국제 바이러스 분류 위원회

International Committee on Taxonomy of Viruses
국제 바이러스 분류 위원회
Official logo
공식 로고
약어ICTV
포메이션1966; 56년 전 (1996년)
목적바이러스 분류법 규정
필드분류학
바이러스학
대통령(2020–2023)
무릴로 제르비니
부사장(2020~2023년)
스튜어트 시델
모조직
국제미생물학회, 바이러스학 분과
소속미생물학회
웰컴
웹사이트talk.ictvonline.org Edit this at Wikidata

국제바이러스분류위원회(International Cateonomy of Viruss, ICTV)는 바이러스에 대한 분류분류와 명명법을 승인하고 구성한다.[1][2][3]ICTV는 바이러스에 대한 보편적인 분류 체계를 개발했고, 따라서 살아있는 유기체에 영향을 미치는 모든 바이러스를 적절하게 묘사하고 이름을 짓고 분류할 수 있는 수단을 가지고 있다.국제 바이러스 분류 위원회의 회원들은 전문 바이러스학자로 여겨진다.[4]ICTV는 국제미생물학회의 비뇨기과에서 결성되어 관리되고 있다.[5]한 가족 내에서 종의 경계를 구분하는 것과 같은 세부적인 작업은 전형적으로 가족 내 전문가 그룹에 의해 수행된다.[2]

역사

바이러스의 명칭을 표준화하기 위해 1966년 모스크바에서 열린 미생물학 국제회의에서 국제 바이러스 명명 위원회(ICNV)가 설립되었다.[6]ICVN은 1971년에 첫 보고서를 발표했다.[6]척추동물을 감염시키는 바이러스의 경우, 첫 번째 보고서는 19개의 제네라와 2개의 패밀리 그리고 24개의 분류되지 않은 그룹을 포함했다.[citation needed]

ICNV는 1974년에 국제 바이러스 분류 위원회로 이름이 바뀌었다.[6]

조직구조

조직은 임기제 선출 역할을 포함하는 집행위원회와 6개 분과위원회로 나뉘는데, 각 분과위원회는 더 나아가 수많은 '연구회'로 나뉘는데, 각 분과위원회는 각각 의장 1명과 특정 세원의 분류체계(예: 명령어 또는 가족)를 전담하는 가변적인 수의 위원으로 구성된다.이 구조물은 다음과 같이 시각화할 수 있다.[7]

집행위원회
  • 대통령
  • 부사장
  • 비서들
  • 비즈니스 비서
  • 제안서 장관
  • 데이터 비서
  • 의자 – 직위: 6개(소위별 1개)
  • 선출직 위원 – 직위: 8
소위원회
  • 동물 DNA 바이러스 및 레트로바이러스 분과위원회 – 연구 그룹: 18
  • 동물 dsRNA 및 ssRNA 바이러스 분과위원회 – 연구 그룹: 22
  • 동물 ssRNA+ 바이러스 소위원회 – 연구 그룹: 15
  • 세균 및 고고 바이러스 분과위원회 – 연구 그룹: 19
  • 곰팡이 및 양성자 바이러스 소위원회 – 연구 그룹: 11
  • 식물 바이러스 소위원회 – 연구 그룹: 22

목표

국제 바이러스 분류 위원회의 목적은 다음과 같다.

  1. 바이러스에 대한 국제적으로 합의된 분류법을 개발하기 위해서입니다.
  2. 바이러스 세금에 대해 국제적으로 합의된 이름을 정립하기 위해서입니다.
  3. 회의를 개최하고 보고서를 발간하여 바이러스 분류와 명칭에 관한 결정을 바이러스학자에게 전달한다.
  4. 바이러스 taxa의 합의된 이름의 공식 지수를 유지하기 위해서입니다.
  5. 현대 사회의 바이러스 효과와 그들의 행동을 연구하기 위해서입니다.

명명법

ICTV의 바이러스 명명법의 기본 원칙은 다음과 같다.

  • 안정성
  • 오류 또는 혼동을 일으킬 수 있는 이름 사용을 방지하거나 거부하려면
  • 불필요한 이름 생성 방지

ICTV의 보편적 바이러스 분류 체계는 표준 생물 분류 체계의 약간 변형된 버전을 사용한다.그것은 오직 세자의 질서, 가족, 하위 가족, 속, 종만을 인식한다.한 종을 어떻게 속주로 분류할 것인지가 확실치 않지만 한 집단의 분류가 명확할 때, 그것은 그 집단의 미지정 종으로 분류될 것이다.많은 세자는 여전히 서열에서 벗어나지 못하고 있다.또한 2005년 현재 ICTV 보고서에는 설명되지 않는 3,142개의 "종"에 할당된 GenBank 시퀀스도 있다(그러나 GenBank의 작동 방식 때문에 실제 적절한 종의 수는 아마도 상당히 적을 것이다).[2]정체불명의 바이러스 시퀀스 수는 바이러스 시퀀싱 속도가 급격히 증가함에 따라 증가할 것으로 예상된다.[2]

