비트로넥틴

Vitronectin
VTN
1OC0.png
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스VTN, V75, VN, VNT, vitronectin
외부 IDOMIM: 193190 MGI: 98940 HomoloGene: 532 GeneCard: VTN
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_000638

NM_011707

RefSeq(단백질)

NP_000629

NP_035837

장소(UCSC)Chr 17: 28.37 ~28.37 MbChr 11: 78.39 ~78.39 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

비트로넥틴(VTN 또는 VN)은 혈청, 세포외 매트릭스[5]에 풍부하게 존재하는 헤모펙신 계열당단백질이다.인간의 경우 VTN [6][7]유전자에 의해 암호화됩니다.

비트로넥틴은 인테그린 알파-V 베타-3에 결합하여 세포 접착 및 확산을 촉진합니다.또한 말단 세포분해 보체 경로의 막 손상 효과를 억제하고 여러 세르핀(세린 단백질 분해효소 억제제)과 결합한다.이것은 분비된 단백질이며 단일 사슬 형태 또는 이황화물 [6]결합에 의해 결합되어 있는 잘린 두 사슬 형태로 존재합니다.비트로넥틴은 지혈[8] 종양 [9][10]악성종양에 관여하는 것으로 추측되고 있다.

구조.

비트로넥틴은 54kDa 당단백질로 478개아미노산 잔류물로 구성되어 있다.단백질 분자량의 약 3분의 1이 탄수화물로 구성되어 있다.경우에 따라 아르기닌 379 이후 단백질을 분해하여 2쇄 비트넥틴을 생성하고, 여기서 2쇄 비트넥틴을 디술피드 결합으로 결합한다.N 말단 도메인을 제외하고 아직 실험적으로 결정된 고해상도 구조는 없습니다.

단백질은 다음 세 가지 도메인으로 구성됩니다.

  • N 터미널 Somatomedin B 도메인(1~39)
  • 헤모펙신 호몰로지를 가진 중심 도메인(131-342)
  • C 말단 도메인(잔류 347-459)도 헤모펙신 호몰로지를 포함한다.

Somatomedin B 도메인에 대해 몇 가지 구조가 보고되었다.단백질은 처음에는 생리 결합 파트너 중 하나인 플라즈미노겐 활성제 억제제 1(PAI-1)과 이 [11]복합체에 대해 해결된 구조와 함께 복합적으로 결정화되었습니다.그 후,[12][13] 2개의 그룹이 도메인의 NMR 구조를 보고했습니다.

소마토메딘 B 도메인은 35개의 잔류물 내에 4개의 디술피드 결합이 있는 밀착형 디술피드 매듭이다.이 도메인에[14][15][16] 대해 다른 디술피드 구성이 보고되었지만 결정 [16]구조에 의해 이 모호성이 해결되었습니다.

중앙 도메인 및 C 터미널 [16]도메인용으로 호몰로지 모델이 구축되어 있습니다.

기능.

비트로넥틴의 소마토메딘 B 도메인은 플라스미노겐 활성제 억제제 1(PAI-1)에 결합하여 [11]안정화시킨다.따라서 비트로넥틴은 플라스미노겐 활성화에 의해 개시되는 단백질 분해를 조절하는 역할을 한다.또한 비트로넥틴은 혈소판의 성분으로 지혈에 관여한다.비트로넥틴은 세포외 매트릭스에 세포를 고정시키는 역할을 하는 예를 들어 비트로넥틴 수용체와 막결합 인테그린의 결합 부위인 RGD(45-47) 배열을 포함한다.소마토메딘 B 도메인은 우로키나아제 수용체와 상호작용하며, 이러한 상호작용은 세포 이동 및 신호 전달에 관여되어 왔다.PAI-1과 우로키나아제 수용체 모두의 높은 혈장 수치는 암 환자에 대한 음성 예후와 상관관계가 있는 것으로 나타났다.세포 접착과 이동은 암 전이와 직접적으로 관련이 있으며, 이는 이러한 관찰에 대한 가능한 기계적 설명을 제공한다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000109072 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000017344 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ 보론, 월터 F.와 불페프, 에밀 L. "의료생리학"Saunders, 2012, 페이지 1097.
  6. ^ a b "Entrez Gene: M Vitronectin".
  7. ^ Jenne D, Stanley KK (Oct 1987). "Nucleotide sequence and organization of the human S-protein gene: repeating peptide motifs in the "pexin" family and a model for their evolution". Biochemistry. 26 (21): 6735–42. doi:10.1021/bi00395a024. PMID 2447940.
  8. ^ Preissner KT, Seiffert D (Jan 1998). "Role of vitronectin and its receptors in haemostasis and vascular remodeling". Thrombosis Research. 89 (1): 1–21. doi:10.1016/S0049-3848(97)00298-3. PMID 9610756.
  9. ^ Felding-Habermann B, Cheresh DA (Oct 1993). "Vitronectin and its receptors". Current Opinion in Cell Biology. 5 (5): 864–8. doi:10.1016/0955-0674(93)90036-P. PMID 7694604.
  10. ^ Hurt, Elaine M.; Chan, King; Serrat, Maria Ana Duhagon; Thomas, Suneetha B.; Veenstra, Timothy D.; Farrar, William L. (2009). "Identification of Vitronectin as an Extrinsic Inducer of Cancer Stem Cell Differentiation and Tumor Formation". Stem Cells. 28 (3): 390–8. doi:10.1002/stem.271. PMC 3448441. PMID 19998373.
  11. ^ a b Zhou A, Huntington JA, Pannu NS, Carrell RW, Read RJ (Jul 2003). "How vitronectin binds PAI-1 to modulate fibrinolysis and cell migration". Nature Structural Biology. 10 (7): 541–4. doi:10.1038/nsb943. PMID 12808446. S2CID 26086796.
  12. ^ Kamikubo Y, De Guzman R, Kroon G, Curriden S, Neels JG, Churchill MJ, Dawson P, Ołdziej S, Jagielska A, Scheraga HA, Loskutoff DJ, Dyson HJ (Jun 2004). "Disulfide bonding arrangements in active forms of the somatomedin B domain of human vitronectin". Biochemistry. 43 (21): 6519–34. doi:10.1021/bi049647c. PMID 15157085.
  13. ^ Mayasundari A, Whittemore NA, Serpersu EH, Peterson CB (Jul 2004). "The solution structure of the N-terminal domain of human vitronectin: proximal sites that regulate fibrinolysis and cell migration". The Journal of Biological Chemistry. 279 (28): 29359–66. doi:10.1074/jbc.M401279200. PMID 15123712.
  14. ^ Kamikubo Y, Okumura Y, Loskutoff DJ (Jul 2002). "Identification of the disulfide bonds in the recombinant somatomedin B domain of human vitronectin". The Journal of Biological Chemistry. 277 (30): 27109–19. doi:10.1074/jbc.M200354200. PMID 12019263.
  15. ^ Horn NA, Hurst GB, Mayasundari A, Whittemore NA, Serpersu EH, Peterson CB (Aug 2004). "Assignment of the four disulfides in the N-terminal somatomedin B domain of native vitronectin isolated from human plasma". The Journal of Biological Chemistry. 279 (34): 35867–78. doi:10.1074/jbc.M405716200. PMID 15173163.
  16. ^ a b c Xu D, Baburaj K, Peterson CB, Xu Y (Aug 2001). "Model for the three-dimensional structure of vitronectin: predictions for the multi-domain protein from threading and docking". Proteins. 44 (3): 312–20. doi:10.1002/prot.1096. PMID 11455604. S2CID 24765480.

추가 정보

외부 링크