SATB2

SATB2
SATB2
PDB 1wi3 EBI.jpg
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스SATB2, GLS, SATB 홈박스 2
외부 IDOMIM: 608148 MGI: 2679336 HomoloGene: 32249 GenCards: SATB2
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

23314

212712

앙상블

ENSG00000119042

ENSMUSG000038331

유니프로트

Q9UPW6

Q8VI24

RefSeq(mRNA)

NM_001172509
NM_001172517
NM_015265

NM_139146
NM_001358580
NM_001358581

RefSeq(단백질)

NP_001165980
NP_001165988
NP_056080

NP_631885
NP_001345509
NP_001345510

장소(UCSC)Chr 2: 199.27 ~199.47 MbChr 1: 56.83 ~57.02 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

DNA결합단백질 SATB2로도 알려진 특별한 AT가 풍부한 배열결합단백질 2(SATB2)는 사람에게서 SATB2 [5]유전자에 의해 암호화되는 단백질이다.SATB2는 핵 매트릭스 부착 영역을 특이하게 결합하는 DNA 결합 단백질로 전사 조절과 염색질 [6]리모델링에 관여한다.SATB2는 제한된 발현 모드[1]를 나타내며 특정 세포핵[2]에서 발현된다.SATB2 단백질은 주로 대장과 직장의 상피 세포에서 발현되고,[7] 그 다음에 뇌의 뉴런 핵에서 발현된다.

기능.

전 세계적으로 평균 800분의 1의 정상 출산율이 있는 구강 구개열은 가장 흔한 선천성 [8]결함 중 하나이다.300개 이상의 기형 증후군이 구강 구개열을 포함할 수 있지만, 비신드롬 형태는 구개열(CL/P)이 있거나 없는 구개열(CP)이 있는 경우 중 약 70%를 나타내고 구개열(CP)이 있는 경우만 약 50%를 나타낸다.비신드롬성 구강열은 유전자와 환경 요인 모두 병인에 기여한다는 점에서 '복잡' 또는 '다인자성'으로 간주된다.최근의 연구는 몇몇 유전자가 모성 [9]흡연과 같은 환경적 요인뿐만 아니라 위험을 통제할 가능성이 있다는 것을 보여준다.

특정 돌연변이를 식별하기 위한 재서열 연구는 여러 다른 유전자가 구강 구분에 대한 위험을 통제할 수 있다는 것을 암시하며, 명백한 원인 유전자의 많은 뚜렷한 변종 또는 돌연변이는 높은 수준의 대립 유전자 이질성을 반영하는 것으로 밝혀졌다.이러한 돌연변이의 대부분은 극히 드물고 종종 불완전한 침투(즉, 영향을 받지 않은 부모나 다른 친척도 돌연변이를 옮길 수 있음)를 보이지만, 결합하면 비신드롬성 구강 균열의 [9]최대 5%를 차지할 수 있다.

SATB2 유전자의 돌연변이는 분리된 [10]구개열을 일으키는 것으로 밝혀졌다.SATB2는 또한 두뇌 발달에 영향을 미칠 수 있다.이는 헤테로 접합성 녹아웃 [11]생쥐에서 명백히 정상적인 말뭉치 칼로섬에도 불구하고 SATB2가 말뭉치 칼로섬에 걸친 피질 뉴런 연결을 적절하게 확립하기 위해 필요하다는 마우스 연구와 일치한다.

구조.

SATB2는 2q33의 SATB2 유전자에 의해 코드된 분자량 82.5kDa의 아미노산 호메오도메인 함유 인간 단백질이다.단백질은 CUT 도메인으로 알려진 두 개의 퇴화 호메오도메인 영역(아미노산 352–437 및 482–560)과 고전 호메오도메인(아미노산 614–677)을 포함한다.I481V, A590T 및 I730T가 포함된 733개의 잔류 단백질에서 예측된 아미노산 치환은 사람과 마우스 단백질 간의 아미노산 차이일 정도로 배열 보존도가 매우 높다.

임상적 의의

SATB2는 2q32q33 미세결손증후군을 [11]가진 개인의 구개열 또는 고입천장에 원인이 있는 것으로 나타났다.

SATB2는 구개열과 [12]피에르 로빈 염기서열과 관련된 de novo 균형 염색체 전위를 가진 관련이 없는 두 사례에서 교란되는 것으로 밝혀졌다.

치아와 턱 발달에서 SATB2의 역할은 심각한 지적 장애와 턱과 치아 이상을 가진 남성의 de novo SATB2 돌연변이와 로빈 시퀀스를 가진 개인의 SATB2를 방해하는 전위 확인에 의해 뒷받침된다.또한 마우스 모델은 사람의 2q32q33 결실에 의해 야기된 것을 페노카피하는 두개 안면 결손의 SATB2의 하플로불능성을 입증했다. 또한, SATB2의 완전한 기능 상실은 이러한 [11]결손을 증폭시킨다.

