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TNNT1

TNNT1
TNNT1
식별자
별칭TNNT1, ANM, NEM5, STNT, TNT, 트로포닌 T1, 느린 골격형
외부 IDOMIM: 191041 MGI: 1333868 호몰로진: 20704 GeneCard: TNNT1
직교체
종인간마우스
엔트레스

7138

21955

앙상블

ENSG00000105048

ENSMUSG00000064179

유니프로트

P13805
Q3B759

O88346

RefSeq(mRNA)

NM_001126132
NM_001126133
NM_001291774
NM_003283

NM_001277903
NM_001277904
NM_011618
NM_001360154

RefSeq(단백질)

NP_001119604
NP_001119605
NP_001278703
NP_003274

NP_001264832
NP_001264833
NP_035748
NP_001347083

위치(UCSC)Cr 19: 55.13 – 55.15MbCr 7: 4.5 – 4.52Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
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느린 골격근 트로포닌 T(sTnT)는 인간에서 TNNT1 유전자에 의해 암호화된 단백질이다.[5][6]

TNNT1 유전자는 인간 염색체 게놈의 19q13.4에 위치하며 트로포닌 T(ssTnT)의 느린 골격근 이소 형태를 인코딩하고 ssTnT는 262개의 아미노산(첫 번째 메티오닌 포함)으로 구성된 약 32kDa 단백질로 5.95의 등전점(pI)이 있다. 느리게 경련이 일어나는 골격근 섬유의 사커에 트로포닌 콤플렉스의 트로포닌 결합 및 얇은 필라멘트 고정 서브 유닛이다.[7][8][9] TNNT1 유전자는 척추동물의 느린 골격근으로 구체적으로 표현되는데, 건조육지 두꺼비(Bufo) 심장근육이 심장 TnT 이외의 ssTnT를 발현한다는 한 가지 예외는 있다.[10]

진화

TnT TnI gene pairs.jpg

척추동물에서 세 개의 동질 유전자가 진화하여 TnT의 세 개의 근육형별 등소형태를 부호화하였다.[9] 각각의 TnT 이소폼 유전자는 염색체 DNA에서 트로포닌 복합체의 억제 하위단위를 인코딩하는 3개의 트로포닌 I[11] 이소폼 유전자 중 하나에 연결되어 3개의 유전자 쌍을 형성한다. 빠른 골격근 TnI(fsTnI)-fsTnT, ssTnI-cardiac(cTnT) 및 cTnI-ssTnT 유전자 쌍. 서열과 에피토프 보존 연구는 근육형별 TnT와 TnI 등본형식을 인코딩하는 유전자가 fsTnI-like-fsTnT-like 유전자 쌍의 복제로부터 진화했을 수 있다는 것을 시사했다.[12] 세 개의 TnI-TnT 유전자 쌍의 진화적 혈통은 cTnI-ssTnT가 가장 최신이며[12] 가장 밀접하게 연관되어 있음을 보여준다.[13]

단백질 시퀀스 정렬을 통해 TNNT1 유전자는 척추동물 종들 사이에서 보존도가 높은 것으로 입증되었다(그림 2). 특히 중후반과 C단자 지역에서, 3가지 근육형 이소형은 척추동물 종들 사이에서 크게 갈라진다.[8][9]

TNNT1 gene phylogenic tree.jpg

대체 스플라이싱

포유류와 조류종에서 TNNT1 유전자는 총 14개의 엑손(exon)을 가지고 있으며, 그 중 5개의 엑손(exon)이 N-단자영역의 11-아미노산을 번갈아 분할하여 높은 분자중량과 느린 분자중량의 TnT 스플라이스를 생성한다(Jin, Chen et al. 1998).[14][15] 생화학적 연구에 따르면 TnT 스플라이스 형태는 중간 및 C-단자 영역에서 서로 다른 분자 순응을 검출할 수 있으며, TnI와 트로포미오신(tropomyosin)에 대해 서로 다른 결합 친화력을 생성한다.[8][9] ssTnT의 대안적인 스플라이스 형태는 생리적 병리적 조건에서의 골격근 적응에 역할을 한다.[16] intron 5의 대체 수용체 부위에서 대체 스플리싱은 ssTnT의 N-단자 영역에 단일 아미노산 차이를 발생시키며,[15] 그 중 기능적 유의성이 확립되지 않았다.

