바실로타

Bacillota
바실로타
Bacillus subtilis Gram.jpg
그램염색 서브틸리스균
과학적 분류 e
도메인: 박테리아
(순위 미지정): 테라박테리아
문: 바실로타
기븐스 앤드[1] 머레이 2021
반
  • 바실리 루드비히 외 연구진 2010
  • 클로스트리디아 레이니 2010
  • 콜리코이디박테리아 Neupane et al. 2020
  • 에리스펠로트리히아 루드비히 외 연구진 2010
  • 림노코르디아 와타나베 외 2015년
  • 네거티뷰테스 2010년 Marchandin 외
  • 열석박테리아 소콜로바 외 2007년
  • '티시렐리아' 알라제트 외 2014년
  • 할당되지 않은 패밀리
    • "Beduinellaceae" 트라오레 외 2016
  • 할당되지 않은 속
    • '아시디바실루스' 홀란다 외 2015
    • '알테릴리박테리박테리움' 박스버거 외, 2019년
    • 케시박테륨속 오렌 외 연구진 2019년
    • "Caldinitratiruptor" Fardeau 외 2010년
    • 카필리박테륨속 웅쿨파스비치 외 2021년
    • "Candidatus Carbonibacillus" 교정기. 카드니코프 외 2018년
    • "Colidextribacter" Ricaboni 외 2017년
    • 데술포바실루스 존슨 외 2009년
    • "Candidatus Desulfopertinax 융블루스 외 2017"
    • "Candidatus Desulforudis" Chivian 외 2008년
    • 'Desulfosporomusa' Sass 등 2004년
    • 2013년 칸디다투스 페리솔라 펠라이더러 외
    • '칸디다투스 헬리오모나스' 아사오 외 2012년
    • '마실리스터코라' 톨 외 2020년
    • '논고박터' 브라히미 외 2017년
    • 네가티바실루스 Vales et al. 2021
    • "Candidatus Soleaferrea" Pfleiderer et al. 2013
    • 2013년 칸디다투스 스토케피쿠스 플레이더러 외
    • '트리고날라' 장 외 2016년
동의어
  • '바실레오타' 오렌 외 2015년
  • "Bacillota" 휘트먼 외 2018년
  • 'Desulfotomaculota' 와타나베 외 2019
  • 엔도스포라 마굴리스와 슈워츠 1998
  • 엔도박테리아 카발리에 스미스 1998
  • "내세균" (1998년) Cavalier-Smith 2020
  • Firmacutes Gibbons와 Murray 1978(1980년 승인 목록)
  • "펌큐트" 오류입니다. Gibbons and Murray 1978(1980년 승인 리스트)
  • '포시박테리아' 캐벌리어 스미스

바실로타(Bacilota, 동의어 Firmicutes)는 그램 양성 세포벽 구조를 가진 박테리아 문이다.[2]2021년에 Firmicutes와 같은 식물군의 이름은 미생물학자들 사이에서 여전히 논란이 되고 있으며,[3] 이들 중 다수는 문헌에서 오랫동안 존재해 온 이전의 이름을 계속 사용하고 있다.

"Firmicutes"라는 이름은 라틴어로 "터프한 피부"를 뜻하는 단어에서 유래했으며, 이 문에서 박테리아가 전형적으로 가지고 있는 두꺼운 세포벽을 가리킨다.과학자들은 한때 Firmicutes를 모든 그램 양성 박테리아를 포함하도록 분류했지만, 최근 방선균군과 대조적으로 저G+C군이라고 불리는 관련 형태의 핵심 그룹으로 정의했다.그들은 구균이라고 불리는 둥근 세포 또는 막대 같은 형태를 가지고 있습니다.Megasphaera, Pectinatus, Selenomonas 및 Zymophilus와 같은 몇 가지 Firmicutes는 그램 음성을 염색하는 다공질 의사-외막을 가지고 있다.

많은 바실로타(Firmicutes)는 건조에 강하고 극한 조건에서도 살아남을 수 있는 내포자를 생성합니다.그들은 다양한 환경에서 발견되며, 이 그룹에는 몇몇 주목할 만한 병원균이 포함되어 있다.헬리오박테리아라는 한 과에 속하는 박테리아는 비산소 광합성을 통해 에너지를 생산한다.바실로타는 맥주, 와인, 사이다 부패에 중요한 역할을 한다.

반

그 그룹은 전형적으로 혐기성 클로스트리디아와 의무적이거나 통성적인 곡예비행인 바실리로 나뉜다.

계통수에서, 처음 두 그룹은 그들의 주요 속인 클로스트리디움과 [4]바실러스처럼 측계통 또는 다계통으로 나타납니다.그러나, 바실로타 전체는 일반적으로 [5]몰리쿠테스를 제외한 단통성 또는 측문성으로 여겨진다.

계통발생학

Annotree 및 GTDB 릴리스 05-RS95(2020년 [7]7월 17일)에 의한[6] 계통 발생.