SATB2 발현은 하부 GI-tract의 암에 대해 매우 특이적이며 [13][14]대장암의 암 바이오마커로 관여하고 있다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000119042 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000038331 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Kikuno R, Nagase T, Ishikawa K, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (June 1999). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XIV. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro". DNA Research. 6 (3): 197–205. doi:10.1093/dnares/6.3.197. PMID 10470851.
  6. ^ "Entrez Gene: SATB homeobox 2".
  7. ^ Uhlén, Mathias; Fagerberg, Linn; Hallström, Björn M.; Lindskog, Cecilia; Oksvold, Per; Mardinoglu, Adil; Sivertsson, Åsa; Kampf, Caroline; Sjöstedt, Evelina (2015-01-23). "Tissue-based map of the human proteome". Science. 347 (6220): 1260419. doi:10.1126/science.1260419. ISSN 0036-8075. PMID 25613900. S2CID 802377.
  8. ^ Jugessur A, Shi M, Gjessing HK, Lie RT, Wilcox AJ, Weinberg CR, Christensen K, Boyles AL, Daack-Hirsch S, Nguyen TT, Christiansen L, Lidral AC, Murray JC (2010). "Maternal genes and facial clefts in offspring: a comprehensive search for genetic associations in two population-based cleft studies from Scandinavia". PLOS ONE. 5 (7): e11493. Bibcode:2010PLoSO...511493J. doi:10.1371/journal.pone.0011493. PMC 2901336. PMID 20634891. open access
  9. ^ a b Beaty TH, Hetmanski JB, Fallin MD, Park JW, Sull JW, McIntosh I, Liang KY, Vanderkolk CA, Redett RJ, Boyadjiev SA, Jabs EW, Chong SS, Cheah FS, Wu-Chou YH, Chen PK, Chiu YF, Yeow V, Ng IS, Cheng J, Huang S, Ye X, Wang H, Ingersoll R, Scott AF (November 2006). "Analysis of candidate genes on chromosome 2 in oral cleft case-parent trios from three populations". Human Genetics. 120 (4): 501–18. doi:10.1007/s00439-006-0235-9. PMID 16953426. S2CID 7836461.
  10. ^ Dixon MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC (March 2011). "Cleft lip and palate: understanding genetic and environmental influences". Nature Reviews. Genetics. 12 (3): 167–78. doi:10.1038/nrg2933. PMC 3086810. PMID 21331089.
  11. ^ a b c Rosenfeld JA, Ballif BC, Lucas A, Spence EJ, Powell C, Aylsworth AS, Torchia BA, Shaffer LG (2009). "Small deletions of SATB2 cause some of the clinical features of the 2q33.1 microdeletion syndrome". PLOS ONE. 4 (8): e6568. Bibcode:2009PLoSO...4.6568R. doi:10.1371/journal.pone.0006568. PMC 2719055. PMID 19668335. open access
  12. ^ FitzPatrick DR, Carr IM, McLaren L, Leek JP, Wightman P, Williamson K, Gautier P, McGill N, Hayward C, Firth H, Markham AF, Fantes JA, Bonthron DT (October 2003). "Identification of SATB2 as the cleft palate gene on 2q32-q33". Human Molecular Genetics. 12 (19): 2491–501. doi:10.1093/hmg/ddg248. PMID 12915443.
  13. ^ Magnusson, Kristina; Wit, Meike de; Brennan, Donal J.; Johnson, Louis B.; McGee, Sharon F.; Lundberg, Emma; Naicker, Kirsha; Klinger, Rut; Kampf, Caroline (2011). "SATB2 in Combination With Cytokeratin 20 Identifies Over 95% of all Colorectal Carcinomas". The American Journal of Surgical Pathology. 35 (7): 937–948. doi:10.1097/pas.0b013e31821c3dae. PMID 21677534. S2CID 33883685.
  14. ^ Dragomir, Anca; de Wit, Meike; Johansson, Christine; Uhlen, Mathias; Pontén, Fredrik (2014-05-01). "The Role of SATB2 as a Diagnostic Marker for Tumors of Colorectal OriginResults of a Pathology-Based Clinical Prospective Study". American Journal of Clinical Pathology. 141 (5): 630–638. doi:10.1309/ajcpww2urz9jkqju. ISSN 0002-9173. PMID 24713733.

추가 정보

외부 링크

SATB2 사례 등록부 http://satb2gene.com

이 기사에는 미국 국립 의학 도서관(미국 국립 의학 도서관)의 공공 도메인 텍스트가 포함되어 있습니다.