IDH3B

IDH3B
IDH3B
식별자
별칭IDH3B, H-IDHB, RP46, 이소시트레이트 탈수소효소 3(NAD(+) 베타, 이소시트레이트 탈수소효소(NAD(+) 3 베타, 이소시트레이트 탈수소효소(NAD(+) 3 비 촉매 서브유닛 베타
외부 IDOMIM: 604526 MGI: 2158650 호몰로진: 5035 GeneCard: IDH3B
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_001258384
NM_006899
NM_174855
NM_174856
NM_001330763

NM_130884
NM_001362752

RefSeq(단백질)

NP_001245313
NP_001317692
NP_008830
NP_777280

n/a

위치(UCSC)Chr 20: 2.66 – 2.66MbChr 2: 130.12 – 130.13Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

이소시트레이트 탈수소효소[NAD] 서브유닛 베타, 미토콘드리아(mitochondrial)는 인간에서 IDH3B 유전자에 의해 인코딩되는 효소다.[5][6]

이소시트레이트 탈수소화효소(IDHs)는 이소시트레이트의 산화 데카르복시화2-옥소글루타산염으로 촉매한다.이들 효소는 두 개의 뚜렷한 하위 분류에 속하며, 그 중 하나는 NAD(+)를 전자 수용기로, 다른 하나는 NADP(+)로 이용한다.미토콘드리아 매트릭스에 국소화되는 3개의 NADP(+-의존성 이소시트레이트 탈수소효소)와 2개의 NADP(+의존성 이소시트레이트 탈수소효소, 그 중 하나는 미토콘드리아와 다른 하나는 주로 세포질이다.NAD(+) 의존성 이산화물 탈수소효소는 삼차복시산 주기알로스테리적으로 규제되는 속도 제한 단계를 촉매로 한다.각 이소자임은 2개의 알파 서브유닛, 1개의 베타 서브유닛, 그리고 1개의 감마 서브유닛으로 구성된 헤테로테트레이머다.이 유전자에 의해 인코딩된 단백질은 NAD(+-의존성 이소시트레이트 탈수소효소)의 한 이소자임 베타 서브단위다.다른 ISO 양식을 인코딩하는 세 가지 대안으로 분할된 대본 변형이 이 유전자에 대해 설명되었다.[RefSeq 제공, 2008년 7월][6]

구조

IDH3는 3개의 이소시트레이트 탈수소효소 이소성분 중 하나이며, 나머지 2개는 IDH1IDH2이며, 5개의 이소시트레이트 탈수소효소 유전자인 IDH1, IDH2, IDH3A, IDH3B, IDH3G 중 하나로 인코딩된다.[7]The genes IDH3A, IDH3B, and IDH3G encode subunits of IDH3, which is a heterotetramer composed of two 37-kDa α subunits (IDH3α), one 39-kDa β subunit (IDH3β), and one 39-kDa γ subunit (IDH3γ), each with distinct isoelectric points.[8][9][10]이들의 아미노산 염기서열을 정렬하면 전체 34%의 아이덴티티와 IDH3β 간 아이덴티티 약 40%의 아이덴티티, IDH3α와 IDH3β 간 아이덴티티 약 42%의 아이덴티티티 약 53%의 더 가까운 아이덴티티가 3개 서브유형에 걸쳐 모두 23%의 아이덴티티티티티티티티티티티티티티로 나타난다.[9][10][11][12]특히 IDH3α의 Arg88은 IDH3 촉매 활성에 필수적인 반면, IDH3β의 Arg99와 IDH3 in의 Arg97은 ADP와 NAD에 의한 효소의 항원성 조절에 크게 관여한다.[11]따라서 이러한 아유닛은 공통 조상의 유전자의 유전자 중복으로부터 생겨났을 가능성이 있으며, 원래의 촉매 아그 잔여물은 β-와 γ-subunits의 알로스테리 함수에 적응하였다.[9][11]마찬가지로, IDH3α의 Asp181은 촉매에 필수적인 반면, IDH3β의 Asp192와 IDH3γ의 Asp190은 NAD-와 Mn-binding을2+ 강화한다.[9]IDH3에 의해 촉매되는 산화 데카복시술은 NAD, Mn2+, 기질 이소시트의 결합을 필요로 하기 때문에 3개의 서브유닛 모두 촉매 반응에 참여한다.[10][11]더욱이 돼지 심장의 효소에 대한 연구는 αβ와 αα 디머가 하나의 IDH3 테트라머에 있는 이소시트레이트, Mn2+, NAD를 포함한 각각의 리간드에 대해 두 개의 결합 부위를 구성한다는 것을 밝혀낸다.[9][10]

