SARS-CoV-2 알파 변종

SARS-CoV-2 Alpha variant
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SARS-CoV-2 변종
알파
Scientifically accurate atomic model of the external structure of SARS-CoV-2. Each "ball" is an atom.
일반내역
WHO 지정알파
리니지B1.1.1.7
처음 탐지됨영국
보고된 날짜2020년 11월; 1년 전(2020-11년)
상태문제의 변종
증상
  • 없음
  • 오싹
  • 식욕부진
  • 두통
  • 근육이 아프다.
사례 지도
2021년[1] 3월 25일 현재 국가별 총 B.1.1.7 시퀀스 수
범례:
10,000개 이상의 확인된 시퀀스
확인된 시퀀스 5,000–9,999개
1,000–4,999개의 확인된 시퀀스
500–999개의 확인된 시퀀스
100–499확정 시퀀스
2-99 확인된 시퀀스
확인된 시퀀스 1개
사용 가능한 데이터가 없거나 없음
SARS-CoV-2 변종
다음 시리즈의 일부
COVID-19 전염병
Scientifically accurate atomic model of the external structure of SARS-CoV-2. Each "ball" is an atom.
타임라인
2019

2020

2021

2022

위치
나라별, 영토별

운반에 의해

국제적 대응

국가별 대응

의학적 대응

백신

백신후보자

변형
문제 유형

기타 변형

경기영향과 불황

나라별

영향

사회

SARS-CoV-2 (Wikimedia colors).svg COVID-19 포털

알파 변종(B.1.1.7)은 SARS-CoV-2 변종이다.야생형 SARS-CoV-2보다 전염성이 40~80% 더 높을 것으로 추정된다(대부분의 추정치가 이 범위의 중간에서 상위까지 차지함).2020년 11월 영국에서[citation needed] 9월 채취한 샘플에서 처음 검출된 뒤 12월 중순까지 감염이 급증하면서 빠르게 확산되기 시작했다.이러한 증가는 적어도 부분적으로 바이러스의 스파이크 단백질에 있는 하나 이상의 돌연변이 때문이라고 생각된다.이 변종은 또한 일반적으로 보이는 것보다 더 많은 돌연변이를 가진 것으로도 유명하다.[2]

2021년 1월 현재 사스-CoV-2의 전체 게놈 염기서열 분석은 영국에서 절반 이상이 수행되었다.[3]이것은 전세계에 얼마나 많은 다른 중요한 변종들이 발견되지 않고 떠돌고 있는지에 대한 의문을 불러일으켰다.[4][5]

2021년 2월 2일, Public Health England는 "[a] 제한된 수의 B.1.1.7 VOC-202012/01 돌연변이를 가진 게놈"[6]을 발견했다고 보고했는데, 이 게놈을 Concern의 변종 202102/02(VOC-202102/02).[7]돌연변이(N501Y) 중 하나는 베타 변종과 감마 변종에도 존재한다.

2021년 5월 31일, 세계보건기구는 관심의 변종이 공공 통신에 사용하기 위해 "알파"라고 라벨을 붙일 것이라고 발표했다.[8][9]

분류

이름

그 변종은 여러 이름으로 알려져 있다.영국 밖에서는 Eta 변종(연령 B.1.525)과 같이 영국에서 처음 식별된 다른 덜 보편적인 변종이 존재함에도 불구하고 영국 변종, 영국 변종 또는 영국 변종이라고 부르기도 한다.[10]영국 내에서는 흔히 켄트 이후의 켄트 변종(Kent variant)이라고 부르는데, 이 변종이 발견된 곳이기도 하다 보면 켄트 변종(Kent variet)이 발견되었다.[11][12]

과학적 실제 사용에서는 변종은 원래 공중 보건 영국(PHE)[13][를]는 12월 2020년(음성 사용자 인터페이스 – 202012/01)에 미라 찬드와 그녀의 동료들에 의한 보고서 PHE에 의해 2112월에 발간된 단면 우려의(단면 형상 변화 우려는 202012/01의, VOC-202012/01을 단축했다)에 재분류 된 첫번째 단면 조사에 따라를 따 왔다. 2020.[b]COVID-19 Genomics UK (COG-UK) 컨소시엄을 대표하여 작성한 보고서에서 앤드류 램보트와 그의 공동저자들은 그것을 혈통 B.1.7로 명명된 명명된 전지구적 발생 라인(팡골린)의 혈장학적 할당 도구를 사용하고,[15] 넥스트스트스트라인은 변종을 20I/501Y로 명명했다.V1.[16]

VOC-202102/02라는 이름은 E484K 돌연변이를 가진 변종을 가리킨다(아래 참조).[7]

유전자 프로파일

  • SARS-CoV-2 알파 변종의 아미노산 돌연변이는 스파이크를 중심으로 SARS-CoV-2의 게놈 지도에 표시되었다.[17]

VOC-202012/01에서 돌연변이 정의
(아미노산만 변경)
유전자 뉴클레오티드 아미노산
ORF1ab C3267T T1001I
C5388A A1708D
T6954C I2230T
11288–11296 삭제 SGF 3675–3677 삭제
스파이크 21765–21770 삭제 HV 69–70 삭제
21991–21993 삭제 Y144 삭제
A23063T N501Y
C23271A A570D
C23604A P681H
C23709T T716I
T24506G S982A
G24914C D1118H
ORF8 C27972T Q27stop
G28048T R52I
A28111G Y73C
N 28280 GAT→CTA D3L
C28977T S235F
출처: Chand 등, 표 1 ( 페이지 5)

COVID-19 Genomics UK(COG-UK) 컨소시엄에 따르면 사스-CoV-2의 돌연변이는 흔하다.[18]

VOC-202012/01은 비동기 돌연변이 14개, 삭제 3개, 동의어 돌연변이[19] 6개(즉, 단백질을 바꾸는 돌연변이가 17개, 그렇지[2] 않은 돌연변이가 6개)의 23개 돌연변이로 정의된다.

증상 및 징후

임페리얼 칼리지 런던은 알파 변종이 지배적인 동안 영국에서 백만 명 이상의 사람들을 조사했고 코비드와 관련된 광범위한 추가 증상들을 발견했다.'감기, 식욕 상실, 두통, 근육통'은 고전적인 증상뿐 아니라 감염자에게도 가장 흔했다.[20]

진단

사스-CoV-2에 대한 몇 가지 신속한 항원 테스트는 COVID-19 진단을 위해 세계적으로 널리 사용되고 있다.그들은 대량 검사 프로그램의 일환으로 많은 수의 환자를 신속하게 확인할 수 있는 수단을 제공함으로써 바이러스의 연쇄 전염을 막는 데 유용하다고 여겨진다.VOC-202012/01의 등장 이후, 처음에는 빠른 테스트가 그것을 감지하지 못할 수 있다는 우려가 있었지만, 공중 보건 잉글랜드에서는 영국에서 평가되고 사용되는 빠른 테스트가 그 변종을 감지한다고 결정했다.[21]

예방

참고 항목:옥스퍼드-아스트라제네카 COVID-19 백신 § Effectivity, Pfizer-BioNTech COVID-19 백신 § 효과성, 모더나 COVID-19 백신 § 효과성, 노바백스 COVID-19 백신 § 유효성, 스푸트니크 V COVID-19 백신 § 변형, 코로나박스 § 변형, 코박신 § 변형, 압달라(백신) 유효성 §

2020년 말 현재 여러 개의 COVID-19 백신이 배치되거나 개발 중에 있다.

다만 추가 변이가 발생하면서 백신 개발에도 변화가 필요한지에 대한 우려가 제기됐다.사스-CoV-2는 예를 들어 인플루엔자 바이러스처럼 빠르게 변이되지 않으며 2020년 말까지 효과가 입증된 새로운 백신들은 필요시 조정할 수 있는 유형이다.[22]2020년 말 현재 독일, 영국, 미국 보건 당국과 전문가들은 기존 백신이 VOC-202012/01에 대해 이전 변종과 마찬가지로 효과가 있을 것으로 보고 있다.[23][24]

12월 18일, NERSTAG는 "현재 []유전자 탈출에 대한 결론을 도출하기에 충분한 데이터가 부족하다"고 결정했다.[25]

2020년 12월 20일 현재, Public Health England는 새로운 변종이 Pfizer-Bio에 내성이 있다는 것을 암시하는 "증거"가 없다고 확인했다.NTech 백신은 현재 영국의 백신 프로그램에서 사용되고 있으며, 여전히 사람들을 보호해야 한다.[26]

E484K 돌연변이

영국 공중보건기구는 2021년 2월 2일 베타 및 감마 변종에도 존재하는 "[[6]a] 제한된 수의 B.1.1.7 VOC-202012/01 돌연변이"[11]를 발견했다고 보고했다.[11]2021년 2월 9일, 주로 브리스톨에서 E484K 돌연변이가 검출된 76여 건이 발견되었지만, 리버풀에서도 유전학적으로 구분된 그룹이 돌연변이를 옮기는 것으로 알려졌다.[27]일주일 후 PHE의 연구 및 분석 보고서는 VUI-202102/01과 VOC-202102/02의 두 변종에서 E484K 돌연변이와 관련된 총 77건의 확인 및 발생 가능한 사례를 제시했으며, 후자는 'B.1.1.7 with E484K'로 기술되었다.[7]

2021년 3월 5일, 미국 환자 2명(오레곤 주와 뉴욕 주)에서 E484K 돌연변이를 가진 B.1.1.7 혈통이 검출된 것으로 보고되었다.연구원들은 오리건 변종에서 E484K 돌연변이가 독립적으로 발생했다고 생각한다.[28][29]

특성.

