XCL1

XCL1
XCL1
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭XCL1, ATAC, LPTN, LTN, SCM-1, SCM-1a, SCM1, SCM1A, SCYC1, X-C 모티브 케모카인 리간드 1
외부 IDOMIM: 600250 MGI: 104593 호몰로진: 2250 GeneCard: XCL1
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_002995

NM_008510

RefSeq(단백질)

NP_002986

NP_032536

위치(UCSC)Chr 1: 168.58 – 168.58MbChr 1: 164.76 – 164.76Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

케모카인(C 모티브) 리간드(XCL1)는 C 케모카인과에 속하는 작은 사이토카인으로 림프토락틴이라고도 한다.케모카인은 염증반응과 면역반응에서 기능을 하는 것으로 알려져 있다.이 C 계열의 케모카인은 대부분의 케모카인과 구조와 기능이 다르다.[5][6]이 계열에는 단 두 개의 케모카인이 있을 뿐이며, 다른 케모카인과 그들을 분리시킨 것은 두 개의 시스테인, 즉 N-터미네랄 시스테인과 다운스트림 시스테인 한 개만 가지고 있다는 것이다.이 두 가지를 모두 림프액틴, 알파, 베타 형태라고 하며, 둘 사이에서만 발견되는 특수성을 주장한다.림프액틴은 구속력을 변화시키는 되돌릴 수 있는 순응적 변화를 겪을 수 있다.[7]

정상 조직에서 XCL1은 비장, 흉선, 소장, 말초혈액 백혈구에서 높은 수치로, , 전립선, 난소에서 낮은 수치로 발견된다.XCL1의 분비는 말초혈액 림프구에서 세포내 칼슘의 증가의 원인이 된다.[8]XCL1을 위한 세포 소스는 활성화된 흉선과 말초혈액 CD8+ T 세포를 포함한다.[9][10][11]NK세포는 감염 초기에 다른 화학약품과 함께 XCL1을 분비한다.[12]덴드리트 세포(DC)[12]를 표현하는 XCR1은 XCL1의 주요 대상이다.

인간에게 있어 XCL1은 XCL2라고 불리는 또 다른 케모카인과 밀접하게 관련되어 있는데, 이 케모카인유전자는 1번 염색체의 같은 위치에서 발견된다.[11]이 두 케모카인은 많은 유전적, 기능적 유사점을 공유한다. 하지만 XCL2는 쥐가 아닌 사람에서만 관찰되는 것으로 알려져 있다.[12]XCL1은 Chemokine 수용체 XCR1에 결합하여 화학적 기능을 유도한다.[13] XCL1은 대식세포, 섬유질, 특정 림프구에 표현된다.[6]

LTN은 10°C의 모노머, LTN10의 모노머와 40°C의 조광기, LTN40의 두 가지 상태에서 발견된다.[14]

게노믹스

XCL1의 유전자는 인포박스에서 보이는 세포유전성 밴드 Q24.2에 위치한 염색체 1의 긴 팔에서 발견된다.인코딩 유전자는 단백질 XCL1을 위해 인코딩하기 위해 6,017개의 DNA 베이스로 만들어진다.[15]이 유전자는 세 개의 엑손과 두 개의 인트론뿐만 아니라 여러 개의 전사 개시 부위도 포함하고 있다.[8]이 유전자는 XCL1이라고 불리는 114-아미노산 단백질인 XCL1을 암호화하는 것으로, 1차, 3차 사이스테인 특성이 없다는 점을 제외하면 다른 케모킨과 비슷하다.이는 XCL1이 다른 화학 물질과 마찬가지로 두 개 또는 세 개 대신 이황화 결합을 생성하는 한 개의 시스테인만 함유하고 있다는 것을 의미한다.[5]

XCL1과 XCL2의 유전적 차이는 매우 작다.두 단백질은 이황화 결합 1개를 포함하는 C 모티브 구조를 포함하는 동일한 계열의 단백질이며 거의 동일한 3차 구조를 가지고 있다.[8]이 C 케모킨들은 또한 동일한 옆구리 영역을 가지고 있는데, 는 RNA 전사 유전자에 기여하지 않는 촉진자와 다른 단백질 빙하를 포함한 유전자의 영역을 의미한다.[8]이 케모카인 계열의 유전자 지도는 단 하나의 뚜렷한 차이와 함께 그들의 인트론엑손 위치의 유사성을 보여준다.XCL1은 L7a라고 불리는 큰 리보솜 서브 유닛을 위해 인코딩하는 첫 번째 인트론에서 단 하나의 차이만을 가지고 있다.XCL2에서 L7a에 대한 지역 인코딩은 차단된다.[8]두 성숙한 단백질 사이의 유일한 다른 유전적 차이점은 위치 7과 8에서 다른 아미노산이다.[8][12]이 아미노산 차이는 약간의 생물학적 차이를 설명할 수 있다.이 두 화학물질을 비교할 때 어려운 점은 XCL2가 생쥐에서 관찰된 적이 없다는 것이다.[12]

