이 유전자에 의해 인코딩된 단백질은 DNA 복구에서 5'의 돌출된 "플랩스(또는 그들의 뉴클레오티드 베이스가 그들의 보완적 베이스 쌍(하류로 어떠한 베이스 쌍에도 불구하고)에 결합되지 않기 때문에 "꺼져" 있는 단일 좌초된 DNA의 짧은 부분들)을 제거하고 오카자키 조각의 5의 끝을 느린 스트랜드 DNA 합성으로 처리한다.롱패치 베이스 절개 수리 중 이 단백질과 AP 엔도누클레스 1 사이의 직접적인 물리적 상호작용은 단백질을 기질에 조정된 하중을 제공하므로 기질을 한 효소에서 다른 효소로 전달한다.이 단백질은 XPG/RAD2 엔도누클리스과에 속하며 세포가 없는 DNA 복제를 위해 필수적인 10가지 단백질 중 하나이다.DNA 이차 구조는 이 유전자에 의해 인코딩된 단백질에 의해 결합과 갈라짐 양쪽에 필요한 플랩의 5' 끝부분을 감춰 특정 트리뉴클레오티드 반복에서 길이 의존적인 방식으로 플랩 처리를 억제할 수 있다.따라서 이차 구조는 이 단백질의 보호 기능을 억제하여 특정 부위의 트리뉴클레오티드 확장으로 이어질 수 있다.[6]
FEN1은 microhomology-dependent ending 또는 mMEJ(microhomology-mediated end joining)라고 불리는 DNA의 이중스트랜드를 복구하기 위한 부정확한 경로의 필수 효소다.[24]MMEJ는 항상 최소의 작은 삭제를 수반하기 때문에 돌연변이 유발 경로다.[25]또한 비호몰 엔드 결합(NHEJ)의 정확도가 낮은 경로와 동질 재조합 수리(HRR)를 사용한 정확한 경로를 포함하여 여러 다른 경로도 DNA의 이중 가닥 파손을 복구할 수 있다.[26]다양한 요소들이 DNA의 이중 가닥 파손의 복구에 사용될 경로를 결정한다.[25]FEN1이 지나치게 강조되면(촉진자가 저메틸화되었을 때 발생하는 현상[17]) 매우 부정확한 MMEJ 경로가 선호될 수 있으며, 이로 인해 돌연변이의 비율이 높아지고 암의 위험이 증가할 수 있다.
암은 한 개 이상의 DNA 수리 유전자의 발현이 매우 부족한 경우가 많지만, DNA 수리 유전자의 과다 발현이 암에서는 이례적이다.예를 들어 세균선 세포에 돌연변이로 결함이 있는 경우 최소 36개의 DNA 수리 효소가 암 위험(계속암 신드롬)을 증가시킨다.[citation needed]이와 유사하게, 적어도 12개의 DNA 수리 유전자가 하나 이상의 암에서 후생적으로 억제되는 것이 자주 발견되었다.([citation needed]후생적으로 감소된 DNA 수리 및 암 참조)일반적으로 DNA 수리 효소의 불충분한 표현은 복제 오류(변환 합성)를 통해 돌연변이와 암을 유발하는 비복제 DNA 손상을 증가시킨다.그러나 FEN1 매개 MMEJ 수리는 부정확성이 매우 높기 때문에 이 경우 저표현보다는 과표현이 암으로 이어진다.
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