사스-CoV-2 엡실론 변종
SARS-CoV-2 Epsilon variant
CAL.20C라고도 하며 두 PANGO 계열 B.1.427과 B.1.429를 가리키는 엡실론 변종은 COVID-19를 일으키는 바이러스인 사스-CoV-2의 변형 중 하나이다.2020년 7월 미국 캘리포니아에서 처음 검출됐다.[1]
2021년 7월 현재 엡실론은 더 이상 WHO의 관심 변종으로 간주되지 않는다.[2]
돌연변이
그 변종의 L452R(이전에 또한 다른 관련이 없는 혈통이)특별한 관심사의 5정의하는 돌연변이(I4205V과 D1183Y은 ORF1ab 유전자의, 그리고 S13I, W152C, L452R는 뾰족한 단백질의 S-gene에)[3]다.[4]B.1.429 어쩌면 더 이전의 변형 지역적으로 순환보닸으나 그 이상의 공부는 필요한 정확 전염될 것o 이것을 확인하다.[4]질병관리본부(CDC)는 B.1.429와 관련 B.1.427을 '관심요인'으로 등재하고, 바이러스 투과율이 20%가량 증가해 '일부에서는 중화에 중대한 영향을 미치지만 전부는 아니다'는 내용의 사전 인쇄물을 인용했다.(EUA) 식품의약품안전청(FDA)이 COVID-19의 치료나 예방을 위해, 이전에 바이러스에 감염되었거나 바이러스에 대항한 백신을 접종한 사람이 채집한 혈장으로 중성화를 적당히 줄인다.[5][6]2021년 5월 세계보건기구(WHO)는 변종에게 '엡실론 변종'[7]이라는 새로운 이름을 부여했다.
SARS-CoV-2 엡실론 변종의 아미노산 돌연변이는 SARS-CoV-2의 게놈 지도에 표시되며 스파이크에 초점을 맞춘다.[8]
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역사
엡실론(CAL.20C)은 COVID-19 전염병이 시작된 이래 로스앤젤레스 카운티에서 채취한 1,230여 개의 바이러스 샘플 중 하나에서 캘리포니아 주 시더스-시나이 메디컬 센터의 연구원들이 2020년 7월 처음 관찰한 것이다.[1]캘리포니아에서 샘플 중 다시 등장한 9월까지는 다시 검출되지 않았지만 11월까지 수치는 매우 낮은 수준을 유지했다.[9][10]2020년 11월 시다스-시나이 메디컬 센터에서 채취한 시료의 36%를 엡실론 변종이 차지했고, 2021년 1월까지 엡실론 변종이 시료의 50%를 차지했다.[4]캘리포니아대, 샌프란시스코, 캘리포니아 공중보건학과, 산타클라라 카운티 공중보건과의 공동 보도자료에서, 이 변종은 북부 캘리포니아의 여러 카운티에서도 검출되었다고 발표되었다.[11]2020년 11월부터 12월까지 북부 캘리포니아에서 서열 처리된 사례에서 변종 발생 빈도가 3%에서 25%[12]로 증가했다.사전 인쇄에서 CAL.20C는 Nextstrain clade 20C에 속하며 샘플의 약 36%를 기여하는 것으로 설명되는 반면, 20G clade의 신흥 변종은 Southern California에 초점을 맞춘 연구에서 샘플의 약 24%를 차지한다.그러나 미국 전체에서는 2021년 1월 현재 20G 클래드가 우세하다는 점에 유의하십시오.캘리포니아의 증가하는 엡실론의 뒤를 이어, 이 변종은 대부분의 미국 주에서 다양한 주파수에서 감지되었다.북아메리카의 다른 나라들과 유럽, 아시아, 호주에서 적은 숫자들이 감지되었다.[9][10]GISAID에 따르면 2021년 7월 현재 45개국에서 엡실론 변종이 검출됐다.[13]초기 증가 후, 그것의 주파수는 2021년 2월에 비해 급격히 감소했는데, 그것은 더 투과 가능한 알파 변종에 의해 경쟁되고 있었기 때문이다.4월에 엡실론은 북부 캘리포니아의 일부 지역에서 비교적 빈번하게 남아 있었지만, 사실상 주 남부에서 사라졌고 다른 곳에서는 거점을 세울 수 없었다. 미국의 모든 사례의 3.2%만이 엡실론인 반면, 그 때까지 2/3 이상이 알파인이었다.[14]
통계
| 나라 | 확정사례(GISAID)[15] 2021년 7월 1일 현재 | 마지막으로 보고된 사례 | |
|---|---|---|---|
 USA | 50,723 | 2021년 6월 23일 | |
 멕시코 | 474 | 2021년 6월 8일 | |
 캐나다 | 326 | 2021년 5월 7일 | |
 대한민국 | 103 | 2021년 4월 26일 | |
 아루바 | 57 | 2021년 4월 24일 | |
 덴마크 | 37 | 2021년 3월 22일 | |
 몰디브 | 36 | 2021년 5월 7일 | |
 칠레 | 30 | 2021년 6월 7일 | |
 아르헨티나 | 28 | 2021년 5월 12일 | |
 영국 | 21 | 2021년 5월 10일 | |
 일본 | 20 | 2021년 4월 16일 | |
 오스트레일리아 | 20 | 2021년 4월 12일 | |
 코스타리카 | 12 | 2021년 5월 5일 | |
 독일 | 10 | 2021년 6월 8일 | |
 이스라엘 | 10 | 2021년 2월 25일 | |
 괌 | 8 | 2021년 3월 27일 | |
 타이완 | 8 | 2021년 1월 31일 | |
 과테말라 | 7 | ||
 프랑스 | 7 | 2021년 3월 1일 | |
 아일랜드 | 7 | 2021년 4월 28일 | |
 네덜란드 | 5 | 2021년 3월 10일 | |
 스페인 | 5 | 2021년 6월 3일 | |
 뉴질랜드 | 4 | 2020년 12월 28일 | |
 싱가포르 | 4 | 2021년 3월 27일 | |
 스위스 | 4 | 2021년 3월 1일 | |
 카메룬 | 3 | 2021년 2월 05일 | |
| 과들루프 | 3 | 2021년 1월 30일 | |
 노르웨이 | 3 | 2021년 4월 12일 | |
 캄보디아 | 2 | 2021년 1월 20일 | |
 핀란드 | 2 | 2021년 2월 6일 | |