Bacilota 또는 Firmicutes
클레이드 G

림노코르디아

클레이드 E

테르마에로박테리아

심비오박테리아

'술포바실리아'

셀레노박테리아속'

네거티뷰테스

클레이드 B

신트로포모나디아

데할로박테리아

펩토코키아

디술피토박테리아

'무렐리아'

테르민콜리아

황토마큘리아속

할라네로포비아오타

'할라네로바이아"

클레이드 A

테르모세미니박테리아

테르모아나에로박테리아

마헬리아

클로스트리디아 s.s.

클레이드 D

프로테이니보라시아

"디시오박테리아'

나트라네로바이아

후소박테리오타

후소박테리아

바실로타

"리시클로바실리아"

데술푸리바실리아

"Bacillia"의 s.

이 순간, 계통 발생은 All-Species 생활 나무 Project,[8]에 의해 현재 인정된 분류학 원핵 이름의 품목 분류 표(LPSN)[9]국립 센터에서 게놈 분류 법은 데이터베이스에서 생물 공학 정보(미국 국가 생물 공학 센터)[10]과 몇몇non-validatedclade 이름에에 함께 목록에 기초하여 16SrRNA-based 핵 연료 하부 결합판 방출 132에 근거한다.[11]

테르마에로박테리아

테르마에로박터{"테르마에로박테라스: 테르마에로박테라스과}

테르모아나에로박테리아

칼디셀룰로시럽토랄레스: 칼디셀룰로시럽토랄레스}

테르모베나불레스

딕티오글로무스

테피다나에로박터과

테르모베나불과

아모니픽스

Thermoanaerobacterales과

무렐라과

테르마세토게니아과

카르복시도더무스 {카르복시도더무스}

심비오박테리아

겔리아

Symbiobacterium {"Symbiobacterium"}:심비오박테리아과}

술포바실러스 {술포바실랄레스}: 술포바실러스과}

클로스트리디아의

바실리아

속

2016년 현재 274개 이상의 속들이 바실로타 문([citation needed]Bacilota phylam)에 속하는 것으로 간주되고 있으며, 주목할 만한 바실로타 속들은 다음과 같다.

바실리, 바실랄레스 주문

바실리, 락토바실랄레스 주문해

클로스트리디아

에리스펠로트리히아

임상적 의의

다음 항목도 참조하십시오.감염성 비만

바실로타는 생쥐와 인간의 내장 미생물체의 [12][failed verification]최대 30%를 차지한다.장내 미생물군의 일부인 바실로타 문(Bacilota)은 에너지 흡수에 관여하며 잠재적으로 당뇨병과 [13][14][15][16]비만의 발병과 관련이 있는 것으로 나타났다.건강한 성인의 장에서 가장 풍부한 박테리아:전체 내장 미생물군의 5%를 차지하는 페칼리박테리움 프라우스니츠이(F. prausnitzii)는 바실로타문에 속한다.이 종은 [17]비만의 낮은 염증 감소와 직접적으로 관련이 있다.F. prausnitzii는 비만 아동의 내장에서 비만이 아닌 아동보다 높은 수준으로 발견되었습니다.

여러 연구에서 살코기 대조군보다 비만인 사람에게서 더 많은 양의 바실로타가 발견되었다.(바실로타문의) 더 높은 수준의 유산균이 비만 환자들에게서 발견되었고, 한 연구에서 체중 감량 식단을 한 비만 환자들에게서 내장 [18]안에 있는 바실로타 양의 감소가 나타났다.

쥐의 식생활 변화는 또한 바실로타의 풍부함의 변화를 촉진하는 것으로 나타났다.표준 저지방/고다당류 식단을 먹은 쥐보다 서양식 식단(고지방/고당류)을 먹은 쥐에서 상대적으로 더 많은 바실로타가 관찰되었다.더 많은 양의 바실로타는 또한 [19]생쥐의 더 많은 지방과 체중과 관련이 있었다.특히 비만 생쥐에서는 (바실로타 문 내) Mollicutes 클래스가 가장 흔했다.이렇게 높은 바실로타 함량을 가진 비만 생쥐의 마이크로바이오타를 무균 생쥐의 내장에 이식했을 때, 무균 생쥐들은 바실로타 [20]함량이 낮은 살찐 생쥐의 마이크로바이오타와 비교하여 상당한 양의 지방을 얻었다.

사람 배설물에서 분리된 크리스텐세넬라(Clostridia 등급의 바실로타)의 존재는 하체질량지수와 [21]관련이 있는 것으로 밝혀졌다.

