PSMC5

PSMC5
PSMC5
Protein PSMC5 PDB 2KRK.png
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭PSMC5, S8, SUG-1, SUG1, TBP10, TRIP1, p45, p45/SUG, proteasome 26S 서브 유닛, ATPase 5, RPT6
외부 IDOMIM: 601681 MGI: 105047 HomoloGene: 2098 GeneCard: PSMC5
직교체
종인간마우스
엔트레스

5705

19184

앙상블

ENSG00000087191

ENSMUSG00000020708

유니프로트

P62195

P62196

RefSeq(mRNA)

NM_001199163
NM_002805

NM_008950

RefSeq(단백질)

NP_001186092
NP_002796

NP_032976

위치(UCSC)Cr 17: 63.83 – 63.83MbChr 11: 106.15 – 106.15Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

26S proteasome AAA-ATPase subunit Rpt6로도 알려진 26S protease 규제 하위 유닛 8은 인간에서 PSMC5 유전자에 의해 인코딩되는 효소다.[5][6][7]This protein is one of the 19 essential subunits of a complete assembled 19S proteasome complex[8] Six 26S proteasome AAA-ATPase subunits (Rpt1, Rpt2, Rpt3, Rpt4, Rpt5, and Rpt6 (this protein)) together with four non-ATPase subunits (Rpn1, Rpn2, Rpn10, and Rpn13) form the base sub complex of 19S regulatory particle for proteasome complex.[8]

유전자

PSMC5 유전자는 ATPase subunit들 중 하나를 암호화하는데, ATPases의 트리플 A 계열의 멤버로 샤퍼론 같은 활동을 한다.프로테아솜 기능 참여 외에도 갑상선 호르몬 수용체 및 레티노이드 X 수용체-알파와의 상호작용이 입증되었기 때문에 이 소분위는 전사 조절에 참여할 수 있다.[7]인간 PSMC5 유전자는 13개의 exon을 가지고 있으며 17q23.3 염색체 대역에 위치한다.

단백질

인간 단백질 26S 프로테아제 조절 서브유닛 8은 크기가 45.6kDa이고 406개의 아미노산으로 구성되어 있다.이 단백질의 계산된 이론적 pI는 8.23이다.[9]

복합 조립체

26S 프로테아솜 콤플렉스는 보통 20S 코어 입자(CP 또는 20S 프로테아솜)와 배럴 모양의 20S 한쪽 또는 양쪽에 1개 또는 2개의 19S 규제 입자(RP 또는 19S 프로테아솜)로 구성된다.CP와 RP는 서로 다른 구조적 특성과 생물학적 기능을 가지고 있다.간단히 말해서, 20S 하위 단지는 카스파제 유사, 트립신 유사, 키모트립신 유사 활동을 포함한 세 가지 유형의 단백질 분해 활동을 제시한다.20S 서브유닛의 4개의 스택 링에 의해 형성된 챔버의 내측에 위치한 이러한 단백질 분해 활성 사이트는 무작위 단백질-엔자임 조우 및 제어되지 않은 단백질 저하를 방지한다.19S 규제 입자는 유비퀴틴 라벨이 부착된 단백질을 분해 기질로 인식하고, 단백질을 선형까지 펼치며, 20S 코어 입자의 문을 열고, 변전체를 프로톨리틱 챔버로 안내할 수 있다.그러한 기능적 복잡성을 충족시키기 위해 19S 규제 입자는 최소 18개의 구성 하위 단위를 포함한다.이러한 서브유닛은 서브유닛의 ATP 의존성, ATP 종속 서브유닛 및 ATP 독립 서브유닛에 근거한 두 가지 등급으로 분류할 수 있다.이 다단위 단지의 단백질 상호작용과 위상학적 특성에 따라 19S 규제 입자는 베이스와 리드 서브콤플렉스로 구성된다.베이스는 6개의 AAA ATPASes(Subunit Rpt1-6, 체계적 명명법)와 4개의 비 ATPase 서브유닛(Rpn1, Rpn2, Rpn10, Rpn13)으로 구성된 링으로 구성된다.따라서 26S 프로테아제 규제 하위 유닛 4(Rpt2)는 19S 규제 입자의 기본 하위 콤플렉스를 형성하는 데 필수적인 구성요소다.19S 기반 서브 콤플렉스 조립의 경우, 4개 그룹의 중추적인 조립체 보호자(HSM3/S5b, Nas2/P27, Nas6/P28 및 RPN14/PAF1, 효모/매몰의 명명법)가 4개 그룹으로 독립적으로 식별되었다.[10][11][12][13][14][15]이러한 19S 규제 입자 기반 전용 보호자는 모두 C-단자 영역을 통해 개별 ATPase 하위 단위에 바인딩된다.예를 들어 HSM3/S5b는 서브 유닛 Rpt1과 Rpt2(이 단백질), Nas2/p27 to Rpt5, Nas6/p28 to Rpt3, RPN14/PAAF1 to Rpt6(이 단백질)에 각각 바인딩된다.이후, 3개의 중간 조립품 모듈인 Nas6/p28-Rpt3-Rpt6-Rpn14/PAF1 모듈, Nas2/p27-Rpt4-Rpt5 모듈, Hsm3/S5b-Rpt1-Rpt2-Rpn2 모듈 등 3개의 중간 조립 모듈을 형성한다.결국, 이 세 개의 모듈은 함께 모여 Rpn1과 함께 6개의 아틀라스의 헤테로헥사메리카 링을 형성한다.Rpn13의 최종 추가는 19S 베이스 서브 콤플렉스 조립체의 완성을 나타낸다.[8]

