XPB

XPB
ERCC3
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭ERCC3, 절개 수리 교차 완료 그룹 3, BTF2, GTF2H, RAD25, TFIIH, XPB, TTD2, ERCC 절개 수리 3, TFIIH 코어 복합 헬리코아제 소단위, Ssl2
외부 IDOMIM: 133510 MGI: 95414 HomoloGene: 96 GeneCard: ERCC3
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_000122
NM_001303416
NM_001303418

NM_133658

RefSeq(단백질)

NP_000113
NP_001290345
NP_001290347

NP_598419

위치(UCSC)Chr 2:127.26 – 127.29MbCr 18: 32.37 – 32.4Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

XPB(xeroderma antexosum type B)는 TFIIH 전사 계수 복합체의 일부인 인간의 ATP 의존 DNA 헬리코아제다.

구조

XPB의 고고학적 호몰로로그의 3D 구조는 Scripps 연구소의 존 타이너 박사와 그의 그룹에 의해 X선 결정학에 의해 해결되었다.[5]

함수

XPB는 정상적인 기저 전사, 전사 결합 수리(TCR), 뉴클레오티드 절연 수리(NER)에서 중요한 역할을 한다.정제된 XPB는 3'-5'의 극성으로 DNA를 풀어준다.

NER에서 XPB(ERCC3) 단백질의 기능은 손상이 처음 인식된 후 DNA 이중나선을 푸는 것을 돕는 것이다.NER은 정상적인 염기쌍을 왜곡하는 광범위한 DNA 손상을 제거하는 다단계 경로다.그러한 손상은 부피가 큰 화학적 유도체, 자외선에 의한 피리미딘 다이머, 그리고 몇 가지 형태의 산화적 손상을 포함한다.XPB(ERCC3) 유전자의 돌연변이는 인간에서 코카인 증후군(XPCS)과 결합된 XP(Xeroderma fluexosum) 또는 XP로 이어질 수 있다.[6]XPCS 표현형을 가진 개개인의 돌연변이 XPB 세포는 UV 조사와 급성 산화 스트레스에 민감하다.[7]

장애

XPB와 다른 관련 보완 그룹인 XPA-XPG의 돌연변이는 제로데르마 색소증후군, 코카인 증후군, 삼초티오디스트로피와 같은 많은 유전적 질환을 유발한다.

상호작용

XPB는 다음과 상호 작용하는 것으로 나타났다.

소분자억제제

일반전사계수 TFIIH의 XPB 소단위 억제를 통해 포유류 전사를 억제하는 트립톨라이드(Triptolide)와 같은 강력한 생체활성 천연물이 최근 포도당 전달체 발현량이 증가한 저독성 암세포를 대상으로 하는 포도당 결합제로 보고되고 있다.[18]

참고 항목

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000163161 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG00000024382 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Fan L, Arvai AS, Cooper PK, Iwai S, Hanaoka F, Tainer JA (April 2006). "Conserved XPB Core Structure and Motifs for DNA Unwinding: Implications for Pathway Selection of Transcription or Excision Repair". Molecular Cell. 22 (1): 27–37. doi:10.1016/j.molcel.2006.02.017. PMID 16600867.
  6. ^ Oh KS, Khan SG, Jaspers NG, Raams A, Ueda T, Lehmann A, Friedmann PS, Emmert S, Gratchev A, Lachlan K, Lucassan A, Baker CC, Kraemer KH (2006). "Phenotypic heterogeneity in the XPB DNA helicase gene (ERCC3): xeroderma pigmentosum without and with Cockayne syndrome". Hum. Mutat. 27 (11): 1092–103. doi:10.1002/humu.20392. PMID 16947863. S2CID 22852219.
  7. ^ Andressoo JO, Weeda G, de Wit J, Mitchell JR, Beems RB, van Steeg H, van der Horst GT, Hoeijmakers JH (2009). "An Xpb mouse model for combined xeroderma pigmentosum and cockayne syndrome reveals progeroid features upon further attenuation of DNA repair". Mol. Cell. Biol. 29 (5): 1276–90. doi:10.1128/MCB.01229-08. PMC 2643825. PMID 19114557.
  8. ^ Takeda N, Shibuya M, Maru Y (January 1999). "The BCR-ABL oncoprotein potentially interacts with the xeroderma pigmentosum group B protein". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96 (1): 203–7. Bibcode:1999PNAS...96..203T. doi:10.1073/pnas.96.1.203. PMC 15117. PMID 9874796.
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  10. ^ a b Rossignol M, Kolb-Cheynel I, Egly JM (April 1997). "Substrate specificity of the cdk-activating kinase (CAK) is altered upon association with TFIIH". EMBO J. 16 (7): 1628–37. doi:10.1093/emboj/16.7.1628. PMC 1169767. PMID 9130708.
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  13. ^ Drapkin R, Reardon JT, Ansari A, Huang JC, Zawel L, Ahn K, Sancar A, Reinberg D (April 1994). "Dual role of TFIIH in DNA excision repair and in transcription by RNA polymerase II". Nature. 368 (6473): 769–72. Bibcode:1994Natur.368..769D. doi:10.1038/368769a0. PMID 8152490. S2CID 4363484.
  14. ^ Iyer N, Reagan MS, Wu KJ, Canagarajah B, Friedberg EC (February 1996). "Interactions involving the human RNA polymerase II transcription/nucleotide excision repair complex TFIIH, the nucleotide excision repair protein XPG, and Cockayne syndrome group B (CSB) protein". Biochemistry. 35 (7): 2157–67. doi:10.1021/bi9524124. PMID 8652557.
  15. ^ Wang XW, Yeh H, Schaeffer L, Roy R, Moncollin V, Egly JM, Wang Z, Freidberg EC, Evans MK, Taffe BG (June 1995). "p53 modulation of TFIIH-associated nucleotide excision repair activity". Nat. Genet. 10 (2): 188–95. doi:10.1038/ng0695-188. hdl:1765/54884. PMID 7663514. S2CID 38325851.
  16. ^ Weeda G, Rossignol M, Fraser RA, Winkler GS, Vermeulen W, van 't Veer LJ, Ma L, Hoeijmakers JH, Egly JM (June 1997). "The XPB subunit of repair/transcription factor TFIIH directly interacts with SUG1, a subunit of the 26S proteasome and putative transcription factor". Nucleic Acids Res. 25 (12): 2274–83. doi:10.1093/nar/25.12.2274. PMC 146752. PMID 9173976.
  17. ^ Yokoi M, Masutani C, Maekawa T, Sugasawa K, Ohkuma Y, Hanaoka F (March 2000). "The xeroderma pigmentosum group C protein complex XPC-HR23B plays an important role in the recruitment of transcription factor IIH to damaged DNA". J. Biol. Chem. 275 (13): 9870–5. doi:10.1074/jbc.275.13.9870. PMID 10734143.
  18. ^ Datan E, Minn I, Peng X, He QL, Ahn H, Yu B, Pomper MG, Liu JO (2020). "A Glucose-Triptolide Conjugate Selectively Targets Cancer Cells under Hypoxia". iScience. 23 (9): 101536. Bibcode:2020iSci...23j1536D. doi:10.1016/j.isci.2020.101536. PMC 7509213. PMID 33083765.

추가 읽기

외부 링크