GPR113
GPR113| ADGRF3 | |||||||||||||||||||||||||
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| 식별자 | |||||||||||||||||||||||||
| 별칭 | ADGRF3, PGR23, hGPCR37, GPR113, 접착 G 단백질 결합 수용체 F3 | ||||||||||||||||||||||||
| 외부 ID | MGI: 2685887 HomoloGene: 17826 GeneCard: ADGRF3 | ||||||||||||||||||||||||
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| 직교체 | |||||||||||||||||||||||||
| 종 | 인간 | 마우스 | |||||||||||||||||||||||
| 엔트레스 | |||||||||||||||||||||||||
| 앙상블 | |||||||||||||||||||||||||
| 유니프로트 | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(mRNA) |
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| RefSeq(단백질) | |||||||||||||||||||||||||
| 위치(UCSC) | Chr 2: 26.31 – 26.35Mb | Cr 5: 30.4 – 30.41Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed 검색 | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| 위키다타 | |||||||||||||||||||||||||
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GPR113은 Problem G-단백질 결합 수용체 113 단백질을 인코딩하는 유전자다.[5][6]
유전자
호모 사피엔스 GPR113 유전자는 2번 염색체(2p23.3)에 위치한다.이 유전자는 염기 26531041부터 음기둥 26569685까지 38.65kb의 영역에 걸쳐 있다.[7]GPR113 유전자는 음의 가닥 양쪽에 OTOF otoferlin 선행과 HADHA hydroxycyl-CoA 후속이라는 두 개의 이웃을 가지고 있다.양성 가닥의 GPR113 바로 맞은편에는 EPT1 유전자가 있다.GPR113 유전자는 PGR23과 HGPCR37이라는 가명으로도 알려져 있다.[8]
호몰로지 앤 에볼루션
GPR113은 5개의 인간 파라로그 GPR110, GPR115, GPR128, GPR111, GPR116을 가지고 있다. GPR113은 영장류에서 반수종까지 포유류에서 일부 양서류뿐만 아니라 잘 보존되어 있다.[8]여기에는 일반 침팬지, 아프리카 부시 코끼리, 플라티푸스, 그리고 서부 발톱 개구리가 포함된다.[9]7 transmembrane reception (Secretin family) 영역의 직교 중심 전체에 잘 보존된 동질 도메인은 그림에서 보라색으로 강조 표시되어 있다.[10]
단백질
GPR113 유전자의 단백질 산물은 G단백질 결합 수용체다.그 단백질은 인간에게 세 가지 성서변형을 가지고 있다.[11]이 세 가지 중에서 GPR113 Variant 1은 아미노산 염기서열이 가장 길고, 직교까지 정체성이 가장 높다.이로써 GPR113 변종 1은 조상 GPR113 유전자의 호모 사피엔스 후손이라는 결론에 이르게 된다.GPR113 Var 1은 1079 아미노산을 함유하고 있으며 플라즈마 막에 내장되어 있다.[12]7-통과 수용체에는 오른쪽 그림에서 강조된 신호 펩타이드(빨간색), 호르몬 수용체 도메인(파란색), 라트로필린/CL-1과 유사한 GPS 도메인(오렌지), 7-트랜섬브레인 수용체(Purple) 4개의 영역이 포함되어 있다.호르몬 수용체 도메인과 GPS 사이에는 강조되지 않은 알 수 없는 기능의 도메인이 있다.
함수
GPR113은 신경펩타이드 신호 경로에 관여하는 G 단백질 결합 수용체다.[12]
표현 & 질병
GPR113은 병든 조건에서 차등적으로 표현되는 것으로 밝혀졌다.제2형 당뇨병의 조건에서 다른 성적표에 상대적인 백분위수는 정상 세포 기능에 비례하여 감소한다.[13]다양한 중요 신체 프로세스를 매개하는 TP63을 삭제하면 GPR113 표현도 줄어든다.[14]생쥐의 뇌에서 소뇌와 후각 전구는 모두 GPR113 유전자의 전사를 보여준다.[15]또한, 국립 청각 및 기타 의사소통 장애 연구소의 연구에 따르면, GPR113 표현은 미각 수용체 세포의 하위 집합으로 매우 제한되는 것으로 밝혀졌다.[16]이 논문의 결론은 후각 전구 표현 수준과 결합되어, 잠재적으로 GPR113의 기능에 대해 더 많은 것을 밝혀내면서, 미래 연구의 길을 제공할 수 있다.
