피브로박테로타
Fibrobacterota| 피브로박테로타 | |
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과학적 분류  | |
| 도메인: | 박테리아 |
| (순위 미지정): | FCB 그룹 |
| 문: | 피브로박테로타 Garrity & Holt 2021[1] |
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| 동의어 | |
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섬유박터균은 반추동물의 식물성 셀룰로오스의 분해를 가능하게 하는 많은 주요 반추동물을 포함하는 작은 세균문이다.이 문군의 구성원들은 다른 문족으로 분류되었다.피브로박터속(피브로박터속의 유일한 속)은 1988년에 [2]박테로이데스속으로부터 제거되었다.
계통발생 및 비교유전체 연구
2종을 포함한 단일속 피브로박터(Fibrobacterota)로 구성된 피브로박터(Fibrobacterota)는 현재 별개의 문, 계통학 연구 기반의 RpoC 및 Gyrase B 단백질 배열로 인식되고 있지만, 피브로박터 숙시노게네스는 박테이스와 클로로비에서 나온 종과 [3]밀접한 관련이 있음을 보여준다.이 세 가지 식물에서 나온 종들은 또한 많은 중요한 [4]단백질의 보존된 시그니처 인델에 근거해 같은 위치에 분기합니다.마지막으로, 그리고 가장 중요한 비교 게놈 연구는 보존된 두 개의 시그니처 인델(RpoC 단백질에 5-7개의 아미노산을 삽입하고 세린 하이드록시메틸전달효소에 13-16개의 아미노산을 삽입)과 이 세 개의 필라에서 [5]모든 종에 의해 고유하게 공유되는 하나의 시그니처 단백질(PG00081)을 확인했다.이 모든 결과는 이 세 가지 박테리아의 종이 다른 모든 박테리아를 제외하고 공통의 조상을 공유했다는 설득력 있는 증거를 제공하며, 이 모든 것들이 단일 "FCB"[3][5] 슈퍼문의 일부로 인식되어야 한다고 제안되었습니다.
계통발생학
피브로박터균의 계통학.
| 16S rRNA 기반 LTP 릴리즈 132 (모든 종류의 살아있는 나무[6] 프로젝트) | GTDB 05-RS95(Genome Taxonomy Database)[9][10]를 사용하는 Annotree v1.2[7][8].0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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분류법
현재 승인된 분류법은 원핵생물명목록(LSPN)[11]과 국립생명공학정보센터(NCBI)[12]에 기초하고 있다.
- 치티니스피리아속 소로킨 외 연구진 2016년
- Chitinispirillales Sorokin et al. 2016]을 주문한다.
- 치티니비브리오니아강 소로킨 외 2014년
- 피브로박테리아류 스페인 외 2012년
- FibrobacteralesSpain 등 2012년 주문 ["Fibromonadales" Abdul Rahman 등 2016년]
- Family Fibrobacterae Spain et al. 2012 [Fibromonadae" Abdul Rahman et al. 2016]
- "Hallerella" Wylensk et al. 2020
- 종 "H. porci" Wylensk et al. 2021
- 종 "H. sucinigenes" Wylensk et al. 2020
- "Candidatus Fibromonas"속 압둘 라만 외 2016년
- 종 "Ca. F. termitidis" 압둘 라만 외 2016년
- FibrobacterMontgomery 등 1988년
- 몽고메리 외 1988년 종 F. 창자
- Montgomery et al. 1988
- 아종 F. s. longatus Montgomery et al. 1988
- 아종 F. s. sucinogenes (1950년 헝가리) Montgomery et al. 1988년
- "Hallerella" Wylensk et al. 2020
- Family Fibrobacterae Spain et al. 2012 [Fibromonadae" Abdul Rahman et al. 2016]
- FibrobacteralesSpain 등 2012년 주문 ["Fibromonadales" Abdul Rahman 등 2016년]
분배
Fibrobacterota문은 CFB[Cytophaga-Flavibacterium-Bacteroidota][5]와 밀접한 관련이 있는 것으로 간주된다.이 문에서 유일한 속은 소와 [13]돼지를 포함한 많은 포유류의 내장에서 나온 변종을 포함하는 피브로박터입니다.이 속에 기재되어 있는 2종, 즉 Fibrobacter sucinogenes와 Fibrobacter generalis는 포유류의 내장에 있는 섬유분해 군집의 중요한 구성원으로 식물섬유를 분해할 수 있는 오랜 관심 미생물 때문에 최근 수십 년 동안 많은 관심을 받아왔다.
다양한 환경으로부터 16rRNA 유전자의 증폭에 기초한 분자 증거는 그 문이 이전에 [14][15]생각했던 것보다 훨씬 더 널리 퍼져있다는 것을 암시한다.포유류 환경에서 나온 대부분의 클론은 아문 [15]1로 불리는 알려진 고립체와 함께 그룹화 된다.그러나 아문 2의 구성원들은 지금까지 [15][16]흰개미의 내장에서만 발견되었다.먹이를 주는 [17]바퀴벌레도 있어요목재를 공급하는 나수티테르메스 코니거의 뒷부분에 있는 세포분해섬유 관련 세균 군집 내 아문 2의 우세는 이들이 고등 [18]흰개미 식물 물질의 분해에 중요한 역할을 한다는 것을 시사한다.
「 」를 참조해 주세요.
레퍼런스
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- Holt JG, ed. (1994). Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (9th ed.). Williams & Wilkins. ISBN 978-0-683-00603-2.