ICTV는 1962년 창설된 이래 안정성에 현저하게 성공했다.예를 들어, 1980년대에 인정된 모든 속과 가족은 2005년 현재 계속 사용되고 있다.[2]

택사 이름 지정 및 변경

새로운 명칭, 명칭 변경, 택사 설립 및 분류 체계 배치 등에 대한 제안은 제안 형식으로 ICTV 집행위원회가 처리한다.모든 관련 ICTV 분과 위원회와 스터디 그룹은 결정이 내려지기 전에 자문을 받는다.

세자의 이름은 ICTV의 승인을 받기 전까지는 공식적인 지위가 없으며, 승인된 계층적 세자와 연계되어야만 이름이 인정된다.세금에 적합한 명칭이 제안되지 않을 경우, 해당 세원은 승인될 수 있으며, ICTV에 제안되어 수락된 국제 명칭이 채택될 때까지 그 명칭은 결정되지 않은 상태로 남겨질 수 있다.이름은 해당 세원의 정당한 구성원인 바이러스를 배제하거나, 언젠가는 그 세원에 속할 수 있는 멤버를 제외하거나, 다른 세자의 구성원인 바이러스를 포함하는 것처럼 보이는 세자에 대한 의미를 전달해서는 안 된다.

택사규칙

종 이름은 가능한 한 적은 단어로 구성되어야 하지만 숙주 이름과 바이러스라는 단어로만 구성되지 않아야 한다.종 이름은 종에 대한 적절한 명확하지 않은 식별을 제공해야 한다.숫자, 문자 또는 그 조합은 이미 널리 사용되고 있는 종별 표식으로 사용될 수 있다.그러나 새로 지정된 일련번호, 문자 또는 그 조합만으로는 종의 형상으로만 사용할 수 없다.숫자 또는 문자 시리즈가 존재한다면 계속 이어질 수 있다.

제네라

바이러스 속은 일부 유의한 속성을 공유하고 종종 숙주 범위와 맹독성만 다른 관련 종의 그룹이다.속 이름은 접미사 -바이러스에서 끝나는 단일 단어여야 한다.새로운 속종의 승인은 반드시 유형종의 승인이 수반되어야 한다.

하위 가족

하위 패밀리는 특정 공통 문자를 공유하는 제네라의 그룹이다.세원은 복잡한 계층적 문제를 해결하기 위하여 필요한 경우에만 사용한다.하위 패밀리 이름은 접미사 -virinae로 끝나는 단일 단어여야 한다.

가족들

가족이란 어떤 공통의 문자를 서로 공유하면서 하위 가족으로 구성되든 말든, 제네라의 집단이다.성은 접미사 -virgae에서 끝나는 단어들이어야 한다.

주문

주문은 특정한 공통 캐릭터를 공유하는 가족 그룹이다.주문 이름은 접미사 -virales로 끝나는 단일 단어여야 한다.

하위 바이러스 에이전트에 대한 규칙

바이러스의 분류와 관련된 규칙은 바이로이드의 분류에도 적용된다.viroids의 taxa 공식 엔딩은 종의 viroid, genera의 접미사 -viroide, sub-families의 접미사 -viroidae, 이 taxon이 필요할 경우 -viroidae이다.

레트로트랜스포존은 분류와 명명법에서 바이러스로 간주된다.인공위성과 프리온은 바이러스로 분류되지 않고 특정 분야의 작업자에게 유용한 것으로 보이는 임의의 분류가 할당된다.

맞춤법 규칙

  1. 공식 분류법에서는 바이러스 명령어, 가족, 하위 가족 및 일반의 승인된 이름이 이탤릭체로 인쇄되고 이름의 첫 글자는 대문자로 표시된다.[8]
  2. 종 이름은 이탤릭체로 인쇄되며 첫 글자의 첫 글자를 대문자로 쓴다.다른 말은 고유명사, 또는 고유명사의 일부분이 아니면 자본화되지 않는다.
  3. 공식적 용어의 경우, 분류단위의 용어 앞에 세원의 명칭을 붙여야 한다.