구조

XCL1을 다른 사이토카인들과 차별화하는 한 가지는 그것의 구조다.[7]대부분의 케모카인은 N-terminus를 구조물의 핵심에 연결하는 이황화 결합을 두 개 가지고 있는 반면, XCL1은 한 개만 가지고 있다.[5]이황화 결합의 단순한 차이는 다른 화학 물질과의 XCL1의 전체적인 3차 구조를 변화시킨다.림프액틴 단백질에는 구조 Ltn10과 Ltn40이라는 두 부분이 서로 접혀 생물학적으로 활동하게 하는 구조 Ltn10과 Ltn40이 있다.[7]이러한 순응적 변화는 케모킨의 결합 구조를 변화시킨다.인터폴딩에 대한 이러한 이해는 림프액틴 운동학을 이해할 수 있는 더 많은 근거를 제공한다.[7]

생물학적 의의

XCL1과 XCR1의 쌍은 적응성 세포독성 면역뿐만 아니라 교차현상, 항원 흡수, 선천성 유도에 관여하는 것으로 알려져 있다.[12]XCL1의 수용체인 XCR1은 기존의 덴드리트 세포로만 표현된다.[12]XCL1은 IFN 감마를 포함한 다른 화학 물질과 함께 NK 세포와 항원 특이 CD8+ T세포에 의해 분비된다.[12]이 과정은 아마도 덴드리트 세포에 의한 항원의 교차표현을 용이하게 할 것이다.

XCL1은 류마티스성 관절염에 걸린 관절의 T세포도 증가시키는 것으로 알려져 있다.[6]그것들은 또한 RA synovial 림프구에 표현된다.[6]

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000143184 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000026573 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b c Wang X, Sharp JS, Handel TM, Prestegard JH (2013). "Chemokine oligomerization in cell signaling and migration". In Giraldo J, Ciruela F (eds.). Progress in Molecular Biology and Translational Science. Vol. 117. pp. 531–578. doi:10.1016/B978-0-12-386931-9.00020-9. ISBN 978-0-12-386931-9. PMC 3937849. PMID 23663982.
  6. ^ a b c d Szekanecz Z, Koch AE (2017). "Cell Recruitment and Angiogenesis". In Firestein GS, Budd RC, Gabriel SE, McInnes IB, O'Dell JR (eds.). Kelly and Firestein's Textbook of Rheumatology. Elsevier. pp. 384–395. doi:10.1016/B978-0-323-31696-5.00025-5. ISBN 978-0-323-31696-5.
  7. ^ a b c d Hundeiker M (2009). "[The clinical picture of the effects of radiation on the skin]". Strahlenschutz in Forschung und Praxis. 28: 160–4. doi:10.1016/S0076-6879(09)05403-2. PMC 3686570. PMID 19480914.
  8. ^ a b c d e f Yoshida T, Imai T, Takagi S, Nishimura M, Ishikawa I, Yaoi T, Yoshie O (October 14, 1996). "Structure and expression of two highly related genes encoding SCM-1/human lymphotactin". FEBS Letters. 395 (1): 82–88. doi:10.1016/0014-5793(96)01004-6. PMID 8849694.
  9. ^ Kelner GS, Kennedy J, Bacon KB, Kleyensteuber S, Largaespada DA, Jenkins NA, Copeland NG, Bazan JF, Moore KW, Schall TJ (November 1994). "Lymphotactin: a cytokine that represents a new class of chemokine". Science. 266 (5189): 1395–9. Bibcode:1994Sci...266.1395K. doi:10.1126/science.7973732. PMID 7973732.
  10. ^ Kennedy J, Kelner GS, Kleyensteuber S, Schall TJ, Weiss MC, Yssel H, Schneider PV, Cocks BG, Bacon KB, Zlotnik A (July 1995). "Molecular cloning and functional characterization of human lymphotactin". Journal of Immunology. 155 (1): 203–9. PMID 7602097.
  11. ^ a b Yoshida T, Imai T, Takagi S, Nishimura M, Ishikawa I, Yaoi T, Yoshie O (October 1996). "Structure and expression of two highly related genes encoding SCM-1/human lymphotactin". FEBS Letters. 395 (1): 82–8. doi:10.1016/0014-5793(96)01004-6. PMID 8849694.
  12. ^ a b c d e f g h Kroczek RA, Henn V (February 10, 2012). "The role of XCR1 and its Ligand XCL1 in antigen cross-presentation by murine and human dendritic cells". Front. Immunol. 3 (14): 14. doi:10.3389/fimmu.2012.00014. PMC 3342032. PMID 22566900.
  13. ^ Yoshida T, Imai T, Kakizaki M, Nishimura M, Takagi S, Yoshie O (June 1998). "Identification of single C motif-1/lymphotactin receptor XCR1". The Journal of Biological Chemistry. 273 (26): 16551–4. doi:10.1074/jbc.273.26.16551. PMID 9632725.
  14. ^ Tyler RC, Murray NJ, Peterson FC, Volkman BF (August 2011). "Native-state interconversion of a metamorphic protein requires global unfolding". Biochemistry. 50 (33): 7077–9. doi:10.1021/bi200750k. PMC 3160782. PMID 21776971.
  15. ^ "XCL1 Gene(Protein Coding)". GeneCards human gene database.