투과성

알파 변종(연령 B.1.1.7)의 투과율은 일반적으로 기존의 사스-CoV-2 변종보다 상당히 높은 것으로 밝혀졌다.그 센터에 의해 수리 모델링 전염병을 위해 런던 학교 위생 및의 한 공부;열대 의학은 변형이 43세 90%(95%신뢰할 수 있는 간격 범위, 38세로 130%)더 영국에서 기존 변형보다 전염될 메서드를 transmissib이 증가함에 따라 평가에 사용한 기기에 따라 보도했다.ility, 그리고 덴마크, 스위스, 그리고 미국에서 혈통 B.1.1.7의 전송능력의 비슷한 증가를 측정했다.[30]게다가, 몇몇 나라와 세계에서 혈통 B.1.1.7의 급속한 상승을 설명하기 위한 간단한 모델은 이 변종이 이 세 나라와 전 세계의 지역 야생형보다 50% 더 전염성이 있다는 것을 발견했다.[31]COG-UK의 연구는 투과성이 50-100% 더 높다는 것을 발견했다.[32]또 다른 연구는 2020년 10월과 11월 사이에 영국에서 75%(70%-80%) 더 많은 전염이 가능하다고 결론지었다.[33]이후 연구에서는 이러한 초기 추정치가 변종의 투과성을 과대평가했으며 투과율 증가가 이들 범위의 하단에 있다는 것을 시사했다.[34][35]

네덜란드 후생체육부는 양성환자의 게놈 염기서열 분석을 토대로 매주 변종별 투과율을 현지 야생형과 비교해 계산한 결과 2021년 첫 6주 동안 28~47% 높은 변동률을 보였다.[36]덴마크 스타텐스 혈청 연구소는 대조적으로 2021년 1월 4일부터 2월 12일까지 상대적 주파수의 관찰된 개발을 바탕으로 덴마크에서 55%(48%–62%) 더 투과 가능한 것으로 계산했다.[37]베른대학교 산하 사회예방의학연구소(ISPM)는 전 세계 유행병기 동안 모든 Covid-19 양성의 관찰된 분수를 주간 개발하여 혈통 B.1.1.7의 투과성을 계산한 결과 야생형 재생산 번호 Rw11과 a를 가정하여 95% 신뢰구간에서 발견되었다.기하급수적으로 발전한 5.2일의 투과율은 덴마크의 와일드타입에 비해 52%(45%~60%), 스위스의 와일드타입에 비해 51%(42%~60%) 높았다.[38]

2020년 12월 18일(이하 "NEVTAG") 영국 과학 자문 기구인 NEVTAG(New and Emerging Respiratory Virus Threats Advisory Group)는 VOC-202012/01이 다른 변종보다 상당히 투과 가능하지만 어떤 결론에 도달하기에 충분한 데이터가 없다고 결론 내렸다.전염성 증가의 기본 메커니즘(예: 바이러스 부하 증가, 바이러스 복제의 조직 분포, 연속 간격 등), 사례의 연령 분포 또는 질병 심각도.[25]NERSTAG가 확인한 데이터에 따르면 상대적 재생산 번호("복제적 우위")는 1.74(즉, 변종이 74% 더 투과 가능)로 결정되어 6.5일의 세대 간격을 가정하였다.다른 변종들과 관련하여 그 변종이 기하급수적으로 빠르게 성장했다는 것이 증명되었다.[39][40][41]이 변종은 마다1. / = 3 1..5.3의 배수로 조상 변종보다 경쟁했다.또 다른 집단은 유사한 결론에 도달하여 "보호조치"와 무관하게 6.73일의 세대당 2.24의 복제적 우위성을 생성하여 2. / 6= 로 선조 변종보다 경쟁하였다2주마다마찬가지로 아일랜드에서도 역사적으로 드물었던 S 유전자[c] 검출 누락(S-gene 표적 장애[SGTF])으로 나타난 변종이 2주 만에 16.3%에서 46.3%로 나타났다.이는 116개 양성 표본의 통계에 근거하여 변종이 % (- %/ (100- % %)= }의 계수만큼 상대적으로 높은 성장률을 보였음을 보여준다 이 2주 기간이 끝날 때까지 다른 모든 변종의 평균 성장과 비교할 때.[44]이 변종은 1~2개월 만에 낮은 수준에서 런던, 영국 동부, 그리고 남동부에서 지배적인 변종이 되었다.새해 벽두 무렵 사스-CoV-2 감염이 급증한 것은 변종 투과율이 높아진 데 반해 다른 변종 투과율은 감소했기 때문으로 보인다[by whom?].[45][46][47]

혈통 B.1.1.7에서 가장 중요한 변화 중 하나는 N501Y로,[18] 아미노산 아세트산 위치 501에서 아스파라긴(N)에서 티로신(Y)으로 바뀐 것으로 보인다.[48]이는 스파이크 단백질의 수용체 결합 영역(RBD) 내부, 특히 RBD의[50] 일부인 [49]수용체 결합 모티브(RBM)[51] 내부에서의 위치 때문에 인간 ACE2가 결합되기 때문이다.RBD의 돌연변이는 항체 인식과 ACE2 결합 특수성을[51] 변화시킬 수 있으며 바이러스의 감염을 증가시킬 수 있다.[18]챈드 외 연구진은 "N501Y가 스파이크 단백질의 수용체 결합 친화력에 영향을 줄 가능성이 높고, 이 돌연변이가 단독으로 또는 NTD(N-terminal Domain) 69/70에서 삭제와 결합해 바이러스의 투과성을 높이고 있을 가능성이 있다"고 결론지었다.[52]2021년 초, 동료 검토 논문에서 언급된 HV 69–70 체외 삭제는 렌즈바이러스 사스-CoV-2 유사 바이러스에서 [야생형 SARS-CoV-2]에 비해 단일 감염에 비해 "2배 높은 감염률을 보이는 것으로 나타났다"고 밝혔다.[53]

Using In Silico approach, Shahhosseini et al. demonstrated that the Y501 mutation in lineage B.1.1.7 forms a shorter H-bond (length of 2.94 Å) than its counterpart in the wild type (WT) variant residue N501, indicating that in lineage B.1.1.7 the RBD and hACE2 have a stable interaction.더욱이, 계통 B.1.1.7의 Y501 돌연변이는 WT 변종 잔류물 N501(-2.92kcal/mol)의 그것보다 결합 자유 에너지(BFE) (-7.18kcal/mol)에 더 부정적으로 기여한다.BFE와 분자 상호작용 결과를 결합한 결과, RBD의 N501Y 돌연변이는 HACE2에 대한 사스-CoV-2 RBD의 결합 친화력을 강화한다.[54]

바이럴런스

알파 변종(연령 B.1.1.7)에 대한 일치 코호트 연구에서는 전반적으로 이전 순환 변종보다 높은 사망률을 발견했지만,[55][56] 입원 환자에서는 그렇지 않았다.[57]생태학적 연구는 전반적으로 사망률의 차이를 발견하지 못했다.[58]

당초 NERSTAG는 2020년 12월 18일 질병의 심각성에 대해 결론을 내리기에는 자료가 불충분하다고 밝혔다.다음 날 보리스 존슨 총리의 브리핑에서 관계자들은 이 변종이 사망률을 높이거나 백신과 치료법에 의해 다르게 영향을 받았다는 "증거"는 없다고 말했다.[59] 비벡 머시는 이에 동의했다.[60]수전 홉킨스 NHS시험추적 및 공중보건 잉글랜드(PHE) 공동의학고문은 2020년 12월 중순 "이 변종이 넓은 지역에서 발견되고 있지만, 특히 더 많은 환자가 발견되고 있다는 증거가 현재 없다"[18]고 선언했다.그러나 약 한 달 후인 2021년 1월 22일 존슨은 정부의 수석 과학 고문인 패트릭 밸런스는 아직 이를 완전히 확신할 만한 충분한 증거가 없다고 강조했지만, "새로운 변종인 [VOC-202012/01]이 더 높은 사망률과 관련이 있을 수 있다는 증거가 있다"고 말했다.[61]

혈통 B.1.1.7 사망률에 대한 12가지 다른 연구 결과를 분석한 논문에서 사망률이 더 높은 것으로 나타났으며(LSHTM에 71%, 엑서터 대학교에 70%, 공중보건 잉글랜드에 65%, 임페리얼 칼리지 런던에 36%) NEVTAG는 이러한 분석을 근거로 다음과 같이 결론을 내렸다.VOC B.1.1.7 감염은 비 VOC 바이러스 감염에 비해 입원 및 사망 위험 증가와 관련이 있을 가능성이 높다."[62]영국이 전체 COVID-19 사망자의 8%에 대해서만 VOC 상태를 분석했다는 사실과 관련된 제한된 샘플 압류 때문에 사망 연구 결과는 높은 불확실성과 신뢰 구간과 연관되었다.[63]

영국의 환자-대조군 연구(VOC 202012/1)는 2020년 10월 1일부터 2021년 1월 29일까지 지역사회 환경에서 사스-CoV-2 양성반응을 보인 54,906명의 참가자를 대상으로 실시한 연구에서 알파 변종(VOC 202012/1)에 감염된 환자가 28일 이내에 사망할 위험비율이 있는 것으로 보고되었다.다른 SARS-CoV-2 변종에서 양성 환자와 비교하여 1.64(95% 신뢰 구간 1.32-2.04)의 검사.[64]영국에서도 2020년 11월 1일부터 2021년 2월 14일 사이에 사스-CoV-2 양성반응을 보인 114만6,534명의 생존 분석 결과, 라인아그에 감염된 개인들 중 28일 이내에 사망에 대한 위험비율이 1.61(95% 신뢰구간 1.42–1.82)인 것으로 나타났다.e B.1.1.7. 혈통 B.1.1.7과 관련된 사망 위험 증가에서 연령, 성별, 민족성, 박탈 수준 또는 거주지가 다른 개인들 사이에서 유의미한 차이는 발견되지 않았다.[56]두 연구 모두 지리적 지역과 시간에 따른 COVID-19 사망률의 차이 또는 시간과 공간에 따른 병원 서비스 가용성 차이로 인한 잠재적 편견을 수정하여 조정했다.[citation needed]

덴마크의 한 연구에 따르면 혈통 B.1.1.7에 감염된 사람들은 다른 혈통에 감염된 사람들에 비해 병원에 입원할 확률이 64%(32%~104%) 높은 것으로 나타났다.[65]

VOC-202012/01의 유전자 염기서열 분석 결과 "ORF8 단백질을 가동시키거나 비활성 상태로 렌더링"[15]하는 Q27stop 돌연변이가 나타났다.ORF8 유전자를 삭제한 SARS-CoV-2 변종에 대한 이전의 연구는 그것들이 "약해진 증상들과 더 나은 질병 결과와 관련이 있다"고 지적했다.[66]The study also noted that "SARS-CoV-2 ORF8 is an immunoglobulin (Ig)–like protein that modulates pathogenesis", that "SARS-CoV-2 ORF8 mediates major histocompatibility complex I (MHC-I) degradation", and that "SARS-CoV-2 ORF8 suppresses type I interferon (IFN)–mediated antiviral response".[66]

