PRKAB1

PRKAB1
PRKAB1
Protein PRKAB1 PDB 1z0m.png
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭PRKAB1, AMPK, HAMPKb, 단백질 키나아제 AMP 활성 비 촉매 서브 유닛 베타 1
외부 IDOMIM: 602740 MGI: 1336167 HomoloGene: 38160 GeneCard: PRKAB1
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_006253

NM_031869

RefSeq(단백질)

NP_006244
NP_006244.2

NP_114075

위치(UCSC)Chr 12: 119.67 – 119.68MbCr 5: 116.15 – 116.16Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

5'-AMP 활성 단백질 키나아제 소단위 베타-1은 인간에서 PRKAB1 유전자에 의해 인코딩되는 효소다.[5][6]

이 유전자에 의해 인코딩된 단백질은 AMP 활성 단백질 키나아제(AMPK)의 규제 하위단위다.AMPK는 알파 촉매 서브유닛과 비 촉매 베타 및 감마 서브유닛으로 구성된 이질트리머다.AMPK는 세포 에너지 상태를 감시하는 중요한 에너지 감지 효소다.세포 대사 스트레스에 대응하여 AMPK가 활성화되어 지방산콜레스테롤의 디노보 생합성 조절에 관여하는 핵심 효소인 아세틸-CoA 카복실라아제(ACC)와 베타-하이드록시 베타-메틸글루타릴-CoA 환원효소(HMGCR)가 활성화되고 불활성화된다.이 하위 장치는 AMPK 활동의 양성 조절기일 수 있다.이 서브유닛의 미리스토일화와 인산화효소는 AMPK의 효소 활성과 세포 국산화 작용에 영향을 미치는 것으로 밝혀졌다.또한 이 서브유닛은 AMPK 복합체의 연결을 매개하는 어댑터 분자의 역할을 할 수 있다.[6]

모형 유기체

Prkab1 녹아웃 마우스 표현형

모델 유기체는 PRKAB1 기능의 연구에 사용되어 왔다.Prkab1이라고tm1a(KOMP)Wtsi[14][15] 불리는 조건부 녹아웃 마우스 라인은 국제 녹아웃 마우스 컨소시엄 프로그램의 일부로 생성되었는데, 이것은 관심 있는 과학자들에게 질병의 동물 모델을 생성하여 배포하는 고투과 돌연변이 유발 프로젝트의 일환이다.[16][17][18]

수컷과 암컷은 삭제 효과를 판단하기 위해 표준화된 표현식 화면을 거쳤다.[12][19]돌연변이 생쥐에 대해 25건의 검사를 실시했으며 4건의 유의미한 이상이 관찰되었다.[12]동질 돌연변이 수컷은 포도당 내성이 손상된 것으로 나타났다.두 성별의 동물들은 순환 빌리루빈 수치가 증가했고 IgG3 수치가 증가했으며 다수의 비정형 혈액학 매개변수가 증가했다.[12]

상호작용

PRKAB1은 PRKAG2[20]PRKAG1상호작용하는 것으로 나타났다.[20]

The 5'-AMP-activated protein kinase beta subunit interaction domain (AMPKBI) is a conserved domain found in the beta subunit of the 5-AMP-activated protein kinase complex, and its yeast homologues Sip1 (SNF1-interacting protein 1), Sip2 (SNF1-interacting protein 2) and Gal83 (galactose metabolism 83), which are found in the SNF1 (sucrose non-fermen팅)키나제 [21]복합체이 영역은 키나제 콤플렉스와 이 서브 유닛의 상호작용을 위해 충분하지만, 상호작용을 전적으로 책임지지는 않으며, 상호작용 파트너는 알려져 있지 않다.[22]

앰프케이비
식별자
기호앰프케이비
PfamPF04739
인터프로IPR006828

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000111725 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000029513 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Stapleton D, Mitchelhill KI, Gao G, Widmer J, Michell BJ, Teh T, House CM, Fernandez CS, Cox T, Witters LA, Kemp BE (February 1996). "Mammalian AMP-activated protein kinase subfamily". J Biol Chem. 271 (2): 611–4. doi:10.1074/jbc.271.2.611. PMID 8557660.
  6. ^ a b "Entrez Gene: PRKAB1 protein kinase, AMP-activated, beta 1 non-catalytic subunit".
  7. ^ "Glucose tolerance test data for Prkab1". Wellcome Trust Sanger Institute.
  8. ^ "Clinical chemistry data for Prkab1". Wellcome Trust Sanger Institute.
  9. ^ "Haematology data for Prkab1". Wellcome Trust Sanger Institute.
  10. ^ "Salmonella infection data for Prkab1". Wellcome Trust Sanger Institute.
  11. ^ "Citrobacter infection data for Prkab1". Wellcome Trust Sanger Institute.
  12. ^ a b c d Gerdin AK (2010). "The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
  13. ^ 마우스 리소스 포털, 웰컴 트러스트 생어 연구소.
  14. ^ "International Knockout Mouse Consortium".
  15. ^ "Mouse Genome Informatics".
  16. ^ Skarnes, W. C.; Rosen, B.; West, A. P.; Koutsourakis, M.; Bushell, W.; Iyer, V.; Mujica, A. O.; Thomas, M.; Harrow, J.; Cox, T.; Jackson, D.; Severin, J.; Biggs, P.; Fu, J.; Nefedov, M.; De Jong, P. J.; Stewart, A. F.; Bradley, A. (2011). "A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function". Nature. 474 (7351): 337–342. doi:10.1038/nature10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
  17. ^ Dolgin E (2011). "Mouse library set to be knockout". Nature. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038/474262a. PMID 21677718.
  18. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (2007). "A Mouse for All Reasons". Cell. 128 (1): 9–13. doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
  19. ^ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). "The mouse genetics toolkit: revealing function and mechanism". Genome Biol. 12 (6): 224. doi:10.1186/gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.
  20. ^ a b Cheung, P C; Salt I P; Davies S P; Hardie D G; Carling D (March 2000). "Characterization of AMP-activated protein kinase gamma-subunit isoforms and their role in AMP binding". Biochem. J. 346 (3): 659–69. doi:10.1042/0264-6021:3460659. ISSN 0264-6021. PMC 1220898. PMID 10698692.
  21. ^ Gao G, Fernandez CS, Stapleton D, Auster AS, Widmer J, Dyck JR, Kemp BE, Witters LA (April 1996). "Non-catalytic beta- and gamma-subunit isoforms of the 5'-AMP-activated protein kinase". J. Biol. Chem. 271 (15): 8675–81. doi:10.1074/jbc.271.15.8675. PMID 8621499.
  22. ^ Yang X, Jiang R, Carlson M (December 1994). "A family of proteins containing a conserved domain that mediates interaction with the yeast SNF1 protein kinase complex". EMBO J. 13 (24): 5878–86. doi:10.1002/j.1460-2075.1994.tb06933.x. PMC 395563. PMID 7813428.

추가 읽기

외부 링크

  • PDBe-KB는 휴먼 5'-AMP 활성화 단백질 키나제 하위단위 베타-1(PRKAB1)에 대해 PDB에서 이용할 수 있는 모든 구조 정보의 개요를 제공한다.
이 문서는 공용 도메인 PfamInterPro의 텍스트를 통합한다: IPR006828