SARS-CoV-2 Iota 변종

SARS-CoV-2 Iota variant

혈통 B.1.526으로도 알려진 [1]이오타 변종COVID-19를 일으키는 바이러스인 사스-CoV-2변형 중 하나이다.그것은 2020년 11월에 뉴욕시에서 처음 발견되었다.이 변종은 두 가지 주목할 만한 돌연변이를 가지고 나타났다: E484K 스파이크 돌연변이와 바이러스가 인간 세포에 더 단단히 결합하는 것을 도울 수 있는 S477N 돌연변이다.[citation needed]

2021년 2월까지 뉴욕 지역에서 급속도로 확산되어 바이러스 서열 4개 중 약 1개를 차지했다.[2][3]2021년 4월 11일까지, 이 변종은 적어도 미국 48개 주와 18개 국가에서 감지되었다.[4][5]

세계보건기구(WHO)가 제안한 단순화된 명칭 체계에서 B.1.526은 Iota 변종이라는 꼬리표가 붙었고, 관심의 변종(VOI)으로 여겨지지만, 아직 우려의 변종은 아니다.[6]

돌연변이

이오타(B.1.526) 게놈에는 다음과 같은 아미노산 돌연변이가 들어 있는데, 모두 바이러스의 스파이크 단백질 코드인 L5F, T95I, D253G, E484K, D614G, A701V에 들어 있다.[7]

역사

Iota 변종의 증가는 SARS-CoV-2의 70만 개 이상의 유전학적 염기서열을 문서화한 글로벌 과학 이니셔티브인 GISAID로 알려진 데이터베이스에서 돌연변이를 스캔함으로써 칼텍의 연구자들에 의해 포착되었다.[9][10]

이오타 변종으로 대표되는 미국 사례의 비율은 델타 변종이 우세해지면서 2021년 7월말까지 급격히 감소했다.[11]

통계

국가별 사례(2021년 8월 11일 기준 업데이트) GISAID[12]
나라 확정사례 마지막으로 보고된 사례
USA 45,558 2021년 6월 24일
에콰도르 168 2021년 6월 10일
캐나다 158
스페인 119 2021년 6월 17일
콜롬비아 115 2021년 5월 24일
아루바 103 2021년 6월 10일
독일 56 2021년 6월 22일
멕시코 50 2021년 6월 11일
영국 43 2021년 5월 16일
신트 마텐 17 2021년 5월 27일
아일랜드 13 2021년 5월 7일
스위스 12 2021년 5월 17일
칠레 11 2021년 5월 12일
덴마크 9 2021년 5월 31일
이스라엘 9 2021년 4월 26일
수리남 9 2021년 5월 10일
아르헨티나 8 2021년 4월 26일
벨기에 8 2021년 4월 18일
도미니카 공화국 8 2021년 6월 10일
프랑스 8 2021년 5월 25일
리투아니아 8 2021년 5월 28일
싱가포르 7 2021년 4월 4일
오스트레일리아 6 2021년 5월 21일
이탈리아 6 2021년 5월 4일
룩셈부르크 6 2021년 3월 5일
코스타리카 5 2021년 5월 21일
네덜란드 5 2021년 4월 19일
러시아 5 2021년 6월 4일
크로아티아 4 2021년 2월 9일
일본 4 2021년 5월 7일
대한민국 4 2021년 4월 14일
스웨덴 4 2021년 5월 14일
터키 4 2021년 5월 4일
몰타 4 2020년 12월 21일
인도 3 2021년 3월 24일
도미니카 3 2021년 1월 15일
슬로베니아 3 2021년 5월 18일
오스트리아 2 2021년 4월 22일
가나 2 2021년 3월 20일
그레나다 2 2021년 1월 17일
인도네시아 2 2021년 1월 8일
자메이카 2 2021년 2월 2일
라이베리아 2 2021년 5월 14일
포르투갈 2 2021년 3월 4일
루마니아 2 2021년 4월 17일
앵귈라 1 2021년 4월 21일
앤티가 바부다 1 2021년 5월 3일
영국령 버진아일랜드 1 2021년 1월 25일
케이먼 제도 1 2021년 4월 15일
중국 1
쿠라카오 1 2021년 4월 30일
핀란드 1 2021년 3월 14일
과들루프 1 2021년 3월 9일
뉴질랜드 1 2021년 3월 16일
폴란드 1 2021년 3월 31일
터키 카이코스 제도 1 2021년 3월 22일
베네수엘라 1 2021년 5월 8일
세계(57개국) 합계: 46,589명 2021년 8월 11일 기준 총계

참고 항목

참조

  1. ^ "Tracking SARS-CoV-2 variants". www.who.int. Retrieved June 1, 2021.
  2. ^ Rosa-Aquino, Matt Stieb, Paola (March 21, 2021). "Everything We Know About the Coronavirus Variant Spreading in New York City". Intelligencer. Retrieved April 10, 2021.
  3. ^ Mandavilli, Apoorva (February 24, 2021). "A New Coronavirus Variant Is Spreading in New York, Researchers Report". The New York Times. ISSN 0362-4331. Retrieved April 10, 2021.
  4. ^ "outbreak.info". outbreak.info. Retrieved April 10, 2021.
  5. ^ "PANGO lineages Lineage B.1.526". cov-lineages.org. April 22, 2021. Retrieved April 22, 2021.
  6. ^ "Tracking SARS-CoV-2 variants". www.who.int. Retrieved June 1, 2021.
  7. ^ "SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions". CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. February 11, 2020. Retrieved July 5, 2021.
  8. ^ "Spike Variants: Iota variant, aka B.1.526". covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database. July 1, 2021. Retrieved July 5, 2021.
  9. ^ Corum, Jonathan; Zimmer, Carl. "Coronavirus Variants and Mutations". The New York Times. ISSN 0362-4331. Retrieved April 10, 2021.
  10. ^ West, Anthony P.; Barnes, Christopher O.; Yang, Zhi; Bjorkman, Pamela J. (February 23, 2021). "SARS-CoV-2 lineage B.1.526 emerging in the New York region detected by software utility created to query the spike mutational landscape". bioRxiv: 2021.02.14.431043. doi:10.1101/2021.02.14.431043. PMC 8077570. PMID 33907745. S2CID 231981267.
  11. ^ 변종별 SARS-CoV-2 시퀀스, 2021년 7월 26일, 미국 우리의 세계 데이터
  12. ^ "GISAID - hCov19 Variants". www.gisaid.org. Retrieved July 2, 2021.