챈드 외 연구진은 스파이크 단백질 내부의 아미노산 위치 501을 언급하면서 "이 위치의 변형이 바이러스의 중화 효능에 영향을 미칠 수 있다"[52]고 결론내렸지만, "현재 자연 감염으로 인한 다면체 세라에서 N501Y에 대한 중화 데이터가 없다"[52]고 언급했다.그러나 HV 69–70 삭제는 "일부 면역항암 환자의 면역 반응을 피한 바이러스에서"[67] 발견되었고, 또한 "다른 변화와 연관되어" 발견되었다.[52]

역학

덴마크, 네덜란드, 영국, 포르투갈, 스위스 및 아일랜드의 모든 코로나바이러스 양성 검체 중 알파 변종(연령 B.1.1.7) 점유율을 개발하기 위해 로그 척도로 성장 곡선을 결정했다.[73]괄호 안에 표시된 기울기는 상대 지수 일일 성장률이다(예: 덴마크의 경우 하루 7.6%)
영국, 영국 및 영국의 모든 코로나바이러스 양성 검체 중 알파 변종(연령 B.1.1.7) 점유율을 개발하기 위해 테스트 결과 로그 척도로 성장 곡선이 결정되었다.[76]괄호 안에 표시된 기울기는 상대 지수 일일 증가율이다(예: 영국의 경우 매일 8.6%)

알파 변종(연령 B.1.1.7)의 경우는 가장 일반적으로 사용되는 테스트가 이 변종과 다른 사스-CoV-2 변종을 구분하지 않고, 많은 사스-CoV-2 감염이 전혀 검출되지 않기 때문에 대부분의 국가에서 과소 보고될 가능성이 높다.특정 변종에[d] 대한 RT-PCR 시험이 알파에 대한 대리시험 또는 전유전자 염기서열을 수행하기 전에 보충적인 1차 선별시험으로 사용될 수 있지만,[77] RNA 염기서열은 이 변종의 검출에 필요하다.[78][70]

3월 23일 현재, 알파 변종은 241개 주권국가 중 125개 국가(또는 194개 WHO 회원국 중 104개 국가)에서 감지되었으며,[e] 그 중 일부는 지역사회 전염의 존재를 보고한 반면, 다른 일부는 지금까지 여행 관련 사례만 발견하였다.[82]3월 16일 현재, 그것은 21개국의 지배적인 COVID-19 변종이 되었다.United Kingdom (week 52), Ireland (week 2), Bulgaria (week 4), Slovakia (week 5), Israel (week 5), Luxembourg (week 5), Portugal (week 6), Denmark (week 7), Netherlands (week 7), Norway (week 7), Italy (week 7), Belgium (week 7), France (week 8), Austria (week 8), Switzerland (week 8), Liechtenstein (week 9), Germany (week 9), Sweden (week 9), Spa(9주), 몰타 (10주), 폴란드 (11주)에서.새로운 변종의 출현과 빠른 확산은 레바논에서 감지되었으며 1월 첫 12일 동안 사스-CoV-2 전송 강도 및 새로운 변종의 빈도 사이에 기록된 관계가 있다.[83]지난 2월부터 알파가 레바논에서 지배적인 변종이 됐다.[84]

2021년 2월 현재 남아메리카, 중앙아메리카, 아프리카, 중동(이스라엘 제외), 아시아, 오세아니아 어느 국가도 그들의 COVID-19 양성반응에서 알파 변종이 검출된 것에 대한 데이터를 보고하지 않았다. 따라서 알파가 그들의 COVID-19 유행에 지배적일 수 있는지 여부는 알 수 없다.

영국에 확산

첫 번째 사례는 2020년 9월 중순 영국 런던이나 켄트에서 있을 가능성이 높다.[85]2020년 12월 13일 현재, 영국에서 이 변종을 가진 1,108건의 사례가 거의 60개의 다른 지역 당국에서 확인되었다.이 사건들은 주로 영국의 남동부에서 발생했다.이 변종은 웨일즈와 스코틀랜드에서도 확인되었다.[86]11월까지 런던에서 발생한 COVID-19 유행병의 약 4분의 1이 새로운 변종에 의해 발생했고, 12월에는 3분의 1이 되었다.[87]12월 중순, 런던에서 일어난 사건 중 거의 60%가 알파와 관련된 것으로 추정되었다.[88]2021년 1월 25일까지, 확인되고 가능성이 있는 영국의 건수는 2만 8122건으로 증가했다.[89]

유럽에 퍼짐

이 변종은 다음과 같은 이유로 지배적이 되었다.

불가리아에서 게놈 염기서열 분석 결과 4주차 52.1%로 이 변종이 우세했고, 9주차 73.4%가 그 뒤를 이었다.[91]

독일 진출 후 사스-CoV-2 바이러스 변종 분포

Also in Slovakia, a RT-PCR Multiplex DX test capable of detecting the 2 deletions specific for lineage B.1.1.7 (ΔH69/ΔV70 and ΔY144),[92] first found the variant nationwide in 74% of cases on 3 February (week 5), followed by 72% of cases on 15 February (week 7), and it then grew to 90% of cases on 3 March (week 9).[93]같은 실험은 앞서 1월 8일 미할로브체 구에서 36%, 니트라에서 29%의 비율로 이 변종이 유행한 것을 발견했다.[94]

이스라엘에서 이 변종은 게놈 염기서열 분석으로 2020년 12월 23일에 처음 검출되었다.[95]그러나 Leumit Healthcare Services는 대리시험 RT-PCR(SGTF)로 분석하여 12월 15일 3-4%의 비율로 변종을 발견했다.[96]보건부는 게놈 염기서열 분석 결과 2월[97] 6일 변종 유병률(70%)이 우세해진 데 이어 2월 16일 90%가 우세한 것으로 추정했다.[98]

룩셈부르크에서 주간 게놈 서열 분석 결과, 접촉 추적, 공항 여행자 및 지역 발생의 잠재적 표적 편향에서 보정이 발생하지 않았기 때문에 결과가 완전히 대표적이지는 않을 수 있지만, 이 변종이 0.3%(51주)에서 5주차에 53.0%로 우세하게 성장했다고 밝혀졌다.대상 편향이 없는 모집단 무작위 시험 풀의 게놈 염기서열 분석은 6주부터 실시됐으며, 경쟁 베타 변종(연간 B.1.351)이 9주 18.5%로 증가하는 54.1%(6주)의 비율로 변종의 지배적 지위를 확인했다.[99]

덴마크의 경우 변종이 0.3%(2020년 46주)에서 65.9%(2021년 7주)로 우세해졌고, 92.7%(10주)로 더 성장했으며, 지역 유병률은 북주틀란드 87.3%에서 중부 덴마크 96.1%에 이른다.[100]상대적 변종 점유율이 관찰된 성장은 2월 중순에 지배력(50% 이상)을 예측하고 3월 초까지 전체 순환 변종의 약 80% 유행을 예측한 이전의 모델링된 예측에 전적으로 부합했다.[37][101]이에 비해 게놈 염기서열 분석 결과 10주차에 양성 사례 2315건 중 0.4%(235건 중 9회)에서만 경쟁 베타 변종이 발견됐다.[102][103]

네덜란드의 경우 무작위로 진행된 게놈 서열 분석 결과 49주 1.3%에서 7주 61.3%로 변종이 증가했고 9주 82.0%가 그 뒤를 이었다. 반면 경쟁 베타 변종은 9주 3.0%로 나타났다.[69]암스테르담의 도시 지역에서는 알파 변종(연령 B.1.1.7)이 5.2%(52주)에서 54.5%(6주)로 성장했다.[104]

노르웨이의 경우 유전체 염기서열 분석 결과 5.7%(1주)에서 58.4%(7주)의 우세로 성장했고, 65.0%(8주)가 뒤를 이었다.[105]게놈 염기서열 분석과 PCR 대리시험 모두로 구성된 또 다른 대규모 조사에서는 주 1000회 이상(4주 이후) 표본 추출이 동시에 2.0%(48주)에서 60.0%(7주) 우위로 성장했고 10주 72.7%에 이어 10주(7주)에서도 72.7%가 우위로 성장한 반면 비교에서는 2.2%만이 우위로 나타났다.베타 변형.[106]그 변형 지역적으로;반면, 21%통사론 샘플의 Viken에서 80%로 25년 1월 23일에서 2월 고랭지 재배 비록 w. 오슬로와 Viken,[107]의 군 18%통사론 샘플의 오슬로에서 90%로 1월 20일에서 2월 23일(비록data-corrected 추정치와 약간의 하위 50-70%에서 2월 23일에)로 증가 내 최고 비중을 차지했다ith데이터 수정 추정치는 2월 23일 50%로 약간 낮았다.[108]2월 15일부터 3월 14일까지 게놈 염기서열 분석과 PCR 대리시험을 합친 조사에서도 알파 변종이 11개 지역 중 8개 지역에서 50%가 넘는 우세한 것으로 나타났으며, 오슬로에서는 최고 비율(82%)이 검출되었으며, 노르드랜드는 우세한 것과 함께 알파 6%만이 검출되어 다른 모든 지역과 달랐다.베타 변종으로 대표되는 케이스의 88%.[106]

포르투갈에서, 변수는 국가 유전체 조사에 따르면:Covid-19 감염의 10–19 1월(주 2)[109]동안었고, 16.0%주에서 지배적인 경우에도 58.2%가 뒤따르6.[110] 국민적 RT-PCR 대리 시험 SGTF과 SGTL 관찰에 기반을 둔, 335%비율로 주 4의 변종을 알아냈으나, 늦어진 후가 decelerat을 관찰했습니다를 대표했다.산만 속도 f또는 변종 점유율의 주간 상승(이유 불명)에 따라 8주차에 50.5%(55.0% SGTFL의 91.8%)만 우세해졌고, 10주차에 64.3%(70% SGTFL의 91.8%)가 뒤를 이었다.[70]

이탈리아에서는 2월 4~5일(주 5일) 전국적으로 알파 변종이 17.8%를 차지했고,[111] 2월 18일(주 7일)이 54.0%로 뒤를 이었다.7주 동안 지역 유병률은 아오스타 계곡의 0%(표본 1개만 검사했지만)에서 몰리스의 93.3%까지 다양했다.7주차에 경쟁하는 감마 변종은 4.3%(지역별 0%-36.2% 범위)의 유병률을 보였으며 남아프리카 변종은 0.4%(지역별 0%-2.9% 범위)의 유병률을 보였다.[112]

