotondo JC, Borghi A, Selvatici R, Magri E, Bianchini E, Montinari E, Corazza M, Virgili A, Tognon M, Martini F (2016). "Hypermethylation-Induced Inactivation of the IRF6 Gene as a Possible Early Event in Progression of Vulvar Squamous Cell Carcinoma Associated With Lichen Sclerosus". JAMA Dermatology. 152 (8): 928–33. doi:10.1001/jamadermatol.2016.1336. PMID 27223861.
  9. ^ Van der Woude, A (June 1954). "Fistula labii inferioris congenita and its association with cleft lip and palate". Am. J. Hum. Genet. 6 (2): 244–56. PMC 1716548. PMID 13158329.
  10. ^ Gorlin RJ, Sedano HO, Cervenka J (February 1968). "Popliteal pterygium syndrome . A syndrome comprising cleft lip-palate, popliteal and intercrural pterygia, digital and genital anomalies". Pediatrics. 41 (2): 503–9. PMID 4384166.
  11. ^ a b Dixon MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC (March 2011). "Cleft lip and palate: understanding genetic and environmental influences". Nat. Rev. Genet. 12 (3): 167–78. doi:10.1038/nrg2933. PMC 3086810. PMID 21331089.
  12. ^ Little HJ, Rorick NK, Su LI, Baldock C, Malhotra S, Jowitt T, Gakhar L, Subramanian R, Schutte BC, Dixon MJ, Shore P (November 2008). "Missense mutations that cause Van der Woude syndrome and popliteal pterygium syndrome affect the DNA-binding and transcriptional activation functions of IRF6". Hum. Mol. Genet. 18 (3): 535–45. doi:10.1093/hmg/ddn381. PMC 2638798. PMID 19036739.
  13. ^ de Lima RL, Hoper SA, Ghassibe M, et al. (April 2009). "Prevalence and non-random distribution of exonic mutations in Interferon Regulatory Factor 6 (IRF6) in 307 families with Van der Woude syndrome and 37 families with popliteal pterygium syndrome". Genet. Med. 11 (4): 241–7. doi:10.1097/GIM.0b013e318197a49a. PMC 2789395. PMID 19282774.
  14. ^ Richardson RJ, Dixon J, Malhotra S, Hardman MJ, Knowles L, Boot-Handford RP, Shore P, Whitmarsh A, Dixon MJ (November 2006). "Irf6 is a key determinant of the keratinocyte proliferation-differentiation switch". Nat. Genet. 38 (11): 1329–34. doi:10.1038/ng1894. PMID 17041603. S2CID 13102953.
  15. ^ Ingraham CR, Kinoshita A, Kondo S, Yang B, Sajan S, Trout KJ, Malik MI, Dunnwald M, Goudy SL, Lovett M, Murray JC, Schutte BC (November 2006). "Abnormal skin, limb and craniofacial morphogenesis in mice deficient for interferon regulatory factor 6 (Irf6)". Nat. Genet. 38 (11): 1335–40. doi:10.1038/ng1903. PMC 2082114. PMID 17041601.
  16. ^ Zucchero TM, Cooper ME, Maher BS, Daack-Hirsch S, Nepomuceno B, Ribeiro L, Caprau D, Christensen K, Suzuki Y, Machida J, Natsume N, Yoshiura K, Vieira AR, Orioli IM, Castilla EE, Moreno L, Arcos-Burgos M, Lidral AC, Field LL, Liu YE, Ray A, Goldstein TH, Schultz RE, Shi M, Johnson MK, Kondo S, Schutte BC, Marazita ML, Murray JC (August 2004). "Interferon regulatory factor 6 (IRF6) gene variants and the risk of isolated cleft lip or palate". N. Engl. J. Med. 351 (8): 769–80. doi:10.1056/NEJMoa032909. PMID 15317890.
  17. ^ Rahimov F, Marazita ML, Visel A, Cooper ME, Hitchler MJ, Rubini M, Domann FE, Govil M, Christensen K, Bille C, Melbye M, Jugessur A, Lie RT, Wilcox AJ, Fitzpatrick DR, Green ED, Mossey PA, Little J, Steegers-Theunissen RP, Pennacchio LA, Schutte BC, Murray JC (November 2008). "Disruption of an AP-2α binding site in an IRF6 enhancer is strongly associated with cleft lip". Nat. Genet. 40 (11): 1341–7. doi:10.1038/ng.242. PMC 2691688. PMID 18836445.
  18. ^ Rotondo JC, Borghi A, Selvatici R, Magri E, Bianchini E, Montinari E, Corazza M, Virgili A, Tognon M, Martini F (2016). "Hypermethylation-Induced Inactivation of the IRF6 Gene as a Possible Early Event in Progression of Vulvar Squamous Cell Carcinoma Associated With Lichen Sclerosus". JAMA Dermatology. 152 (8): 928–33. doi:10.1001/jamadermatol.2016.1336. PMID 27223861.
  19. ^ a b Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (April 2015). "Gene expression changes in progression of cervical neoplasia revealed by microarray analysis of cervical neoplastic keratinocytes". J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. doi:10.1002/jcp.24808. PMID 25205602. S2CID 24986454.

외부 링크

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