SMC3
SMC3| SMC3 | |||||||||||||||||||||||||
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| 식별자 | |||||||||||||||||||||||||
| 별칭 | SMC3, BAM, BMH, CDLS3, CSPG6, HCAP, SMC3L1, 염색체 구조 유지 3 | ||||||||||||||||||||||||
| 외부 ID | OMIM: 606062 MGI: 1339795 HomoloGene: 3974 GeneCard: SMC3 | ||||||||||||||||||||||||
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| 직교체 | |||||||||||||||||||||||||
| 종 | 인간 | 마우스 | |||||||||||||||||||||||
| 엔트레스 | |||||||||||||||||||||||||
| 앙상블 | |||||||||||||||||||||||||
| 유니프로트 | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(단백질) | |||||||||||||||||||||||||
| 위치(UCSC) | Chr 10: 110.57 – 110.61Mb | Cr 19: 53.59 – 53.63Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed 검색 | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| 위키다타 | |||||||||||||||||||||||||
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염색체 단백질 3(SMC3)의 구조적 유지(Structural maintenance)는 인간에서 SMC3 유전자에 의해 암호화된 단백질이다.[5]SMC3는 자매 크로마티드 응집, 동질 재조합 및 DNA 루핑을 매개하는 응집체 복합체의 하위 단위다.응집력은 SMC3, SMC1, RAD21 및 SA1 또는 SA2로 구성된다.인간의 경우 SMC3는 모든 응집 복합체에서 존재하지만 다른 하위 유니트에 대해서는 여러 개의 파라로그가 존재한다.
SMC3는 SMC 단백질 계열의 일원이다.이 가족의 구성원들은 DNA 수리, 염색체 응축, 염색체 분리의 핵심 규제자들이다.
구조와 상호작용
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-RAD21_(green)_interface_(PDB_4UX3).png)
SMC 단백질의 도메인 조직은 진화적으로 보존되어 있으며 N-단자 워커 A 모티브, 코일 코일, "힌지", 코일 코일 및 C-단자 워커 B 모티브로 구성되어 있다.단백질은 스스로 다시 접혀 한쪽 끝에는 이질화 "힌지" 영역, 다른 쪽 끝에는 ABC형 ATPase "head" 영역을 가진 로드 모양의 분자를 형성한다.이러한 구상 영역은 50nm의 반병렬 코일 코일로 구분된다.SMC3와 SMC1은 힌지 도메인을 통해 V자 모양의 헤테로디머를 생성한다.RAD21의 N단자 도메인은 헤드 도메인 바로 위에 SMC3의 코일형 코일에 바인딩되고 RAD21의 C단자 도메인은 SMC1의 헤드 도메인을 바인딩한다.SMC3-SMC1-RAD21 트리머의 이 엔드 투 엔드 바인딩은 DNA가 끼일 수 있는 폐쇄 링을 생성한다.SA1 또는
DNA가 복제되고 자매 크로마티드 응집력이 확립되면 SMC3는 ESCO1과 ESCO2에 의해 보존도가 높은 라이신 한 쌍에 아세틸화된다.싹이 돋아나는 효모에서는 이 개조가 유사분열까지 DNA의 응집력을 안정시키기에 충분하지만 동물에서는 소로린의 결합도 필요하다.
감수분열 시 SMC3는 균질 염색체와 자매 크로마티드 사이에 응집력을 생성하는 SMC1ß, STAG3, REC8과 결합하는 복합체를 형성한다.[6]
코넬리아 데 란지 증후군
코넬리아 데 랑게 증후군(CdLS)은 이상형 특징, 심각한 성장지체, 전지구적 발달지체, 지적장애 등 임상적 이상이 가변적으로 나타나는 희귀 유전질환이다.SMC3는 CdLS에 연루된 5개 유전자 중 하나이다.[7]한 사례 보고서에서 CdLS의 번성 실패, 저혈압, 얼굴 이상형 특징에서 새로운 SMC3 유전자 복제가 발견되었다.[7]가벼운 이형적 외모를 가진 산모에게도 같은 복제가 관찰됐다.
