KDM5A

KDM5A
KDM5A
Protein KDM5A PDB 2JXJ.png
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스KDM5A, RBBP-2, RBBP2, RBP2, JARID1A, 리신탈메틸라아제5A
외부 IDOMIM: 180202 MGI: 2136980 HomoloGene: 3419 GeneCard: KDM5A
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_005056
NM_001042603

NM_145997

RefSeq(단백질)

NP_001036068

NP_666109

장소(UCSC)Chr 12: 0.28 ~ 0.39 MbChr 6: 120.34 ~120.42 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

리신특이적 데메틸라아제 5A는 KDM5A [5][6]유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 효소이다.

기능.

이 유전자에 의해 암호화된 단백질은 널리 발현되는 핵단백질이다.그것은 세포 증식을 조절하는 망막아종 단백질에 다른 단백질과 직접적으로 결합합니다.그것은 이전에 망막아세포종 결합 단백질 2(RBP2)로 알려져 있었다.또한 이 단백질은 적혈구 및 T세포 백혈병 발생에서 뚜렷하게 기능하는 마름보틴-2와 상호작용한다.Rhombotin-2는 부호화 단백질의 활성에 직접 영향을 미치거나 이 단백질에 결합함으로써 망막아종 단백질의 기능을 간접적으로 변조할 수 있다고 생각된다.[6]유전자에 대해 별개의 아이소폼을 코드하는 대체적으로 스플라이스된 전사 변이가 발견되었다.

드로소필라 호몰로그인 LID는 c-Myc[7]결합하는 H3K4 히스톤 탈메틸라아제인 것으로 밝혀졌다.그것은 최근에 리신 데메틸라아제 5(KDM5)로 이름이 바뀌었다.

효소적으로 α-케토글루타르산 의존성 히드록실화효소 슈퍼패밀리(EC 1.14.11.8)의 구성원인 트리메틸리신디옥실화효소로 지정할 수 있다.

상호 작용

JARID1A는 에스트로겐 수용체 알파,[8] LMO2[9], 망막아종 [8][10]단백질과 상호작용하는 으로 나타났다.

JARID1A는 수면 단계 말기에 HDAC1 활동을 차단하는 생체시계의 주요 구성요소이다.HDAC1 활성을 차단하면 CLOCK 및 BMAL1이 상향 조절되고 그에 따라 PER 단백질이 상향 조절됩니다.PER 복합체 내의 PSF(폴리피리미딘 트랙 결합 단백질 관련 스플라이싱 인자)는 전사 억제 복합체의 조립을 위한 발판인 SIN3A를 모집하여 Per1 프로모터에 히스톤탈아세틸라아제를 리드미컬하게 전달하여 Per1 [11][12]전사를 억제한다.

JARID1A의 녹다운은 체외 및 체외에서 인간 지방 유래 간질세포의 골형성 분화를 촉진하였고, 알칼리 포스파타아제(ALP), 골칼신(OC), 오스테릭스(OSX)와 같은 골형성 관련 유전자의 mRNA 발현을 현저하게 증가시켰다.RBP2는 염색질 면역침강 분석에 의해 H3K4me3 마크 수준을 유지하기 위해 OSX와 OC의 프로모터를 점유하는 것으로 나타났다.또한 RBP2는 골아세포 분화를 관장하는 필수 전사 인자 RUNX2와 물리적, 기능적으로 관련이 있었다.RUNX2 녹다운은 인간 지방 유도 간질 [13]세포의 골형성 분화에서 RBP2의 억제 활성을 손상시켰다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG000073614 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000030180 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Defeo-Jones D, Huang PS, Jones RE, Haskell KM, Vuocolo GA, Hanobik MG, Huber HE, Oliff A (Jul 1991). "Cloning of cDNAs for cellular proteins that bind to the retinoblastoma gene product". Nature. 352 (6332): 251–4. Bibcode:1991Natur.352..251D. doi:10.1038/352251a0. PMID 1857421. S2CID 4357523.
  6. ^ a b "Entrez Gene: JARID1A jumonji, AT rich interactive domain 1A".
  7. ^ Secombe J, Li L, Carlos L, Eisenman RN (Mar 2007). "The Trithorax group protein Lid is a trimethyl histone H3K4 demethylase required for dMyc-induced cell growth". Genes & Development. 21 (5): 537–51. doi:10.1101/gad.1523007. PMC 1820896. PMID 17311883.
  8. ^ a b Chan SW, Hong W (Jul 2001). "Retinoblastoma-binding protein 2 (Rbp2) potentiates nuclear hormone receptor-mediated transcription". The Journal of Biological Chemistry. 276 (30): 28402–12. doi:10.1074/jbc.M100313200. PMID 11358960.
  9. ^ Mao S, Neale GA, Goorha RM (Apr 1997). "T-cell oncogene rhombotin-2 interacts with retinoblastoma-binding protein 2". Oncogene. 14 (13): 1531–9. doi:10.1038/sj.onc.1200988. PMID 9129143.
  10. ^ Kim YW, Otterson GA, Kratzke RA, Coxon AB, Kaye FJ (Nov 1994). "Differential specificity for binding of retinoblastoma binding protein 2 to RB, p107, and TATA-binding protein". Molecular and Cellular Biology. 14 (11): 7256–64. doi:10.1128/mcb.14.11.7256. PMC 359260. PMID 7935440.
  11. ^ DiTacchio L, Le HD, Vollmers C, Hatori M, Witcher M, Secombe J, Panda S (2011). "Histone lysine demethylase JARID1a activates CLOCK-BMAL1 and influences the circadian clock". Science. 333 (6051): 1881–5. Bibcode:2011Sci...333.1881D. doi:10.1126/science.1206022. PMC 3204309. PMID 21960634.
  12. ^ Duong HA, Robles MS, Knutti D, Weitz CJ (2011). "A molecular mechanism for circadian clock negative feedback". Science. 332 (6036): 1436–9. Bibcode:2011Sci...332.1436D. doi:10.1126/science.1196766. PMC 3859310. PMID 21680841.
  13. ^ Ge W, Shi L, Zhou Y, Liu Y, Ma GE, Jiang Y, Xu Y, Zhang X, Feng H (2011). "Inhibition of osteogenic differentiation of human adipose-derived stromal cells by retinoblastoma binding protein 2 repression of RUNX2-activated transcription". Stem Cells. 29 (7): 1112–25. doi:10.1002/stem.663. PMID 21604327. S2CID 41977627.

추가 정보

외부 링크

이 기사에는 미국 국립 의학 도서관(미국 국립 의학 도서관)의 공공 도메인 텍스트가 포함되어 있습니다.