60S 리보솜 단백질 L38

60S ribosomal protein L38
RPL38
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스RPL38, L38, 리보솜단백질 L38
외부 IDOMIM: 604182 MGI: 1914921 HomoloGene: 87098 GeneCard: RPL38
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_001035258
NM_000999

NM_001048057
NM_001048058
NM_023372
NM_001362918

RefSeq(단백질)

NP_000990
NP_001030335

NP_001041522
NP_001041523
NP_075861
NP_001349847

장소(UCSC)Chr 17: 74.2~74.21 MbChr 11: 114.56 ~114.56 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

60S 리보솜 단백질 L38은 RPL38 [5][6]유전자에 의해 인체에서 암호화되는 단백질이다.

인간 RPL38 유전자는 17q25.1의 염색체 긴 팔에 있다.6223 bp의 거리에 걸쳐 5개의 엑손으로 구성되어 있습니다.213 뉴클레오티드 공개 판독 프레임은 70개의 아미노산 단백질을 암호화합니다.동일한 단백질을 코드하는 대체 스플라이스 변형이 확인되었다.리보솜 단백질을 코드하는 유전자의 전형과 같이, 이 유전자의 복수의 가공된 의사유전자가 게놈을 통해 분산되어 있으며, 앤지오텐신 II 수용체 타입 1 [6]유전자의 프로모터 영역에 위치하고 있는 것을 포함한다.

기능.

단백질 합성을 촉매하는 기관인 리보솜은 작은 40S 서브유닛과 큰 60S 서브유닛으로 구성됩니다.이 소단위들은 모두 4개의 RNA 종과 약 80개의 구조적으로 구별되는 단백질로 구성되어 있다.이 유전자는 60S 서브유닛의 구성요소인 리보솜 단백질을 암호화한다.이 단백질은 리보솜 단백질의 L38E 계열에 속합니다.그것은 세포질[6]위치해 있다.

유전학

Rpl38 궤적 전체를 포함하는 ~18kbp 삭제는 테일 쇼트(Ts) 돌연변이 마우스 표현형의 기초가 됩니다.호모 접합 상태에서 Ts 쥐는 임신 3~4일 후에 죽는다.Ts/+ 헤테로 접합 배아는 빈혈을 겪고 골격 기형을 일으킨다.산전 기간 동안 헤테로 접합체의 30%가 죽는다.살아남은 헤테로 접합 T는 짧은 꼬리,[7] 구부러진 꼬리, 기타 변형된 꼬리의 많은 변형을 보인다.그들은 또한 야생형 동물들보다 무게가 덜 나가지만 그 외에는 정상적인 수명을 가지고 있다.또한 Ts 마우스는 생후 3~4주 정도에 청력 시작 직후 전도성 난청이 발생한다.난청은 달팽이관 바깥의 둥근 창문 능선을 따라 이소성 골화, 중이강 내 콜레스테롤 결정의 대량 퇴적, 확장된 이관, 그리고 [8]누수가 있는 만성 중이염의 결과입니다.

RPL38의 기능상실 대립 유전자인 Drosophila melanogaster는 호모 접합체의 배아 치사, 장기 성장 및 헤테로 접합체의 강모 단축을 일으킨다.돌연변이의 하플로 불충분한 성질 때문에 표현형은 우성 [9]형질로서 유전된다.

인간의 경우, 리보솜 단백질의 돌연변이는 다이아몬드 블랙팬 빈혈을 일으킨다.그러나 인간 RPL38의 돌연변이와 관련된 질병은 아직 없다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000172809 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000057322 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, Davis E, Goodman N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (Aug 1998). "A map of 75 human ribosomal protein genes". Genome Res. 8 (5): 509–23. doi:10.1101/gr.8.5.509. PMID 9582194.
  6. ^ a b c "Entrez Gene: RPL38 ribosomal protein L38".
  7. ^ Morgan, WC (1950). "A new tail-short mutation in the mouse whose lethal effects are conditioned by the residual genotypes". The Journal of Heredity. 41 (8): 208–15. doi:10.1093/oxfordjournals.jhered.a106131. PMID 14779008.
  8. ^ Noben-Trauth K, Latoche JR (January 2011). "Ectopic Mineralization in the Middle Ear and Chronic Otitis Media with Effusion Caused by RPL38 Deficiency in the Tail-short (Ts) Mouse". J. Biol. Chem. 286 (4): 3079–3093. doi:10.1074/jbc.M110.184598. PMC 3024801. PMID 21062742.
  9. ^ Marygold, S. J.; Coelho, C.; Leevers, S. (2005). "Genetic Analysis of RpL38 and RpL5, Two Minute Genes Located in the Centric Heterochromatin of Chromosome 2 of Drosophila melanogaster". Genetics. 169 (2): 683–695. doi:10.1534/genetics.104.034124. PMC 1449105. PMID 15520262.

외부 링크

추가 정보