GISAID

GISAID
GISAID 이니셔티브
Official GISAID logo
약어GISAID
포메이션2008년 5월; 13년 전(2008년 5월)
유형비영리단체
민관협력
목적글로벌 보건, 연구, 교육
본부독일 뮌헨
서비스 영역
월드와이드
방법기부금 및 보조금
주요인
  • 피터 보그너 (대통령)[1]
  • Ron A. M. Fouchier와 John W. McCauley (공동위원장 과학자문위원회)[2]
웹사이트gisaid.org

GISAID는 인플루엔자 바이러스의[3] 게놈 데이터와 COVID-19 대유행을 담당하는 코로나바이러스 등에 대한 개방적 접근을 제공하는 글로벌 과학 이니셔티브 및 1차 원천이다.[4][5]2020년 1월 10일 사스-CoV-2의 첫 번째 유전자 순서가 GISAID에 제공되어 첫 번째 백신을[7] 개발하고 사스-CoV-2를 검출하기 위한 진단 테스트를[8] 포함한 [6]전 세계적인 대유행 반응들이 가능해졌다.이 데이터베이스는 사스-CoV-2 시퀀스를 위한 세계 최대의 저장소가 되었다.GISAID는 유전자 역학 및 실시간 감시를 용이하게 하여 지구 전체에 새로운 COVID-19 바이러스 변종의 출현을 감시한다.[6][9]

GISAID는 기존 공공영역 보관소를 통해 조류인플루엔자 데이터를[10] 공유하는 대안으로 설립된 이후 2009년 H1N1 대유행[12][13], 2013년 H7N9 대유행[14][15], 2020년 초 COVID-19 대유행[16][17] 때 발생 데이터의[11] 신속한 교환을 유도한 공로를 인정받았다.[3][11]

GISAID는 2017년 G20 보건장관으로부터 세계 보건에 대한 중요성을 인정받았고,[18] 2020년 세계보건기구(WHO) 수석과학자는 데이터 과학 이니셔티브를 '게임 체인저'[4]라고 불렀다.

기원

GISAID 통신 편지는 저널 네이처에 게재된 2006,[19]에 첫 언급을 발견한 약자를 앞으로 새로운 글로벌 이니셔티브 공유 조류 독감이 자료에, 그 members[11]공개적으로 이용 가능한 데이터베이스에서 분석과 va.에게 최대 6개월 후 데이터를 공개할 것에 대한"컨소시엄"을 생성할 수 있는 초기 열망을lidation.[20]

A group of scientists at a meeting posing outdoors
GISAID 차세대 시퀀싱 워크샵(Institute Pasteur, 2015 파리)

때문에 결과 고 병원성 H5N1동물원성 감염증의. 바이러스를 가장 현재 유전자 데이터에 접근은 종종 세계 보건 기구 회원국의 주저하는 부분에 제한되었지만 공유를 위하는 필수 기본 원칙 established,[21]통신한 편지 7의 노벨 수상자들을 포함해 70선도 과학자들에 의해 서명하였다.sta그들의 바이러스 게놈을 공유하고 소유권을 위험에 빠뜨리기 위해 테스.[22]

GISAID 공유 메커니즘의 실제 규칙에 대한 국제적인 합의가 정부와 연구자들 사이에서 이루어지기까지는 18개월이 더 걸릴 것이다.따라서 GISAID는 2008년 5월 제61차 세계보건회의를 계기로 제네바에서 회원 가입을 요구하는 컨소시엄이 아닌 공개 접속 데이터베이스로 공식 출범했다[9].[11][12]

접근하다

데이터를 예치하는 자에게 인센티브를 주고 인정해주는 GISAID 모델이 향후 이니셔티브의 모델로 추천됐다.[23]시퀀스 데이터의 투명성과 시기적절한 공유는 많은 연구자와 이해관계자 모두의 목표였다.GISAID 플랫폼은 국경과 과학 분야에 걸쳐 있으며, 수의학, 인간 의학, 생물정보학, 역학 및 지적 재산 분야의 선두주자가 있다.이러한 학문간 노력은 각 분야마다 뚜렷한 이해관계가 있지만 유사한 목표를 공유하기 때문에 정보를 소통하고 공유하는 새로운 수단을 제공한다.Initiative는 데이터를 제출하는 사람들에게 신뢰를 주고 바이러스 시퀀스 데이터에 대한 협업 분석에 이를 포함시키기 위해 상당한 노력을 기울이는 방식으로 협력함으로써 "협업에 유리한 척도를 더욱 확장"[23]했다.데이터뿐 아니라 결과적 연구의 이점까지 공유한다는 개념은 상위와 하위 자원 환경의 기여자들을 보다 동등한 지위에 두는 "패러다임 변화"를 나타냈다.[23]

