KLF1

KLF1
KLF1
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스KLF1, CDAN4, EKLF, HBFQTL6, INLU, 크루펠 유사 인자 1(에트로이드), 크루펠 유사 인자 1, EKLF/KLF1
외부 IDOMIM: 600599 MGI: 1342771 HomoloGene: 4785 GenCard: KLF1
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

10661

16596

앙상블

ENSG00000105610

ENSMUSG000054191

유니프로트

문제 13351

P46099

RefSeq(mRNA)

NM_006563

NM_010635

RefSeq(단백질)

NP_006554

NP_034765

장소(UCSC)Chr 19: 12.88 ~12.89 MbChr 8: 85.63 ~85.63 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

크루펠 유사인자 1은 KLF1 유전자에 의해 인체 내에서 코드되는 단백질이다.KLF1의 유전자는 인간 염색체 19와 마우스 염색체 8에 있다. Krueppel 유사 인자 1은 적혈구(적혈구) 세포의 적절한 성숙에 필요한 전사 인자이다.

구조.

분자는 트랜스활성화 도메인과 염색질 재모델링 도메인이라는 두 개의 도메인을 가지고 있다.카르복실(C) 말단은 DNA에 결합하는 세 개의 C2H2 아연 핑거로 구성되며, 아미노(N) 말단은 프롤린이 풍부하고 [5]산성이다.

기능.

생쥐를 대상으로 한 연구는 조혈 발달에서 KLF1의 중요한 기능을 최초로 입증했다.KLF1 결핍(녹아웃) 마우스 배아는 치명적인 빈혈 표현형을 나타내며, 성인 β-글로빈의 전사를 촉진하지 못하고,[6] 배아 15일까지 사망한다.KLF1의 과잉 발현은 순환 혈소판 수를 감소시키고 β-글로빈 [7]유전자의 시작을 촉진한다.

KLF1은 말단 적혈구 [8]분화에 필수적인 6가지 세포 경로의 조절을 조정한다.

  1. 세포막 및 세포골격
  2. 아포토시스
  3. Heme 합성 및 수송
  4. 셀 사이클링
  5. 철의 조달
  6. 글로빈 체인 생산

또한 β 글로빈 유전자의 전사에 필수적인 세 가지 주요 과정과도 연결되어 있다.

  1. 염색질 리모델링
  2. 감마-베타 글로빈 스위치의 변조
  3. 문자 변환 활성화

KLF1은 β-글로빈 유전자 프로모터의 "[6]CACCC" 모티브에 특이적으로 결합한다.프로모터에서 자연 돌연변이가 발생하면 사람에게서 β+ 시상혈증이 발생할 수 있다.살라세미아의 유병률(전 세계적으로 200만 명이 이 형질을 가지고 있음)은 KLF1을 임상적으로 중요하게 만든다.

