PTPRC

PTPRC
PTPRC
Protein PTPRC PDB 1ygr.png
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭PTPRC, B220, CD45, CD45R, GP180, L-CA, LCA, LCA, LY5, T200, 단백질 티로신인산효소, 수용체 유형 C, 단백질 티로신인산효소 수용체 유형 C
외부 IDOMIM: 151460 MGI: 97810 HomoloGene: 2126 GeneCard: PTPRC
직교체
종인간마우스
엔트레스

5788

19264

앙상블

ENSG00000081237
ENSG00000262418

ENSMUSG00000026395

유니프로트

P08575

P06800

RefSeq(mRNA)

NM_001267798
NM_002838
NM_080921
NM_080922

NM_0011316
NM_001268286
NM_011210

RefSeq(단백질)

NP_001254727
NP_002829
NP_563578
NP_563578.2
NP_002829.3

NP_001104786
NP_001255215
NP_035340

위치(UCSC)Chr 1: 198.64 – 198.76MbChr 1: 137.99 – 138.1Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

단백질 티로신인산효소, 수용체형, C로도 알려진 PTPRC는 인간에서 PTPRC 유전자에 의해 암호화되는 효소다.[5]PTPRC는 원래 백혈구 공통항원(LCA)으로 불렸던 CD45 항원(CD는 분화 군집을 의미한다)으로도 알려져 있다.[6]

함수

CD45로 가장 잘 알려진 이 유전자의 단백질 생산물은 단백질 티로신인산효소(PTP) 계열의 일원이다.PTP는 세포 성장, 분화, 미토틱 주기, 그리고 인공 변형을 포함한 다양한 세포 과정을 조절하는 분자들을 신호로 하고 있다.CD45는 세포외 영역, 단일 투과체 세그먼트, 2개의 탠덤 내 촉매 도메인을 포함하고 있어 수용체형 PTP 계열에 속한다.[citation needed]

CD45는 모든 분화된 조혈모세포(적혈모세포와 혈장세포 제외)의 다양한 이소형태에 존재하는 I형 트랜스메브레인 단백질이다.[7]CD45는 T-세포 항원 수용체 신호의 필수 조절기로 밝혀졌다.세포외 영역(공동 자극의 일종)을 통해 항원 수용체 복합체의 성분과 직접 상호작용하거나 세포질 영역을 통해 항원 수용체 신호에 필요한 다양한 Src 계열 키나제를 활성화하여 기능한다.CD45는 또한 JAK 키나제를 억제하므로 사이토카인 수용체 신호의 음성 조절기로서 기능한다.[citation needed]

구별되는 등소형태를 암호화하는 이 유전자의 많은 대안으로 분열된 성서변형이 보고되었다.[6]CD45의 서로 다른 등소형상에 대한 항체는 면역세포 유형을 구별하기 위해 일상적인 면역항체화학에 사용되며, 림프종과 발암에서 조직적인 부분을 구별하기 위해 사용된다.[8]

이소폼스

CD45 단백질군은 하나의 복잡한 유전자의 모든 생산물인 여러 구성원으로 구성되어 있다.이 유전자는 34개의 엑손(exon)을 함유하고 있어 세포외 영역과 세포질 영역 둘 다 비정상적으로 큰 거대한 단백질을 생성한다.Exon 4, 5, 6(단백질 영역 A, B, C에 대응)은 0, 1, 2 또는 3개의 Exon의 조합이 포함된 최대 8개의 서로 다른 단백질 제품을 생성하기 위해 대체적으로 분할된다.[9]

CD45의 큰 세포외 영역은 글리코실화성이 높으며, 이 8개의 이소 형태는 그것의 사이드 체인의 구조에 큰 변화를 허용한다.이소 형태는 단백질의 N단자 영역에 영향을 미치며, 이는 세포로부터 선형적으로 확장되며 O-연계 글리칸 체인을 포함하고 있다.[citation needed]

CD45 이소폼은 세포 형태와 분화 단계별 특정한 표현을 보여주는데, 이것은 포유류에게 꽤 잘 보존된 패턴이다.[10]이러한 이소성형은 다른 종류의 면역세포들을 식별하고 구별하는 표지로 자주 사용된다.