스위스의 경우 전국 주간 게놈 염기서열 조사 결과 알파 변종이 8주차에 0.05%(51주)에서 58.2%로 우세한 것으로 나타났으며, 9주차에 71.1%가 그 뒤를 이었다.[71]이는 2월 중순경 우위를 점할 것으로 예측된 2월 9일 모델에 따른 것이다.[113]이와는 대조적으로, 경쟁 베타 변종은 9주 동안 양성 사례의 1.0%에서 전국적으로만 발견되었다.[71]

벨기에에서 현지 발생 또는 이동과 관련된 활성 표적 검사에서 모든 샘플을 제외한 후 무작위로 선택한 샘플의 게놈 분석 결과(모든 COVID-19 양성 테스트의 4.4%에 해당하는 점유율을 가진 통계적 대표 국가 샘플 생성) 알파 변종 점유율이 1주차 7.1%에서 우세한 51.5% i로 증가했다.10주차에 79.3%가 그 뒤를 이었다.[114]이 변종은 49주 동안 표적 게놈 염기서열 분석으로 처음 발견되었지만, 작은 표본 포착(임의적이지 않고 주당 100회 미만) 때문에 1주 전에는 신뢰할 수 있는 변종 공유 데이터를 확인할 수 없었다.[115]또한 이 변종에 대한 대리시험(RT-PCR SGTF)은 모든 COVID-19 양성시험의 25.8%에 해당하는 시료포획에 대해 실시되었으며, 10주 동안 54.8%의 SGTF 비율이 우세한 것으로 나타났다.이에 비해 경쟁 베타 변종은 3.6%로 나타났으며 감마 변종은 10주 동안 1.8%의 유병률을 보였다.[114]

프랑스에서 과학자들은 알파 변종(VOC-202012/01)이 2021년 8~11주쯤 전국적으로 우세해질 것으로 정확하게 예측했다.[116]무작위로 선정된 긍정적인 COVID-19 샘플 먼저 RT-PCR 선발 시험에 의해 분석하고 전국적인 조사와 그 후 게놈 서열 분석에 의해 확인이 변종 3.3%(388/11916)의에서 7-81월에(주 1)[117]1월 27일(주 4)[80]에 13.3%(475/3561)44.3%(273/615)에 의해 2월 16일(주 7)에 이어 올랐다고 밝혔다..[80]8주 동안, 이 변종은 모든 COVID-19 양성 테스트의 0.9% 또는 변종별 RT-PCR 조사의 59.5%로 구성된 주간 게놈 염기서열 조사의 해석 가능한 결과에 따르면 56.4%(758/1345)의 우세한 점유율을 보였다.[118]10주차에, 이 변종별 RT-PCR 조사에서는 COVID-19 양성 테스트의 56.9%를 시험한 결과, 이 변종별 RT-PCR 조사에서는 71.9%의 점유율을 보였다.이 변종의 확산은 메트로폴리탄 프랑스에 위치한 96개 부서에서 10주 동안 지역적으로 차이를 보였으며, 50% 이상의 91개 부서와 30%~50%의 5개 부서(특히 모젤 부서는 경쟁 베타 변종에서 38.3%의 높은 비율을 발견하여 주목할 만했으며, 54.4%의 우세한 수준에서 하락했음에도 불구하고)가 두드러졌다.8주 단위의 값 - 여전히 이 특정 변종에 대한 전국 평균 5.0%를 크게 상회했다.)[119]

In Austria, Agentur für Gesundheit und Ernährungssicherheit (AGES) collected data from N501Y RT-PCR specific tests combined with subsequent genome sequencing analysis, and found that the variant grew from 7.2% (week 1) to a dominant 61.3% (week 8), followed by 61.2% in week 9 and 48.3% in week 10.만약 모든 N501Y 양성 반응이 게놈 염기서열 분석을 통해 분석되었다면, 예를 들어, 이러한 상장 주식은 1주차 2.4%, 7주차 23.0%, 8주차 4.0%, 9주차 6.8%, 10주차 25.4%만큼 더 높을 수 있었을 것이다.경쟁 베타 변종은 10주차 양성 반응의 0.3%에서만 전국적으로 발견되었으며, 가장 성행했던 지역인 티롤의 경우 4주차 24.5%에서 10주차 1.9%로 점유율이 감소했다.지역적으로 알파가 9개 지역 중 7개 지역에서 50% 이상 우세한 것으로 나타났으며, 유일하게 티롤과 보랄베르그가 두 가지 예외였다.[120]

독일에서 Robert Koch Institute가 발표한 가장 크고 아마도 가장 대표적인 국가 조사(RKI-Testzahlerfassung)는 5만3,272개의 COVID-19 양성 검체를 게놈 염기서열 분석 또는 RT-PCR 프록시 테스트에 의해 수집된 데이터와 함께 최근 주 동안 순환하는 COVID-19 변종의 몫을 결정했다.y는 대학/연구/임상/외환자 분야의 84개 연구소에서 온 기초가 전국에 골고루 퍼져 있다.이 조사는 지리적 대표성의 존재를 보장하기 위해 데이터 가중치나 데이터 선택 기준을 활용하지 않았지만, 표본 포착이 크기 때문에 여전히 전국 평균을 어느 정도 대표하는 것으로 간주될 수 있다.RKI-Testzahlerfassung 조사에 따르면, 이 변종은 2.0%(2주)에서 54.5%(9주)의 우세한 점유율로 성장했고, 10주에는 63.5%가 그 뒤를 이었다.이와는 대조적으로, 경쟁 베타 변종은 10주차에 양성 사례의 0.9%에서만 전국적으로 발견되었다.[121]

몰타에서 이 변종은 2020년 12월 30일 게놈 염기서열에 의해 처음으로 검출되었으며,[122] 7주차에 양성 환자의 8%를 나타냈다.[123]감시를 위해 새로운 RT-PCR 변종별 테스트가 도입되었는데,[124] 3월 10일에 보고된 첫 번째 결과에서 이 변종이 현재 전국적으로 61%를 차지하고 있는 것으로 나타났다.[125]

스웨덴의 경우 당초 12~14주 전후에 원래 바이러스에 비해 투과성이 50% 증가할 것으로 가정해 변종이 우세해질 것으로 예상했다.[126]평균적으로 변종 점유율은 남부 5개 지역(스킨, 베스트라 괴탈란드, 베스트만랜드, 게블레보그, 외레브로)에서 10.8%(4주)에서 36.9%(7주)로 증가하는 것으로 나타났다.[127]7주 동안, 변종 점유율은 또한 처음으로 스웨덴 21개 지역 중 19개 지역(블루킹 3.3%에서 게블레보르 45%)에 대한 전체 평균 30.4%로 계산되었다.9주 동안 19개 지역(크로노베르크 16%에서 게블레보르그 72%)의 전체 평균으로 변종 점유율이 56.4%로 우세했다.10주 동안 19개 지역의 전체 평균(크로노베르크의 40%에서 욘코핑의 84%)으로 변종 점유율이 71.3%로 더 늘어난 것으로 계산됐다.19개 지역에 대해 계산된 평균에 대한 지리적 대표성을 보장하기 위해 지리적 가중치를 적용하지 않았지만, 12,417개 변종 시험의 전체 표본 포착은 10주 동안 모든 COVID-19 양성 PCR 시험의 43.1%를 차지하여 조사 결과가 n에 대한 실제 평균을 나타내기 위해 근접할 수 있음을 추론했다.전체로서[81]

마이크로주 리히텐슈타인에서는 2020년 12월 19일 알파 첫 사례가 검출됐다.전체 유행병 중 2021년 3월 18일 현재 알파 58건, 베타 1건(2월 1일 검출), 미식별 N501Y 8건(12월 10일~2월 22일)으로 구성된 67건의 VOC-N501Y PCR 양성 환자가 검출됐다.The weekly average of each days calculated 7-day rolling average for the share of all detected VOC-N501Y cases (which is a good proxy for Alpha in Liechtenstein), was found to be 10.9% in week 5, followed by a dominant 52.2% in week 9 (where 8 out of 15 tests were found to be Alpha); and grew further to 73.4% in week 10 (where 6 out of 9 tests were 알파인 것으로 확인됨).[128]

스페인에서는 1월 29일 변종별 점유율이 전국적으로 5%-10%로 추정되었고,[129] 2월[130][131] 18일 20%-25%, 2월 22일 25%-30%로 3월 3일(9주) 현재 50% 이상이 우세한 것으로 추정되었다.[132][133]주 10일 현재 변종의 유병률은 17개 지역의 18.3%~97.0%로, 2개 지역을 제외한 모든 지역이 50%를 상회하는 우세한 비율을 보이고 있다.[134]

폴란드에서는 감염된 교사들을 대상으로 한 전국적인 설문조사를 통해 전문가들은 2월 11일 현재 변종 점유율이 전국적으로 5%에서 10% 사이인 것으로 추정하고 있으며,[135] ECDC는 2월 15일 현재 9%로 보고하고 있다.[136]아담 니데젤스키 보건부 장관에 따르면 이 변종은 1월 하반기부터 1차 연구에서 5%의 비율로 발견됐다가 열흘마다 10%포인트씩 증가해 3월 16일(11주) 전국적으로 52%의 비율로 우세한 것으로 나타났다.[137][138]지역적으로는 2월 22~23일(주 8) 워미안-마수리아인과 포메라니안의 경우 이미 70%를 넘었고,[139] 3월 17일(주 11) 대폴란드 음성통로의 경우 90%에 도달하기도 했다.[140]

핀란드의 경우, 2021년 2월 현재 통계적 대표 국가 조사가 실시되지 않았으며, 국가 게놈 염기서열 분석은 주로 여행자와 지역 발생 클러스터의 COVID-19 양성 검체를 추가 분석하는 것을 목표로 했기 때문이다.[141]헬싱키와 우시마아 병원 지구에서 운영되는 헬싱키 대학병원(HUS)은 의사당 지역(헬싱키 선거구, 우시마 선거구라고도 한다)에서 2월 14일을 앞두고 며칠 동안 무작위로 채취한 모든 표본의 10%에서 이 변형을 발견했다.국회의사당 지역의 경우, 이 변종은 3월 하반기(11~13주)에 우세(50% 이상)하도록 모델링되었다.[142]

