소규모 헤테로다이머 파트너

Small heterodimer partner
NR0B2
Protein NR0B2 PDB 1YUC.png
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스NR0B2, SHP, SHP1, 핵수용체 서브패밀리 0그룹 B멤버 2
외부 IDOMIM: 604630 MGI: 1346344 HomoloGene: 8030 GeneCard: NR0B2
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

8431

23957

앙상블

ENSG00000131910

ENSMUSG000037583

유니프로트

문제 15466

Q62227

RefSeq(mRNA)

NM_021969

NM_011850

RefSeq(단백질)

NP_068804

NP_035980

장소(UCSC)Chr 1: 26.91 ~26.91 MbChr 4: 133.28 ~133.28 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
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소형 헤테로디머 파트너(SHP)는 NR0B2(핵수용체 서브패밀리 0, 그룹 B, 멤버 2)라고도 알려져 있으며, NR0B2 [5]유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 단백질이다.SHP는 세포내 전사인자의 [6]핵수용체 패밀리의 구성원이다.SHP는 DNA 결합 도메인이 없다는 점에서 핵 수용체로는 이례적이다.따라서 기술적으로 전사인자도 핵수용체도 아니지만 다른 핵수용체 패밀리와의 배열 상동성이 상대적으로 높기 때문에 여전히 전사인자로 분류된다.

기능.

SHP의 주요 역할은 비생산적 헤테로디머를 [7]생성하기 위한 결합을 통한 다른 핵 수용체의 억제인 것으로 보인다.단백질은 또한 대사 주기 시계의 매개 인자로 확인되었습니다. 연구 결과 단백질은 레티노이드 및 갑상선 호르몬 수용체와 상호작용하여 그들의 배위자 의존적 전사 활성화를 억제하는 것으로 나타났습니다.또한 에스트로겐 수용체와의 상호작용이 증명되어 기능저해로 이어지고 있다.연구에 따르면 단백질은 두 가지 단계를 통해 핵호르몬 수용체 매개 트랜스 활성화를 억제한다. 즉, 공동활성화제와의 경쟁과 전사억제제 기능의 [5]직접적인 영향이다.

구조 및 배위자

EID1과의 공결정화에 의해 생성된 LBD 전용 SHP의 결정구조를 얻을 수 있다.일반적인 AF-2 부위에 결합하는 대신, EID1은 LBD의 보통 나선형 α1 대신 채워져 SHP를 더 용해시킨다.전체적인 구조는 다른 LBD의 apo(리간드리스) 형태와 유사합니다.일부 합성 레티노이드 배위자는 SHP의 LBD에 결합할 수 있으며 AF-2 [9]부위를 사용하여 LXLL 함유 코어프레서와의 상호작용을 촉진할 수 있다.

상호 작용

NR 문헌의 텍스트 마이닝뿐만 아니라 대규모 및 중규모 Y2H 실험은 핵 수용체 이량화 네트워크에서 SHP의 중요한 역할과 다른 NR에 비해 상대적으로 높은 연결 상태를 부각시켰다.[10]

소규모 헤테로다이머 파트너는 다음과 상호작용하는 것으로 나타났습니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000131910 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000037583 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: NR0B2 nuclear receptor subfamily 0, group B, member 2".
  6. ^ Lee HK, Lee YK, Park SH, Kim YS, Park SH, Lee JW, et al. (June 1998). "Structure and expression of the orphan nuclear receptor SHP gene". The Journal of Biological Chemistry. 273 (23): 14398–402. doi:10.1074/jbc.273.23.14398. PMID 9603951.
  7. ^ Båvner A, Sanyal S, Gustafsson JA, Treuter E (December 2005). "Transcriptional corepression by SHP: molecular mechanisms and physiological consequences". Trends in Endocrinology and Metabolism. 16 (10): 478–88. doi:10.1016/j.tem.2005.10.005. PMID 16275121. S2CID 7884363.
  8. ^ Wu N, Kim KH, Zhou Y, Lee JM, Kettner NM, Mamrosh JL, et al. (September 2016). "Small Heterodimer Partner (NR0B2) Coordinates Nutrient Signaling and the Circadian Clock in Mice". Molecular Endocrinology. 30 (9): 988–95. doi:10.1210/me.2015-1295. PMC 5004116. PMID 27427832.
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  11. ^ Gobinet J, Auzou G, Nicolas JC, Sultan C, Jalaguier S (December 2001). "Characterization of the interaction between androgen receptor and a new transcriptional inhibitor, SHP". Biochemistry. 40 (50): 15369–77. doi:10.1021/bi011384o. PMID 11735420.
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  15. ^ Lee YK, Moore DD (January 2002). "Dual mechanisms for repression of the monomeric orphan receptor liver receptor homologous protein-1 by the orphan small heterodimer partner". The Journal of Biological Chemistry. 277 (4): 2463–7. doi:10.1074/jbc.M105161200. PMID 11668176.
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  17. ^ Seol W, Choi HS, Moore DD (May 1996). "An orphan nuclear hormone receptor that lacks a DNA binding domain and heterodimerizes with other receptors". Science. 272 (5266): 1336–9. Bibcode:1996Sci...272.1336S. doi:10.1126/science.272.5266.1336. PMID 8650544. S2CID 32853062.
  18. ^ Seol W, Hanstein B, Brown M, Moore DD (October 1998). "Inhibition of estrogen receptor action by the orphan receptor SHP (short heterodimer partner)". Molecular Endocrinology. 12 (10): 1551–7. doi:10.1210/me.12.10.1551. PMID 9773978.

추가 정보

외부 링크