순진한 T 림프구는 일반적으로 A 단백질 부위만 포함하는 CD45RA에 양성이다.활성화 및 메모리 T 림프구는 A, B, C 세 부위가 모두 부족한 가장 짧은 CD45 ISO 형태인 CD45RO를 표현한다.이 최단 등소형태는 T세포 활성화를 촉진한다.[citation needed]

CD45R(CD45RABC라고도 함)에는 가능한 세 가지 exon이 모두 포함되어 있다.가장 긴 단백질로 T세포에서 분리하면 200kDa로 이동한다.또한 B세포는 CD45R을 보다 무거운 글리코실레이션으로 표현하여 분자량을 220 kDa로 하여 B220(B세포 등소형 220 kDa)이라는 명칭을 사용한다.

상호작용

PTPRC는 다음과 상호 작용하는 것으로 나타났다.

CD45는 최근 HCMV UL11 단백질과 상호작용하는 것으로 밝혀졌다.이 상호작용은 T세포의 기능 마비를 초래한다.[18]또한 CD45는 D 아데노바이러스 19a E3/49K 단백질의 표적이 되어 NK와 T세포의 활성화를 억제하는 것으로 나타났다.[19]

임상적 중요성

CD45는 조혈모세포의 신호전달 규제에 관여하는 티로신인산효소 활성을 가진 범레우코세포 단백질이다.CD45는 머린과 인간의 비변형 조혈세포에 있는 지질 뗏목으로 콜오칼라화하지 않지만, 지질 뗏목 내에서의 CD45 포지셔닝은 급성 골수성 백혈병으로의 인공적인 전환 과정에서 수정된다.CD45는 AML 세포에 지질 뗏목으로 콜로칼라화하는데, 이는 백혈구 증식에 관여하는 GM-CSF 신호 강도의 상승에 기여한다.[citation needed]

적합한 표시로 사용

마우스에는 CD45.1(역학적으로 Ly5.1)과 CD45.2(역학적으로 Ly5.2)의 두 가지 식별 가능한 알림이 있다.[20]이 두 종류의 CD45는 기능적으로 동일하다고 여겨진다.이와 같이, 그것들은 세포의 식별을 허용하는 과학 연구에 일상적으로 사용된다.예를 들어 백혈구는 CD45.1 기증 마우스에서 CD45.2 호스트 마우스로 옮겨질 수 있으며, CD45.1의 표현으로 인해 이후에 식별할 수 있다.이 기술은 또한 키메라를 생성할 때 일상적으로 사용된다.대체 시스템은 CD90(Ty1) 알레르기의 사용으로, CD90.1/CD90.2 시스템은 CD45.1/CD45.2 시스템과 동일한 방식으로 사용된다.[citation needed]

2016년 C57Bl/6 배경에 새로운 마우스 클릭이 생성되어 완벽한 착향성 균형이 되었다.[21]CD45.1로 불리는 이 마우스STEM 마우스, 단일 염기쌍에 의해 C57Bl/6 변형률과 달라져 단일 아미노산이 변화하여 항-CD45.1 항체와 항-CD45.2 항체에 의한 반응성의 차이를 혼동한다.이 변종은 경쟁적인 골수 이식 검사를 위해 설계되었으며, 이전의 표준과는 달리, 펩 보이로 더 공식적으로 알려진 "SJL" 마우스와는 달리 완벽한 동등성을 보여주었다.[22]

참조

  1. ^ a b c ENSG00000262418 GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG000081237, ENSG00000262418 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000026395 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Kaplan R, Morse B, Huebner K, Croce C, Howk R, Ravera M, et al. (September 1990). "Cloning of three human tyrosine phosphatases reveals a multigene family of receptor-linked protein-tyrosine-phosphatases expressed in brain". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 87 (18): 7000–4. Bibcode:1990PNAS...87.7000K. doi:10.1073/pnas.87.18.7000. PMC 54670. PMID 2169617.
  6. ^ a b "Entrez Gene: PTPRC protein tyrosine phosphatase, receptor type, C".
  7. ^ Holmes N (February 2006). "CD45: all is not yet crystal clear". Immunology. 117 (2): 145–55. doi:10.1111/j.1365-2567.2005.02265.x. PMC 1782222. PMID 16423050.
  8. ^ Leong AS, Cooper K, Leong FJ (2003). Manual of Diagnostic Cytology (2nd ed.). Greenwich Medical Media, Ltd. pp. 121–124. ISBN 1-84110-100-1.
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참고 문헌 목록

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  • Jameson R (2006). "CD45". Immunology course for undergraduates. Davidson College. Retrieved 2011-10-24.

외부 링크

  • PDBe-KB에서 UniProt: P08575(Receptor tyrosine-단백질 인산염 C)에 대한 PDB의 모든 구조 정보 개요.