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SCNN1D

SCNN1D
SCNN1D
식별자
별칭SCNN1D, ENACd, ENACdelta, SCNED, dNaCh, 나트륨 채널 상피 1 델타 서브 유닛, 나트륨 채널 상피 델타 1 서브 유닛
외부 IDOMIM: 601328 호몰로진: 48152 GeneCard: SCNN1D
직교체
종인간마우스
엔트레스

6339

n/a

앙상블

ENSG00000162572

n/a

유니프로트

P51172

n/a

RefSeq(mRNA)

NM_001130413
NM_002978

n/a

RefSeq(단백질)

NP_00112385

n/a

위치(UCSC)Chr 1: 1.28 – 1.29Mbn/a
PubMed 검색[2]n/a
위키다타
인간 보기/편집

SCNN1D 유전자는 척추동물의 상피 나트륨 채널 ENAC의 Δ(델타) 하위 단위에 대해 인코딩한다.ENaC는 3개의 동음이의 서브유닛 α, β 및 β 또는 Δ, β, of로 구성된 이단트리머로 조립된다.[3]다른 ENAC 하위 유니트는 SCNN1A, SCN1B 및 SCN1G에 의해 인코딩된다.

ENAC는 상피세포로 표현되며 뉴런의 작용 전위 생성에 관여하는 전압 게이트 나트륨 채널과는 다르다.전압 게이트 나트륨 채널에 대한 유전자 인코딩의 약어는 SCN이라는 세 글자로 시작한다. 이러한 나트륨 채널과 대조적으로 ENaC는 구성적으로 활성적이며 전압에 의존하지 않는다.약어(SCNN1D)의 두 번째 N은 이들 채널이 비전압 게이트 채널임을 나타낸다.

대부분의 척추동물에서, 나트륨 이온은 세포외 액체의 삼몰래성의 주요 결정인자다.[4]ENAC는 투과성이 낮은 이른바 '긴축성'으로 상피세포막을 가로질러 나트륨 이온의 전달을 허용한다.상피에 걸친 나트륨 이온의 흐름은 세포외 액체의 삼몰래성에 영향을 미친다.따라서 ENaC는 체액과 전해질 동태현상 조절에 중심적인 역할을 하며 결과적으로 혈압에 영향을 미친다.[5]

ENAC는 아밀로라이드에 의해 강하게 억제되므로, 「아밀로라이드 민감 나트륨 채널」이라고도 한다.

역사

ENA의 델타 서브 유닛을 인코딩하는 첫 번째 cDNA는 인간의 신장 mRNA에서 발트만 외 연구진에 의해 복제되고 시퀀싱되었다.[6]

유전자 구조

SCNN1D 유전자의 순서는 인간 게놈 프로젝트에 의해 처음 밝혀졌다.SCNN1D는 1번 염색체의 짧은 팔(ENSG00000162572)에 위치하며, 전방 스트랜드의 뉴클레오티드 1,280,436에서 시작한다.그것의 길이는 약 11,583 bp이다.이 유전자는 서로 다른 전사 및 번역 개시 사이트를 통해 몇 가지 대체 대본을 인코딩한다(아래 그림 1 참조).인간의 뇌에서 추출한 mRNA 샘플에서 대체 스플리싱 제품이 검출되고, 복제되고, 특성이 있다.[7][8] SCNN1D 유전자는 대부분의 척추동물에서 발견된다.[3]하지만 이 유전자는 쥐와 쥐 게놈에서 사라졌다.[9] [10]

조직별 표현식

Δ-subunit의 조직별 표현은 SCNN1A, SCN1B, SCN1G로 인코딩된 다른 3개의 하위 유니트의 표현과는 매우 다르다.α, β, γ 아유닛은 주로 신장관 상피부, 호흡기 기도,[11] 여성 생식기관,[11] 대장, 침엽, 땀샘에서 발현되는 반면 [12]Δ-부위는 주로 뇌, 췌장, 고환, 난소에서 발현된다.[10]

단백질 구조

4개의 ENAC 하위 단위의 1차 구조는 모두 강한 유사성을 보여준다.따라서 이 네 가지 단백질은 공통의 조상을 공유하는 단백질군을 나타낸다.글로벌 정렬(부분적인 부분만이 아니라 전체 길이를 따라 시퀀스 정렬을 의미)에서 인간 Δ 하위 유닛은 α 하위 유닛과 34%, β 및 β 하위 유닛과 23%의 아이덴티티를 공유한다.[3]

,이 TM부문은 막 이중층 구조 안에 내장되어 있는 모든 네개의 ENaC 소단위 시퀀스가 두 투과 성막 세그먼트 TM1과 TM2.[13]은 막결합 형태에서 이름을 구성하는 두 소수성 스트레칭, 그리고 카르복시 말단amino- 지역 세포 내에서, 그리고 두 TMs 부분이 전 남편은 세포 밖에서 여전히 위치해 있다.tracENAC의 타원형 영역이 세포외 영역은 각 서브 유닛의 잔류물의 약 70%를 포함한다.그러므로 멤브레인 결합형에서는 각 서브 유닛의 대부분이 셀 외부에 위치한다.