임상적 의의

차세대 염기서열 분석 노력은 인간 KLF1에서 돌연변이의 유병률이 놀라울 정도로 높다는 것을 밝혀냈다.[9]KLF1 영아 임신 가능성은 중국 [10]남부에서 약 1:24,000입니다.출생 전 수혈과 골수 이식을 통해 KLF1 [11]없이 태어날 수 있다.KLF1의 대부분의 돌연변이는 열성 기능 상실 표현형으로 [10]이어지지만, 반우성 돌연변이는 사람과 생쥐에서[13] 희귀한[12] 유전성 빈혈 CDA 타입 IV의 원인으로 확인되었다.추가적인 가족 연구와 임상 연구는[14] HPFH KLF1 관련 상태의 분자 유전학을 공개하고 KLF1을 HBF(HBFQTL6)[15]의 새로운 정량적 특성 궤적으로 확립했다.여러 RBC 항원의 발현에 대한 KLF1의 역할의 허용성은 루터 혈액형 In(Lu) 즉 "루터의 금지자"에 대한 수식 유전자 효과에서 명명된 일련의 알려진 KLF1 돌연변이에 의해 증명된다.흥미롭게도 살아있는 인간 호모 접합의 예는 알려져 있지 않으며, KLF1 호모 접합 생쥐의 배아 치사성을 입증한다.따라서 In(Lu) 돌연변이는 RBC가 형성될 정도로 KLF1 기능에 대해 유의하게 이질적인 영향을 미치지만, 루터 항원(Basal cell accession molecular)의 발현에는 명백한 지배적인 부정적 영향이 있지만, Colton(Aquaporin 1 Ok)의 발현 억제 정도는 유의하지만 다소 가변적이다.(CD147 ie EMMPRIN), 인도(CD44), 더피(Duffy 항원/케모카인 수용체 또는 Fy), 시안나(ERMAP), MN(글리코포린 A), 디에고(밴드 3) P1, i, AnWj(CD44) 등RBC [16]막의 항원 및 그 중 일부는 CDA 타입 IV의 태아 헤모글로빈의 유전적 지속성을 유발하는 KLF1 돌연변이와 중복될 수 있다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000105610 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000054191 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Brown RC, Pattison S, van Ree J, Coghill E, Perkins A, Jane SM, Cunningham JM (January 2002). "Distinct domains of erythroid Krüppel-like factor modulate chromatin remodeling and transactivation at the endogenous beta-globin gene promoter". Molecular and Cellular Biology. 22 (1): 161–70. doi:10.1128/mcb.22.1.161-170.2002. PMC 134232. PMID 11739731.
  6. ^ a b Perkins AC, Sharpe AH, Orkin SH (May 1995). "Lethal beta-thalassaemia in mice lacking the erythroid CACCC-transcription factor EKLF". Nature. 375 (6529): 318–22. Bibcode:1995Natur.375..318P. doi:10.1038/375318a0. PMID 7753195. S2CID 4300395.
  7. ^ Tewari R, Gillemans N, Wijgerde M, Nuez B, von Lindern M, Grosveld F, Philipsen S (April 1998). "Erythroid Krüppel-like factor (EKLF) is active in primitive and definitive erythroid cells and is required for the function of 5'HS3 of the beta-globin locus control region". The EMBO Journal. 17 (8): 2334–41. doi:10.1093/emboj/17.8.2334. PMC 1170576. PMID 9545245.
  8. ^ Tallack MR, Perkins AC (December 2010). "KLF1 directly coordinates almost all aspects of terminal erythroid differentiation". IUBMB Life. 62 (12): 886–90. doi:10.1002/iub.404. PMID 21190291. S2CID 10762358.
  9. ^ Gillinder K, Magor G, Perkins A (May 2018). "Variable serologic and other phenotypes due to KLF1 mutations". Transfusion. 58 (5): 1324–1325. doi:10.1111/trf.14529. PMID 29683509.
  10. ^ a b Perkins A, Xu X, Higgs DR, Patrinos GP, Arnaud L, Bieker JJ, Philipsen S (April 2016). "Krüppeling erythropoiesis: an unexpected broad spectrum of human red blood cell disorders due to KLF1 variants". Blood. 127 (15): 1856–62. doi:10.1182/blood-2016-01-694331. PMC 4832505. PMID 26903544.
  11. ^ Magor GW, Tallack MR, Gillinder KR, Bell CC, McCallum N, Williams B, Perkins AC (April 2015). "KLF1-null neonates display hydrops fetalis and a deranged erythroid transcriptome". Blood. 125 (15): 2405–17. doi:10.1182/blood-2014-08-590968. PMC 4521397. PMID 25724378.
  12. ^ Arnaud L, Saison C, Helias V, Lucien N, Steschenko D, Giarratana MC, Prehu C, Foliguet B, Montout L, de Brevern AG, Francina A, Ripoche P, Fenneteau O, Da Costa L, Peyrard T, Coghlan G, Illum N, Birgens H, Tamary H, Iolascon A, Delaunay J, Tchernia G, Cartron JP (November 2010). "A dominant mutation in the gene encoding the erythroid transcription factor KLF1 causes a congenital dyserythropoietic anemia". American Journal of Human Genetics. 87 (5): 721–7. doi:10.1016/j.ajhg.2010.10.010. PMC 2978953. PMID 21055716.
  13. ^ Gillinder KR, Ilsley MD, Nébor D, Sachidanandam R, Lajoie M, Magor GW, Tallack MR, Bailey T, Landsberg MJ, Mackay JP, Parker MW, Miles LA, Graber JH, Peters LL, Bieker JJ, Perkins AC (February 2017). "Promiscuous DNA-binding of a mutant zinc finger protein corrupts the transcriptome and diminishes cell viability". Nucleic Acids Research. 45 (3): 1130–1143. doi:10.1093/nar/gkw1014. PMC 5388391. PMID 28180284.
  14. ^ Borg J, Papadopoulos P, Georgitsi M, Gutiérrez L, Grech G, Fanis P, Phylactides M, Verkerk AJ, van der Spek PJ, Scerri CA, Cassar W, Galdies R, van Ijcken W, Ozgür Z, Gillemans N, Hou J, Bugeja M, Grosveld FG, von Lindern M, Felice AE, Patrinos GP, Philipsen S (September 2010). "Haploinsufficiency for the erythroid transcription factor KLF1 causes hereditary persistence of fetal hemoglobin". Nature Genetics. 42 (9): 801–5. doi:10.1038/ng.630. PMC 2930131. PMID 20676099.
  15. ^ 온라인 Mendelian In Man (OMIM) : HBFQTL6 - 613566
  16. ^ Daniels, Geoff (15 April 2013). Human blood groups (3rd ed.). John Wiley & Sons. pp. 267–270. ISBN 978-1-4443-3324-4.

외부 링크

  • PDB for UniProt: Q13351(Krueppel-like factor 1)에서 PDBe-KB에 있는 모든 구조 정보의 개요.