임상적 유의성

한 난센스 돌연변이 E180X은 엑손 11TNNT1 유전자의 열성 nemaline myopathy의 심각한 형태는 원래 펜실베이니아의 올드 주문 아미시 인구, USA.[17][18]버림은ssTnT 폴리 펩티드 사슬의 E180X는 돌연변이에 의해에서 발견된 아미시 사람들 Nemaline Myopathy(ANM)을 일으키는데, 삭제합니다는tropomyosin-binding 사이트 2[19]뿐만 아니라. 결합 자리s C-단자 영역의 TnI 및 트로포닌 C(TnC)용(그림 3). 열성 표현형과 일치하여 잘린 ssTnT는 근막에 통합할 수 없고 근육 세포에서 완전히 저하된다.[20]

Skeletal troponin complex structure.tif

Tnnt1 유전자 표적 쥐 연구는 ANM의 균질한 표현형태를 재현했다.[21][22] ssTnT null 마우스의 경우 격막 및 발바닥 근육에서 타입 I 느린 섬유질이 현저하게 감소했고, 타입 II 빠른 섬유들의 비대증, 피로성 증가, 느린 섬유들의 활성 재생이 나타났다([21]Wei, Lu et al. 2014).

최근의 사례 보고에 따르면 TNNT1 유전자에서 아미쉬 개체군 이외의 네말린 균사체를 유발하는 세 가지 돌연변이가 더 발견되었다. exon 9의 말도 안 되는 돌연변이 S108X는 심각한 열성성 네말린 근병증 표현형을 가진 히스패닉 남성 환자에게서 발견되었다.[23] 8번과 14번 삭제의 원인이 되는 복합 이질 TNNT1 유전자 돌연변이를 가진 네덜란드 환자도 네말린 근병증 표현형을 나타낸다.[24] TNNT1 유전자(c.574_577 delins TAGTCTGT)의 재배열로 인해 단백질의 C단말 절단을 유발하는 이상 스플라이싱(L203 절단)이 열성적으로 유전된 네말린 미병증이 있는 관련되지 않은 7가족의 9명의 팔레스타인 환자들에게 보고되었다.[25]

그림 3에 나타낸 S108X 돌연변이는 ssTnT 단백질을 잘라 E180X와 동등한 기능적 구조의 손실을 유발한다. exon 8 삭제는 중간 지역인 트로포미오신 바인딩 사이트 1을 파괴한다.[19][26] L203 절단은 TnI와 TnC의 결합 부위는 삭제하지만 트로포모신 결합 부위 1과 2는 모두 보존한다.[19] 이 새로운 돌연변이가 체내 액틴트로포미오신의 얇은 필라멘트를 어떻게 결합시킬 수 있는지, 열성 네말린 근증을 어떻게 유발하는지는 아직 연구할 필요가 있다.

exon 5의 대체 스플라이싱은 ssTnT의 높은 분자량 및 낮은 분자량 스플라이스 형태를 생성한다. 저분자 ssTnT는 제1형(데밀레이션)에서는 크게 상향조정되었지만 제2형(axon loss) 샤르코트-마리-토스병은 아니었으며,[16] 근섬유에서 TnT의 구조변형이 뉴런 활성화의 이상 적응에 기여할 수 있음을 시사했다.

상호작용

TNNT1은 PRKG1과 상호작용하는 것으로 나타났다.[27]

[28] [29] [30]

메모들

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000105048 - 앙상블, 2017년 5월
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