캐시 도메인

Cache domain
캐시 도메인
식별자
기호.캐시_1
PF02743
빠맘 클랜CL0165
인터프로IPR004010
캐시 도메인(타입 2)
식별자
기호.캐시_2
PF08269
빠맘 클랜CL0165
인터프로IPR013163

분자생물학에서 캐시 도메인은 동물성 디히드로피리딘 감수성 전압-게이트 Ca2+ 채널 알파-2delta 서브유닛 및 다양한 세균 화학축성 수용체를 포함한 광범위한 단백질에서 소분자 인식에 역할을 할 것으로 예측되는 세포외 단백질 도메인이다.캐시라는 이름은 CAlcium 채널과 CHEMotaxis 수용체에서 유래했다.이 도메인은 3개의 예측 가닥과 알파-나선을 가진 N-말단 부분과 스트랜드-다이어드를 가진 C-말단 부분과 그에 이은 비교적 구조화되지 않은 영역으로 구성됩니다.(분산되지 않은) 캐시 도메인의 N 터미널 부분에는 PAS 도메인 구조의 핵심에 존재하는 것과 유사한 시트를 형성할 수 있는3개의 예측 스트랜드가 포함되어 있습니다.캐시 도메인은 Vibrio cholerae같은 박테리아에 특히 널리 퍼져 있습니다.동물 칼슘 채널 알파-2delta 서브유닛박테리아 [1]소스로부터 세포외 도메인의 일부를 획득했을 수 있다.캐시 도메인은 [2]다른 기능에도 불구하고 GAF-PAS 폴드에서 발생한 것으로 보입니다.

레퍼런스

  1. ^ Anantharaman V, Aravind L (November 2000). "Cache - a signaling domain common to animal Ca(2+)-channel subunits and a class of prokaryotic chemotaxis receptors". Trends Biochem. Sci. 25 (11): 535–7. doi:10.1016/s0968-0004(00)01672-8. PMID 11084361.
  2. ^ Anantharaman V, Koonin EV, Aravind L (April 2001). "Regulatory potential, phyletic distribution and evolution of ancient, intracellular small-molecule-binding domains". J. Mol. Biol. 307 (5): 1271–92. doi:10.1006/jmbi.2001.4508. PMID 11292341.
이 문서에는 퍼블릭 도메인 Pfam 및 InterPro: IPR004010의 텍스트가 포함되어 있습니다.
이 문서에는 퍼블릭 도메인 Pfam 및 InterPro: IPR013163의 텍스트가 포함되어 있습니다.