진핵 시작 인자 3
Eukaryotic initiation factor 3진핵 시작 인자 3(eIF3)은 진핵 변환의 개시 단계 동안 기능하는 다단백질 복합체다.[2]그것은 대부분의 형태의 캡 의존적이고 캡 독립적인 번역 개시에 필수적이다.인간의 경우 eIF3는 13개의 비식별적 서브유닛(eIF3a-m)으로 구성되며, 결합 분자량이 ~800kDa에 달해 가장 큰 번역 개시계수가 된다.[3]eIF3 단지는 eukaryotes에 걸쳐 광범위하게 보존되지만, 개별 하위 단위의 보존은 유기체마다 다르다.예를 들어, 대부분의 포유류 eIF3 단지는 13개의 서브유닛으로 구성되어 있지만, 신생 효모의 eIF3는 서브유닛이 6개(eIF3a, b, c, g, i, j)[4]에 불과하다.
함수
eIF3는 번역 시작의 거의 모든 단계를 자극한다.[4]eIF3는 또한 재활용과 같은 번역의 다른 단계에 참여하는 것으로 보이며, 여기서 말기 후 리보솜의 분리를 촉진한다.[5]uORF에 따른 재조정의 특수한 경우, eIF3는 후속 개시 이벤트를 촉진하기 위해 연장 및 종료를 통해 리보솜에 계속 구속될 수 있다.[6]또한 연구 결과 eIF3는 효모에 있는 코돈 읽기를 프로그램화한 중지 코돈 읽기를 통해 사전종단 복합체와 상호작용하고 해독을 방해하는 역할을 하는 것으로 나타났다.[7]
상호작용
eIF3는 소형 리보솜 서브 유닛(40S)을 용매 측면과 근방에서 결합하며, 몇 가지 다른 시작 요소인 DHX29와 mRNA의 발판 역할을 한다. eIF3는 멀티팩터 콤플렉스(MFC)와 43S 및 48S 프리초기 콤플렉스(PICs)의 구성요소다.[4]예를 들어 포유류 eIF3가 eIF4G를 통해 eIF4F 복합체와 직접 상호작용하는 반면, 싹트기 효모는 이러한 연결이 결여되어 있다.[4]그러나 포유류와 효모 eIF3 모두 eIF1, eIF4B, eIF5를 독립적으로 결합한다.[2][8]
eIF3의 여러 하위유닛에는 RNA 인식 모티브(RM) 및 기타 RNA 결합 도메인이 포함되어 있어 eIF3가 HCV IRES를 포함하여 세포 및 바이러스 IRES mRNA와 상호 작용하는 멀티유닛 RNA 결합 인터페이스를 형성하고 있다.[4] eIF3는 또한 특별히6 mA 수정 RNA를 5' 내에 바인딩하는 것으로 입증되었다.캡 독립 번역을 촉진하기 위한 UTR.[9]
싹트고 있는 효모의 eIF3의 5가지 핵심 부항은 열로 인한 응력 과립에 있으며, 다른 몇 가지 번역 요소도 있다.[10]
구조
기능적 eIF3 복합체는 고유 출처에서 정제하거나 재표현된 서브유닛에서 재구성할 수 있다.[11][12]개별 서브유닛은 구조적으로 X선 결정학과 NMR이 특징인 반면 단지들은 크라이오-EM이 특징이다.[13][14][15]완전한 인간 eIF3의 구조는 이용할 수 없지만, 거의 완전한 복합체는 43S PIC의 맥락에서 중간 해상도로 결정되었다.[1]포유류 eIF3의 구조 코어는 주로 PCI/MPN 옥타머로 구성된 의인화된 특징을 가진 5-로브 입자로 설명된다.[12]PCI 도메인은 프로테아솜 캡(P), COP9 시그널로솜(C), eIF3(I) 사이의 구조적 유사성을 위해 명명된 반면 MPN 도메인은 MPr1-PadI N-단자 도메인과 구조적 유사성을 위해 명명되었다.[12]
신호
eIF3는 S6K1과 mTOR/Raptor를 통한 셀룰러 신호의 허브 역할을 한다.[16]특히 eIF3는 비활성 상태에서 S6K1에 의해 구속되며, 활성화된 mTOR/Raptor는 eIF3에 바인딩되어 있고, 인산염 S6K1은 eIF3에서 출시를 촉진한다.인광 처리된 S6K1은 eIF4B를 포함한 다수의 자체 표적에서 인광화되지 않으므로 변환 제어의 메커니즘으로 작용한다.
