NACHT 도메인

NACHT domain
NACHT 도메인
식별자
기호나흐트
PfamPF05729
인터프로IPR007111
프로사이트PS50837

NACHT 도메인은 진화적으로 보존된 단백질 영역이다.NTPase 도메인은 MHC 전사 관련 단백질뿐만 아니라 세포사멸 단백질에서도 발견된다.[1] 그것의 이름은 NAIP, CITA(, C2)와 같은 그것을 포함하는 단백질의 일부를 반영한다.TA 또는 MHC 클래스 II 전사 활성제), HET-E(포도스포라 안세리나에서 추출한 비호환성 로커스 단백질) 및 TEP1(즉, TP1 또는 텔로머레이즈 관련 단백질).

NACHT 영역은 300~400개의 아미노산을 포함하고 있다. 동물성, 곰팡이, 박테리아성 단백질에서 발견되는 예측 뉴클레오사이드-삼인산효소(NTPase) 영역이다. It is found in association with other domains, such as the CARD domain (InterPro: IPR001315), the pyrin domain (InterPro: IPR004020), the HEAT repeat domain (InterPro: IPR004155), the WD40 repeat (InterPro: IPR001680), the leucine-rich repeat (LRR) or the BIR repeat (InterPro: IPR001370).[1]

NACHT 영역은 ATP/GTPase 특정 P-루프, Mg-binding2+ 사이트(각각 Walker A와 B 모티프)와 5개의 특정 모티브를 포함하여 7개의 뚜렷한 보존 모티브로 구성된다. NACHT 영역의 고유한 특징으로는 다른 NTPas에 만연된 두 번째 산성 잔류물 대신 Walker B 모티브에 있는 Mg 조정2+ 아스파테이트의 '티니' 잔류물(글리신, 알라닌 또는 세린)의 직접 C-단자 유행이 포함된다. 두 번째 산성 잔류물은 일반적으로 NACHT 함유 단백질에서 아래쪽의 두 위치에서 발견된다. 또한 원위 모티브 VII는 다른 NTPase 제품군에서는 볼 수 없는 극성, 방향성 및 소수성 잔류물의 보존된 패턴을 포함하고 있다.[1]

이 영역을 포함하는 인간의 단백질은 다음과 같다.

참조

  1. ^ a b c Koonin EV, Aravind L (May 2000). "The NACHT family - a new group of predicted NTPases implicated in apoptosis and MHC transcription activation". Trends in Biochemical Sciences. 25 (5): 223–4. doi:10.1016/S0968-0004(00)01577-2. PMID 10782090.
이 문서는 공용 도메인 PfamInterPro의 텍스트를 통합한다: IPR007111