역사

Peter Bogner shakes hands with Robert Kloos
피터 보그너(l) GISAID 대통령, 로버트 클로스 출처 독일 국무장관과의 공식 서명식: BMLV (베를린, 2010년 4월)

GISAID Initiative는 처음에 그것의 설립자이자 주요 촉진자 역할을 하는 전략 고문이자 국제 방송 임원인 Peter Bogner에 의해 자금 지원을 받았다.보그너는 과학 데이터와 결과를 신속하게 공유함으로써 이 잠재적 인류 대유행의 이해를 가속화하는 데 적극적으로 헌신하고 있는 세계 유수의 과학자들과 이해관계자들을 모아 이 플랫폼의 구축을 지휘해 왔다.보그너는 2006년 1월 스위스 다보스에서 열린 세계경제포럼(WEF)에서 마이클 처토프 미 국토안보부 장관을 만나 독감 대유행 가능성에 대처하는 미국 정부의 대비 개념에 대해 들었다.[24]대유행 시나리오에 대한 우려가 고조되었다.[25]

2006년 11월, 이니셔티브는 왕립 학회와 의학 아카데미의 승인을 받았다.[26]2007년 2월, 인플루엔자 바이러스 변종에 관한 GISAID 데이터베이스를 관리하기 위한 스위스 컨소시엄을 이끌고 있는 GISAID와 스위스 생명정보학 연구소가 협력협약을 체결했다고 발표했다.[11]이 협약에 따라 제네바에 본부를 둔 연구소는 유전, 역학, 임상 데이터의 안전한 저장과 분석을 위한 서비스를 제공하게 되었다.

2007년 1월 인도네시아는 모든 H5N1 임상 샘플을 WHO와 공유하는 것을 중단했다.시티 파딜라 수파리 인도네시아 보건장관은 2007년 3월 자카르타에서 열린 '조류인플루엔자 바이러스 공유 책임사례' 고위급 WHO 회의에 이어 인도네시아 정부가 '세계 조류인플루엔자 데이터베이스 공유 이니셔티브(GISAID)' 구성을 지지한다고 발표했다[27].2007년 4월 인도네시아 과학아카데미는 GISAID가 조류인플루엔자(AI)와 신종 감염병의 자유로운 정보 교환과 책임 있는 공유와 관련해 같은 이상을 공유하고 있다며 GISAID에 대한 지지를 재확인했다.

2008년에는 WHO 글로벌 인플루엔자 감시 및 대응 시스템에 있는 국립 인플루엔자 센터(NICs)로부터 받은 샘플의 시퀀스 데이터를 입력하기 위해 "WHO 인플루엔자 협력 센터"에 의해 GISAID가 채택되었다.

2010년 4월 독일 연방공화국은 베트남 하노이에서 열린 제7차 조류·유행성 인플루엔자 국제장관회의에서 GISAID Initiative가 독일 정부와 협력협정을[28] 체결했다고 발표하여 독일이 GISAID 플랫폼의 장기 개최국이 되었다.[29]협약에 따라, 연방식품부 BMLV로 대표되는 독일은 본에 위치한 GISAID 플랫폼과 EpiFlu™ 데이터베이스의 기술 유치 시설을[30] 연방 농림축산식품부(BL)를 통해 제공함으로써 이니셔티브의 지속가능성을 보장하게 된다.리엠스 섬에 위치한 독일연방동물보건연구소 프리드리히 뢰플러 연구소(FLI)는 과학 표준을 충족시키기 위해 GISAID의 과학 데이터의 신뢰성 및 큐레이션을 보장할 것이다.

