젬마티모나도타
Gemmatimonadota| 젬마티모나도타 | |
|---|---|
과학적 분류  | |
| 도메인: | 박테리아 |
| (순위 미지정): | FCB 그룹 |
| 문: | 젬마티모나도타 장 외 2021년 |
| 반 | |
| 동의어 | |
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Gemmatimonadota는 2003년에 설립된 박테리아 문이다.문에는 젬마티모나데테목과 롱기미크로비아의 두 종류가 있다.
종.
2003년 모식종 Gemmatimonas aurantiaca T-27이T 하수 처리 시스템의 활성 슬러지에서 분리되었다.[1]유산소 호흡과 무산소 호흡으로 [2]증식할 수 있는 그램 음성 세균입니다.
두 번째 배양종은 Gemmatirosa kalamazoonensis gen., 11월 sp. kbs708로, 미국 [3]미시간주의 유기농 토양에서 분리되었다.
세 번째 배양종 Gemmatimonas photototrophica AP64는T 중국 [4]북부의 얕은 민물 사막 호수 Tiann é hu(Swan Lake)에서 분리되었습니다.이 유기체의 독특한 특징은 박테리아 광합성 반응 센터의 존재이다.그것은 아마도 수평 유전자 전달을 통해 비산소 광합성을 위한 유전자를 획득했을 것이다.G. 광영양성 생물은 통성 광영양성 생물이다.성장을 위해서는 유기 기질의 공급이 필요하지만 [5]빛으로부터 신진대사를 위해 추가적인 에너지를 얻을 수 있다.
Longimicrobium terrae 균주 CB-286315T는 스페인 그라나다에 위치한 전형적인 지중해 삼림 생태계의 토양 샘플에서 분리되었다.다른 배양된 Gemmatimonades와의 큰 계통발생학적 거리 때문에,[6] 그것은 Longimicrobia라는 이름의 새로운 클래스를 확립했다.
환경 분포
문화에 의존하지 않는 연구로부터 얻은 데이터는 Gemmatimonadota가 많은 자연 서식지에 널리 분포하고 있다는 것을 보여준다.그들은 토양 세균 군집의 약 2%를 차지하며 토양에서 발견되는 상위 9개의 균류 중 하나로 확인되었습니다. 하지만, 현재 배양된 분리주는 [7]6개뿐입니다.보석 마티모나도타는 초원, 대초원, 목초지 토양 등 다양한 건조한 토양과 부영양 호수 퇴적물, 고산 토양에서 발견되었다.Gemmatimonadota가 발견된 이 광범위한 환경은 낮은 토양 [8]수분에 대한 적응을 암시합니다.수행된 연구는 토양에서 Gemmatimonadota의 분포가 집합보다 수분 가용성에 더 의존하는 경향이 있다는 것을 보여주면서, 이 문(文)[9]의 구성원들이 건조기 토양을 선호한다는 믿음을 강화했다.민물이나 퇴적물과 같은 다양한 수중 환경에서도 더 적은 수가 발견되었다.
분류법
현재 승인된 분류법은 LSPN([10]Standing in Nomenclature), 국립생명공학정보센터,[11] 전종 생물목[12] 프로젝트 및 GTDB 05-RS95(Genome Taxonomy Database)[13][14]를 기반으로 한다.
- Gemmatimonadota Zhang 등 2003년 연구
- 클래스 Gemmatimonadetes Zhang 외 2003
- Gemmatimonadales Zhang 등 2003년 주문
- Gemmatimonadaceae Zhang 등 2003년
- Roseisolibacter Pascual 등 2018년
- "Gemmatirosa" DeBruyn et al. 2013
- GemmatimonasZhang et al. 2003 em. 쩡 외 2015년
- Gemmatimonadaceae Zhang 등 2003년
- Gemmatimonadales Zhang 등 2003년 주문
- Class Longimicrobia Pascual et al. 2016
- LongimicrobialesPascual et al. 2016
- 긴이미크로비과 Pascual et al. 2016
- Longimicrobium Pascual et al. 2016
- 긴이미크로비과 Pascual et al. 2016
- LongimicrobialesPascual et al. 2016
- 클래스 Gemmatimonadetes Zhang 외 2003
「 」를 참조해 주세요.
