RmYN02

RmYN02
RmYN02
바이러스 분류 e
(랭킹되지 않음): 바이러스
영역: 리보비리아
킹덤: 오르토나비라과
망울: 피수비리코타
클래스: 피소니비리케테스
순서: 니도비라목
패밀리: 코로나비루스과
속: 베타코로나바이러스
하위 게놈: 사르베코바이러스
종:
중증급성호흡기증후군 관련 코로나바이러스
변형률:
RmYN02

RmYN02는 박쥐에서 파생된 중증 급성 호흡기 증후군 관련 코로나바이러스 변종이다.중국 윈난성 멘글라 현의 유적에서 2019년 5월부터 10월 사이에 채취한 박쥐 배설물에서 발견됐다.COVID-19를 유발하는 바이러스 변종인 사스-CoV-2와 가장 가까운 친척으로 전체 바이러스 게놈 규모에서 93.3%의 뉴클레오티드 정체성을 공유하고 있다.RmYN02에는 SARS-CoV-2와 유사한 S1/S2 분할 부위의 삽입이 들어 있어 이러한 삽입 이벤트가 자연스럽게 발생할 수 있음을 시사한다.[1]

유전학

사스-CoV-2와 93.3%의 게놈을 공유하고 있다.RmYN02는 1ab의 SARS-CoV-2와 97.2% 동일했다.RmYN02는 S유전자에서 SARS-CoV-2에 비해 뉴클레오티드가 71.8%, 아미노산이 97.4%로 RaTG13과 SARS-CoV-2 사이의 아미노산 정체성이 97.4%로 나타났다.모든 유전 데이터는 웨이펑시와 그의 팀에 의해 발견되었다.[1]

디스커버리

RmYN02는 앨리스 C교수가 윈난에서 2019년 5월부터 7월 사이에 수집한 것이다.시샹반나 열대식물원의 휴즈, 산둥의대 웨이펑시가 시샹반나 열대식물원에서 근거리 내에 중국 윈난성 멘글라 현에서 채취한 227마리의 박쥐로부터 채취한 배설물 샘플 302개를 분석한 결과, 이 시황반나 열대식물원에서 근거리에서 채취한 배설물 샘플 302개를 분석하였다.[1]게놈 자체는 11개의 표본으로 이루어진 풀에서 조립되었다.


SARS-CoV-2 및 관련 코로나비루스의 유전적 순서에 기초한 계통생성 트리는 다음과 같다.[2][3]

SARS-CoV‑2 관련 코로나바이러스

(bat) Rc-o319, 일본[4] 이와테시 리놀로푸스 코르누투스 SARS-CoV-2에 81%

Bat SL-ZXC21, 88% SARS-CoV-2, 리놀로푸스푸실러스, 저우산, 저장성[5]

Bat SL-ZC45, SARS-CoV-2, 리놀로푸스푸실러스 88% 저장성[5] 저우산

판골린[6] 사스르-코브-GX 89% 마니스 자바니카 사스-코브-2에 89%

판골린 사스르-코브-GD 91% 마니스 자바니카 사스-코브-2로 동남아에서[7] 밀반입

Bat RshSTT182, 캄보디아[8] Steung Treng, Rinolophus shamely, SARS-CoV-2에 92.6% 사용

Bat RshSTT200, 캄보디아[8] Steung Treng, Rinolophus shamely, SARS-CoV-2에 92.6% 사용

(배트) RacCS203, 91.5% ~ SARS-CoV-2, Rinolophus acuminatus, 태국[3] 차초엥사오

(Bat) RmYN02년, 사스-CoV-2, 리놀로푸스 말라야누스, 멘글라, 윈난성에[9] 93.3%

(배트) RpYN06, 사스-CoV-2, 리놀로푸스푸실러스, 시샹바나, 윈난시[2]