2020년 1월 10일 중국 질병관리본부에 의해 최초의 사스-CoV-2 유전자 서열이 공개되고 GISAID를 통해 공유되었다.[7]2020년 내내 전 세계에서 샘플링되고 분석된 방대한 양의 SARS-CoV-2 게놈 시퀀스가 GISAID 데이터베이스에 추가되어 전 세계 연구소가 빠르게 공유해 왔다.[31][32]

SARS-CoV-2 게놈 데이터베이스

GISAID는 사스-CoV-2 시퀀스의 세계 최대 저장소를 유지하고 있다.[33]GISAID의 SARS-CoV-2 데이터베이스는 2020년 1월 10일 최초 완전한 게놈 서열을 공유한 이후 2021년 4월 중순까지 120만 건 이상의 제출에 이르렀으며 이는 170여 개국의 연구원들이 열심히 연구했다는 증거다.[34]불과 3개월 후, 사스-CoV-2 시퀀스 업로드 건수는 다시 두 배로 증가해 240만 건을 넘어섰다.[35]2021년 후반까지, 데이터베이스는 5백만 개 이상의 게놈 서열을 포함했다.[36]2021년 12월 현재 큰 폭의 금리 인상으로 600만건이 넘는 시퀀스가 제출되었다.[37]COVID-19 대유행의 첫 해에 걸쳐 전 세계적으로 생성되고 공유된 사스-CoV-2 전유전자 시퀀스의 대부분은 GISAID를 통해 제출되었다.[38]남아프리카에서 사스-CoV-2 오미크론 변종이 발견되었을 때, 이 염기서열을 빠르게 GISAID에 업로드함으로써, 보츠와나와 홍콩도 같은 유전자 염기서열을 가진 환자들을 보고했다는 것을 알 수 있었다.[39]

거버넌스

GISAID의 지배구조는[40] 의사결정에서 편향성을 경계하기 위한 목적으로 서로 독립적으로 운영되는 여러 조직체를 제공한다.GISAID의 행정 업무는 GISAID의 자금 출처와 관련한 잠재적인 이해 상충을 최소화할 것으로 예상되는 이사회에 의해 감독된다.이 시책에 대한 과학적 감독관은 세계동물보건기구(WHO)와 세계식량기구의 조류인플루엔자(AI) 연구를 위한 동물위생기준연구소장 등 6개 주요 공중보건연구소 이사들로 구성된 과학자문회의에서 비롯됐다.국제 연합의 양식업 기구이 거버넌스 구조는 분석을 위한 소프트웨어 및 개발자와 상호작용하기 위해 사용자 커뮤니티를 대표하는 바이러스 염기서열 분석 및 생물정보학 전문가로 구성된 GISAID의 Database Technical Group이 관리하는 EpiFlu™ 데이터베이스의 기능적 능력을 향상시키기 위한 것이다.[41]

접근 및 지적 재산권

GenBank, EMBL과 같은 공용 도메인 데이터베이스와 달리, GISAID 사용자는 자신의 신원을 확인하고 GISAID 데이터의 사용 방법을 지배하는 데이터베이스 접근 계약에[42] 동의해야 한다.이 이용약관은 이용자들이 이용약관에 동의하지 않은 다른 이용자들과 어떠한 데이터도 공유하지 못하게 한다.이용약관에서는 데이터 사용자가 게시된 작업에서 데이터 생성기를 인정해야 하며, 데이터 생성기와 협업하여 자신의 데이터를 사용하는 연구 및 분석에 참여하도록 합리적으로 시도해야 한다.

GISAID의 데이터 접근 협정이 다루려고 하는 어려움은 많은 연구자들이 인플루엔자 시퀀스 데이터를 공유하면 백신 산업 등의 지적 재산권 주장을 통한 유용이 촉진되어 높은 비용이나 사전 비용에 의해 개발 도상국의 백신 및 기타 품목에 대한 접근을 방해할 수 있다는 것이다.환기 기술 이전대부분의 공익 전문가들은 인플루엔자 시퀀스 데이터를 공개해야 한다는 GISAID에 동의하고 있으며, 이것은 많은 연구자들의 동의 대상이지만, 어떤 연구자들은 특허청구를 한 후에만 정보를 제공하는 반면, 어떤 연구자들은 그것에 대한 접근은 특허나 다른 지적 재산권 침해의 어떤 조건에서만 이루어져야 한다고 말했다.ms는 인간 게놈 프로젝트에서 논란이 됐던 것처럼 파일화되었다.[43]GISAID의 데이터 액세스 협약은 데이터 공유를 촉진하기 위해 이를 직접 다룬다.GISAID의 절차는 EpiFlu 데이터베이스에 접속하는 사람들이 유전자 서열의 원산지 국가들과 그 서열을 발견한 연구자들과 상의하는 것을 추가로 제안한다.이에 따라 GISAID 면허는 바이러스 시퀀스 데이터 분석 분야를 바꿨다.

참고 항목

참조

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추가 읽기

외부 링크