마우스 모델
| 특성 | 표현형 |
|---|---|
| 호모지고테 생존 가능성 | 비정상적 |
| 열성 치사 연구 | 비정상적 |
| 동족 생식 | 비정상적 |
| 체중 | 비정상적[8] |
| 불안 | 정상 |
| 신경학적 평가 | 정상 |
| 그립 강도 | 정상 |
| 핫 플레이트 | 정상 |
| 이형학 | 비정상적[9] |
| 간접열량측정법 | 정상 |
| 포도당 공차 검정 | 정상 |
| 청각 뇌계 반응 | 정상 |
| 덱사 | 비정상적[10] |
| 방사선 촬영 | 정상 |
| 체온 | 정상 |
| 눈 형태학 | 정상 |
| 임상화학 | 정상 |
| 혈액학 | 정상 |
| 말초혈액 림프구 | 정상 |
| 심장 무게 | 정상 |
| 눈 조직병리학 | 정상 |
| 살모넬라균 감염 | 정상[11] |
| 시트로박터 감염 | 정상[12] |
| 다음에서[13][14] 모든 테스트 및 분석 |
SMC3 기능 연구에 모델 유기체가 사용되어 왔다.조건부tm1a(EUCOMM)Wtsi[15][16] 녹아웃 마우스 라인은 국제 Knockout Mouse Consortium 프로그램의 일환으로 생성되었는데, 이것은 관심 있는 과학자들에게 질병의 동물 모델을 생성하여 배포하는 고투과 돌연변이 유발 프로젝트였다.[17][18][19]
수컷과 암컷은 삭제 효과를 판단하기 위해 표준화된 표현식 화면을 거쳤다.[13][20]돌연변이 생쥐에 대한 스물두 가지 테스트를 실시했고 6개의 유의미한 이상이 관찰되었다.[13]임신 중 동란 돌연변이 배아는 발견되지 않았으며, 따라서 젖을 뗄 때까지 생존한 배아는 없다.나머지 테스트는 이질 돌연변이 성인 쥐를 대상으로 실시됐다.암컷은 자손에서 정상보다 월경 전 사망률이 높았으며, 체중도 감소했다.수컷 이형체들은 짧아지고 위로 올라간 주둥이를 보였다.[13][20]
지하막에서의 역할
SMC3는 특정 세포 유형에서 분비된 단백질로서 발생하며, 콘드로이틴 황산염 체인의 변환 후 첨가는 풍부한 지하 막 단백질인 단백질이 분비된 프로테오글리칸 바마칸을 발생시킨다.[5]
참조
- ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000108055 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000024974 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ a b "Entrez Gene: SMC3 structural maintenance of chromosomes 3".
- ^ Garcia-Cruz R, Brieño MA, Roig I, Grossmann M, Velilla E, Pujol A, Cabero L, Pessarrodona A, Barbero JL, Garcia Caldés M (2010). "Dynamics of cohesin proteins REC8, STAG3, SMC1 beta and SMC3 are consistent with a role in sister chromatid cohesion during meiosis in human oocytes". Hum. Reprod. 25 (9): 2316–27. doi:10.1093/humrep/deq180. PMID 20634189.
- ^ a b Infante E, Alkorta-Aranburu G, El-Gharbawy A (2017). "Rare form of autosomal dominant familial Cornelia de Lange syndrome due to a novel duplication in SMC3". Clinical Case Reports. 5 (8): 1277–1283. doi:10.1002/ccr3.1010. PMC 5538066. PMID 28781842.
- ^ "Body weight data for Smc3". Wellcome Trust Sanger Institute.
- ^ "Dysmorphology data for Smc3". Wellcome Trust Sanger Institute.
- ^ "DEXA data for Smc3". Wellcome Trust Sanger Institute.
- ^ "Salmonella infection data for Smc3". Wellcome Trust Sanger Institute.
- ^ "Citrobacter infection data for Smc3". Wellcome Trust Sanger Institute.
- ^ a b c d Gerdin AK (2010). "The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ 마우스 리소스 포털, 웰컴 트러스트 생어 연구소.
- ^ "International Knockout Mouse Consortium".
- ^ "Mouse Genome Informatics".
- ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (2011). "A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function". Nature. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038/nature10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
- ^ Dolgin E (2011). "Mouse library set to be knockout". Nature. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038/474262a. PMID 21677718.
- ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (2007). "A mouse for all reasons". Cell. 128 (1): 9–13. doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
- ^ a b van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). "The mouse genetics toolkit: revealing function and mechanism". Genome Biol. 12 (6): 224. doi:10.1186/gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.