상호작용 단백질
GPR113은 고아 G 단백질 결합 수용체 GPR123과 연관된 것으로 밝혀졌다.[17]
전사 계수
| 가장 가능성이[18] 높은 상위 10개의 전사 요인 |
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| S8형 홈도메인 바인딩 사이트 |
| S8형 홈도메인 바인딩 사이트 |
| DLX-1, -2 및 -5 바인딩 사이트 |
| TCF/LEF-1(2차 DNA 결합 기본 설정) |
| 세균세포특정 전사인자 NOBOX를 함유한 홈박스 |
| 스팔트 유사 전사 인자 1 |
| 전사적 압착기 CDP |
| ESC에서 활성화된 FOXP1의 대체 스플리싱 변종 |
| S8형 홈도메인 바인딩 사이트 |
| 세균세포특정 전사인자 NOBOX를 함유한 홈박스 |
임상적 유의성
이 단백질의 임상적 중요성은 규명되지 않았다.그러나 표현 프로파일은 특히 맛과 냄새를 연구하는 분야에서 GPR113 유전자의 향후 연구에 대한 흥미로운 방향을 제시한다.
참조
- ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000173567 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000067642 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Fredriksson R, Lagerstrom MC, Hoglund PJ, Schioth HB (November 2002). "Novel human G protein-coupled receptors with long N-terminals containing GPS domains and Ser/Thr-rich regions". FEBS Lett. 531 (3): 407–14. doi:10.1016/S0014-5793(02)03574-3. PMID 12435584. S2CID 7449692.
- ^ "Entrez Gene: GPR113 G protein-coupled receptor 113".
- ^ "Homo sapiens chromosome 2, GRCh37.p13 Primary Assembly". 2013-08-13.
{{cite journal}}:Cite 저널은 필요로 한다.journal=(도움말) - ^ a b https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=GPR113
- ^ "BLAST: Basic Local Alignment Search Tool".
- ^ "SDSC Biology Workbench".
- ^ "Homo sapiens adhesion G protein-coupled receptor F3 (ADGRF3), transcript variant 2, mRNA". 2018-06-24.
{{cite journal}}:Cite 저널은 필요로 한다.journal=(도움말) - ^ a b "ADGRF3 - Adhesion G-protein coupled receptor F3 precursor - Homo sapiens (Human) - ADGRF3 gene & protein".
- ^ "71224040 - GEO Profiles - NCBI".
- ^ "34655140 - GEO Profiles - NCBI".
- ^ "Gene Detail :: Allen Brain Atlas: Mouse Brain".
- ^ Lopezjimenez, N. D.; Sainz, E; Cavenagh, M. M.; Cruz-Ithier, M. A.; Blackwood, C. A.; Battey, J. F.; Sullivan, S. L. (2005). "Two novel genes, Gpr113, which encodes a family 2 G-protein-coupled receptor, and Trcg1, are selectively expressed in taste receptor cells". Genomics. 85 (4): 472–82. doi:10.1016/j.ygeno.2004.12.005. PMID 15780750.
- ^ "STRING: Functional protein association networks".
- ^ "ElDorado Introduction".
추가 읽기
- Takeda S, Kadowaki S, Haga T, et al. (2002). "Identification of G protein-coupled receptor genes from the human genome sequence". FEBS Lett. 520 (1–3): 97–101. doi:10.1016/S0014-5793(02)02775-8. PMID 12044878. S2CID 7116392.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Vassilatis DK, Hohmann JG, Zeng H, et al. (2003). "The G protein-coupled receptor repertoires of human and mouse". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100 (8): 4903–8. Bibcode:2003PNAS..100.4903V. doi:10.1073/pnas.0230374100. PMC 153653. PMID 12679517.
- Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al. (2003). "The Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), a Large-Scale Effort to Identify Novel Human Secreted and Transmembrane Proteins: A Bioinformatics Assessment". Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
- Bjarnadóttir TK, Fredriksson R, Höglund PJ, et al. (2005). "The human and mouse repertoire of the adhesion family of G-protein-coupled receptors". Genomics. 84 (1): 23–33. doi:10.1016/j.ygeno.2003.12.004. PMID 15203201.
