SOX6
SOX6
전사인자 SOX-6는 사람 내 SOX6 [5][6]유전자에 의해 암호화되는 단백질이다.
기능.
SOX 유전자 패밀리는 Conserved High Mobility Group(HMG) DNA 결합 도메인에 의해 정의된 전사 인자 그룹을 부호화합니다.대부분의 전사 인자와 달리 SOX 전사 인자는 DNA의 작은 홈에 결합하여 70~85도의 굽힘을 일으키고 국소적인 구조 변화를 일으킵니다.[OMIM [6]제공]
상호 작용
SOX6는 CTBP2[7] 및 CENPK와 [8]상호작용하는 것으로 나타났습니다.
또한 SOX6 단백질이 분화하는 인간 적혈구에 축적된 후 SOX6 전사 시작 [9]부위 근처에 위치한 진화적으로 보존된 컨센서스 배열에 직접 결합함으로써 자신의 전사를 다운조절할 수 있다는 것이 입증되었다.
Sox6는 글로빈 유전자의 전사 조절과 적혈구의 [10]말단 분화를 지시하는 데 중요한 역할을 하는 것으로 보인다.또한 SOX6는 유잉 [11]육종의 종양 성장에 역할을 할 수 있다.레닌 및 프로레닌 조절에서 Sox6의 새로운 역할은 Sox KO 마우스 모델을 사용하여 연구되었습니다. Sox6는 레닌 발현 세포에서만 녹아웃됩니다.이 연구는 레닌 프로모터가 Sox6의 결합 부위를 소유한다는 것을 보여주었다.이 연구의 하이라이트는 Sox6가 쥐의 저염과 탈수 동안 레닌과 프로레닌 조절과 JG 세포 증식의 핵심 조절제 중 하나라는 것이다.PMID: 31760770, DOI: 10.1152/ajprenal.00095.2019
「 」를 참조해 주세요.
레퍼런스
- ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000110693 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000051910 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Cohen-Barak O, Hagiwara N, Arlt MF, Horton JP, Brilliant MH (March 2001). "Cloning, characterization and chromosome mapping of the human SOX6 gene". Gene. 265 (1–2): 157–164. doi:10.1016/S0378-1119(01)00346-8. PMID 11255018.
- ^ a b "Entrez Gene: SOX6 SRY (sex determining region Y)-box 6".
- ^ Murakami A, Ishida S, Thurlow J, Revest JM, Dickson C (August 2001). "SOX6 binds CtBP2 to repress transcription from the Fgf-3 promoter". Nucleic Acids Research. 29 (16): 3347–3355. doi:10.1093/nar/29.16.3347. PMC 55854. PMID 11504872.
- ^ Yamashita A, Ito M, Takamatsu N, Shiba T (September 2000). "Characterization of Solt, a novel SoxLZ/Sox6 binding protein expressed in adult mouse testis". FEBS Letters. 481 (2): 147–151. doi:10.1016/S0014-5793(00)01987-6. PMID 10996314. S2CID 20831354.
- ^ Cantu' C, Grande V, Alborelli I, Cassinelli L, Cantu' I, Colzani MT, et al. (January 2011). "A highly conserved SOX6 double binding site mediates SOX6 gene downregulation in erythroid cells". Nucleic Acids Research. 39 (2): 486–501. doi:10.1093/nar/gkq819. PMC 3025548. PMID 20852263.
- ^ Cantù C, Ierardi R, Alborelli I, Fugazza C, Cassinelli L, Piconese S, et al. (March 2011). "Sox6 enhances erythroid differentiation in human erythroid progenitors". Blood. 117 (13): 3669–3679. doi:10.1182/blood-2010-04-282350. PMID 21263153.
- ^ Marchetto A, Ohmura S, Orth MF, Knott MM, Colombo MV, Arrigoni C, et al. (May 2020). "Oncogenic hijacking of a developmental transcription factor evokes vulnerability toward oxidative stress in Ewing sarcoma". Nature Communications. 11 (1): 2423. Bibcode:2020NatCo..11.2423M. doi:10.1038/s41467-020-16244-2. PMC 7228971. PMID 32415069.
