16번 염색체

Chromosome 16
16번 염색체
Human male karyotpe high resolution - Chromosome 16 cropped.png
인간 염색체 16쌍은 G-밴드화 후야
하나는 어머니로부터, 다른 하나는 아버지로부터.
Human male karyotpe high resolution - Chromosome 16.png
16번 염색체 쌍
인간 남성 핵그램에서요
특징들
길이(bp)90,338,345 bp
(GRCh38)[1]
No. 유전자의795(CCDS)[2]
유형오토썸
동원체 위치메타센트릭[3]
(36.8 Mbp[4])
완전한 유전자 리스트
CCDS유전자 리스트
HGNC유전자 리스트
유니프로트유전자 리스트
엔씨비유전자 리스트
외부 지도 뷰어
앙상블16번 염색체
엔트레즈16번 염색체
엔씨비16번 염색체
UCSC16번 염색체
완전한 DNA 배열
참조NC_000016(FASTA)
GenBankCM000678(FASTA)

16번 염색체는 인간의 23쌍의 염색체 중 하나이다.사람들은 보통 이 염색체를 두 개 복제한다.16번 염색체는 약 9천만 개의 염기쌍(DNA의 구성 물질)에 걸쳐 있으며 세포 총 DNA의 3% 미만을 차지한다.

유전자

유전자수

다음은 인간 16번 염색체의 유전자 수 추정치입니다.연구자들이 게놈 주석을 달기 위해 다른 접근 방식을 사용하기 때문에 각 염색체의 유전자 수에 대한 예측은 다양합니다(기술적인 자세한 내용은 유전자 예측 참조).다양한 프로젝트 중 CCDS(협업적 합의 코딩 시퀀스 프로젝트)는 매우 보수적인 전략을 취합니다.따라서 CCDS의 유전자 수 예측은 인간의 단백질을 코드하는 [5]유전자 수의 하한선을 나타냅니다.

추정자 단백질 코드화 유전자 비부호화 RNA 유전자 유사 유전자 원천 발매일
CCDS 795 [2] 2016-09-08
HGNC 802 251 365 [6] 2017-05-12
앙상블 865 1,046 462 [7] 2017-03-29
유니프로트 838 [8] 2018-02-28
엔씨비 912 652 502 [9][10][11] 2017-05-19

유전자 리스트

다음은 인간 염색체 16번 유전자의 일부 목록입니다.전체 목록은 오른쪽 정보 상자에 있는 링크를 참조하십시오.

질병 및 장애

관련 특성

세포유전대

인간 염색체 G-밴드 표식문자 16
분해능 850 bph의 인간 염색체 16의 G-밴드 표상문자.이 다이어그램의 밴드 길이는 베이스 페어 길이에 비례합니다.이러한 유형의 표의문자는 일반적으로 게놈 브라우저(Ensubbl, UCSC Genome Browser)에서 사용됩니다.
세 가지 다른 분해능(400,[14] 550[15][4] 850)에서 인간 염색체 16의 G-밴드 패턴.이 다이어그램의 밴드 길이는 ISCN(2013)[16]의 IDEogram을 참조해 주세요.이러한 유형의 표의문자는 유사분열 [17]과정 동안 서로 다른 순간에 현미경으로 관찰된 실제 상대 밴드 길이를 나타냅니다.
분해능 850 bphs의[18] 인간 16번 염색체의 G-밴드
크르. [19] 밴드[20] ISCN
개시하다[21]
ISCN
멈추다[21]
베이스 페어
개시하다
베이스 페어
이제 그만
얼룩[22] 밀도
16 p 13.3 0 352 1개 7,800,000 불량품
16 p 13.2 352 596 7,800,001 10,400,000 gpos 50
16 p 13.13 596 813 10,400,001 1,250,000 불량품
16 p 13.12 813 948 12,500,001 1,470,000 gpos 50
16 p 13.11 948 1070 14,700,001 1,670,000 불량품
16 p 12.3 1070 1246 16,700,001 21,200,000 gpos 50
16 p 12.2 1246 1409 21,200,001 24,200,000 불량품
16 p 12.1 1409 1558 24,200,001 28,500,000 gpos 50
16 p 11.2 1558 1856 28,500,001 3,530,000 불량품
16 p 11.1 1856 2045 35,300,001 36,800,000 acen
16 q 11.1 2045 2194 36,800,001 38,400,000 acen
16 q 11.2 2194 2709 38,400,001 4700,000 gvar
16 q 12.1 2709 2953 47,000,001 5,260,000 불량품
16 q 12.2 2953 3142 52,600,001 56,000,000 gpos 50
16 q 13 3142 3346 56,000,001 57,300,000 불량품
16 q 21 3346 3657 57,300,001 66,600,000 gpos 100
16 q 22.1 3657 4023 66,600,001 70,800,000 불량품
16 q 22.2 4023 4118 70,800,001 7,200,000 gpos 50
16 q 22.3 4118 4294 72,800,001 74,100,000 불량품
16 q 23.1 4294 4551 74,100,001 79,200,000 gpos 75
16 q 23.2 4551 4659 79,200,001 81,600,000 불량품
16 q 23.3 4659 4768 81,600,001 84,100,000 gpos 50
16 q 24.1 4768 4930 84,100,001 8700,000 불량품
16 q 24.2 4930 5025 87,000,001 88,700,000 gpos 25
16 q 24.3 5025 5120 88,700,001 90,338,345 불량품

