60S 리보솜 단백질 L13

60S ribosomal protein L13
RPL13
사용 가능한 구조
PDB휴먼 유니프로트 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스RPL13, BBC1, D16S444E, D16S44E, L13, 리보솜단백질 L13, SEMDIST
외부 IDOMIM: 113703 MGI: 3642685 HomoloGene: 5568 GeneCard: RPL13
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_033251
NM_000977
NM_001243130
NM_001243131

XM_036163486

RefSeq(단백질)

NP_000968
NP_001230060
NP_150254

없음

장소(UCSC)Chr 16: 89.56 ~89.56 MbChr 3: 58.89 ~58.9 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

60S 리보솜 단백질 L13은 RPL13 [5][6]유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 단백질이다.

기능.

단백질 합성을 촉매하는 기관인 리보솜은 작은 40S 서브유닛과 큰 60S 서브유닛으로 구성됩니다.이 소단위들은 모두 4개의 RNA 종과 약 80개의 구조적으로 구별되는 단백질로 구성되어 있다.이 유전자는 60S 서브유닛의 구성요소인 리보솜 단백질을 암호화한다.이 단백질은 L13E 계열의 리보솜 단백질에 속합니다.그것은 세포질에 위치해 있다.이 유전자는 유방암보다 양성 유방 병변에서 현저하게 높은 수준으로 발현된다.대체 스플라이싱 및/또는 대체 폴리아데닐화로부터 파생된 전사 변종이 존재하며, 이러한 변종들은 동일한 단백질을 부호화한다.리보솜 단백질을 코드하는 유전자의 전형과 같이,[6] 이 유전자의 여러 가공된 유사 유전자가 게놈을 통해 분산되어 있다.

상호 작용

RPL13은 CDC5L[7]상호작용하는 으로 나타났습니다.

BBC1

Bbc1(Mti1p)은 효모에서 발현되는 단백질로 액틴 네트워크와 관련이 있다고 생각됩니다.Bbc1은 Bni1 합성치사, Bee1 복합체 멤버의 줄임말이다.[8]다른 이름인 Mti1p는 Myosin tail region-interacting [9]protein의 줄임말이다.Bbc1은 세포내구증 동안 세포골격 조절에 관여한다.발아 효모 Bbc1은 Arp2/3 복합체 Las17(WASP 호몰로그)[10]의 활성을 억제한다.그 단백질은 또한 마이오신1 [9]단백질의 꼬리와 상호작용한다.

핵분열 효모에서 Bbc1은 WIP 계열 세포골격 단백질로 간주된다.Bbc1은 피질 패치, 세포 분열 부위, 세포 끝 및 세포에서 작용하도록 국소화한다.bbc1 유전자 결실을 가진 세포는 생존할 [11]수 있다.Bbc1은 Nebulin 패밀리 액틴 필라멘트 고정 단백질 Cyk3와[12] SMARCAD1 패밀리 ATP 의존성 DNA 헬리케이스 Fft3에 [11][13]의해 포착된다.Bbc1은 WIP 호몰로그 Vrp1과 경쟁하여 Myosin 1 꼬리를 결합하고 세포 부위의 [14]액틴 조립을 조절합니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000167526 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000059776 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, Davis E, Goodman N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (August 1998). "A map of 75 human ribosomal protein genes". Genome Res. 8 (5): 509–23. doi:10.1101/gr.8.5.509. PMID 9582194.
  6. ^ a b "Entrez Gene: RPL13 ribosomal protein L13".
  7. ^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (December 2000). "Functional analysis of the human CDC5L complex and identification of its components by mass spectrometry". EMBO J. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093/emboj/19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.
  8. ^ "BBC1 SGD". www.yeastgenome.org. Retrieved 2020-01-09.
  9. ^ a b Mochida J, Yamamoto T, Fujimura-Kamada K, Tanaka K (March 2002). "The novel adaptor protein, Mti1p, and Vrp1p, a homolog of Wiskott-Aldrich syndrome protein-interacting protein (WIP), may antagonistically regulate type I myosins in Saccharomyces cerevisiae". Genetics. 160 (3): 923–34. doi:10.1093/genetics/160.3.923. OCLC 678661938. PMC 1462009. PMID 11901111.
  10. ^ Rodal AA, Manning AL, Goode BL, Drubin DG (June 2003). "Negative regulation of yeast WASp by two SH3 domain-containing proteins". Current Biology. 13 (12): 1000–8. doi:10.1016/s0960-9822(03)00383-x. PMID 12814545. S2CID 11363803.
  11. ^ a b "Pombase". www.pombase.org. Retrieved 2020-01-09.
  12. ^ Roberts-Galbraith RH, Ohi MD, Ballif BA, Chen JS, McLeod I, McDonald WH, et al. (July 2010). "Dephosphorylation of F-BAR protein Cdc15 modulates its conformation and stimulates its scaffolding activity at the cell division site". Molecular Cell. 39 (1): 86–99. doi:10.1016/j.molcel.2010.06.012. PMC 2916701. PMID 20603077.
  13. ^ Lee J, Choi ES, Seo HD, Kang K, Gilmore JM, Florens L, et al. (February 2017). "Fft3 induces nucleosome disassembly to facilitate RNA polymerase II elongation". Nature Communications. 8: 14527. Bibcode:2017NatCo...814527L. doi:10.1038/ncomms14527. PMC 5321744. PMID 28218250.
  14. ^ MacQuarrie CD, Mangione MC, Carroll R, James M, Gould KL, Sirotkin V (September 2019). "S. pombe adaptor protein Bbc1 regulates localization of Wsp1 and Vrp1 during endocytic actin patch assembly". Journal of Cell Science. 132 (17): jcs233502. doi:10.1242/jcs.233502. PMC 6771142. PMID 31391237.

추가 정보

외부 링크

  • PDBe-KB는 인간 60S 리보솜 단백질 L13에 대한 PDB에서 사용 가능한 모든 구조 정보에 대한 개요를 제공합니다.