추가 정보
- Denny P, Swift S, Brand N, Dabhade N, Barton P, Ashworth A (June 1992). "A conserved family of genes related to the testis determining gene, SRY". Nucleic Acids Research. 20 (11): 2887. doi:10.1093/nar/20.11.2887. PMC 336939. PMID 1614875.
- Lefebvre V, Li P, de Crombrugghe B (October 1998). "A new long form of Sox5 (L-Sox5), Sox6 and Sox9 are coexpressed in chondrogenesis and cooperatively activate the type II collagen gene". The EMBO Journal. 17 (19): 5718–5733. doi:10.1093/emboj/17.19.5718. PMC 1170900. PMID 9755172.
- Hagiwara N, Klewer SE, Samson RA, Erickson DT, Lyon MF, Brilliant MH (April 2000). "Sox6 is a candidate gene for p100H myopathy, heart block, and sudden neonatal death". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 97 (8): 4180–4185. Bibcode:2000PNAS...97.4180H. doi:10.1073/pnas.97.8.4180. PMC 18189. PMID 10760285.
- Yamashita A, Ito M, Takamatsu N, Shiba T (September 2000). "Characterization of Solt, a novel SoxLZ/Sox6 binding protein expressed in adult mouse testis". FEBS Letters. 481 (2): 147–151. doi:10.1016/S0014-5793(00)01987-6. PMID 10996314. S2CID 20831354.
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (November 2000). "DNA cloning using in vitro site-specific recombination". Genome Research. 10 (11): 1788–1795. doi:10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, et al. (March 2001). "Toward a catalog of human genes and proteins: sequencing and analysis of 500 novel complete protein coding human cDNAs". Genome Research. 11 (3): 422–435. doi:10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
- Murakami A, Ishida S, Thurlow J, Revest JM, Dickson C (August 2001). "SOX6 binds CtBP2 to repress transcription from the Fgf-3 promoter". Nucleic Acids Research. 29 (16): 3347–3355. doi:10.1093/nar/29.16.3347. PMC 55854. PMID 11504872.
- Cohen-Barak O, Yi Z, Hagiwara N, Monzen K, Komuro I, Brilliant MH (October 2003). "Sox6 regulation of cardiac myocyte development". Nucleic Acids Research. 31 (20): 5941–5948. doi:10.1093/nar/gkg807. PMC 219484. PMID 14530442.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, et al. (October 2004). "From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline". Genome Research. 14 (10B): 2136–2144. doi:10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
- Ueda R, Yoshida K, Kawakami Y, Kawase T, Toda M (2005). "Expression of a transcriptional factor, SOX6, in human gliomas". Brain Tumor Pathology. 21 (1): 35–38. doi:10.1007/BF02482175. PMID 15696967. S2CID 23632021.
- Ueda R, Yoshida K, Kawakami Y, Kawase T, Toda M (2005). "Immunohistochemical analysis of SOX6 expression in human brain tumors". Brain Tumor Pathology. 21 (3): 117–120. doi:10.1007/BF02482186. PMID 15696972. S2CID 27841927.
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, et al. (January 2006). "The LIFEdb database in 2006". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D415–D418. doi:10.1093/nar/gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
- Fernández-Lloris R, Osses N, Jaffray E, Shen LN, Vaughan OA, Girwood D, et al. (February 2006). "Repression of SOX6 transcriptional activity by SUMO modification". FEBS Letters. 580 (5): 1215–1221. doi:10.1016/j.febslet.2006.01.031. PMID 16442531. S2CID 38625057.
- Ikeda T, Saito T, Ushita M, Yano F, Kan A, Itaka K, et al. (June 2007). "Identification and characterization of the human SOX6 promoter". Biochemical and Biophysical Research Communications. 357 (2): 383–390. doi:10.1016/j.bbrc.2007.03.133. PMID 17433257.
외부 링크
- SOX6+단백질+미국 국립의학도서관의 의학 주제 제목(MeSH)
이 기사에는 미국 국립 의학 도서관(미국 국립 의학 도서관)의 공공 도메인 텍스트가 포함되어 있습니다.
PDB 갤러리 | |
|---|---|
|
