CTBP2

CTBP2
CTBP2
Protein CTBP2 PDB 2ome.png
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스CTBP2, C말단결합단백질2
외부 IDOMIM : 602619 MGI : 1201686 HomoloGene : 75187 Genecard : CTBP2
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

1488

13017

앙상블

ENSG00000175029

ENSMUSG000030970

유니프로트

P56545

P56546

RefSeq(mRNA)

NM_001170744
NM_009980
NM_001347623

RefSeq(단백질)

NP_001164215
NP_001334552
NP_034110

장소(UCSC)Chr 10: 124.98 ~125.16 MbChr 7: 132.99 ~133.12 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

CtBP2라고도 불리는 C 말단결합단백질 2는 CTBP2 [5][6][7]유전자에 의해 사람에게서 암호화되는 단백질이다.

기능.

CtBPs(포유동물에서 CtBP1 및 CtBP2)는 가장 잘 특성화된 전사 코어프레서 [8]중 하나입니다.그들은 전형적으로 그들의 표적 유전자를 끄죠.그들은 일반적인 형태의 Proline-Isoleucine-Aspartate-Leucine-Serine(PIDLS 모티브)의 짧은 모티브를 갖는 배열 특이적 DNA 결합 단백질에 결합함으로써 이를 수행한다.그런 다음 그들은 히스톤 수정 효소, 히스톤 탈아세틸화효소, 히스톤 메틸화효소 및 히스톤 데메틸화효소를 모집한다.이 효소들은 활성을 제거하고 억제성 히스톤 마크를 추가하기 위해 함께 일하는 것으로 생각된다.예를 들어 히스톤탈아세틸라아제1(HDAC1) 및 HDAC2는 활성화 마크3 아세틸리신9(H3K9Ac)를 제거하고, 히스톤메틸라아제G9a는 [9]메틸기를 첨가할 수 있으며, 히스톤데메틸라아제1(LSD1)은 활성화 마크H3K4를 제거할 수 있다.

CtBPs는 많은 다른 DNA 결합 단백질에 결합하고 또한 GATA의 친구(Friend of GATA)[10]와 같이 DNA 결합 단백질에 결합하는 공동 억제 물질에도 결합합니다.또, CtBP 는, 보다 큰 문자 변환 복합체를 브리징 하기 위해서, 디머라이즈 및 멀티머라이즈를 실시할 수도 있습니다.그것들은 주로 유전자 억제 복합체를 조립할 수 있는 골격 단백질로 보인다.

CtBP의 흥미로운 측면 중 하나는 NADH와 결합하는 능력과 NAD의 범위가+ 작다는 것입니다.이것은 그들이 세포의 대사 상태를 감지하고 NADH/NAD 비율의 변화에 반응하여 유전자를 조절하는 것을 가능하게 할 것이라고 제안되었다.따라서 CtBPs는 지방생물학에서 중요한 것으로 밝혀졌으며 PRDM16, NRIP,[11] FOG2와 같은 주요 단백질에 결합한다.

포유류에서 CtBP 단백질의 완전한 기능적 [12]역할은 CtBP1과 CtBP2 사이의 부분 중복성 때문에 평가하기가 어려웠다.마찬가지로, CtBP2 녹아웃과 더블 녹아웃 생쥐의 초기 치사율은 이러한 단백질 삭제의 세포 효과에 대한 상세한 분석을 배제했다.CtBP 유전자가 하나뿐인 모델 유기체로부터 중요한 결과가 나왔다.드로소필라에서 CtBP는 발달과 일주기 [13]리듬에 관여한다.C. elegans 웜에서는 CtBP가 [14]수명에 관여합니다.일주기 리듬과 수명 모두 대사 감지에서 CtBPs의 역할을 뒷받침하는 신진대사와 관련이 있는 것으로 보인다.

포유류의 CtBP2 유전자는 두 개의 다른 단백질을 코드하는 대체 전사를 생성한다.위에서 설명한 전사억제기(코어프레서) 외에도 시냅스 리본으로 알려진 특수 시냅스의 주요 구성요소인 더 긴 등소형이 있습니다.두 단백질 모두 NAD 의존성+ 2-히드록시산 탈수소효소와 유사한 NAD 결합+ 도메인을 포함한다.이 유전자를 염색체 21q21.3에 매핑하기 위해 3' 미번역 영역의 일부가 사용되었지만, 게놈의 다른 곳에서도 유사한 위치가 있을 가능성이 높다는 것이 지적되었다.블라스트 분석 결과 이 유전자는 [7]10번 염색체에 존재하는 것으로 나타났다.

대체 프로모터 사용

CtBP2 유전자는 망막발달 중 대체촉진제로부터 전사되어 CTBP2 전사핵심조절기와 더 큰 리본 시냅스 발판단백질 RIBEYE를 생성한다.[15] CtBP2 궤적의 다용도 기능은 조류 망막과 영장류 망막 사이에서 보존되는 것으로 보이며, 후생유전학적 소음 메커니즘에 의해 RIBEYE mRNA의 생산은 발달적으로 지연된다.[16] 발달 중인 인간망막에서 RIBEYE mRNA 동질체의 전사는 후생적으로 DNA 메틸화에 의해 조절된다.근위 RIBEYE 프로모터를 포함한 DNA 배열을, 아마도 콘로드 호메오박스(CRX) 전사 인자의 결합을 억제함으로써, 이 아이소폼의 DNA 메틸화 및 지연 전사를 위해 농축한다.[16]

상호 작용

CTBP2는 다음과 상호작용하는 것으로 나타났습니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000175029 - 앙상블, 2017년 5월
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  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
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추가 정보

외부 링크