ENAC의 구조는 아직 결정되지 않았다.그러나, 동질 단백질 ASIC1의 구조는 해결되었다.[14][15]치킨 ASIC1 구조는 ASIC1이 3개의 동일한 서브유닛의 호모트라이머로 조립된 것을 밝혔다.원래의 연구의 저자들은 ASIC1 트리머가 공을 잡는 손과 닮았다고 제안했다.[14]따라서 ASIC1의 구별되는 영역은 손바닥, 너클, 손가락, 엄지손가락 및 β-볼이라고 한다.[14]

ENAC 서브유닛 시퀀스를 ASIC1 시퀀스로 정렬하면 TM1과 TM2 세그먼트 및 팜 영역이 보존되며 너클, 핑거 및 엄지 도메인이 ENAC에 삽입되어 있음을 알 수 있다.ENAC 서브유닛에 대한 현장 지향 돌연변이 유발 연구는 ASIC1 구조 모델의 많은 기본 특성이 ENAC에도 적용된다는 증거를 제공한다.[3]그러나 ENaC는 αβ³ 또는 βδΔ 트리머로 3개의 서브유닛으로 구성된 의무 이단형 헤테로트리머이다.[16]

관련 질병

지금까지 델타 서브 유닛의 돌연변이는 특정 질병과 연관되지 않았다.

메모들

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000162572 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ a b c d Hanukoglu I, Hanukoglu A (January 2016). "Epithelial sodium channel (ENaC) family: Phylogeny, structure-function, tissue distribution, and associated inherited diseases". Gene. 579 (2): 95–132. doi:10.1016/j.gene.2015.12.061. PMC 4756657. PMID 26772908.
  4. ^ Bourque CW (July 2008). "Central mechanisms of osmosensation and systemic osmoregulation". Nature Reviews. Neuroscience. 9 (7): 519–31. doi:10.1038/nrn2400. PMID 18509340. S2CID 205504313.
  5. ^ Rossier BC, Baker ME, Studer RA (January 2015). "Epithelial sodium transport and its control by aldosterone: the story of our internal environment revisited". Physiological Reviews. 95 (1): 297–340. doi:10.1152/physrev.00011.2014. PMID 25540145.
  6. ^ Waldmann R, Champigny G, Bassilana F, Voilley N, Lazdunski M (November 1995). "Molecular cloning and functional expression of a novel amiloride-sensitive Na+ channel". The Journal of Biological Chemistry. 270 (46): 27411–4. doi:10.1074/jbc.270.46.27411. PMID 7499195.
  7. ^ Yamamura H, Ugawa S, Ueda T, Nagao M, Shimada S (October 2006). "A novel spliced variant of the epithelial Na+ channel delta-subunit in the human brain". Biochemical and Biophysical Research Communications. 349 (1): 317–21. doi:10.1016/j.bbrc.2006.08.043. PMID 16930535.
  8. ^ Giraldez T, Afonso-Oramas D, Cruz-Muros I, Garcia-Marin V, Pagel P, González-Hernández T, Alvarez de la Rosa D (August 2007). "Cloning and functional expression of a new epithelial sodium channel delta subunit isoform differentially expressed in neurons of the human and monkey telencephalon". Journal of Neurochemistry. 102 (4): 1304–15. doi:10.1111/j.1471-4159.2007.04622.x. PMID 17472699. S2CID 18291486.
  9. ^ Ji HL, Zhao RZ, Chen ZX, Shetty S, Idell S, Matalon S (December 2012). "δ ENaC: a novel divergent amiloride-inhibitable sodium channel". American Journal of Physiology. Lung Cellular and Molecular Physiology. 303 (12): L1013–26. doi:10.1152/ajplung.00206.2012. PMC 3532584. PMID 22983350.
  10. ^ a b Giraldez T, Rojas P, Jou J, Flores C, Alvarez de la Rosa D (August 2012). "The epithelial sodium channel δ-subunit: new notes for an old song". American Journal of Physiology. Renal Physiology. 303 (3): F328–38. doi:10.1152/ajprenal.00116.2012. PMID 22573384.
  11. ^ a b Enuka Y, Hanukoglu I, Edelheit O, Vaknine H, Hanukoglu A (March 2012). "Epithelial sodium channels (ENaC) are uniformly distributed on motile cilia in the oviduct and the respiratory airways". Histochemistry and Cell Biology. 137 (3): 339–53. doi:10.1007/s00418-011-0904-1. PMID 22207244. S2CID 15178940.
  12. ^ Duc C, Farman N, Canessa CM, Bonvalet JP, Rossier BC (December 1994). "Cell-specific expression of epithelial sodium channel alpha, beta, and gamma subunits in aldosterone-responsive epithelia from the rat: localization by in situ hybridization and immunocytochemistry". The Journal of Cell Biology. 127 (6 Pt 2): 1907–21. doi:10.1083/jcb.127.6.1907. PMC 2120291. PMID 7806569.
  13. ^ Canessa CM, Merillat AM, Rossier BC (December 1994). "Membrane topology of the epithelial sodium channel in intact cells". The American Journal of Physiology. 267 (6 Pt 1): C1682–90. doi:10.1152/ajpcell.1994.267.6.C1682. PMID 7810611.
  14. ^ a b c Jasti J, Furukawa H, Gonzales EB, Gouaux E (September 2007). "Structure of acid-sensing ion channel 1 at 1.9 A resolution and low pH". Nature. 449 (7160): 316–23. doi:10.1038/nature06163. PMID 17882215.
  15. ^ Baconguis I, Bohlen CJ, Goehring A, Julius D, Gouaux E (February 2014). "X-ray structure of acid-sensing ion channel 1-snake toxin complex reveals open state of a Na(+)-selective channel". Cell. 156 (4): 717–29. doi:10.1016/j.cell.2014.01.011. PMC 4190031. PMID 24507937.
  16. ^ Hanukoglu I (2017). "ASIC and ENaC type sodium channels: Conformational states and the structures of the ion selectivity filters". The FEBS Journal. 284 (4): 525–545. doi:10.1111/febs.13840. PMID 27580245. S2CID 24402104.

추가 읽기

외부 링크