콜라겐, VI형, 알파3

Collagen, type VI, alpha 3
COL6A3
Protein COL6A3 PDB 1knt.png
사용 가능한 구조
PDB휴먼 유니프로트 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스COL6A3, DYT27, BTHLM1, UCMD1, 콜라겐형 VI 알파3, 콜라겐형 VI 알파3 체인
외부 IDOMIM : 120250MGI : 88461 HomoloGene : 37917 GenCard : COL6A3
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_004369
NM_057164
NM_057165
NM_057166
NM_057167

NM_001243008
NM_001243009
NM_009935

RefSeq(단백질)

NP_004360
NP_476505
NP_476506
NP_476507
NP_476508

없음

장소(UCSC)Chr 2: 237.32 ~237.41 MbChr 1: 90.77 ~90.84 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

콜라겐 알파-3(VI) 사슬COL6A3 [5][6][7]유전자에 의해 인간에게 암호화되는 단백질이다.이 단백질은 미세 섬유화 [8]형성을 돕는 VI형 콜라겐의 알파 사슬입니다.VI형 콜라겐의 일부로서, 이 단백질은 베슬렘 근병증, 울리히 선천성 근위축증, 그리고 근육과 결합 [7][9][10]조직과 관련된 다른 질병들과 관련이 있다.

구조.

이 유전자는 VI형 콜라겐의 세 가지 알파 사슬 중 하나인 알파 3 사슬을 암호화하는데, 이것은 대부분의 결합 조직에서 발견되는 구슬 모양의 필라멘트 콜라겐이다.VI형 콜라겐의 알파 3 체인은 알파 1 및 2 체인에 비해 훨씬 큽니다.이러한 크기 차이는 주로 모든 알파 사슬의 아미노 말단 구상 도메인에서 발견되는 폰 윌브랜드 인자 유형 A 도메인과 유사한 하위 도메인 수의 증가에 기인한다.전체 길이 전사 외에도 다양한 [7]크기의 N 말단 구상 도메인으로 단백질을 코드하는 네 가지 전사 변형이 확인되었다.

기능.

알파 3 타입 VI 사슬은 세포 외 [7]기질 단백질과 결합하는 것으로 나타났는데, 이 상호작용은 기질 구성 요소를 구성하는 데 있어서 이 콜라겐의 중요성을 설명한다.마이크로파이브릴 형성은 인접한 VI형 콜라겐 단량체 [8]N-말단 서브 도메인 N5와 C-말단 C5 도메인 간의 상호작용으로 추적되었다.

임상적 의의

VI형 콜라겐 유전자의 돌연변이는 Bethlem myopathy와 Ullrich 선천성 근디스트로피(UCMD)[7][9]와 관련된다.일반적으로 Bethlem myopathy와 상염색체 열성 UCMD 환자 모두 VI형 콜라겐 알파 사슬의 돌연변이에 대해 헤테로 접합하지만 전 증상만 나타난다.세 개의 알파 사슬 중 COL6A3 돌연변이는 베슬렘 근병증과 UCMD [9]사례의 18%만 기여한다.장 외 연구진의 UCMD 돌연변이 연구는 COL6A3에서 [10]비병원성 돌연변이를 하나만 발견했다.단, siRNA를 이용한 환자섬유아세포의 돌연변이 COL6A3의 녹다운은 상염색체 우성 UCMD의 VI형 콜라겐 세포 증착을 성공적으로 개선하여 유망한 [9]치료법이 될 수 있다.COL6A3의 높은 발현 수준은 생쥐의 비만 및 당뇨병과 관련이 있지만,[11] 이 관계는 사람에게서 관찰되지 않았다.근육과 결합조직과 관련된 다른 질환으로는 약함, 관절의 이완과 수축, 그리고 비정상적인 [9]피부가 있다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000163359 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000048126 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Zanussi S, Doliana R, Segat D, Bonaldo P, Colombatti A (Nov 1992). "The human type VI collagen gene. mRNA and protein variants of the alpha 3 chain generated by alternative splicing of an additional 5-end exon". The Journal of Biological Chemistry. 267 (33): 24082–9. PMID 1339440.
  6. ^ Demir E, Sabatelli P, Allamand V, Ferreiro A, Moghadaszadeh B, Makrelouf M, Topaloglu H, Echenne B, Merlini L, Guicheney P (Jun 2002). "Mutations in COL6A3 cause severe and mild phenotypes of Ullrich congenital muscular dystrophy". American Journal of Human Genetics. 70 (6): 1446–58. doi:10.1086/340608. PMC 419991. PMID 11992252.
  7. ^ a b c d e "Entrez Gene: COL6A3 collagen, type VI, alpha 3".
  8. ^ a b Lamandé SR, Mörgelin M, Adams NE, Selan C, Allen JM (Jun 2006). "The C5 domain of the collagen VI alpha3(VI) chain is critical for extracellular microfibril formation and is present in the extracellular matrix of cultured cells". The Journal of Biological Chemistry. 281 (24): 16607–14. doi:10.1074/jbc.M510192200. PMID 16613849.
  9. ^ a b c d e Bushby KM, Collins J, Hicks D (2014). "Collagen type VI myopathies". Advances in Experimental Medicine and Biology. 802: 185–99. doi:10.1007/978-94-007-7893-1_12. ISBN 978-94-007-7892-4. PMID 24443028.
  10. ^ a b Zhang YZ, Zhao DH, Yang HP, Liu AJ, Chang XZ, Hong DJ, Bonnemann C, Yuan Y, Wu XR, Xiong H (May 2014). "Novel collagen VI mutations identified in Chinese patients with Ullrich congenital muscular dystrophy". World Journal of Pediatrics. 10 (2): 126–32. doi:10.1007/s12519-014-0481-1. PMID 24801232. S2CID 38175712.
  11. ^ McCulloch LJ, Rawling TJ, Sjöholm K, Franck N, Dankel SN, Price EJ, Knight B, Liversedge NH, Mellgren G, Nystrom F, Carlsson LM, Kos K (Jan 2015). "COL6A3 is regulated by leptin in human adipose tissue and reduced in obesity". Endocrinology. 156 (1): 134–46. doi:10.1210/en.2014-1042. PMID 25337653.

추가 정보

외부 링크