레퍼런스

  1. ^ Oren A, Garrity GM (2021). "Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes". Int J Syst Evol Microbiol. 71 (10): 5056. doi:10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987. S2CID 239887308.
  2. ^ 돌랜드 의학 사전의 "펌큐테스"
  3. ^ Robitzki, Dan (4 January 2022). "Newly Renamed Prokaryote Phyla Cause Uproar". The Scientist Magazine. Retrieved 23 May 2022.
  4. ^ Wolf M, Müller T, Dandekar T, Pollack JD (May 2004). "Phylogeny of Firmicutes with special reference to Mycoplasma (Mollicutes) as inferred from phosphoglycerate kinase amino acid sequence data". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. (Comparative Study). 54 (Pt 3): 871–5. CiteSeerX 10.1.1.126.3863. doi:10.1099/ijs.0.02868-0. PMID 15143038. Archived from the original on 2012-12-09.
  5. ^ Ciccarelli, FD (2006). "Toward automatic reconstruction of a highly resolved tree of life". Science. 311 (5765): 1283–1287. Bibcode:2006Sci...311.1283C. CiteSeerX 10.1.1.381.9514. doi:10.1126/science.1123061. PMID 16513982. S2CID 1615592.
  6. ^ Mendler, K; Chen, H; Parks, DH; Hug, LA; Doxey, AC (2019). "AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life". Nucleic Acids Research. 47 (9): 4442–4448. doi:10.1093/nar/gkz246. PMC 6511854. PMID 31081040.
  7. ^ "GTDB release 05-RS95". Genome Taxonomy Database.
  8. ^ "16S rRNA-based LTP release 132 (full tree)". All-Species Living Tree Project. Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Retrieved 2013-03-20.
  9. ^ J. P. Euzéby. "Firmicutes". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Archived from the original on January 27, 2013. Retrieved 2013-03-20.
  10. ^ Sayers; et al. "Firmicutes". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 24 April 2019.
  11. ^ "GTDB taxonomy". Genome Taxonomy Database. Archived from the original on 2018-07-29. Retrieved 2018-07-20.
  12. ^ Ley RE, Peterson DA, Gordon JI (2006). "Ecological and evolutionary forces shaping microbial diversity in the human intestine". Cell (Review). 124 (4): 837–848. doi:10.1016/j.cell.2006.02.017. PMID 16497592. S2CID 17203181.
  13. ^ Ley RE, Turnbaugh PJ, Klein S, Gordon JI (2006). "Microbial ecology: human gut microbes associated with obesity". Nature (Clinical Trial). 444 (7122): 1022–1023. Bibcode:2006Natur.444.1022L. doi:10.1038/4441022a. PMID 17183309. S2CID 205034045.
  14. ^ Henig, Robin Marantz (2006-08-13). "Fat Factors". New York Times Magazine. Retrieved 2008-09-28.
  15. ^ Ley RE, Bäckhed F, Turnbaugh P, Lozupone CA, Knight RD, Gordon JI (August 2005). "Obesity alters gut microbial ecology". Proc. Natl. Acad. Sci. USA (Research Support). 102 (31): 11070–11075. Bibcode:2005PNAS..10211070L. doi:10.1073/pnas.0504978102. PMC 1176910. PMID 16033867.
  16. ^ 코마로프 AL마이크로바이옴과 비만과 당뇨병의 위험.JAMA. 2016년 12월 22일 온라인 발행.doi:10.1001/jama.2016.09
  17. ^ Chakraborti, Chandra Kanti (15 November 2015). "New-found link between microbiota and obesity". World Journal of Gastrointestinal Pathophysiology. 6 (4): 110–119. doi:10.4291/wjgp.v6.i4.110. PMC 4644874. PMID 26600968.
  18. ^ Million, M.; Lagier, J.-C; Yahav, D.; Paul, M. (April 2013). "Gut bacterial microbiota and obesity". Clinical Microbiology and Infection. 19 (4): 305–313. doi:10.1111/1469-0691.12172. PMID 23452229.
  19. ^ Turnbaugh, Peter J. (17 April 2008). "Diet-Induced Obesity Is Linked to Marked but Reversible Alterations in the Mouse Distal Gut Microbiome". Cell Host & Microbe. 3 (4): 213–223. doi:10.1016/j.chom.2008.02.015. PMC 3687783. PMID 18407065.
  20. ^ Million, M. (April 2013). "Gut bacterial microbiota and obesity". Cell Microbiology and Infection. 19 (4): 305–313. doi:10.1111/1469-0691.12172. PMID 23452229.
  21. ^ Goodrich, Julia K.; Waters, Jillian L.; Poole, Angela C.; Sutter, Jessica L.; Koren, Omry; Blekhman, Ran; Beaumont, Michelle; Van Treuren, William; Knight, Rob; Bell, Jordana T.; Spector, Timothy D.; Clark, Andrew G.; Ley, Ruth E. (2014). "Human Genetics Shape the Gut Microbiome". Cell. 159 (4): 789–799. doi:10.1016/j.cell.2014.09.053. ISSN 0092-8674. PMC 4255478. PMID 25417156.open access

외부 링크

  • Firmicutes 문 - J.P. Euzeby: 명명법에 서 있는 원핵생물 이름 목록