해리 상수

Dissociation constant

화학, 생화학약리학에서 해리상수( D \displaystyle 복합체분자로 분해되거나 소금이 분해될 때처럼 더 작은 구성요소로 가역적으로 분리(분리)하려는 더 큰 물체의 성향을 측정하는 특정 유형의 평형상수이다.o 성분 이온해리 상수는 연관 상수의 역수입니다.소금의 특수한 경우 해리 상수는 이온화 [1]상수라고도 할 수 있다.[2] 일반적인 반응의 경우:

A B(\style }})가 x A 서브유닛과 y B 서브유닛으로 분해되는 경우 해리상수는 다음과 같이 정의됩니다.

여기서 [A], [B], [ABxy]는 각각 A, B, 착체x A의y 평형 농도이다.

는 해리 생화학과 약리학에서 상수의 인기의 한 이유는은 점에서 자주 발생 사례에서 x)y=1, KD 간단한 물리적 해석:[A]=KD{\displaystyle[{\ce{A}}]=K_{D}}, 그때[B])[AB형입니다]{\displaystyle[{\ce{B}}]=[{\ce{AB}}]}거나 동등하다. [ + [ ] 2{ { } } { { \ { B } } } + [ { \ { AB } }} = 420 {= 즉, 농도의D 크기는 A의 절반과 같습니다.이 간단한 해석은 x 또는 y 이 큰 경우에는 적용되지 않습니다.또한 파생상품이 경쟁적 [citation needed]구속력을 명시적으로 허용하고 기술하도록 확장될 수 있지만 경쟁적 반응이 없다고 가정한다.EC50IC50이 물질의 생물학적 활성을 설명하는 것과 마찬가지로 물질의 결합에 대한 간단한 설명으로 유용합니다.

결합분자 농도

결합 부위가 1개인 분자

실험적으로 분자복합체 [AB][3]의 농도는 [A] 또는 [B] 중 하나의 유리분자의 농도 측정에서 간접적으로 구한다.원칙적으로 반응에 첨가되는 분자 [A]0와 [B]0의 총량은 알려져 있다.질량 보존 원리에 따라 자유 성분과 결합 성분으로 분리됩니다.

복합체 [AB]의 농도를 추적하기 위해 각 보존 방정식의 자유 분자([A] 또는 [B])의 농도를 해리 상수의 정의로 대체한다.

이것은 유리 분자 중 하나의 농도와 관련된 복합체의 농도를 산출한다.

동일한 독립 결합 부위를 가진 고분자

많은 생물학적 단백질과 효소는 하나 이상의 결합 [3]부위를 가질 수 있다.일반적으로 리간드 L이 고분자 M과 결합하면 고분자에 결합하는 다른 리간드 L의 결합 동태에 영향을 미칠 수 있다.모든 결합부위의 친화성이 고분자에 결합된 리간드의 수에 관계없이 고려될 수 있는 경우 단순화된 메커니즘을 공식화할 수 있다.이는 둘 이상의 동일한 서브유닛으로 구성된 고분자에 유효합니다.그런 다음 이들 n개의 서브유닛은 각각 동일하고 대칭적이며 단일 결합부위만을 가지고 있다고 가정할 수 있다.결합 리간드[ 농도는

이 경우 [] [ [ ]}는) 모든 부분 포화 상태의 고분자를 포함합니다.

포화가 단계적으로 일어나는 곳

일반 결합 방정식의 도출에서 포화 rr은 결합 배위자 부분에서 고분자 총량에 대한 몫으로 정의된다.

모든 미시적 해리[clarification needed] 상수가 동일하더라도 거시적 해리 상수와 다르며 결합 [clarification needed]단계마다 차이가 있다.결합 부위 n개에 대한 두 유형의 해리 상수 사이의 일반적인 관계는 다음과 같습니다.

따라서 고분자에 대한 결합 배위자의 비율은

여기서( i ) ! ( -)! ( { {} { i } ={ n ! ( n - ) !i(는) 이항 계수입니다.그리고 첫 번째 방정식은 이항규칙을 적용하여 증명된다.

단백질-리간드 결합

해리 상수는 일반적으로 L: P리간드 P) 사이의 친화력, 즉 리간드가 특정 단백질에 얼마나 단단히 결합하는지를 설명하는 데 사용됩니다.리간드-단백질 친화력은 수소 결합, 정전 상호작용, 소수성 [4][5]판데르발스 힘과 같은 두 분자 사이의 비공유 분자간 상호작용에 의해 영향을 받는다.친화력은 또한 고분자의 고농도의 다른 고분자에 의해 영향을 받을 수 있으며, 고분자는 고분자 [6][7]밀집 현상을 일으킨다.

