bZIP 도메인
bZIP domainbZIP 전사율 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||
식별자 | |||||||||
기호. | bZIP_1 | ||||||||
팜 | PF00170 | ||||||||
인터프로 | IPR011616 | ||||||||
프로 사이트 | PDOC00036 | ||||||||
SCOP2 | 1ysa/SCOPe/SUPFAM | ||||||||
CDD | cd48086 | ||||||||
막질 | 235 | ||||||||
|
베이직 류신 지퍼 도메인(bZIP 도메인)은 진핵생물 단백질과 결합하는 많은 DNA에서 발견됩니다.도메인의 한 부분은 배열 특이적 DNA 결합 특성을 매개하는 영역과 두 개의 DNA 결합 영역을 함께 유지하는 데 필요한 류신 지퍼를 포함한다.DNA 결합 영역은 아르기닌과 리신과 같은 많은 염기성 아미노산으로 구성됩니다.이 도메인을 포함하는 단백질은 전사인자이다.[1][2]
bZIP 문자 변환 계수
bZIP 전사 인자는 모든 진핵생물에서 발견되며 이합체 TF의 [3]가장 큰 패밀리 중 하나를 형성합니다.2008년의 진화 연구는 4개의 bZIP 유전자가 모든 [4]식물의 가장 최근의 공통 조상의 게놈에 의해 암호화되었다는 것을 밝혀냈다.bZIP 전사인자 간의 상호작용은 다양하고 복잡하며 상피조직의[7] [8]암 발생, 내분비조직의 세포에 의한 스테로이드 호르몬 합성,[9] 생식기능에 영향을 미치는 요인 및 인간의 건강에 영향을 미치는 여러 가지 다른 현상에 중요한 역할을 한다.
단백질을 포함한 bZIP 도메인
- 전사인자를 형성하는 AP-1 fos/jun 헤테로다이머
- 준-B 전사인자
- CREB cAMP 응답 요소 전사인자
- 옥수수(Zea Mays) 알맹이의 내배엽에서 저장 단백질의 클래스를 코드하는 22-kD 제인 유전자의 OPACE2(O2) 전사인자
- NFE2L2 또는 Nrf2
- Bzip Maf 전사 계수
이 영역을 포함하는 인간 단백질
ATF1, ATF2, ATF5, ATF6, ATF7, BACH1, BACH2, BATF, BATF2, CEBPA, CEBPB, CEBPD, CEBPE, CEBP, CEBP, CEBP, CEBP, CEBP, CREZ; MAFF, MAFG, NRL, C-MAF, MAFK, NFE2, NFE2L2, NFE2L3, SNFT, XBP1
레퍼런스
- ^ Ellenberger T (1994). "Getting a grip in DNA recognition: structures of the basic region leucine zipper, and the basic region helix-loop-helix DNA-binding domains". Curr. Opin. Struct. Biol. 4 (1): 12–21. doi:10.1016/S0959-440X(94)90054-X.
- ^ Hurst HC (1995). "Transcription factors 1: bZIP proteins". Protein Profile. 2 (2): 101–68. PMID 7780801.
- ^ a b Amoutzias, Grigoris D.; Robertson, David L.; Van de Peer, Yves; Oliver, Stephen G. (2008-05-01). "Choose your partners: dimerization in eukaryotic transcription factors". Trends in Biochemical Sciences. 33 (5): 220–229. doi:10.1016/j.tibs.2008.02.002. ISSN 0968-0004. PMID 18406148.
- ^ Corrêa LG, Riaño-Pachón DM, Schrago CG, dos Santos RV, Mueller-Roeber B, Vincentz M (2008). Shiu S (ed.). "The Role of bZIP Transcription Factors in Green Plant Evolution: Adaptive Features Emerging from Four Founder Genes". PLOS ONE. 3 (8): e2944. Bibcode:2008PLoSO...3.2944C. doi:10.1371/journal.pone.0002944. PMC 2492810. PMID 18698409.
- ^ Vinson, Charles; Acharya, Asha; Taparowsky, Elizabeth J. (2006-01-01). "Deciphering B-ZIP transcription factor interactions in vitro and in vivo". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Structure and Expression. 1759 (1–2): 4–12. doi:10.1016/j.bbaexp.2005.12.005. ISSN 0006-3002. PMID 16580748.
- ^ Newman, John R. S.; Keating, Amy E. (2003-06-27). "Comprehensive identification of human bZIP interactions with coiled-coil arrays". Science. 300 (5628): 2097–2101. Bibcode:2003Sci...300.2097N. doi:10.1126/science.1084648. ISSN 1095-9203. PMID 12805554. S2CID 36715183.
- ^ Vlahopoulos SA, Logotheti S, Mikas D, Giarika A, Gorgoulis V, Zoumpourlis V (April 2008). "The role of ATF-2 in oncogenesis". BioEssays. 30 (4): 314–27. doi:10.1002/bies.20734. PMID 18348191. S2CID 678541.
- ^ Manna PR, Dyson MT, Eubank DW, Clark BJ, Lalli E, Sassone-Corsi P, Zeleznik AJ, Stocco DM (January 2002). "Regulation of steroidogenesis and the steroidogenic acute regulatory protein by a member of the cAMP response-element binding protein family". Mol. Endocrinol. 16 (1): 184–99. doi:10.1210/mend.16.1.0759. PMID 11773448.
- ^ Hoare S, Copland JA, Wood TG, Jeng YJ, Izban MG, Soloff MS (May 1999). "Identification of a GABP alpha/beta binding site involved in the induction of oxytocin receptor gene expression in human breast cells, potentiation by c-Fos/c-Jun". Endocrinology. 140 (5): 2268–79. doi:10.1210/endo.140.5.6710. PMID 10218980.
외부 링크
- SMART 데이터베이스의 bZIP 도메인 엔트리
- 플랜트의 bZIP 패밀리TFDB: 플랜트 트랜스크립션 팩터 데이터베이스
- 플랜트 bZIP 문자 변환 팩터 2012-03-20 웨이백 머신에 아카이브