 이탈리아 | 2 | 2021년 2월 11일 | |
 페루 | 2 | 2021년 2월 24일 | |
 스웨덴 | 2 | 2021년 1월 28일 | |
 터키 | 2 | 2021년 2월 11일 | |
 터키 카이코스 제도 | 2 | 2021년 3월 22일 | |
 콜롬비아 | 2 | 2021년 1월 8일 | |
 앵귈라 | 1 | 2021년 3월 19일 | |
 앤티가 바부다 | 1 | 2021년 4월 24일 | |
 바베이도스 | 1 | 2021년 4월 12일 | |
 벨기에 | 1 | 2021년 1월 18일 | |
 영국령 버진아일랜드 | 1 | 2021년 1월 7일 | |
 쿠라카오 | 1 | 2021년 3월 19일 | |
 인도 | 1 | 2021년 3월 2일 | |
 북마케도니아 | 1 | 2021년 1월 26일 | |
 북마리아나 제도 | 1 | 2021년 1월 16일 | |
 신트 마텐 | 1 | 2021년 2월 16일 | |
 도미니카 공화국 | 1 | ||
| 세계(46개국) | 합계: 51,966 | 2021년 7월 1일 기준 총계 |
참고 항목
참조
- ^ a b "Local COVID-19 Strain Found in Over One-Third of Los Angeles Patients". news wise (Press release). California: Cedars Sinai Medical Center. January 19, 2021. Retrieved March 3, 2021.
- ^ "Tracking SARS-CoV-2 variants". who.int. World Health Organization.
{{cite web}}: CS1 maint : url-status (링크) - ^ 스파이크 변형: Epsilon, 일명 B.1.427/B.1.429 및 CAL.20C/S:452R covdb.stanford.edu, 2021년 7월 3일에 액세스
- ^ a b c "New California Variant May Be Driving Virus Surge There, Study Suggests". The New York Times. January 19, 2021.
- ^ "SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions". CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. March 24, 2021. Retrieved April 4, 2021.
- ^ Shen X, Tang H, Pajon R, Smith G, Glenn GM, Shi W, et al. (April 2021). "Neutralization of SARS-CoV-2 Variants B.1.429 and B.1.351". The New England Journal of Medicine. 384 (24): 2352–2354. doi:10.1056/NEJMc2103740. PMC 8063884. PMID 33826819.
- ^ Helen Branswell 코로나바이러스 변종의 네임게임은 2021년 5월 31일 www.statnews.com에 접속되어 2021년 6월 28일에 접속되었다.
- ^ "Spike Variants: Epsilon variant, aka B.1.427/B.1.429". covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database. July 1, 2021. Retrieved July 5, 2021.
- ^ a b "B.1.429". Rambaut Group, University of Edinburgh. PANGO Lineages. February 15, 2021. Retrieved February 16, 2021.
- ^ a b "B.1.429 Lineage Report". Scripps Research. outbreak.info. February 15, 2021. Retrieved February 16, 2021.
- ^ "COVID-19 Variant First Found in Other Countries and States Now Seen More Frequently in California". California Department of Public Health. Retrieved January 30, 2021.
- ^ Weise E, Weintraub K. "New strains of COVID swiftly moving through the US need careful watch, scientists say". USA Today. Retrieved January 30, 2021.
- ^ "Watching the new Epsilon variant of SARS-CoV-2". Healthcare Purchasing News. Retrieved September 12, 2021.
According to GISAID, 45 countries, from US to South Korea, from India to Japan have reported Epsilon variant cases.
- ^ Zimmer, Carl; Mandavilli, Apoorva (May 14, 2021). "How the United States Beat the Variants, for Now". New York Times. Archived from the original on December 28, 2021. Retrieved May 17, 2021.
- ^ "GISAID - hCov19 Variants". www.gisaid.org. Retrieved July 2, 2021.