아이슬란드에서는, 국가 당국이 해외에서 입국하는 모든 사람들을 대상으로 엄격한 3가지 테스트와 검역 제도를 시행하여 지금까지 새로운 감염성 VOCs가 국내에 발판을 마련하는 것을 성공적으로 막았다.3월 4일 현재, 총 90명의 여행객들이 아이슬란드 국경에서 알파 변종 양성반응을 보였으며, 20명의 추가 국내 사례들은 모두 국경 사건과 밀접하게 연관되어 있으며, 지역사회 전염과 관련된 사례는 없었다.[143]

북아메리카에 확산

미국에서는 2020년 11월 말 처음 등장한 [144]이 변종이 1월 말 1.2%에서 성장해 3월 말경 우위에 섰다.[145][146]

캐나다에서 이 변종은 2020년 12월 말 온타리오에서 처음 등장했다.[147]2월 13일까지, 그것은 10개의 모든 지방으로 퍼졌다.[148]COVID-19 양성 검체의 알파 변종(연간 B.1.1.7)에 대한 시험과 확인은 전국적으로 일관성이 없었다.[149]2월 3일, 앨버타 주는 COVID-19 양성 검체를 검사한 첫 번째 주였다.[149][150]3월 23일 현재, 알파 변종은 5812건에서 검출되었으며, 알버타 지방에서 가장 널리 퍼져 있었다.[151]온타리오 주에서, RT-PCR (N501Y)와 게놈 염기서열 분석 연구를 합친 결과, 1월 20일(3주)에 모든 VOCs가 COVID-19 양성의 4.4%를 나타냈고, 알파는 이러한 VOCs의 99%를 구성했다.[152]Public Health Ontario 연구소는 5주 동안 모든 COVID-19 양성의 거의 7%에서 이 변종을 발견했으며, 이는 모든 검출된 VOCs의 97%(309/319)를 나타낸다.[153]알파는 3월 16일경에 지배적인 변종이 되었다; 모든 양성 환자의 53%가 VOCs였고, VOCs의 97%가 알파인 것으로 추정되었다.[154]변종도 널리 퍼진 퀘벡에서는 3월 말이나 4월쯤이면 우세해질 것으로 예상됐다.[155]

예측된 우위 날짜의 민감도가 변종의 현재 백분율에 비해 상대적으로 낮다는 것은 상대 지수 성장이 빨랐기 때문이다.최근 델타가 영국처럼 북미에서 알파에 추월당한 것으로 보인다.

개발

알파 변종 개발(연간 B.1.1.7)
(특정 주에 분석된 SARS-CoV-2–양성 테스트의 공유)
나라 테스트 2020년 주 42 43주 44주 45주 46주 47주 48주 49주 50주 51주 52주 53주 2021 주 1 2주차 3주차 주4 5주차 6주차 7주차 8주차 9주차 10주
영국 Seq.[72] 0.05% 0.35% 1.0% 2.7% 6.3% 10.2% 10.2% 13.9% 32.9% 45.7% 51.3% 70.6% 74.1% 78.6% 86.0% 89.1% – – – – – –
잉글랜드 SGTF[156]*Seq.%[157]

Seq.[90]
SGTF 원시 데이터[f]
SGTF 모형[f]

0.07%

(0.02%)
(없음)
(없음)

0.4%

(0.5%)
(없음)
(없음)

0.9%

(1.2%)
(없음)
(없음)

2.9%

(1.5%)
(없음)
(없음)

5.5%

(5.3%)
(없음)
(없음)

9.1%

(7.8%)
(15.2%)
(m:13.3%)

18.0%

(11.4%)
(24.3%)
(m:15.9%)

32.2%

(22.1%)
(36.8%)
(m:22.0%)

51.8%

(38.1%)
(49.3%)
(m:32.1%)

63.7%

(61.8%)
(60.7%)
(m:57.2%)

72.4%

(62.1%)
(72.1%)
(m:68.9%)

77.9%

(78.4%)
(75.0%)
(m:74.0%)

82.1%

(76.7%)
(80.7%)
(m:78.3%)

87.5%

(79.7%)
(83.3%)
(m:82.1%)

90.6%

(–)
(88.2%)
(m:86.0%)

93.8%

(–)
(87.7%)
(m:89.3%)

95.7%

(–)
(93.4%)
(m:92.5%)

97.4%

(–)
(95.3%)
(m:94.5%)

98.1%

(–)
(97.0%)
(m:95.4%)

98.6%

(–)
(95.6%)
(m:95.5%)

98.7%

(–)
(94.2%)
(m:95.2%)

–

(–)
(96.1%)
(m:94.1%)

북아일랜드 SGTF 원시 데이터[f]
SGTF 모형[f] 		해당 없음 해당 없음 해당 없음 해당 없음 해당 없음 17.9%
(m:14.0%) 		7.4%
(m:14.9%) 		37.5%
(m:16.3%) 		23.0%
(m:18.5%) 		50.0%
(m:36.1%) 		25.0%
(m:42.1%) 		58.8%
(m:44.7%) 		45.2%
(m:52.7%) 		71.4%
(m:67.0%) 		78.2%
(m:74.0%) 		72.4%
(m:81.4%) 		95.7%
(m:86.5%) 		88.9%
(m:90.5%) 		92.2%
(m:92.4%) 		100.0%
(m:93.0%) 		86.2%
(m:92.6%) 		100.0%
(m:91.1%)
스코틀랜드 SGTF 원시 데이터[f]
SGTF 모형[f] 		해당 없음 해당 없음 해당 없음 해당 없음 해당 없음 9.5%
(m:5.8%) 		9.7%
(m:6.7%) 		10.4%
(m:7.7%) 		11.7%
(m:10.2%) 		51.4%
(m:26.2%) 		40.0%
(m:39.5%) 		35.8%
(m:43.9%) 		64.1%
(m:49.8%) 		67.2%
(m:64.2%) 		63.3%
(m:65.0%) 		69.2%
(m:70.0%) 		70.6%
(m:77.3%) 		93.9%
(m:84.7%) 		82.0%
(m:90.0%) 		100.0%
(m:93.7%) 		93.0%
(m:95.8%) 		100.0%
(m:96.9%)
웨일스 SGTF 원시 데이터[f]
SGTF 모형[f] 		해당 없음 해당 없음 해당 없음 해당 없음 해당 없음 27.9%
(m:18.1%) 		8.3%
(m:16.0%) 		10.7%
(m:13.3%) 		26.3%
(m:12.1%) 		13.4%
(m:15.0%) 		15.9%
(m:14.7%) 		19.8%
(m:20.4%) 		54.4%
(m:34.8%) 		61.5%
(m:59.6%) 		69.0%
(m:65.0%) 		68.1%
(m:68.7%) 		77.0%
(m:73.4%) 		71.8%
(m:76.6%) 		75.8%
(m:78.5%) 		87.9%
(m:78.9%) 		80.0%
(m:77.2%) 		69.9%
(m:73.3%)
아일랜드 SGTF 원시 데이터[44] – – – 1.9%
(일반 데이터) 		0.0%
(일반 데이터) 		0.0%
(일반 데이터) 		6.1%
(일반 데이터) 		2.2%
(일반 데이터) 		1.6%
(일반 데이터) 		7.5% 16.3% 26.2% 46.3% 57.7% 69.5% 75.0% 90.1% 88.6% 90.8% – – –
불가리아 Seq.[91] – – – – – – – – – – – – – – – 52.1% – 70.8% – – 73.4% –
이스라엘 SGTF(51+1)
. w. w. 이. . 이후. 		– – – – – – – – – 3–4%
(12월 15일)[96] 		– – 10–20%
(1월 5일)[96] 		10–20%
(1월 11일)[160] 		30–40%
(1월 19일)[161] 		40–50%
(1월 25일)[162] 		~70%
(2월 2일)[97] 		~80%
(2월 9일)[163] 		~90%
(2월 16일)[98] 		– – –
슬로바키아 PCR(SGTF+ΔY144) – – – – – – – – – – – – – – – – ~74%
(2월 3일) 		– ~72%
(2월 15일) 		– ~90%
(3월 3일) 		–
룩셈부르크 Seq.[99] – – – – – – – – – 0.3% 0.9% 4.2% 8.7% 15.5% 16.9% 36.2% 53.0% 54.1% 53.8% 63.7% 62.8% –
덴마크 Seq.[100] – – – – 0.3% 0.2% 0.4% 0.4% 0.4% 0.8% 1.8% 1.9% 3.5% 7.0% 13.1% 19.6% 29.6% 47.0% 65.9% 75.3% 85.1% 92.7%
네덜란드 Seq.[69] – – – – – – – 1.3% 0.8% 0.5% 2.1% 4.4% 9.6% 15.9% 22.7% 24.7% 31.0.% 40.3% 61.3% 75.2% 82.0% –
노르웨이 PCR 프록시 및 Seq.[106]
Seq.[164][105] 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		0.0%
(–) 		2.0%
(–) 		0.0%
(0.0%) 		4.9%
(0.0%) 		8.9%
(7.2%) 		6.0%
(2.9%) 		14.9%
(1.3%) 		18.9%
(5.7%) 		19.5%
(11.6%) 		15.2%
(9.3%) 		19.8%
(20.1%) 		34.1%
(30.3%) 		43.6%
(40.8%) 		60.0%
(58.4%) 		71.8%
(65.0%) 		76.7%
(–) 		72.7%
(–)
이탈리아 Seq.%[111][112] – – – – – – – – – – – – – – – – 17.8% – 54.0% – – –
프랑스. PCR 프록시
Seq.
SGTF*Seq.% 		–
(–)
(–) 		–
(–)
(–) 		–
(–)
(–) 		–
(–)
(–) 		–
(–)
(–) 		–
(–)
(–) 		–
(–)
(–) 		–
(–)
(–) 		–
(–)
(–) 		–
(–)
(–) 		–
(–)
(–) 		–
(–)
(–) 		–
(–)
(3.3%)[117] 		–
(–)
(–) 		–
(–)
(–) 		–
(–)
(13.3%)[80] 		–
(–)
(–) 		36.1%[165]
(–)
(–) 		49.3%[166]
(45.8%)[166]
(44.3%)[80] 		59.5%[118]
(56.4%)[118]
(–) 		65.8%[80]
(69.0%)[119]
(–) 		71.9%[119]
(–)
(–)
Seq.[71] – – – – – – – – – 0.05% 0.4% 0.8% 2.6% 4.9% 9.2% 16.5% 26.0% 32.4% 47.0% 58.2% 71.1% –
오스트리아 PCR(N501Y)*Seq.%[120]
Seq.B117+unseq.N501Y[120] 		– – – – – – – – – – – – 7.2%[g]
(9.6%) 		17.4%[g]
(23.8%) 		14.7%[g]
(19.6%) 		22.5%[g]
(28.6%) 		28.7%[g]
(37.2%) 		24.0%[g]
(45.4%) 		35.1%[g]
(58.1%) 		61.3%[g]
(65.3%) 		61.2%[g]
(68.0%) 		48.3%[g]
(73.7%)
벨기에 Seq.[115][114]
SGTF[115][114] 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		0.0%
(<5%) 		0.0%
(<5%) 		0.0%
(<5%) 		13.6%
(<5%) 		0.0%
(<5%) 		7.1%
(7.2%) 		7.7%
(6.9%) 		13.4%
(16.6%) 		23.3%
(19.5%) 		39.4%
(22.4%) 		43.2%
(27.9%) 		51.5%
(34.4%) 		57.6%
(45.8%) 		66.5%
(46.3%) 		79.3%
(54.8%)
포르투갈 SGTFL*Seq.%[70] – – – – – – – 1.7% 0.8% 1.2% 1.7% 2.9% 6.8% 12.3% 22.7% 33.5% 39.2% 40.9% 45.7% 50.5% 56.0% 64.3%
스웨덴 Seq. 모두 N501Y+A570D pos. 테스트[81] – – – – – – – – – – – – – – – 10.8%
(21개 지역 중 5개 지역)[h] 		15.1%
(21개 지역 중 5개 지역)[i] 		27.3%
(21개 지역 중 5개 지역)[j] 		30.4%
(21개 지역 중 19개 지역)[k] 		41.5%
(21개 지역 중 19개 지역)[l] 		56.4%
(21개 지역 중 17개 지역)[m] 		71.3%
(21개 지역 중 18개 지역)[n]
이요. PCR 프록시 및 Seq.[121]
Seq.[121] 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(–) 		–
(2.6%) 		2.0%
(8.8%) 		3.6%
(4.9%) 		4.7%
(10.7%) 		7.2%
(17.7%) 		17.6%
(20.8%) 		25.9%
(33.2%) 		40.0%
(42.9%) 		54.5%
(48.3%) 		63.5%
(–)
리히텐슈타인 PCR 프록시: N501Y[128] – – – – – – – – – – – – – – – – 10.9% 28.5% 32.8% 47.0% 52.2% 73.4%
스페인 PCR 프록시에[134] 기반한 추정치 – – – – – – – – – – – – – – – 5-10%
(1월 29일)[129] 		– – 20-25%
(2월 18일)[131] 		25-30%
(2월 22일)[132] 		>50%
(3월 3일)[133] 		–
미국 SGTF*Seq.%[168] – – – – – – – – – 0.05% 0.2% 0.4% 0.5% 1.0% 1.9% 3.0% 4.7% 7.6% 12.4% 19.3% 28.8% 37.4%
캘리포니아 SGTF*Seq.%[168] – – – – – – – – – 0.3% 0.3% 0.7% 1.1% 1.3% 2.0% 1.9% 4.2% 5.9% 13.1% 16.6% 18.8% 28.0%
플로리다 주 SGTF*Seq.%[168] – – – – – – – – – 0.2% 0.5% 0.9% 1.0% 2.3% 4.6% 8.1% 10.7% 14.5% 21.0% 28.3% 39.8% 47.0%
주간/주기별 데이터가 없지만 변종 점유율이 5% 이상인 다른 국가: 00 몰타(61%),[125] 폴란드(52%)[138] 등.

