리가아제
Ligase생화학에서 연결효소는 새로운 화학적 결합을 형성함으로써 두 개의 큰 분자의 결합을 촉매할 수 있는 효소이다.이는 일반적으로 더 큰 분자 중 하나에 있는 작은 펜던트 화학 그룹의 가수 분해 또는 두 가지 화합물(예: C-O, C-S, C-N 등의 결합을 촉매하는 효소)의 결합을 통해 이루어진다.일반적으로 연결효소는 다음과 같은 반응을 촉매한다.
- Ab + C → A–C + b
혹은 때때로
- Ab + cD → A–D + b + c + d + e + f
여기서 소문자는 소규모 종속 그룹을 나타낼 수 있습니다.리가아제는 두 개의 상보적인 핵산 조각에 결합할 수 있고 복제 중에 이중 가닥 DNA에서 발생하는 단일 가닥 파괴를 복구할 수 있습니다.
명명법
연결효소의 일반적인 이름은 종종 DNA 조각들을 결합하기 위해 분자 생물학 실험실에서 일반적으로 사용되는 효소인 DNA 연결효소와 같은 "연결효소"를 포함합니다.연결효소에 대한 다른 일반적인 이름은 "합성효소"라는 단어를 포함하는데, 왜냐하면 그것들은 새로운 분자를 합성하는데 사용되기 때문이다.
생화학적 명명법은 때때로 합성 효소와 합성 효소를 구별하고 때로는 단어를 동의어로 취급했다.하나의 정의에 따르면, 합성효소는 뉴클레오사이드 트리포스페이트(예: ATP, GTP, CTP, TTP, UTP)로부터 에너지를 사용하지 않는 반면, 합성효소는 뉴클레오사이드 트리포스페이트를 사용한다.합성효소는 리아제(가수분해 및 산화 이외의 방법으로 다양한 화학결합의 분해를 촉매하여 새로운 이중결합이나 새로운 고리구조를 형성하는 효소)라고 하며, 합성효소는 에너지를 필요로 하지 않는 반면, 합성효소는 리아제(리가아제는 두 개의 화학성분 또는 화합물을 결합하는 효소)라고 한다.에너지를 필요로 합니다.그러나, JCBN(Joint Commission on Phiothical Nomenclature)은 "합성효소"는 (뉴클레오시드 트리포스페이트를 사용하든 사용하지 않든) 합성을 촉매하는 효소와 함께 사용될 수 있는 반면, "합성효소"는 동의어로 [1]사용되어야 한다고 명령한다.
분류
연결효소는 효소의 EC 번호 분류에서 EC 6으로 분류된다.연결효소는 6개의 하위 분류로 분류할 수 있다.
- EC 6.1은 탄소-산소 결합을 형성하기 위해 사용되는 연결가수소를 포함한다.
- EC 6.2는 탄소-황 결합 형성에 사용되는 연결가수분해효소를 포함한다.
- EC 6.3은 탄소-질소 결합을 형성하기 위해 사용되는 연결효소(아르기노숙신산합성효소 포함)를 포함한다.
- EC 6.4는 탄소-탄소 결합 형성에 사용되는 연결가수분해효소를 포함한다.
- EC 6.5는 인산 에스테르 결합 형성에 사용되는 연결가수분해효소를 포함한다.
- EC 6.6은 킬라타아제처럼 질소-금속 결합을 형성하는 데 사용되는 연결효소를 포함한다.
막관련결합가수분해효소
일부 연결효소는 말초막 단백질로서 생물학적 막과 결합하거나 단일 막 통과 [2]나선을 통해 고정되는데, 예를 들어 특정 유비퀴틴 연결효소 관련 단백질이다.
어원과 발음
리가아제라는 단어는 결합 효소를 생성하는 결합 형태(라틴 동사 리가레에서 "결합하다" 또는 "결합하다") + -ase (효소를 나타냄)를 사용한다.
「 」를 참조해 주세요.
레퍼런스
- ^ "Synthases and ligases". chem.qmul.ac.uk. Archived from the original on October 15, 2012. Retrieved July 28, 2013.
- ^ 멤브롬 데이터베이스의 단일 패스 막간 연결효소 슈퍼 패밀리
- EC6 런던대학교 퀸메리 화학과 소개