레퍼런스

  1. ^ "Human Genome Assembly GRCh38 - Genome Reference Consortium". National Center for Biotechnology Information. 2013-12-24. Retrieved 2017-03-04.
  2. ^ a b "Search results - 16[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("has ccds"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. CCDS Release 20 for Homo sapiens. 2016-09-08. Retrieved 2017-05-28.
  3. ^ Tom Strachan; Andrew Read (2 April 2010). Human Molecular Genetics. Garland Science. p. 45. ISBN 978-1-136-84407-2.
  4. ^ a b 게놈 장식 페이지, NCBIHomo sapient에 대한 표의도 데이터(850 bphs, 어셈블리 GRCh38.p3)최종 갱신 2014-06-03.2017-04-26 취득.
  5. ^ Pertea M, Salzberg SL (2010). "Between a chicken and a grape: estimating the number of human genes". Genome Biol. 11 (5): 206. doi:10.1186/gb-2010-11-5-206. PMC 2898077. PMID 20441615.
  6. ^ "Statistics & Downloads for chromosome 16". HUGO Gene Nomenclature Committee. 2017-05-12. Retrieved 2017-05-19.
  7. ^ "Chromosome 16: Chromosome summary - Homo sapiens". Ensembl Release 88. 2017-03-29. Retrieved 2017-05-19.
  8. ^ "Human chromosome 16: entries, gene names and cross-references to MIM". UniProt. 2018-02-28. Retrieved 2018-03-16.
  9. ^ "Search results - 16[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Retrieved 2017-05-20.
  10. ^ "Search results - 16[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ( ("genetype miscrna"[Properties] OR "genetype ncrna"[Properties] OR "genetype rrna"[Properties] OR "genetype trna"[Properties] OR "genetype scrna"[Properties] OR "genetype snrna"[Properties] OR "genetype snorna"[Properties]) NOT "genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Retrieved 2017-05-20.
  11. ^ "Search results - 16[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype pseudo"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Retrieved 2017-05-20.
  12. ^ Maillard, A M (25 November 2014). "The 16p11.2 locus modulates brain structures common to autism, schizophrenia and obesity". Molecular Psychiatry. 20 (1): 140–147. doi:10.1038/mp.2014.145. PMC 4320286. PMID 25421402.
  13. ^ Richter, M (21 February 2018). "Altered TAOK2 activity causes autism-related neurodevelopmental and cognitive abnormalities through RhoA signaling". Molecular Psychiatry. 24 (9): 1329–1350. doi:10.1038/s41380-018-0025-5. PMC 6756231. PMID 29467497.
  14. ^ 게놈 장식 페이지, NCBIHomo sapient에 대한 표의도 데이터(400 bphs, 어셈블리 GRCh38.p3)마지막 업데이트 2014-03-04.2017-04-26 취득.
  15. ^ 게놈 장식 페이지, NCBIHomo sapient에 대한 표의도 데이터(550 bphs, 어셈블리 GRCh38.p3)최종 갱신 2015-08-11.2017-04-26 취득.
  16. ^ International Standing Committee on Human Cytogenetic Nomenclature (2013). ISCN 2013: An International System for Human Cytogenetic Nomenclature (2013). Karger Medical and Scientific Publishers. ISBN 978-3-318-02253-7.
  17. ^ Sethakulvichai, W.; Manitpornsut, S.; Wiboonrat, M.; Lilakiatsakun, W.; Assawamakin, A.; Tongsima, S. (2012). Estimation of band level resolutions of human chromosome images. In Computer Science and Software Engineering (JCSSE), 2012 International Joint Conference on. pp. 276–282. doi:10.1109/JCSSE.2012.6261965. ISBN 978-1-4673-1921-8. S2CID 16666470.
  18. ^ 게놈 장식 페이지, NCBIHomo sapient에 대한 표의도 데이터(850 bphs, 어셈블리 GRCh38.p3)최종 갱신 2014-06-03.2017-04-26 취득.
  19. ^ "p" : 짧은 팔, "q" : 긴 팔.
  20. ^ 세포 유전학적 밴드 명명법은 문서 궤적을 참조하십시오.
  21. ^ a b 이러한 값(ISCN 시작/중지)은 ISCN 책, 인간 세포유전학적 명명법을 위한 국제 시스템(2013)의 밴드/아이디어의 길이를 기반으로 한다.임의의 단위
  22. ^ gpos: G 밴딩에 의해 긍정적으로 염색된 영역, 일반적으로 AT가 풍부하고 유전자가 부족한 영역, gneg: G 밴딩에 의해 음성적으로 염색된 영역, 일반적으로 CG가 풍부하고 유전자가 풍부한 영역, acen Centromere.var: 가변 영역; 줄기: 줄기.

외부 링크

  • National Institutes of Health. "Chromosome 16". Genetics Home Reference. Archived from the original on August 3, 2004. Retrieved 2017-05-06.
  • "Chromosome 16". Human Genome Project Information Archive 1990–2003. Retrieved 2017-05-06.