다음의 추가 국가는 변종 점유율을 보고하지 않았지만, 2021년 3월 13일에 전체 게놈 염기서열 분석으로 확인된 50건 이상이 발견되었기 때문에 상당한 점유율이 존재할 가능성이 있다.[169]

모든 시퀀싱된 COVID-19 게놈의 GISAID 데이터베이스는 제출된 샘플에 대해 지난 4주 동안 각 국가에 대해 평균 "상대변종 게놈 빈도"를 계산한다.그러나 그러한 관측 빈도는 표본 추출 및 보고 편향의 영향을 받으며, 통계적 대표성이 없기 때문에 정확한 변종 주식 유병률을 나타내지 않는다.[169]

최초 사례를 보고하는 국가

2020년 12월

12월 중에 덴마크, 벨기에,[59][170][171] 네덜란드, 호주[59][170], 이탈리아에서 이 변종의 사례가 보고되기 시작했다.[172]그 직후 몇몇 다른 나라들이 첫 번째 사례를 확인했는데, 그 중 첫 번째 사례가 아이슬란드와 지브롤터,[173][174] 그 후 12월 23일 싱가포르, 이스라엘과 북아일랜드,[175][176][177] 24일 독일과 스위스,[178][179] 그리고 12월 25일 아일랜드와 일본이 확인했다.[180][181]

캐나다, 프랑스, 레바논, 스페인, 스웨덴에서 12월 26일 첫 사례가 보고되었다.[182][183][184][185]요르단, 노르웨이, 포르투갈은 12월 27일 [186][187]첫 사례를, 핀란드와 한국은 12월 [188][189]28일 첫 사례를, 칠레, 인도, 파키스탄, 아랍에미리트는 12월 29일 첫 사례를 보고했다.[190][191][192][193]몰타와 대만의 새로운 변종의 첫 사례는 12월 30일에 보고된다.[122][194]중국과 브라질은 12월 31일에 새로운 변종의 첫 사례를 보고했다.[195][196]영국과 덴마크는 SARS-CoV-2를 다른 나라들보다 상당히 높은 비율로 배열하고 있으며,[197] 나중에 다른 나라들이 이 변종을 발견하게 될 것으로 여겨졌다.[198]

미국은 12월 29일 콜로라도에서 여행경력이 없는 사례를 보고했고, 샘플은 12월 24일에 채취되었다.[199]2021년 1월 6일, 미국 질병관리본부는 캘리포니아, 플로리다, 콜로라도, 조지아, 뉴욕에서 적어도 52명의 확진환자를 발견했다고 발표했다.[200]그 다음 날, 다른 주에서 이 변종의 사례가 더 많이 보고되었고, 톰 프리든 전 CDC 국장은 미국이 곧 "최악의 시나리오에 근접할 것"[201]이라는 우려를 표명했다.

2021년 1월

터키는 2021년 1월 1일 영국에서 15명 중 첫 사례를 적발했다.[202]그것은 1월 1일에 덴마크, 그 나라에서 11월 중순에서 첫 검출에 12월 말까지의 기간 동안의 순차의 경우 1%미만 종합 주파수 새로,[203][204]이 서열을 시험의 1.6%까지의 기간 동안에 mid-November 주 tw으로 증대시킨 변형의 86사건은 발견된 것으로 알려졌다.2021년의시이번 주에만 시퀀싱된 테스트의 7%가 알파 변종(연간 B.1.1.7)이었다.[205]룩셈부르크와 베트남은 2021년 1월 2일 이 변종의 첫 사례를 보고했다.[206][207]

2021년 1월 3일 그리스와 자메이카가 이 변종에서[208][209] 처음 4건의 사례를 발견했고 키프로스는 12건의 표본에서 알파(VOC 202012/01)를 검출했다고 발표했다.[210]동시에 뉴질랜드와 태국은 이 변종의 첫 사례를 보고했는데, 전자는 영국에서 5건, 남아공에서 1건으로 구성된 6건을 보고했고,[211] 후자는 켄트에서 도착한 4인 가족으로부터 사건을 보고받았다.[212]그루지야는 첫 번째 사례를 보고했고 오스트리아는[213] 1월 4일 베타 변종 1건과 함께 이 변종의 첫 4건을 보고했다.[214]

1월 5일 이란,[215] 오만,[216] 슬로바키아는 첫 VOC-202012/01 사례를 보고했다.[217]1월 8일, 루마니아는 최근 출국하지 않았다고 선언한 주르기우 군 출신의 성인 여성인 이 변종의 첫 사례를 보고했다.[218]1월 9일, 페루는 이 변종의 첫 사례를 확인했다.[219]멕시코와 러시아는 1월 10일에 이 변종의 첫 사례를 보고했고,[220] 그 후 말레이시아와 라트비아는 1월 11일에 발표했다.[221][222]

1월 12일, 에콰도르는 이 변종의 첫 사례를 확인했다.[223]필리핀과 헝가리 모두 1월 13일에 이 변종의 존재를 감지했다.[224][225]감비아는 1월 14일 이 변종의 첫 사례를 기록했으며, 이 변종이 아프리카에 존재한다는 것을 처음으로 확인했다.[226]1월 15일, 도미니카 공화국은 새로운 변종의[227] 첫 사례를 확인했고 아르헨티나는 1월 16일에 변종의 첫 사례를 확인했다.[228]체코와 모로코는 1월[229][230] 18일 첫 사례를 보고했고 가나와 쿠웨이트는 1월 19일 첫 사례를 확인했다.[231][232]나이지리아는 1월 25일 첫 번째 사례를 확인했다.[233]1월 28일, 세네갈은 이 변종의 첫 번째 사례를 발견했다.[234]

1월 초, 한 초등학교와 연관된 발병으로 인해 네덜란드 버그센후크 지역에서 적어도 30건의 새로운 변종이 발견되어 현지 전송을 의미했다.[235]

1월 16일, 로스앤젤레스 카운티 공중 보건부는 이 변종이 LA에서 검출되었음을 확인했다.카운티, 보건 공무원들이 지역사회에 퍼지고 있다고 믿고 있다.[236]

1월 24일, 아프리카에서 파로 섬으로 여행하는 한 사람이 그 섬에 도착하자마자 양성 반응을 보였고, 바로 검역에 들어갔다.[237]

1월 28일, 북마케도니아는 이 변종이 이미 회복된 46세의 남성에게서 발견되었다고 확인했다.[238]

2021년 2월

2월 1일, 리투아니아는 새로운 혈통의 첫 번째 사례를 확인했다.[citation needed]2월 4일, 우루과이의 보건 당국은 우루과이의 첫 번째 변종 사례를 발표했다.이 사건은 2020년 12월 20일 입국해 이후 검역 중인 사람에게서 적발됐다.[239]크로아티아 보건부는 지난 2월 10일 1월 20일 이후 서열 61개 시료 가운데 자그레브에서 온 50세, 3.5세 남성 1개 시료와 브로드포사비나 카운티에서 온 34세 남성 등 3개 시료에서 이 변종이 검출됐다고 확인했다.[240]지난 2월 12일 스리랑카의 4개 지역에서 변종이 검출됐으며 캐나다 뉴펀들랜드주와 래브라도주는 변종 발생을 확인했다.[241][242]

2021년 3월

3월 2일, 인도네시아는 사우디 아라비아에서 돌아온 두 명의 이주 노동자들에게서 이 변종의 첫 사례를 보고했다.[243]같은 날 튀니지는[244] 이 변종의 첫 사례를 보고했다.코트디부아르의 존재는 3월 25일에 확인되었다.[245]

다른 N501Y 돌연변이

N501Y 돌연변이는 여러 위치에서 독립적으로 여러 번 발생하였다.