메타게노믹스에 의해 발견된 바이러스의 분류

ICTV는 바이러스 메타게놈노믹스의 중요성을 인정하면서 메타게놈 데이터에서 조립된 게놈들이 실제 바이러스를 나타낸다고 인식하고 고전적인 바이러스학 접근법을 이용해 격리·특성화된 바이러스에 사용되는 게놈과 동일한 절차에 따라 공식 분류를 권장하고 있다.[9][10]

ICTV 보도

ICTV는 1971년(이하 "보고서") 이후 10년에 약 두 차례씩 바이러스 분류 보고서를 발간했다.제9차 ICTV 보고서는 2011년 12월에 발표되었으며,[11] 그 내용은 ICTV 웹사이트를 통해 자유롭게 이용할 수 있다.[12]2017년부터 제10차 ICTV 보고서는 ICTV 웹사이트에[13] 온라인에 게재될 예정이며, 개별 지부가 롤링 방식으로 업데이트되어 무료로 접속할 수 있게 된다.2018 분류법은 온라인에서 이용할 수 있으며,[14] 모든 공인된 종의 다운로드 가능한 엑셀 스프레드시트를 포함한다.

ICTVdb 데이터베이스

ICTVdb는 ICTV 분류 데이터베이스의 동반자 역할을 하기 위해 고안된 종이자 분리 데이터베이스다.ICTVdB의 개발은 1991년부터 ICTV의 지원을 받아 왔으며, 처음에는 분류학 연구에 도움을 주기 위한 것이었다.데이터베이스는 바이러스의 화학적 특성, 게놈 유형, 핵산 복제, 질병, 벡터, 지리적 분포 등을 주로 기준으로 바이러스를 분류한다.

데이터베이스는 호주국립대학교에서 미국 국립과학재단의 지원을 받아 개발되었으며, 미국형 문화전당이 후원하였다.호주 연방과학산업연구기구(CSIRO)에서 개발한 분류학 데이터 교환의 세계 표준인 DELTA(Description Language for Taxonomy, DELTA) 시스템을 사용한다. DETA는 다양한 데이터를 저장하여 전통적인 보고서와 웹 출판물에 적합한 언어로 번역할 수 있다.예를 들어 ICTVdB는 그 자체로 게놈 시퀀스 정보를 포함하고 있지 않지만 DETA 데이터를 NEXX 형식으로 변환할 수 있다.[15]또한 대용량 데이터 입력을 처리할 수 있으며 바이러스 속성, 텍스트 설명 및 이미지의 긴 목록을 컴파일하는 데 적합하다.

ICTVdB는 주요 참고자원과 연구 도구가 될 수 있는 개념과 능력을 키웠다. 1999년에는 호주 국립대학의 주요 사이트와 영국과 미국에 기반을 둔 두 곳의 미러 사이트로부터 하루에 3만 건 이상의 온라인 히트를 받고 있었다.[16]

2011년 ICTV는 ICTVdb 프로젝트와 웹사이트를 중단하기로 결정했다.이 같은 결정은 해당 사이트에 제공된 분류법이 수년이 지난 데다 ICTVdb 웹사이트의 자연어 출력을 지원하기 위해 데이터베이스를 조회하고 처리하는 방식에 문제가 있어 해당 사이트의 일부 정보가 부정확하다는 사실이 명백해진 뒤 내려졌다.ICTV는 이러한 문제를 가장 잘 해결할 수 있는 방법에 대한 논의를 시작했지만, 업데이트와 오류 수정을 위한 기간이 충분히 길어서 부정확한 정보의 공개를 영구화하기보다는 사이트를 해체하는 것이 최선이라고 판단했다.[citation needed]2013년 8월 현재, 데이터베이스는 보류 상태에 있다.[3]일부 견해에 따르면, "ICTV는 또한 ICTV 데이터베이스를 개인 바이러스의 주요 메타데이터의 저장소로 대체하기 위한 공공 데이터베이스 사용을 촉진해야 하며, ICTV 보고서의 개요를 그 데이터베이스에 공개하여 '열린 접근'[3]이 되도록 해야 한다"는 의견도 있다.

참고 항목

보고서

  • Viruses, International Committee on Nomenclature of; Wildy, Peter (1971). Classification and nomenclature of viruses. 1st report. Out of print
  • Viruses, International Committee on Taxonomy of; Fenner, Frank (1976). Classification and nomenclature of viruses. 2nd report. ISBN 978-3805524186.
  • Viruses, International Committee on Taxonomy of; Matthews, Richard Ellis Ford; Section On Virology, International Association of Microbiological Societies (1979). Classification and nomenclature of viruses. 3rd report. ISBN 978-3805505239.
  • Ellis, Richard; Matthews, Ford, eds. (1982). Classification and nomenclature of viruses. 4th report. Karger. p. 199. ISBN 9783805535571.
  • Viruses, International Committee on Taxonomy of; Francki, R. I. B (1991). Classification and nomenclature of viruses. 5th report. ISBN 978-3211822869.
  • Murphy, Frederik A (1995). Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses. 6th report. ISBN 978-3211825945.
  • Viruses, International Committee On Taxonomy Of; Van Regenmortel, M. H. V; Fauquet, C. M; Bishop, D. H. L (2000). Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses. 7th report. ISBN 978-0123702005.
  • Fauquet, C.M., ed. (2005). Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses. 8th report. Elsevier/Academic Press. ISBN 978-0080575483.
  • King, Andrew M. Q.; Lefkowitz, Elliot; Adams, Michael J.; et al., eds. (2011). Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses. 9th report. Elsevier/Academic Press. p. 1338. ISBN 9780123846846. 온라인으로도 이용 가능.[12]
  • ICTV 10일(온라인) 보도[13]

