대사망

Metabolic network

대사 네트워크는 세포생리적, 생화학적 특성을 결정하는 대사 및 물리적 과정의 전체 세트이다.따라서 이러한 네트워크는 신진대사의 화학반응, 신진대사 경로 및 이러한 반응을 이끄는 조절 상호작용을 포함한다.

완전한 게놈 배열로, 박테리아에서 인간에 이르는 많은 유기체의 생화학 반응 네트워크를 재구성하는 것이 가능해졌다.다음 중 몇 가지 네트워크를 온라인으로 사용할 수 있습니다.교토 유전자와 게놈 백과사전(KEGG),[1] 에코사이크,[2] 바이오사이크[3], 메타TIGER.[4] 대사 네트워크는 신진대사를 연구하고 모델링하는 강력한 도구입니다.


Metro-style map of major metabolic pathways



MEP
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메트로 스타일 맵의 주요 대사 경로.텍스트(경로 또는 대사물 이름)를 클릭하여 해당 문서에 연결합니다.
한 줄: 대부분의 생명체에 공통되는 경로입니다.이중선: 사람 내에는 없는 경로(식물, 곰팡이, 원핵생물 등)Metabolic metro orange.svg 오렌지노드: 탄수화물 Metabolic metro purple.svg대사. 보라색 림프절: 광합성.Metabolic metro red.svg 빨간색 노드: 세포 호흡.Metabolic metro pink.svg 분홍색 노드: 세포 시그널링.Metabolic metro blue.svg 파란 노드: 아미노산 대사.Metabolic metro grey.svg 회색 림프절: 비타민보조인자 대사.Metabolic metro brown.svg 갈색 림프절: 뉴클레오티드단백질 대사.Metabolic metro green.svg 녹색 림프절: 지질대사.


사용하다

대사 네트워크는 병든 [5]환자의 동병상련 패턴을 검출하기 위해 사용될 수 있다.비만과 당뇨병과 같은 특정 질병은 같은 개인에게 동시에 존재할 수 있으며, 때로는 한 질병이 다른 [6]질병의 중요한 위험 요인이 되기도 한다.질병 표현형 자체는 일반적으로 세포가 필수적인 기질을 파괴하거나 생성하지 못한 결과이다.그러나 한 반응에서의 효소 결함은 다른 후속 반응의 플럭스에 영향을 미칠 수 있다.이러한 계단식 효과는 동반 질환 효과를 초래하는 후속 반응과 관련된 대사 질환을 결합한다.따라서, 대사 질환 네트워크는 상관된 [5]반응으로 인해 두 장애가 연관되어 있는지 여부를 판단하기 위해 사용될 수 있다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ "GenomeNet". www.genome.ad.jp. Archived from the original on 2009-02-24. Retrieved 2020-04-01.
  2. ^ "EcoCyc: Encyclopedia of E. coli Genes and Metabolic Pathways". www.ecocyc.org.
  3. ^ "BioCyc Pathway/Genome Database Collection". biocyc.org.
  4. ^ "metaTIGER - Home". www.bioinformatics.leeds.ac.uk. Archived from the original on 2012-03-04. Retrieved 2010-06-09.
  5. ^ a b Lee, D.- S.; Park, J.; Kay, K. A.; Christakis, N. A.; Oltvai, Z. N.; Barabasi, A.- L. (2008). "The implications of human metabolic network topology for disease comorbidity". Proceedings of the National Academy of Sciences. 105 (29): 9880–9885. doi:10.1073/pnas.0802208105. PMC 2481357. PMID 18599447.
  6. ^ Ross, R.; Dagnone, D.; Jones, P. J.; Smith, H.; Paddags, A.; Hudson, R.; Janssen, I. (2000). "Reduction in obesity and related comorbid conditions after diet-induced weight loss or exercise-induced weight loss in men. A randomized, controlled trial". Annals of Internal Medicine. 133 (2): 92–103. doi:10.7326/0003-4819-133-2-200007180-00008. PMID 10896648. S2CID 13415272.