문제의 변종

Variant of concern
사스-코브-2, COVID-19를 일으키는 바이러스

The term variant of concern (VOC) for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2, which causes COVID-19) is a category used for variants of the virus where mutations in their spike protein receptor binding domain (RBD) substantially increase binding affinity (e.g., N501Y) in RBD-hACE2 complex (genetic data), while also being linked인구에 급속한 확산([1]위험 데이터).

그 전에, 신흥 변종에게는 "관심 변종"이라는 딱지가 붙었을지도 모른다.[2]"관심 요인"으로 평가되는 동안 또는 이후에 이 변형은 일반적으로 PANGOLIN 명명 시스템의[3] 계통 및 넥스트스트스트레인[4] 및 GISAID[5] 시스템 내의 계통에 할당된다.

COVID-19 대유행 동안, 사스-CoV-2 바이러스는 변이하는 것으로 관찰되었고, 특정 지점 돌연변이의 특정 조합은 다른 것들보다 더 중요한 것으로 판명되었다.[6]이것은 주로 전염성과 맹독성의 이유와 탈출 돌연변이의 출현 가능성에 관한 것이기도 했다.

기준

Several national and international health organisations (e.g. Centers for Disease Control and Prevention (CDC) (US), Public Health England (PHE) and the COVID-19 Genomics UK Consortium for the UK, and the Canadian COVID Genomics Network (CanCOGeN)) use some or all of the following criteria to assess variants:[7][8]

  • 투과력 증가
  • 질병성 증가
  • 사망률 증가
  • "긴 COVID" 위험 증가
  • 진단 테스트에 의한 탐지 회피 기능
  • 항바이러스 약물에 대한 민감도 감소(해당 약물이 사용 가능한 경우 및 사용 가능한 경우)
  • 치료용(예: 회복성 플라즈마 또는 단일클론 항체) 또는 실험실 실험에서 항체를 중화시킬 민감성 감소
  • 자연 면역 회피 능력(예: 재감정 유발)
  • 예방접종 대상자를 감염시키는 능력
  • 다계통 염증 증후군 또는 장거리 COVID와 같은 특정 조건의 위험 증가.
  • 아동이나 면역 촉진 개인과 같은 특정 인구통계학적 또는 임상 그룹에 대한 친화력 증가.

이러한 기준 중 하나 이상을 충족하는 것으로 보이는 변종에는 이러한 속성의 검증 및 유효성 검사가 보류되는 동안 "관심 변수" 또는 "조사 중인 변수"('VUI')라는 라벨이 표시될 수 있다.일단 유효성이 확인되면 CDC와 같은 모니터링 조직에 의해 관심 /VUI의 명칭이 "관심 요소"로 변경될 수 있다.[2][6][9]관련 범주는 특정 변종에 대한 예방 또는 개입 조치의 효과가 실질적으로 감소한다는 명백한 증거가 있는 경우 CDC가 사용하는 "높은 결과의 변수"이다.[10]

국가별 분류

세계보건기구

세계보건기구는 전 세계적인 관심사 목록을 유지하고 있다.[11]WHO는 2021년 11월 26일 이전에 B.1.1.529로 알려진 다섯 번째 우려 변종인 오미크론 변종을 추가했다.[12]오미크론은 알파, 베타, 감마, 델타 변형에 합류한다.

아프리카

남아공의 NICD는 KRISP와 협력하여 현지에서 변형 및 테스트 시설의 목록을 관리하고 있다.[13][14]

유럽

유럽질병예방통제센터는 2021년 11월 말 현재 베타, 감마, 델타, B.1.1.529(참조 내용이 업데이트된 후 '오미크론'이라는 명칭) 등 4가지 변형을 '관심 요소'로 선언했다.Mu, Lambda, AY.4.2는 VOI(관심 변종)로 명명되었고, 9개의 '감시 중인 변종'이 있었다.25개의 변형이 'de-decific'[15]으로 설명되었다.

