ADF-H 도메인
ADF-H domain코필린_ADF | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() 아라비도시스탈리아나의 adf1 결정구조 | |||||||||
식별자 | |||||||||
기호. | 코필린_ADF | ||||||||
팜 | PF00241 | ||||||||
빠맘 클랜 | CL0092 | ||||||||
인터프로 | IPR002108 | ||||||||
스마트 | ADF | ||||||||
프로 사이트 | PDOC00297 | ||||||||
SCOP2 | 2prf/SCOPe/SUPFAM | ||||||||
CDD | cd00013 | ||||||||
|
분자생물학에서 ADF-H 도메인(액틴 탈중합인자 호몰로지 도메인)은 진핵생물 액틴 결합 [1][2][3]단백질의 세 가지 계통학적으로 다른 클래스에 존재하는 약 150개의 아미노산 모티브이다.
- ADF, 코필린, 데스트린, 액토포린, 코액토신, 디팩틴 및 글리아 성숙인자(GMF) 베타 및 감마를 포함하는 ADF/코필린.ADF/코필린은 단일 ADF-H 도메인으로 구성된 작은 액틴 결합 단백질이다.그들은 액틴 모노머와 필라멘트를 결합하고 액틴 필라멘트를 탈중합/파쇄함으로써 세포에서 빠른 필라멘트 회전을 촉진한다.ADF/코필린은 ATP-액틴보다 높은 친화력으로 ADP-액틴과 결합하고 액틴 단량체에서의 자발적인 뉴클레오티드 교환을 저해한다.
- 2개의 ADF-H 도메인으로 이루어진 액틴 단량체 결합 단백질인 트윈필린
- Abp1/Drebrins, N 말단 ADF-H 도메인과 이어서 가변 영역 및 C 말단 SH3 도메인으로 구성된 비교적 큰 단백질.Abp1/Drebrins는 액틴 필라멘트와만 상호작용하며 필라멘트 탈중합 또는 단편화를 촉진하지 않는다.이러한 단백질들은 생화학적으로 구별되고 액틴 역학에서 다른 역할을 하지만, 모두 액틴과의 상호작용을 위해 ADF-H 도메인을 사용하는 것으로 보인다.
ADF-H 도메인은 네 개의 중심 가닥(베타2-베타5)이 반평행이고 두 개의 가장자리 가닥(베타1 및 베타6)이 인접 가닥과 평행하게 실행되는 6가닥 혼합 베타 시트로 구성된다.그 시트는 [1][2][4]양쪽에 두 개의 알파-헬리쉬로 둘러싸여 있다.
레퍼런스
- ^ a b Lappalainen P, Kessels MM, Cope MJ, Drubin DG (August 1998). "The ADF homology (ADF-H) domain: a highly exploited actin-binding module". Mol. Biol. Cell. 9 (8): 1951–9. doi:10.1091/mbc.9.8.1951. PMC 25446. PMID 9693358.
- ^ a b Paavilainen VO, Merckel MC, Falck S, Ojala PJ, Pohl E, Wilmanns M, Lappalainen P (November 2002). "Structural conservation between the actin monomer-binding sites of twinfilin and actin-depolymerizing factor (ADF)/cofilin". J. Biol. Chem. 277 (45): 43089–95. doi:10.1074/jbc.M208225200. PMID 12207032.
- ^ Liu LX, Xu H, Weller PF, Shi A, Debnath I (February 1997). "Structure and expression of a novel filarial gene for glia maturation factor". Gene. 186 (1): 1–5. doi:10.1016/S0378-1119(96)00585-9. PMID 9047337.
- ^ Liu L, Wei Z, Wang Y, Wan M, Cheng Z, Gong W (November 2004). "Crystal structure of human coactosin-like protein". J. Mol. Biol. 344 (2): 317–23. doi:10.1016/j.jmb.2004.09.036. PMID 15522287.