리간드 단백질 LPdisplaystyle 형성은 두 가지 상태 프로세스로 설명할 수 있습니다.

대응하는 해리 상수가 정의되어 있다

여기서[[ { [[ 단백질, 리간드,의 몰 농도를 나타낸다.

그 해리 상수(M)고, 단백질의 절반 equilibrium,[8]에 즉 종사하고 있는 리간드 집중({\displaystyle{\ce{[L]}}}에, 리간드의 집중에서 리간드와 단백질의 농도}[LP]{\displaystyle{\ce{[LP]}반드시 해당합니다}는 사기꾼과 맞먹는 것 몰 단위고 있다.cen리간드가결합되지 않은 단백질의 전이 [해리상수가 작을수록 배위자가 단단하게 결합되거나 배위자와 단백질의 친화력이 높아진다.예를 들어 나노몰(nM) 해리 상수를 가진 리간드는 마이크로몰(μM) 해리 상수를 가진 리간드보다 특정 단백질에 더 밀접하게 결합한다.

두 분자 사이의 비공유 결합 상호작용의 결과로 나타나는 부피코몰 해리 상수는 드물다.[9]그럼에도 불구하고 몇 가지 중요한 예외가 있다.비오틴아비딘은 약 10M−15 = 1fM [10]= 0.000001nM의 해리 상수로 결합한다.리보핵산가수분해효소 억제 단백질은 또한 유사한−15 10M [11]친화력으로 리보핵산가수분해효소에 결합할 수 있다.특정 리간드-단백질 상호작용에 대한 해리 상수는 용액 조건(예: 온도, pH 및 소금 농도)에 따라 유의하게 변할 수 있습니다.다른 용액 조건의 효과는 특정 리간드-단백질 복합체를 함께 유지하는 분자상호작용의 강도를 효과적으로 수정하는 것이다.

약물은 그들이 의도하지 않았거나 상호작용하도록 설계된 단백질과의 상호작용을 통해 해로운 부작용을 일으킬 수 있다.따라서 많은 제약 연구는 높은 친화력을 가진 표적 단백질에만 결합하는 약물(음성 설계)을 설계하거나(일반적으로 0.1-10nM), 특정 약물과 생체 내 단백질 표적 사이의 친화력을 개선하는 데 목적이 있다(양성 설계).

항체

항원(Ag)에 결합하는 항체(Ab)의 특이적 경우, 일반적으로 친화상수라는 용어는 연관상수를 의미한다.

화학적 평형은 온레이트(kforward) 또는 (ka)와 오프레이트(kback) 또는 (kd) 상수의 비율이기도 하다.두 항체는 동일한 친화력을 가질 수 있지만, 하나는 온레이트 상수와 오프레이트 상수를 모두 가질 수 있고, 다른 하나는 온레이트 상수와 오프레이트 상수를 둘 다 가질 수 있다.

산염기 반응

탈양성자의 경우, K는 해리 상수인 K로 알려져a 있다.황산이나 인산처럼 강한 산은 더 큰 해리 상수를 가지고 있고, 아세트산과 같이 약한 산은 더 작은 해리 상수를 가지고 있습니다.

(산 해리 상수에 사용되는 K 결합 상수와 혼동될 수 있으므로 반응 또는 평형 표현을 보고 의미를 파악해야 할 수 있습니다.)

산해리 상수는 p a {\a되는 경우가 있습니다.이것은 다음과 같이 정의됩니다.

p 표기법은 다른 맥락에서도 볼 수 있다. 이러한 해리 상수는 크게 다를 수 있기 때문에 주로 공유 해리(즉, 화학적 결합이 생성되거나 끊기는 반응)에 사용된다.

분자는 여러 개의 산 해리 상수를 가질 수 있다.이 점에서, 그것은 그들이 포기할 수 있는 양성자의 수에 따라 달라지며, 우리는 단프로톤, 이프로톤, 삼프로톤산을 정의한다.첫 번째(예: 아세트산 또는 암모늄)는 하나의 해리성 그룹만을 가지며, 두 번째(예: 탄산, 중탄산, 글리신)는 두 개의 해리성 그룹, 세 번째(예: 인산)는 세 개의 해리성 그룹을 가진다.pK 값이 여러 개인 경우 pK1, pK2, pK3 등의 인덱스로 지정됩니다.아미노산의 경우 pK1 상수는 카르복실기(COOH)를, pK는2 아미노기(-NH2)를, pK는3 측쇄의 pK 값을 나타낸다.