참조

  1. ^ King, Andrew M.Q.; Lefkowitz, E.; Adams, M.J.; Carstens, E.B. (2012). Virus Taxonomy Classification and Nomenclature of Viruses: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Elsevier. ISBN 978-0-12-384684-6. Archived from the original on 10 December 2017. Retrieved 13 April 2017.
  2. ^ a b c d e Fauquet, C.M.; Fargette, D. (2005). "International Committee on Taxonomy of Viruses and the 3,142 unassigned species". Virology Journal. 2: 64. doi:10.1186/1743-422X-2-64. PMC 1208960. PMID 16105179.
  3. ^ a b c Gibbs, A.J. (2013). "Viral taxonomy needs a spring clean; its exploration era is over". Virology Journal. 10: 254. doi:10.1186/1743-422X-10-254. PMC 3751428. PMID 23938184.
  4. ^ "Banking Diverse Data - The Origins of ICTVdB". 13 November 2005. Archived from the original on 13 November 2005. Retrieved 6 April 2018.
  5. ^ "Archived copy". Archived from the original on 30 September 2007. Retrieved 22 June 2006.{{cite web}}: CS1 maint: 타이틀로 보관된 사본(링크)
  6. ^ a b c Kuhn, Jens H. (2021). "Virus taxonomy". Encyclopedia of Virology. 1: 28–37. doi:10.1016/B978-0-12-809633-8.21231-4. ISBN 9780128145166. PMC 7157452.
  7. ^ "International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)". talk.ictvonline.org. Retrieved 17 September 2020.
  8. ^ Ali, Muhammad (2016). "Towards a coherent nomenclature of plant viruses". Virologica Sinica. 31 (3): 197–198. doi:10.1007/s12250-016-3741-5. PMC 8193424. PMID 27052507. S2CID 10162214.
  9. ^ Simmonds P, Adams MJ, Benkő M, Breitbart M, Brister JR, Carstens EB, Davison AJ, Delwart E, Gorbalenya AE, Harrach B, Hull R, King AMQ, Koonin EV, Krupovic M, Kuhn JH, Lefkowitz EJ, Nibert ML, Orton R, Roossinck MJ, Sabanadzovic S, Sullivan MB, Suttle CA, Tesh RB, van der Vlugt RA, Varsani A, Zerbini FM (2017). "Consensus statement: Virus taxonomy in the age of metagenomics" (PDF). Nature Reviews Microbiology. 15 (3): 161–168. doi:10.1038/nrmicro.2016.177. PMID 28134265. Archived (PDF) from the original on 23 July 2018. Retrieved 18 October 2019.
  10. ^ Adams MJ, Lefkowitz EJ, King AM, Harrach B, Harrison RL, Knowles NJ, Kropinski AM, Krupovic M, Kuhn JH, Mushegian AR, Nibert ML, Sabanadzovic S, Sanfaçon H, Siddell SG, Simmonds P, Varsani A, Zerbini FM, Orton RJ, Smith DB, Gorbalenya AE, Davison AJ (2017). "50 years of the International Committee on Taxonomy of Viruses: progress and prospects" (PDF). Archives of Virology. 162 (5): 1441–1446. doi:10.1007/s00705-016-3215-y. PMID 28078475. Archived (PDF) from the original on 23 July 2018. Retrieved 17 September 2019.
  11. ^ King, Andrew M. Q.; et al., eds. (2012). Virus taxonomy : classification and nomenclature of viruses : ninth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London: Academic Press. ISBN 978-0123846846. Archived from the original on 11 September 2014. Retrieved 9 December 2014.
  12. ^ a b "International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)". talk.ictvonline.org. Archived from the original on 2 April 2019. Retrieved 18 October 2019.
  13. ^ a b "International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)". talk.ictvonline.org. Archived from the original on 1 July 2019. Retrieved 18 October 2019.
  14. ^ "International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)". talk.ictvonline.org. Archived from the original on 4 March 2018. Retrieved 18 October 2019.
  15. ^ Maddison DR, Swofford DL, Maddison WP (December 1997). "NEXUS: an extensible file format for systematic information". Syst. Biol. 46 (4): 590–621. doi:10.1093/sysbio/46.4.590. PMID 11975335. S2CID 30267491.
  16. ^ "Banking Diverse Data - The Origins of ICTVdB". 13 November 2005. Archived from the original on 13 November 2005. Retrieved 18 October 2019.

외부 링크