병
eIF3의 개별 하위유닛은 여러 인간 암에서 과압축(a, b, c, h, i, m)과 불압축(e, f)이다.[3]유방암과 악성 전립선암에서는 eIF3h가 과다압박된다.[17]또한 eIF3는 특정 세포 증식 mRNA를 결합하고 이들의 번역을 규제하는 것으로 나타났다.[18]eIF3는 또한 HIV와 HCV를 포함한 많은 중요한 인간 병원체의 수명 주기에도 기능한다.특히 eIF3의 d-분위는 HIV 프로테아제의 기질이며, eIF3 서브유닛 d, e, f의 유전적 녹다운은 알 수 없는 이유로 바이러스 감염성을 증가시킨다.[19]
수부닛
eIF3 서브유닛은 여러 종에서 느슨하게 구속되고 생존가능성에 필수적이지 않은 eIF3J를 제외하고, 단지 내에서 동일한 스토이치측정법에 존재한다.[11][20][21]서브유닛은 원래 포유류에서 분자량(A가 가장 높음)에 의해 알파벳순으로 조직되었지만, 분자량의 배열은 종마다 다를 수 있다.[22]
서브유닛 | MW(kDa)[A] | 주요 기능 |
---|---|---|
A | 167 | 몇 가지 인간 암에 대한 규제를 강화했다.[3]셀룰러 mRNA에 직접 연동.[18] PCI 도메인 포함.[12] |
B | 92 | 몇 가지 암에 대한 규제 강화.[3]셀룰러 mRNA와 직접 연결. [18]RRM 포함.[11] |
C | 105 | 몇 가지 암에 대한 규제 강화.[3]PCI 도메인 포함.[12]인간 패러로그 eIF3CL이 있다. |
D | 64 | 핵분열 효모 생장에 필수불가결한 것.[4]셀룰러 mRNA와 직접 교차 링크하고 선택된 mRNA의 5'cap을 바인딩한다.[23]HIV 프로테아제의 기질.[19] |
E | 52 | 유방암과 폐암에 대한 규제완화.[3]핵분열 효모와[24] 뉴로스포라 크라사 성장의 필수불가결한 것.[21]PCI 도메인 포함.[12] |
F | 38 | 몇몇 암에 대한 규제를 완화했다.[3]MPN 도메인 포함.[12] |
G | 36 | RRM. Crosslinks를 세포 mRNA에 직접 연결한다.[11][18] |
H | 40 | 몇 가지 암에 대한 규제 강화.[3]핵분열 효모,[25] Neurospora crassa [21]및 인간 세포 라인의 성장에 필수적이지 않음.[26][27]MPN 도메인 포함.[12] |
I | 36 | 몇 가지 암에 대한 규제 강화.[3] |
J | 29 | 느슨하게 묶인 비스토리히계 소단위.[4]40S 리보솜 서브 유닛을 디코딩 센터 내에 결합한다.[28]싹이 돋아나는 효모 생장에 필수적이지 않다.[4] |
K | 25 | Neurospora crassa의 성장에 필수적이지 않음.[21]PCI 도메인 포함.[12] |
L | 67 | Neurospora crassa의 성장에 필수적이지 않음.[21]PCI 도메인 포함.[12] |
M | 43 | 인간 대장암에 대한 규제를 강화했다.[3] |
A 유니프로트에서 나온 인간 서브유닛프로트의 인간 서브유닛의 분자량.
참고 항목
참조
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