물의 해리 상수

의 해리 상수는 K로 표시된다w.

물의 농도 [HO2]는 관례상 생략된다. 즉, K의 값이 해당w 농도를 사용하여 계산되는 K의 eq 다르다는 것을 의미한다.

K w 아래 표와 같이 온도에 따라 달라집니다.pH와 같은 수량을 정확하게 측정할 때 이 변동을 고려해야 합니다.

수온 Kw pKw[12]
000°C 00.112×10−14 14.95
025 °C 01.023×10−14 13.99
050 °C 05.495×10−14 13.26
075°C 19.120×10−14 12.70
100 °C 56.230×10−14 12.25

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ "Dissociation Constant". Chemistry LibreTexts. 2015-08-09. Retrieved 2020-10-26.
  2. ^ 생물분석화학교과서 De Gruyter 2021 https://doi.org/10.1515/9783110589160-206
  3. ^ a b Bisswanger, Hans (2008). Enzyme Kinetics: Principles and Methods (PDF). Weinheim: Wiley-VCH. p. 302. ISBN 978-3-527-31957-2.
  4. ^ Srinivasan, Bharath (2020-09-27). "Words of advice: teaching enzyme kinetics". The FEBS Journal. 288 (7): 2068–2083. doi:10.1111/febs.15537. ISSN 1742-464X. PMID 32981225.
  5. ^ Srinivasan, Bharath (2021-07-16). "A Guide to the Michaelis‐Menten equation: Steady state and beyond". The FEBS Journal: febs.16124. doi:10.1111/febs.16124. ISSN 1742-464X. PMID 34270860.
  6. ^ Zhou, H.; Rivas, G.; Minton, A. (2008). "Macromolecular crowding and confinement: biochemical, biophysical, and potential physiological consequences". Annual Review of Biophysics. 37: 375–397. doi:10.1146/annurev.biophys.37.032807.125817. PMC 2826134. PMID 18573087.
  7. ^ Minton, A. P. (2001). "The influence of macromolecular crowding and macromolecular confinement on biochemical reactions in physiological media" (PDF). The Journal of Biological Chemistry. 276 (14): 10577–10580. doi:10.1074/jbc.R100005200. PMID 11279227.
  8. ^ Björkelund, Hanna; Gedda, Lars; Andersson, Karl (2011-01-31). "Comparing the Epidermal Growth Factor Interaction with Four Different Cell Lines: Intriguing Effects Imply Strong Dependency of Cellular Context". PLOS ONE. 6 (1): e16536. Bibcode:2011PLoSO...616536B. doi:10.1371/journal.pone.0016536. ISSN 1932-6203. PMC 3031572. PMID 21304974.
  9. ^ Srinivasan, Bharath (2021). "Explicit Treatment of Non‐Michaelis‐Menten and Atypical Kinetics in Early Drug Discovery*". ChemMedChem. 16 (6): 899–918. doi:10.1002/cmdc.202000791. PMID 33231926. S2CID 227157473.
  10. ^ Livnah, O.; Bayer, E.; Wilchek, M.; Sussman, J. (1993). "Three-dimensional structures of avidin and the avidin-biotin complex". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 90 (11): 5076–5080. Bibcode:1993PNAS...90.5076L. doi:10.1073/pnas.90.11.5076. PMC 46657. PMID 8506353.
  11. ^ Johnson, R.; Mccoy, J.; Bingman, C.; Phillips Gn, J.; Raines, R. (2007). "Inhibition of human pancreatic ribonuclease by the human ribonuclease inhibitor protein". Journal of Molecular Biology. 368 (2): 434–449. doi:10.1016/j.jmb.2007.02.005. PMC 1993901. PMID 17350650.
  12. ^ Bandura, Andrei V.; Lvov, Serguei N. (2006). "The Ionization Constant of Water over Wide Ranges of Temperature and Density" (PDF). Journal of Physical and Chemical Reference Data. 35 (1): 15–30. Bibcode:2006JPCRD..35...15B. doi:10.1063/1.1928231.