후보 Phyla 방사선(심폐소생술 그룹이라고도 함)은 세균 계통의 대규모 진화 방사선으로, 구성원은 대부분 배양되지 않았으며메타게노믹스와 단일 세포 염기서열 분석에서만 알려져 있다.이들은 나노박테리아(같은 이름의 무생물 나노입자와 혼동하지 말 것) 또는 크기가 작아 초소형 박테리아(나노미터)로 묘사돼 왔다.
원래(2016년경) CPR은 전체 세균 다양성의 15% 이상을 차지하며 70개 이상의 서로 다른 [1]균류로 구성될 수 있다고 제안되었습니다.그러나 상대적 진화적 분리에 기초한 게놈 분류 데이터베이스(2018)는 CPR이 단일 [2]문임을 나타내며, 리보솜 [3]단백질의 빠른 진화로 인해 초기 수치가 부풀려진 것을 발견했다.CPR 계열은 일반적으로 게놈이 작고 여러 생합성 경로와 리보솜 단백질이 부족한 것이 특징이다.이는 그들이 의무 공생[4][5]관계일 가능성이 높다는 추측을 불러 일으켰다.
초기 연구는 파테시박테리아라고 불리는 슈퍼문(superphylam)을 제안했는데, 이 슈퍼문에는 나중에 CPR [6]그룹에 속하는 여러 개의 식물군이 포함되어 있었다.그래서 파테시박테리아와 심폐소생술은 동의어로 [7]많이 쓰인다.예를 들어 GTDB는 CPR 그룹을 [2]문으로 간주하기 때문에 이 이름을 사용합니다.
몇 가지 예외가 있지만, Phyla 방사선의 후보 구성원은 일반적으로 여러 아미노산과 뉴클레오티드에 대한 여러 생합성 경로가 부족하다.현재까지, 그들이 세포 외피 [5]형성에 필수적인 지질을 생산할 수 있다는 것을 나타내는 게놈 증거는 없었다.또한, 그들은 완전한 TCA 사이클과 ATP 합성효소를 포함한 전자전달사슬 복합체가 부족한 경향이 있다.대부분의 자유 생물 원핵 생물에서 발견되는 몇 가지 중요한 경로가 없다는 것은 후보 필라 방사선이 필수 발효 [8]공생체로 구성되어 있다는 것을 나타냅니다.
또한 CPR 부재는 독특한 리보솜 특징을 가지고 있습니다.심폐소생술의 구성원은 일반적으로 문화 의존적인 방법에서는 누락되지만, 16S rRNA 시퀀스에 의존하는 문화 의존적인 연구에서는 누락되는 경우가 많다.그들의 rRNA 유전자는 단백질을 암호화하고 박테리아에서 거의 볼 수 없는 자기 분열 인트론을 가지고 있는 것으로 보이지만, 이전에 [9]보고된 바 있다.이러한 인트론 때문에 16S 의존 방식에서는 CPR 부재가 검출되지 않습니다.또한, 모든 CPR 구성원들은 공생동물에서 [8]종종 볼 수 있는 특성인 L30 리보솜 단백질을 놓치고 있다.
리보솜 단백질과 단백질 패밀리 발생 프로파일을 기반으로 한 이 그룹의 초기 계통학 분석에 따르면 Candidate Phyla 방사선은 박테리아에서 가장 기초적인 분기 계통인 것으로 밝혀졌다.이 연구들은 필라와 슈퍼필라 사이의 다음과 같은 계통 발생을 발견했다.슈퍼필라는 굵은 [5][4]글씨로 표시되어 있습니다.
많은 심폐소생술 부재는 배양할 수 없기 때문에 세균 분류법에 공식적으로 포함될 수 없지만, 많은 잠정적인 이름(칸디다투스)은 일반적으로 합의되어 있다.[6][14][15]2017년 현재 심폐소생술에 따라 Parcubacteria와 Microgenomates [1]두 가지 슈퍼필라가 일반적으로 인정되고 있습니다.심폐소생술의 Phyla에는 다음이 포함됩니다.
^Beam, Jacob P.; Becraft, Eric D.; Brown, Julia M.; Schulz, Frederik; Jarett, Jessica K.; Bezuidt, Oliver; Poulton, Nicole J.; Clark, Kayla; Dunfield, Peter F.; Ravin, Nikolai V.; Spear, John R.; Hedlund, Brian P.; Kormas, Konstantinos A.; Sievert, Stefan M.; Elshahed, Mostafa S.; Barton, Hazel A.; Stott, Matthew B.; Eisen, Jonathan A.; Moser, Duane P.; Onstott, Tullis C.; Woyke, Tanja; Stepanauskas, Ramunas (2020). "Ancestral Absence of Electron Transport Chains in Patescibacteria and DPANN". Frontiers in Microbiology. 11: 1848. doi:10.3389/fmicb.2020.01848. PMC7507113. PMID33013724.