(bat) RaTG13, 사스-CoV-2, 리놀로푸스 아피니스, 모장, 윈난성에 96.1%

사스-코브-2

사스-코브-1, 사스-코브-2에 79%

참고 항목

참조

  1. ^ a b c Zhou, Hong; Chen, Xing; Hu, Tao; Li, Juan; Song, Hao; Liu, Yanran; Wang, Peihan; Liu, Di; Yang, Jing; Holmes, Edward C.; Hughes, Alice C. (June 8, 2020). "A Novel Bat Coronavirus Closely Related to SARS-CoV-2 Contains Natural Insertions at the S1/S2 Cleavage Site of the Spike Protein". Current Biology. 30 (11): 2196–2203.e3. doi:10.1016/j.cub.2020.05.023. ISSN 1879-0445. PMC 7211627. PMID 32416074.
  2. ^ a b Zhou H, Ji J, Chen X, Bi Y, Li J, Wang Q, et al. (June 2021). "Identification of novel bat coronaviruses sheds light on the evolutionary origins of SARS-CoV-2 and related viruses". Cell. 184 (17): 4380–4391.e14. doi:10.1016/j.cell.2021.06.008. PMC 8188299. PMID 34147139.
  3. ^ a b Wacharapluesadee S, Tan CW, Maneeorn P, Duengkae P, Zhu F, Joyjinda Y, et al. (February 2021). "Evidence for SARS-CoV-2 related coronaviruses circulating in bats and pangolins in Southeast Asia". Nature Communications. 12 (1): 972. Bibcode:2021NatCo..12..972W. doi:10.1038/s41467-021-21240-1. PMC 7873279. PMID 33563978.
  4. ^ Murakami S, Kitamura T, Suzuki J, Sato R, Aoi T, Fujii M, et al. (December 2020). "Detection and Characterization of Bat Sarbecovirus Phylogenetically Related to SARS-CoV-2, Japan". Emerging Infectious Diseases. 26 (12): 3025–3029. doi:10.3201/eid2612.203386. PMC 7706965. PMID 33219796.
  5. ^ a b Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y, et al. (June 2020). "A Novel Bat Coronavirus Closely Related to SARS-CoV-2 Contains Natural Insertions at the S1/S2 Cleavage Site of the Spike Protein". Current Biology. 30 (11): 2196–2203.e3. doi:10.1016/j.cub.2020.05.023. PMC 7211627. PMID 32416074.
  6. ^ Lam TT, Jia N, Zhang YW, Shum MH, Jiang JF, Zhu HC, et al. (July 2020). "Identifying SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins". Nature. 583 (7815): 282–285. Bibcode:2020Natur.583..282L. doi:10.1038/s41586-020-2169-0. PMID 32218527. S2CID 214683303.
  7. ^ Liu P, Jiang JZ, Wan XF, Hua Y, Li L, Zhou J, et al. (May 2020). "Are pangolins the intermediate host of the 2019 novel coronavirus (SARS-CoV-2)?". PLOS Pathogens. 16 (5): e1008421. doi:10.1371/journal.ppat.1008421. PMC 7224457. PMID 32407364.
  8. ^ a b Delaune, Deborah; Hul, Vibol; Karlsson, Erik A.; Hassanin, Alexandre; Ou, Tey Putita; Baidaliuk, Artem; Gámbaro, Fabiana; Prot, Matthieu; Tu, Vuong Tan; Chea, Sokha; Keatts, Lucy; Mazet, Jonna; Johnson, Christine K.; Buchy, Philippe; Dussart, Philippe; Goldstein, Tracey; Simon-Lorière, Etienne; Duong, Veasna (9 November 2021). "A novel SARS-CoV-2 related coronavirus in bats from Cambodia". Nature Communications. 12 (1): 6563. doi:10.1038/s41467-021-26809-4. ISSN 2041-1723.
  9. ^ Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y, et al. (June 2020). "A Novel Bat Coronavirus Closely Related to SARS-CoV-2 Contains Natural Insertions at the S1/S2 Cleavage Site of the Spike Protein". Current Biology. 30 (11): 2196–2203.e3. doi:10.1016/j.cub.2020.05.023. PMC 7211627. PMID 32416074.


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