  • 2020년 4월, 브라질에서 몇 개의 고립된 시퀀스에서 처음으로 목격되었다.[246]
  • 2020년 6월 호주 혈통에서 돌연변이가 나타났다.[246]
  • 2020년 7월(Julian Tang, Lesster University of Lesster) N501Y가 미국에서 유통되는 혈통에 등장했다.[246][citation needed]
  • 2020년 9월 웨일스의 한 혈통에서 발견되었는데, 이는 독립적으로 진화하여 혈통 B.1.1.7과는 달랐다.[48]
  • 2020년 9월,[1] 훨씬 더 많은 투과 가능하고 널리 퍼져 있는 혈통 B.1.1.7 (501Y)이다.V1)은 켄트(잉글랜드)에서 처음으로 검출됐다.[15]
  • 2020년 10월, 또 다른 전염성이 높은 우려 변종인 혈통 B.1.351 (501Y)이라고 불렸다.V2, 베타 변종)은 넬슨 멘델라 베이(남아공)에서 게놈 염기서열에 의해 처음 검출됐다.[247]식물학적 분석은 이 혈통이 이미 2020년 7월이나 8월에 나타났다는 것을 보여준다.[248]
  • 2020년 12월,[249] 또 다른 전염성이 높은 변종은 혈통 P.1 (501Y)로 불린다.V3, 감마 변종)이 마나우스(브라질)에서 검출되었다.[250]

통계

테이블

그래픽스

국가별 확정사례

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역사

탐지

알파 변종의 거짓 색전 전자 마이크로그래프.이 변종의 투과능력은 여기 녹색으로 표시된 스파이크 단백질의 구조 변화 때문인 것으로 생각된다.

알파 변종(연령 B.1.1.7)은 국가적인 제약에도 불구하고 켄트의 감염률이 떨어지지 않는다는 사실을 알고 게놈 데이터를 분석해 2020년 12월 초 처음 검출됐다.[2][254]

혈통 B.1.1.7에 속하는 두 개의 초기 게놈은 켄트에서 2020년 9월 20일에, 다른 게놈은 그레이터런던에서 2020년 9월 21일에 수집되었다.[15]이러한 시퀀스는 GISAID 시퀀스 데이터베이스(시퀀스 액세스 EPI_)에 제출되었다.ISL_601443 및 EPI_각각 ISL_581117).[255]

유전적 증거를 이용한 역추적은 혈통 B.1.1.7이 2020년 9월에 출현하여 11월 중순까지 인구의 매우 낮은 수준으로 유통되었음을 시사한다.이 변종과 관련된 사례의 증가는 11월 말 영국 공중보건기구가 국가적인 제한에도 불구하고 켄트의 감염률이 떨어지지 않는 이유를 조사하면서 처음으로 명백해졌다.그 후 PHE는 이 변종과 연관된 클러스터가 런던과 에섹스로 빠르게 퍼지는 것을 발견했다.[26]

또한 영국에서 주로 사용되는 RT-PCR 테스트의 특성인 써모 피셔 사이언티픽의 TaqPath COVID-19도 중요했다.이 테스트는 세 곳의 RNA와 일치하며, 혈통 B.1.1.7의 스파이크 단백질에서 각각 위치[256] 69와 70의 아미노산 히스티딘과 발린이 삭제된 HV 69–70의 삭제로 인해 스파이크 유전자에 대한 작업을 중단했다.이는 유전체 염기서열 분석을 통해 혈통 B.1.1.7이 어떤 환자인지 더 잘 알 수 있기 때문에 예비 식별이 더 쉬워졌다.[257]

이 변종은 만성적으로 감염된 면역항암제 환자에게서 발생하여 바이러스를 복제하고 진화할 수 있는 오랜 시간을 주었을 것이라는 주장이 제기되었다.[258][2][259][260]

컨트롤

전염성이 더 강한 변종이 존재하는 상황에서, 기하급수적으로 증가하는 경향 때문에 인구를 압도하는 것을 피하기 위해 더 강력한 물리적 거리 및 봉쇄 조치가 선택되었다.[261]

2020년 12월 20일부터 효력이 있는 알파 바이러스의 확산이 최소한 부분적인 원인이 된 것에 대한 대응으로 영국의 모든 국가는 국내 여행 제한의 영향을 받았다.[262][263]2020년 12월 동안, 전 세계의 점점 더 많은 나라들이 영국으로부터 그리고 네덜란드와 덴마크와 같은 다른 나라들로부터의 승객 여행을 일시적으로 금지하거나 금지하는 것을 고려하고 있었다.일부 국가는 비행을 금지했고, 다른 국가는 음성 사스-CoV-2 검사를 받아 자국 국적자만 입국을 허용했다.[264]세계보건기구(WHO) 대변인은 "전파가 격렬하고 광범위한 유럽을 가로지르는 국가들은 통제와 예방 접근법을 배가할 필요가 있다"고 말했다.EU 회원국들은 12월 21일 새로운 변종으로부터의 위협을 평가하고 공동 대응을 조정하기 위한 EU 대표들의 통합 정치적 위기 대응 회의를 앞두고 48시간 동안 대부분의 금지 조치를 취했다.[265][266]

세계의 많은 나라들은 영국으로부터의 승객 여행에 제한을 가했다; 이웃 프랑스 또한 유인 화물 운송을 제한했다. (시험 프로토콜을 고안하기 전에 전면 금지령을 내리고 그들의 통과를 한 번 더 허용했다.)[267]일부는 또한 다른 나라로부터의 여행에 제한을 가했다.[268][269][270][271]2020년 12월 21일 현재, 최소 42개국이 영국으로부터의 비행을 제한했고,[264] 일본은 새로운 변종 사례가 영국에서 발견된 후 모든 외국인의 입국을 제한하고 있다.[272]

여행 금지의 유용성은 변종이 이미 도래했을 가능성이 높은 경우, 특히 바이러스의 주당 추정 성장률이 현지에서 더 높은 경우에서 제한적으로 논쟁되어 왔다.[273][274]

참고 항목

메모들

  1. ^ GISAID와[275] ECDC가 VUI 202012/01([276]조사 대상 변수, 2020년, 12개월, 변형 01)로 작성.
  2. ^ 둘의 차이는 PHE에 의해 설명된다.

    SARS-CoV-2 변종은 역학, 면역학 또는 병원성 성질에 관련된 것으로 간주되는 경우 정식 조사를 위해 제기된다.이 시점에서 그들은 1년, 월 및 숫자를 가진 VUI(Variant Under Investigation, VUI)로 지정된다.관련 전문가 위원회와 함께 위험 평가를 수행한 후 VOC(Variant of Concern)로 지정할 수 있다.[14]
  3. ^ a b SARS-CoV-2의 S 유전자는 그것의 스파이크 단백질을 암호화한다.[43]
  4. ^ 이것의 예는 델타 (Δ)–이다.PCR test, which in connection to SARS-CoV-2, has been used to detect the HV 69–70 deletion in variants with this mutation[78] through what has been named "spike-gene target failure" (SGTF) or "spike-gene drop out"[70] for the spike (S) gene[c] in a subset of RT-PCR assays (e.g., TaqPath COVID-19 RT-PCR assay, ThermoFisher).[79]SARS-CoV-2의 다른 몇몇 변종에도 존재하지만,[70] 스파이크 단백질의 HV 69–70 삭제는 B.1.1.7 게놈의 대부분에 존재하며, 이는 델타-PCR 시험을 계통의 대리 시험으로 사용하거나, 전체 유전체 염기서열을 수행하기 전에 보충하는 1차 선별 시험으로 사용할 수 있게 한다.[78][70]
    특정 변형을 검출하기 위한 RT-PCR 테스트의 또 다른 예는 N501Y 돌연변이(예: 알파, 감마 변종 및 베타 변종)가 있는 모든 게놈을 검출하는 것이다. 현재 이 테스트는 여러 연구소/국가의 게놈 염기서열 분석(예: 프랑스의 일부 지역)에 앞서 1단계 검사 도구로도 사용되고 있다.[80]
    특정 변형을 감지하기 위한 세 번째 및 네 번째 RT-PCR 테스트는 각각 N501Y+로 샘플의 변형을 미리 스크린화한다.A570D 돌연변이 없는 A570D 돌연변이(Alpha) 및 N501Y(베타, 감마 및 기타 N501Y 변종)[81]
  5. ^ 104 WHO 회원국은 2021년 3월 23일 현재 알파 변종(연령 B.1.1.7)의 검출 사실을 보고하였다. Albania, Angola, Argentina, Australia, Austria, Azerbaijan, Bahrain, Bangladesh, Barbados, Belarus, Belgium, Belize, Bosnia and Herzegovina, Brazil, Brunei Darussalam, Bulgaria, Cabo Verde, Cambodia, Canada, Chile, China, Costa Rica, Croatia, Cyprus, Czech Republic, Democratic Republic of the Congo, Denmark, Dominican Republic, Ecuador, Estonia, Finland, France, Gambia, Georgia, Germany, Ghana, Greece, Hungary, Iceland, India, Indonesia, Iran, Iraq, Ireland, Israel, Italy, Jamaica, Japan, Jordan, Kenya, Kuwait, Latvia, Lebanon, Libya, Lithuania, Luxembourg, Malaysia, Malta, Mauritania, Mauritius, Mexico, Monaco, Montenegro, Morocco, Nepal, Netherlands, New Zealand, Nigeria, North Macedonia,Norway, Oman, Pakistan, Peru, Philippines, Poland, Portugal, Republic of Korea (South Korea), Republic of Moldova, Romania, Russia, Rwanda, Saint Lucia, Saudi Arabia, Senegal, Serbia, Singapore, Slovakia, Slovenia, South Africa, Spain, Sri Lanka, Sweden, Switzerland, Thailand, Trinidad and Tobago, Tunisia, Turkey, Ukraine, United Arab Emirates, UnIted Kingdom, 미국, 우루과이, 우즈베키스탄, 베트남.[82]