함수

세포내 단백질 분해의 약 70%를 담당하는 분해기계로서 프로테아솜 콤플렉스(26S 프로테아솜)는 세포 프로테오메의 동태성을 유지하는 데 중요한 역할을 한다.[16]따라서 잘못 접힌 단백질과 손상된 단백질은 새로운 합성을 위해 아미노산을 재활용하기 위해 지속적으로 제거되어야 한다; 동시에, 일부 핵심 규제 단백질은 선택적 저하를 통해 생물학적 기능을 수행하며, 더욱이 단백질은 MHC 등급 I 항원 발현을 위해 펩타이드로 소화된다.공간적 및 시간적 단백질분해를 통해 생물학적 과정에서 이처럼 복잡한 요구를 충족시키기 위해서는 단백질 기판을 잘 통제된 방식으로 인식하고, 모집하고, 결국에는 가수분해해야 한다.따라서 19S 규제 입자는 이러한 기능적 과제를 해결하기 위한 일련의 중요한 기능을 포함한다.단백질을 지정된 기질로 인식하기 위해 19S 콤플렉스는 특수 분해 태그인 유비쿼터스비닐화(ubiquititial tag)로 단백질을 인식할 수 있는 서브유닛을 갖췄다.또한 19S와 20S 입자의 연계를 용이하게 하기 위해 뉴클레오티드(예: ATP)와 결합할 수 있는 서브유닛(subunit)을 가지고 있으며, 20S 단지의 하부 정문을 형성하는 알파 서브유닛 C-단자의 확인변경을 유발한다.

ATPAS 서브유닛은 일련의 Rpt1–Rpt5–Rpt4–Rpt4–Rpt3–Rpt6–Rpt2와 함께 6-membed 링으로 조립되며, 이 링은 20S 코어 입자의 7-membed 알파 링과 상호 작용하며 19S RP와 20S CP 사이의 비대칭 인터페이스가 동쪽에 위치한다.[17][18]뚜렷한 Rpt ATPases의 HbYX 모티브가 있는 세 개의 C단자 꼬리는 CP의 두 개의 정의된 알파 서브 유니트 사이에 포켓에 삽입되고 CP 알파 링에서 중앙 채널의 게이트 개방을 조절한다.[19][20]증거는 ATPase 서브유닛 Rpt5가 다른 ubuiqinted 19S proteasome 서브유닛(Rpn13, Rpn10) 및 deubiquitization 효소 Uch37과 함께 proteasome 관련 편재 효소에 의해 현장에서 보편화될 수 있다는 것을 보여주었다.프로테아솜 서브유닛의 편재화는 세포 편재 수준의 변화에 대응하여 프로테아솜 활동을 조절할 수 있다.[21]

상호작용

PSMC5는 다음과 상호 작용하는 것으로 나타났다.

PSMC5 돌연변이가 있는 어린이

2021년 현재 PSMC5 돌연변이를 가진 아동의 신고는 18건에 불과하다.《GeneMatcher》에는 PSMC5 재단이라고 불리는 PSMC5 돌연변이를 가진 아이들과 함께 연구를 수행하고 있는 한 재단이 있다.그 목적은 치료법을 찾고 돌연변이로 문제를 해결하는 방법에 대해 더 배우는 것이다.일반적인 영향은 모터 지연에서 최소 표현 언어에 이르기까지 발달 지연이었다.

참조

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