ARID 도메인
ARID domain| 건조. | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 인간 mrf-2 도메인, nmr, 11개의 구조 | |||||||||
| 식별자 | |||||||||
| 기호. | 건조. | ||||||||
| 팜 | PF01388 | ||||||||
| 인터프로 | IPR001606 | ||||||||
| SCOP2 | 1ig6/SCOPe/SUPFAM | ||||||||
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분자생물학에서 ARID 도메인(AT가 풍부한 상호작용 도메인, BRIGHT([2]B-cell Regulator of Ig Heavy Chain Transcription) 도메인[1])은 DNA에 결합하는 단백질 도메인이다.ARID 도메인을 포함한 단백질은 곰팡이, 식물, 무척추동물, 척추동물 메타조안에서 발견된다.ARID 암호화 유전자는 배아 발달, 세포 계보 유전자 조절 및 세포 주기 조절을 포함한 다양한 생물학적 과정에 관여한다.이 도메인과 전사조절에서의 ARID 함유 단백질의 구체적인 역할은 아직 설명되지 않았지만, 그것들은 양전사조절과 음전사조절과 염색질구조 [4]수정에 대한 가능한 관여를 포함한다.ARID 도메인의 기본 구조는 베타 스트랜드, 루프 또는 턴으로 분리된 일련의 6개의 알파 헬리크로 보이지만, 구조화된 영역은 기본 6개의 한쪽 또는 양쪽 끝에서 추가 나선까지 확장될 수 있다.1차 시퀀스 호몰로지를 기반으로 다음 세 가지 구조 클래스로 분할할 수 있습니다.6개의 알파 헬리크로 구성된 코어 도메인으로 구성된 최소 ARID 단백질, N 말단 알파 헬리크로 코어 도메인을 보완하는 ARID 단백질, N 말단과 C 말단에 코어 도메인과 추가 알파 헬리스를 포함하는 Extended-ARID 단백질.
인간 SWI-SNF 복합단백질 ARID1A는 비배열 특이적 DNA 결합 활성을 가진 ARID 패밀리이다.ARID 컨센서스와 기타 구조적 특징은 ARID1A와 효모 SWI1에 공통적으로 나타나 ARID1A가 SUI1의 인간 [5]대응물임을 시사한다.약 100-잔류 ARID 배열은 세포 성장, 발달 및 조직 특이적 유전자 발현 조절에 강하게 관여하는 일련의 단백질에 존재한다.데이터베이스 검색에서 약 12개의 ARID 단백질이 식별될 수 있지만, 현재까지 Bright(B세포 특이 유전자 발현 조절제), dead ringer(정상적인 발달에 필요한 Drosophila melanogaster 유전자 생성물), MRF-2(Cytomegalovirus Enhancer로부터의 발현을 억제하는)만이 직접적으로 분석되었다.DNA 결합 성질에 영향을 미칩니다.각각은 AT가 풍부한 사이트에 우선적으로 바인드됩니다.이와는 대조적으로, ARID1A는 DNA 결합 활성에서 배열 선호도를 보이지 않으며, 따라서 AT-리치 결합은 ARID 도메인의 고유 특성이 아니며, ARID 패밀리 단백질이 광범위한 DNA [5]상호작용에 관여할 수 있음을 입증한다.
레퍼런스
- ^ Webb CF, Smith EA, Medina KL, Buchanan KL, Smithson G, Dou S (May 15, 1998). "Expression of Bright at Two Distinct Stages of B Lymphocyte Development". The Journal of Immunology. 160 (10): 4747–4754. PMID 9590220. Retrieved 15 July 2020.
- ^ Herrscher RF, Kaplan MH, Lelsz DL, Das C, Scheuermann R, Tucker PW (1995). "The immunoglobulin heavy-chain matrix-associating regions are bound by Bright: a B cell-specific trans-activator that describes a new DNA-binding protein family". Genes Dev. 9 (24): 3067–82. doi:10.1101/gad.9.24.3067. PMID 8543152.
- ^ 정 B, He H, 정 Y, Wu W, McCormick S (2014) 아라비도시스 탈리아나의 정자 세포 형성에 핵체 내 ARID 도메인 함유 단백질이 필요하다.PLoS Genet 10(7): e1004421.doi: 10.1371/journal.pgen.1004421
- ^ Kortschak RD, Tucker PW, Saint R (June 2000). "ARID proteins come in from the desert". Trends Biochem. Sci. 25 (6): 294–9. doi:10.1016/S0968-0004(00)01597-8. PMID 10838570.
- ^ a b Dallas PB, Pacchione S, Wilsker D, Bowrin V, Kobayashi R, Moran E (May 2000). "The human SWI-SNF complex protein p270 is an ARID family member with non-sequence-specific DNA binding activity". Mol. Cell. Biol. 20 (9): 3137–46. doi:10.1128/MCB.20.9.3137-3146.2000. PMC 85608. PMID 10757798.