레퍼런스
- ^ Zhang H, Sekiguchi Y, Hanada S, Hugenholtz P, Kim H, Kamagata Y, Nakamura K (2003). "Gemmatimonas aurantiaca gen. nov., sp. nov., a gram-negative, aerobic, polyphosphate-accumulating micro-organism, the first cultured representative of the new bacterial phylum Gemmatimonadetes phyl. nov". Int J Syst Evol Microbiol. 53 (Pt 4): 1155–63. doi:10.1099/ijs.0.02520-0. PMID 12892144.
- ^ Takaichi, S; Maoka, T; Takasaki, K; Hanada, S (2009). "Carotenoids of Gemmatimonas aurantiaca (Gemmatimonadetes): identification of a novel carotenoid, deoxyoscillol 2-rhamnoside, and proposed biosynthetic pathway of oscillol 2,2′-dirhamnoside". Microbiology. 156 (3): 757–763. doi:10.1099/mic.0.034249-0. PMID 19959572.
- ^ DeBruyn J.M.; Fawaz M.N.; Peacock, A.D.; Dunlap J.R.; Nixon L.T.; Cooper K.E.; Radosevich M. (2013). "Gemmatirosa kalamazoonesis gen. nov., sp. nov., a member of the rarelycultivated bacterial phylum Gemmatimonadetes". J Gen Appl Microbiol. 59 (4): 305–312. doi:10.2323/jgam.59.305. PMID 24005180.
- ^ Zeng Y.; Selyanin V.; Lukeš M.; Dean J.; Kaftan D.; Feng F.; Koblížek M. (2015). "Characterization of the microaerophilic, bacteriochlorophyll a-containing bacterium Gemmatimonas phototrophica sp. nov., and emended descriptions of the genus Gemmatimonas and Gemmatimonas aurantiaca". Int J Syst Evol Microbiol. 65 (8): 2410–2419. doi:10.1099/ijs.0.000272. PMID 25899503.
- ^ Zeng Y.; Feng F.; Medová H.; Dean J.; Koblížek M. (2014). "Functional type 2 photosynthetic reaction centers found in the rare bacterial phylum Gemmatimonadetes". Proc Natl Acad Sci USA. 111 (21): 7795–7800. Bibcode:2014PNAS..111.7795Z. doi:10.1073/pnas.1400295111. PMC 4040607. PMID 24821787.
- ^ Pascual J.; García-López M.; Bills G.F.; Genilloud O. (2016). "Longimicrobium terrae gen. nov., sp. nov., a novel oligotrophic bacterium of the underrepresented phylum Gemmatimonadetes isolated through a system of miniaturized diffusion chambers". Int J Syst Evol Microbiol. 66 (5): 1976–1985. doi:10.1099/ijsem.0.000974. PMID 26873585.
- ^ Fawaz, Mariam (2013). "Revealing the Ecological Role of Gemmatimonadetes Through Cultivation and Molecular Analysis of Agricultural Soils". Master's Thesis, University of Tennessee: vi.
- ^ DeBruyn, J; Nixon, L; Fawaz, M; Johnson, M; Radosevich, M (2011). "Global Biogeography and Quantitative Season Dynamics of Gemmatimonadetes in Soil". Appl. Environ. Microbiol. 77 (17): 6295–300. doi:10.1128/AEM.05005-11. PMC 3165389. PMID 21764958.
- ^ Fawaz, Mariam (2013). "Revealing the Ecological Role of Gemmatimonadetes Through Cultivation and Molecular Analysis of Agricultural Soils". Master's Thesis, University of Tennessee: vi.
- ^ J.P. Euzéby. "Gemmatimonadetes". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2016-03-20.
- ^ Sayers; et al. "Gemmatimonadetes". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2016-03-20.
- ^ 모든 종류의 살아있는 나무 프로젝트"16S rRNA-based LTP release 132". Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Retrieved 2015-08-20.
- ^ "GTDB release 05-RS95". Genome Taxonomy Database.
- ^ Parks, DH; Chuvochina, M; Chaumeil, PA; Rinke, C; Mussig, AJ; Hugenholtz, P (September 2020). "A complete domain-to-species taxonomy for Bacteria and Archaea". Nature Biotechnology. 38 (9): 1079–1086. bioRxiv 10.1101/771964. doi:10.1038/s41587-020-0501-8. PMID 32341564. S2CID 216560589.
외부 링크
- 간단한 분류법
- 파와즈, M. N. (2013) 농업토양의 재배와 분자분석을 통한 Gemmatimonadetes의 생태적 역할을 밝혀낸다.44~60.문(文)에 대한 간단한 검토.
