엔트레즈
Entrez
Entrez('n[1]'tre'로 발음) Global Query Cross-Database Search System은 National Center for Biotechnology Information(NCBI) [2]웹사이트에서 다수의 개별 건강과학 데이터베이스를 검색할 수 있는 연합 검색 엔진 또는 웹 포털입니다.NCBI는 National Library of Medicine(NLM)의 일부이며, NIH(National Institute of Health)는 NIH(National Institute of Health)의 한 부서이며, NLM은 미국 보건 및 휴먼 서비스부의 일부입니다.'엔트레즈'(프랑스어로 '들어오세요'라는 뜻의 인사말)는 대중이 NLM에서 이용할 수 있는 콘텐츠를 검색하는 것을 환영하는 정신을 반영하여 선택되었다.
Entrez Global Query는 단일 쿼리 문자열과 사용자 인터페이스를 통해 모든 데이터베이스에 동시에 액세스할 수 있는 통합 검색 및 검색 시스템입니다.Entrez는 관련된 시퀀스, 구조 및 참조를 효율적으로 가져올 수 있습니다.Entrez 시스템은 유전자 및 단백질 배열과 염색체 지도를 제공할 수 있습니다.일부 교과서는 엔트레즈 시스템을 통해서도 온라인으로 이용할 수 있다.
특징들
Entrez 의 선두 페이지에서는, 디폴트로 글로벌 쿼리에 액세스 할 수 있습니다.Entrez에 의해 색인화된 모든 데이터베이스는 단일 쿼리 문자열을 통해 검색할 수 있으며, 검색문의 일부를 특정 필드로 제한하는 부울 연산자와 검색어 태그를 지원합니다.그러면 각 데이터베이스의 검색 조회 수를 보여주는 통합 결과 페이지가 반환되며, 이 페이지는 특정 데이터베이스에 대한 실제 검색 결과에 대한 링크이기도 합니다.
Entrez는 또한 각각의 특정 데이터베이스를 검색하고 검색 결과를 개선하기 위한 유사한 인터페이스를 제공합니다.제한 기능을 사용하면 웹 양식 인터페이스를 검색 범위를 좁힐 수 있습니다.History 기능은 최근에 수행된 쿼리의 번호 목록을 제공합니다.이전 쿼리의 결과는 번호로 참조할 수 있으며 부울 연산자를 통해 결합할 수 있습니다.검색 결과를 클립보드에 임시로 저장할 수 있습니다.MyNCBI 계정을 가진 사용자는 쿼리를 무기한 저장할 수 있으며 대부분의 데이터베이스에 저장된 쿼리에 대해 새로운 검색 결과를 이메일로 업데이트하도록 선택할 수도 있습니다.그것은 학생과 전문가 모두를 위한 참조 도구로서 생명공학 분야에서 널리 사용되고 있다.
데이터베이스
Entrez는 다음 데이터베이스를 검색합니다.
- PubMed: Medline을 포함한 생물의학 문헌 인용과 추상 - (주로 의학) 저널의 기사, 종종 추상화도 포함합니다.1990년대 기사에 대한 PubMed Central 및 기타 전문 자료 링크가 제공됩니다.
- PubMed Central: 무료 전문 저널 기사
- 사이트 검색: NCBI 웹 사이트 및 FTP 웹 사이트
- 서적: 온라인 서적
- 온라인 Mendelian In Man(OMIM)
- 뉴클레오티드: 배열 데이터베이스(GenBank)
- 단백질: 시퀀스 데이터베이스
- 게놈: 전체 게놈 배열 및 매핑
- 구조: 3차원 고분자 구조
- 분류법: GenBank 분류법의 생물
- dbSNP: 단일 뉴클레오티드 다형성
- 유전자:[3] 유전자 중심 정보
- 호몰로진 : 진핵생물 호몰로지 그룹
- PubChem 화합물: 독특한 소분자 화학 구조
- PubChem 물질 : 퇴적된 화학물질 기록
- 게놈 프로젝트: 게놈 프로젝트 정보
- UniGene: 유전자 지향 전사 배열 클러스터
- CDD: 보존 단백질 도메인 데이터베이스
- PopSet: 모집단 연구 데이터 세트(역학)
- GEO 프로파일: 발현과 분자 풍성 프로파일
- GEO 데이터 세트: 실험적인 GEO 데이터 세트
- 시퀀스 읽기 아카이브: 높은 스루풋의 시퀀스 데이터
- 암염색체: 세포유전학적 데이터베이스
- PubChem BioAssay : 화학물질의 생체활성화면
- 프로브: 배열별 시약
- NLM 카탈로그: Locator Plus에 상주하는 120만 개 이상의 저널, 서적, 오디오 비주얼, 컴퓨터 소프트웨어, 전자 리소스 및 기타 자료에 대한 NLM 서지 데이터(평일마다 업데이트)
접근
검색 엔진 폼을 사용하여 Entrez의 데이터를 쿼리하는 것 외에 NCBI는 Entrez Programming[4] Utils(eUtils)를 제공하여 쿼리 결과에 보다 직접적으로 액세스합니다.eUtils에는 특별히 형성된 URL을 NCBI 서버에 게시하고 XML 응답을 구문 분석하여 액세스합니다.2015년 [5]7월에 종료된 eUtils SOAP 인터페이스도 있습니다.
역사
1991년에 엔트레즈는 CD 형태로 출시되었습니다.1993년에는 클라이언트-서버 버전의 소프트웨어가 인터넷 접속을 제공했습니다.1994년, NCBI는 웹사이트를 설립했고 Entrez는 이 초기 릴리즈의 일부였습니다.2001년에는 Entrez 책장이 출시되었고 2003년에는 Entrez Gene 데이터베이스가 [6]개발되었습니다.
레퍼런스
- ^ "Definition of 'entrez'". Collins Dictionary [Internet].
- ^ NCBI Resource Coordinators (2012). "Database resources of the National Center for Biotechnology Information". Nucleic Acids Research. 41 (Database issue): D8–D20. doi:10.1093/nar/gks1189. PMC 3531099. PMID 23193264.
- ^ "Home - Gene - NCBI".
- ^ Entrez Utilities. National Center for Biotechnology Information (US). 2010.
- ^ The E-utility Web Service (SOAP). National Center for Biotechnology Information (US). 23 January 2015.
- ^ Smith, Kent. "A Brief History of NCBI's Formation and Growth". The NCBI Handbook [Internet]. 2nd edition. Retrieved 3 May 2014.