영국

2021년 11월 말 현재 영국은 '관찰대상'에 15개 변종이 있으며, 4개 변종이 'VOC' 지위에 있으며 11개 등급이 'VUI'로 평가되고 있다.'VOC'로 지정된 이들은 알파, 베타, 감마, 델타였다.2021년 12월 초에는 오미크론이 VOCs에 추가되었다.조사 중인 변형으로는 'VUI-21OCT-01/A'가 있다.Y 4.2'.[16]

북아메리카

캐나다 ('health-infobase.canada.ca'[17]을 통해)와 미국 (CDC를 통해)[18] 또한 다양한 관심사 목록을 유지하고 있다.12월 초 현재 캐나다는 다음과 같은 5가지 종류의 우려사항을 모니터링하고 있다.미국은 알파, 베타, 감마, 델타, 오미크론 두 가지를 감시하고 있었다.델타와 오미크론.[19]

참조

  1. ^ Shahhosseini, Nariman; Babuadze, George (Giorgi); Wong, Gary; Kobinger, Gary P. (May 2021). "Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS-CoV-2 Variants of Concern". Microorganisms. 9 (5): 926. doi:10.3390/microorganisms9050926. PMC 8146828. PMID 33925854.
  2. ^ a b "Variants: distribution of cases data". GOV.UK. 28 January 2021. At "Differences between a Variant of Concern and Variant Under Investigation". Retrieved 19 February 2021. SARS-CoV-2 variants, if considered to have concerning epidemiological, immunological, or pathogenic properties, are raised for formal investigation. At this point they are designated Variant Under Investigation (VUI) with a year, month, and number. Following a risk assessment with the relevant expert committee, they may be designated Variant of Concern (VOC)
  3. ^ Rambaut, A.; Holmes, E.C.; O’Toole, Á.; et al. (2020). "A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology". Nature Microbiology. 5 (11): 1403–1407. doi:10.1038/s41564-020-0770-5. PMC 7610519. PMID 32669681. S2CID 220544096.
  4. ^ Bedford, Trevor; Hodcroft, Emma B; Neher, Richard A (6 January 2021). "Updated Nextstrain SARS-CoV-2 clade naming strategy". nextstrain.org/blog. Retrieved 19 January 2021.
  5. ^ "clade tree (from 'Clade and lineage nomenclature')". www.gisaid.org. 4 July 2020. Retrieved 7 January 2021.
  6. ^ a b Griffiths, Emma; Tanner, Jennifer; Knox, Natalie; Hsiao, Will; Van Domselaar, Gary (15 January 2021). "CanCOGeN Interim Recommendations for Naming, Identifying, and Reporting SARS-CoV-2 Variants of Concern" (PDF). CanCOGeN (nccid.ca). Retrieved 25 February 2021.
  7. ^ Contributor, IDSA (2 February 2021). "COVID "Mega-variant" and eight criteria for a template to assess all variants". Science Speaks: Global ID News. Retrieved 20 February 2021. {{cite web}}: last=일반 이름 포함(도움말)
  8. ^ CDC (11 February 2020). "Emerging SARS-CoV-2 Variants". Centers for Disease Control and Prevention. Retrieved 4 January 2021. Public Domain 이 글은 공개 도메인에 있는 이 출처의 텍스트를 통합한다..
  9. ^ 영국의 SARS-CoV-2 변종 우려 조사기술 브리핑 6 2021년 2월 13일 (섹션 참조):영국 내 변종 명칭, P.3) assets.publishing.service.gov.uk, 2021년 2월 27일 접속
  10. ^ CDC (11 February 2020). "Cases, Data, and Surveillance". Centers for Disease Control and Prevention. Retrieved 16 March 2021.
  11. ^ "Tracking SARS-CoV-2 variants". www.who.int. Retrieved 28 November 2021.
  12. ^ "Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern". World Health Organization. Retrieved 28 November 2021.
  13. ^ "New COVID-19 variant detected in South Africa". NICD. 25 November 2021. Retrieved 29 November 2021.
  14. ^ "Kwazulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform". www.krisp.org.za. Retrieved 29 November 2021.
  15. ^ SARS-CoV-2 변종 우려 2021년 11월 26일 www.ecdc.europa.eu 접속 2021년 11월 27일
  16. ^ 문제 유형 또는 조사 대상: 2021년 11월 24일까지 데이터 업데이트 2021년 11월 26일, www.gov.uk, 2021년 11월 27일 액세스
  17. ^ COVID-19 일일 역학 업데이트 2021년 5월 12일 health-infobase.canada.ca에서 2021년 5월 13일 액세스
  18. ^ "SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions". Centers for Disease Control and Prevention. 11 February 2020. Retrieved 30 April 2021.
  19. ^ SARS-CoV-2 변종 분류 및 정의 2021년 12월 1일 www.cdc.gov, 2021년 12월 7일 접속