    WHO 회원 90명은 2021년 3월 23일 현재 알파 변종(연령 B.1.1.7)의 검출 사실을 보고하지 않았다. Afghanistan, Algeria, Andorra, Antigua and Barbuda, Armenia, Bahamas, Benin, Bhutan, Bolivia, Botswana, Burkina Faso, Burundi, Cameroon, Central African Republic, Chad, Colombia, Comoros, Congo, Cook Islands, Côte d'Ivoire, Cuba, Democratic People's Republic of Korea (North Korea), Djibouti, Dominica, Egypt, El Salvador, Equatorial Guinea, Eritrea,Ethiopia, Fiji, Gabon, Grenada, Guatemala, Guinea-Bissau, Guyana, Haiti, Honduras, Guinea, Kazakhstan, Kiribati, Kyrgyzstan, Lao People's Democratic Republic, Lesotho, Liberia, Madagascar, Malawi, Maldives, Mali, Marshall Islands, Micronesia, Mongolia, Mozambique, Myanmar, Namibia, Nauru, Nicaragua, Niger, Niue, Palau, Panama, Papua New Guinea, Paraguay, Qatar, Saint Kitts and Nevis, Saint Vincent and the Grenadines, Samoa, San Marino, Sao Tome and Principe, Seychelles, Sierra Leone, Solomon Islands, Somalia, South Sudan, Sudan, Suriname, Swaziland, Syrian Arab Republic, Tajikistan, Timor-Leste, Togo, Tonga, Turkmenistan, Tuvalu, Uganda, United Republic of Tanzania, Vanuatu, Venezuela, YemeN, 잠비아, 짐바브웨.[82]
  6. ^ a b c d e f g h 영국의 주간 영국 감염 조사 목록은 SGTF의 원시 데이터 및 평균 흡연 모델 데이터를 분석한 것으로, 민간 가정(병원, 관리 센터 및 공공 기관의 테스트 제외)에서 수집된 PCR 테스트를 분석했다.원시 데이터는 물론 웨일스, 북아일랜드, 스코틀랜드의 모델 데이터는 수집된 샘플 수가 적어 데이터 불확실성이 커 주의해야 한다.[158][159]
    • 모든 PCR 테스트는 코로나바이러스 내에 존재하는 N단백질, S단백질, ORF1ab의 3가지 유전자에 대해 분석되었다(감염 조사의 표6A 참조).각각의 PCR 테스트는 하나, 둘 또는 세 개의 유전자를 모두 검출할 수 있다.코로나바이러스 양성(Coronavirus positive)은 이러한 유전자 중 하나 이상이 면봉에서 검출되는 것을 말한다(S-gene에서만 양성인 검사는 제외하며, 단독으로 발견되면 바이러스의 신뢰할 수 있는 지표로 간주되지 않는다).COVID-19의 새로운 B.1.1.7 변종은 S 유전자의 유전적 변화를 가지고 있는데, 이는 현재 시험에서 S-gene이 더 이상 검출되지 않게 되며, 이는 ORF1ab과 N 유전자에서만 양성이 된다는 것을 의미한다.이 조사에서는 ORF1ab + N 단백질 유전자 양성에 대해 "New UK 변종 양립 가능", ORF1ab + N 단백질 + S 단백질 유전자 양성에 대해 "New UK 변종과 호환되지 않음", 다른 모든 유전자 패턴에 대해 "너무 낮은 바이러스"라는 용어를 사용한다(COVID-19 질환의 첫 단계부터 모든 샘플을 채취한 것을 고려할 때 합리적인 정의).재 바이러스는 식별 가능한 양으로 존재하며, "ORF1ab+N" 또는 "ORF1ab+N+S"로 양성이 된다.그러나 모든 "새로운 영국 변종 호환" SGTF 사례(ORF1ab 및 N-genes에서 양성이지만 S-gene은 아님)가 새로운 영국 변종이 될 수 없다는 점에서 추가적인 불확실성이 존재한다. 일부 다른 경쟁 변종도 이와 동일한 시험 패턴을 전달하기 때문에 2020년 11월 중순 이전 데이터는 변종의 지표로 읽혀서는 안 된다.아예[158][159]
    • 주간 B.1.1.7 변종 공유 원시 데이터는 "ORF1ab+N" 백분율을 "ORF1ab+N"과 "ORF1ab+N+S" 백분율로 나누어 표 6A에서 계산한다.표 6C는 표 6A의 원시 데이터를 "새로운 영국 변종 호환 바이러스" 또는 "새로운 영국 변종 바이러스와 호환되지 않음" 또는 "신규 식별이 불가능한 바이러스"에 의해 양성 코로나바이러스인 모집단의 각 백분율에 대한 모델링(평균-스무팅 및 가중) 일일 추정 수치를 계산하기 위한 입력값으로 활용했다."2020년 이전 날짜의 데이터도 감염 조사의 이전 버전을 다운로드할 때 사용할 수 있다."이 표에서 값(m: %)으로 명시된 알파 변종에 대한 모델링된 주간 평균 값은 "새로운 영국 변종 호환 비율"과 "새로운 영국 변종 호환 비율"의 합으로 나눈 "새로운 영국 변종 호환 비율"의 각 주 7일 동안의 평균으로 계산된다.[158][159]
  7. ^ a b c d e f g h i j 오스트리아에서 열거된 B.1.1.7 변종 주식은 게놈 염기서열 분석을 통해 B.1.1.7로 확인되는 모든 양성 COVID-19 시험의 비율을 나타낸다.그러나, 많은 N501Y 양성 RT-PCR 테스트는 게놈 염기서열에 의해 추가로 결정된 변종이 아니었으며, 만약 게놈 염기서열 분석이 수행되었다면 그러한 테스트의 대부분에 대해 B.1.7 양성 결과를 반환했을 가능성이 높다.If all N501Y positive tests had been analysed further by genome sequencing, then the listed weekly B.1.1.7 shares could have been uptil: 9.6% for week 1 (2.4% higher), 23.8% for week 2 (6.4% higher), 19.6% for week 3 (4.9% higher), 28.6% for week 4 (6.1% higher), 37.2% for week 5 (8.5% higher), 45.4% for week 6 (21.4% higher), 58.1% for week 7 (230.0%, 8주 65.3%(4.0%), 9주 68.0%(6.8%), 10주 73.7%(25.4%) 등이었다.[120]
  8. ^ 스웨덴의 경우, 4주 동안 전국 모든 사스-CoV-2–양성 PCR 표본의 11%로 구성된 연구에서 B.1.1.7 점유율이 10.8%(243/2244명)로 나타났다.그러나 표본은 스웨덴 전체의 인구통계학과 지리에 통계적으로 대표되는 것으로 간주되지 않았던 남부 5개 지역(스킨, 베스트라 괴탈란드, 베스트만랜드, 게블보그, 외레브로)에서만 채취되었다.국가당국은 2021년 2월 이후 몇 주간 더 많은 지역을 대상으로 주간연구를 확대할 계획이다.[167][127]
  9. ^ 스웨덴의 경우, 5주 동안 전국 모든 사스-CoV-2–양성 PCR 표본의 16%로 구성된 연구에서 B.1.1.7 점유율이 15.1%(488/3224)로 나타났다.그러나 표본은 스웨덴 전체의 인구통계학과 지리에 통계적으로 대표되는 것으로 간주되지 않았던 남부 5개 지역(스킨, 베스트라 괴탈란드, 베스트만랜드, 게블보그, 외레브로)에서만 채취되었다.국가 당국도 21개 지역 중 19개 지역에 대해 2주 평균(5+6)을 산출했으며, 2021년 2월 이후 1주간 더 많은 지역을 대상으로 주간연구를 확대할 계획이다.[127]
  10. ^ 스웨덴의 경우 6주 동안 전국 모든 사스-CoV-2–양성 PCR 표본의 18%로 구성된 연구에서 B.1.1.7 점유율이 27.3%(1021/3742)로 나타났다.그러나 표본은 스웨덴 전체의 인구통계학과 지리에 통계적으로 대표되는 것으로 간주되지 않았던 남부 5개 지역(스킨, 베스트라 괴탈란드, 베스트만랜드, 게블보그, 외레브로)에서만 채취되었다.국가 당국도 21개 지역 중 19개 지역에 대해 2주 평균(5+6)을 산출했으며, 2021년 2월 이후 1주간 더 많은 지역을 대상으로 주간연구를 확대할 계획이다.[127]
  11. ^ In Sweden, a study comprising 47.8% of all SARS-CoV-2–positive PCR samples nationwide for week 7, collected samples from 19 out of 21 regions (all except Gotland and Västerbotten), and found the B.1.1.7 share to be 30.4% (3316/10910) as a simple overall average (with a potential geographically skewed misrepresentation in the calculation as no data전체 표본의 각 영역 점유율을 정규화/수정하기 위해 가중치를 사용했다.)[81]
  12. ^ In Sweden, a study comprising 42.2% of all SARS-CoV-2–positive PCR samples nationwide for week 8, collected samples from 19 out of 21 regions (all except Gotland and Västerbotten), and found the B.1.1.7 share to be 41.5% (4643/11191) as a simple overall average (with a potential geographically skewed misrepresentation in the calculation as no data전체 표본의 각 영역 점유율을 정규화/수정하기 위해 가중치를 사용했다.)[81]
  13. ^ In Sweden, a study comprising 37.8% of all SARS-CoV-2–positive PCR samples nationwide for week 9, collected samples from 17 out of 21 regions (all except Gotland, Västerbotten, Norrbotten and Östergötland), and found the B.1.1.7 share to be 56.4% (5939/10528) as a simple overall average (with a potential geographically skewed misrepresentation in t전체 표본의 각 영역 점유율을 정규화/수정하기 위해 데이터 가중치를 사용하지 않았기 때문에 그는 계산한다.[81]
  14. ^ In Sweden, a study comprising 43.1% of all SARS-CoV-2–positive PCR samples nationwide for week 10, collected samples from 18 out of 21 regions (all except Gotland, Västerbotten and Östergötland), and found the B.1.1.7 share to be 71.3% (8850/12417) as a simple overall average (with a potential geographically skewed misrepresentation in the calculat전체 표본의 각 영역 점유율을 정규화/수정하기 위해 데이터 가중치를 사용하지 않았기 때문에 이온).[81]

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