이소폼스

IDH3B 유전자는 12개의 exon을 포함하고 있으며, 2개의 대안으로 분할된 esison 형태인 IDH3β1 (349개 잔류물)과 IDH3β2 (354개 잔류물)를 인코딩한다.[13][14]이 등소형태는 조직마다 다르며 대상 조직과 일치하는 최적의 pHs를 가지고 있다.최적의 pH가 8.0인 IDH3β1은 신장으로, IDH3β2는 최적의 pH가 7.6인 심장골격근으로 표현된다.[14]

함수

이소시트레이트 탈수소효소로서 IDH3는 이소시트레이트의 가역성 산화 데카르복시화를 촉매하여 포도당 대사 시 TCA 사이클의 일부로 α-케토글루타레이트(α-KG)와 CO2를 산출한다.[8][9][10][11][15]이 단계는 또한 NAD+를 NADH로 동반 환원시키는 것을 허용하며, NADH는 전자 전송 체인을 통해 ATP를 생성하는 데 사용된다.특히 IDH3는 IDH1이나 IDH2와 같은 NADP+와는 반대로 NADP+를 전자수용기로서 의존한다.[8][9]IDH3 활성도는 셀의 에너지 요구에 의해 조절된다. 셀이 에너지를 필요로 할 때 IDH3는 ADP에 의해 활성화되며, 에너지가 더 이상 필요하지 않을 때 IDH3는 ATP와 NADH에 의해 억제된다.[9][10]이 불가항력적 규제는 IDH3가 TCA 사이클에서 속도 제한 단계로 기능할 수 있도록 한다.[15][16]세포 내에서 IDH3와 그 서브유닛이 미토콘드리아국부화 되는 것이 관찰되었다.[9][10][15]

임상적 중요성

IDH3B 유전자의 동질상 기능상실 돌연변이는 망막에서 로드와 원뿔의 신경분열인 망막염 색소변이와 연관되어 실명을 초래했다.[12][13][17]

대화형 경로 지도

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TCACycle_WP78 편집
  1. ^ 대화형 경로 맵은 WikiPathways에서 편집할 수 있다."TCACycle_WP78".

참고 항목

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000101365 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000027406 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Kim YO, Park SH, Kang YJ, Koh HJ, Kim SH, Park SY, Sohn U, Huh TL (Jan 2000). "Assignment of mitochondrial NAD(+)-specific isocitrate dehydrogenase beta subunit gene (IDH3B) to human chromosome band 20p13 by in situ hybridization and radiation hybrid mapping". Cytogenet Cell Genet. 86 (3–4): 240–1. doi:10.1159/000015348. PMID 10575215. S2CID 85139434.
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  7. ^ Dimitrov L, Hong CS, Yang C, Zhuang Z, Heiss JD (2015). "New developments in the pathogenesis and therapeutic targeting of the IDH1 mutation in glioma". International Journal of Medical Sciences. 12 (3): 201–13. doi:10.7150/ijms.11047. PMC 4323358. PMID 25678837.
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  10. ^ a b c d e f g Soundar, S; O'hagan, M; Fomulu, KS; Colman, RF (28 July 2006). "Identification of Mn2+-binding aspartates from alpha, beta, and gamma subunits of human NAD-dependent isocitrate dehydrogenase". The Journal of Biological Chemistry. 281 (30): 21073–81. doi:10.1074/jbc.m602956200. PMID 16737955.
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추가 읽기

외부 링크