마이크로콕칼핵산가수분해효소
Micrococcal nuclease| 마이크로콕칼핵산가수분해효소 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Ca 및 TdtP 억제제를 사용한2+ 미세핵산가수분해효소 3D 구조의 리본 도식 | |||||||||
| 식별자 | |||||||||
| EC 번호 | 3.1.31.1 | ||||||||
| CAS 번호 | 9013-53-0 | ||||||||
| 데이터베이스 | |||||||||
| 인텐츠 | IntEnz 뷰 | ||||||||
| 브렌다 | 브렌다 엔트리 | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme 뷰 | ||||||||
| 케그 | KEGG 엔트리 | ||||||||
| 메타사이크 | 대사 경로 | ||||||||
| 프라이머리 | 프로필 | ||||||||
| PDB 구조 | RCSB PDB PDBe PDBum | ||||||||
| |||||||||
| 테르모핵산가수분해효소 | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 식별자 | |||||||
| 유기체 | |||||||
| 기호. | 하지 않다 | ||||||
| 유니프로트 | P00644 | ||||||
| |||||||
| 포도상구균핵산가수분해효소 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 식별자 | |||||||||
| 기호. | ? | ||||||||
| 팜 | PF00565 | ||||||||
| 빠맘 클랜 | CL0049 | ||||||||
| 인터프로 | IPR016071 | ||||||||
| 프로 사이트 | PDOC00865 | ||||||||
| 캐스 | 1tt2 | ||||||||
| SCOP2 | 1tt2/SCOPe/SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
마이크로코칼뉴클레아제(EC 3.1.31.1, S7뉴클레아제, MNase, 비장엔도뉴클레아제, 테르모뉴클레아제, 뉴클레아제T', 마이크로코칼뉴클레아제, 뉴클레아제T', 비장포스포디에스테라아제, 스타필로코칼뉴클레아제단핵산을 소화한다.절단 속도는 A 또는 T의 5' 측에서 G 또는 C에서보다 30배 더 높으며 말단 3'-인산염으로 모노뉴클레오티드와 올리고뉴클레오티드를 생성한다.효소는 또한 이중가닥 DNA와 RNA에 대해 활성화되며 모든 배열은 궁극적으로 분해될 것이다.
특성.
pH 최적치는 9.2로 보고된다.효소 활성은 Ca에 따라2+ 엄격히 달라지며, pH 최적치는 [1]Ca 농도에2+ 따라 달라진다.따라서 효소는 EGTA에 의해 쉽게 비활성화된다.
원천
이 효소는 황색포도상구균의 세포외핵산가수분해효소이다.두 변종인 V8과 Foggi는 거의 동일한 [2]효소를 생산한다.일반적인 공급원은 포도상구균 황색뉴클레아제(마이크로코칼뉴클레아제)를 코드하는 복제뉴크 유전자를 가진 E.coli 세포이다.
구조.
마이크로코칼 뉴클레아제(당시 포도상구균 뉴클레아제)의 3차원 구조는 1969년 [3]단백질 결정학 역사에서 매우 초기에 해결되었으며 현재는 사용되지 않는 단백질 데이터 뱅크 파일 1SNS로 퇴적되었다.단백질 데이터 뱅크 파일 1SNO: [1]인 apo 형태와 단백질 데이터 뱅크 파일 3H6M: [2] 또는 1SNC: [3]인 티미딘-디인산염 억제 형태에 대해 보다 고해상도의 최신 결정 구조를 사용할 수 있다.상기 리본 다이어그램에서 볼 수 있듯이 뉴클레아제 분자는 SCOP 데이터베이스에 분류된 OB-폴드(올리고뉴클레오티드 결합 접힘용)로 알려진 배열로 3개의 긴 알파 나선형 및 5가닥의 배럴형 베타 시트를 가진다.
적용들
- CUT&RUN 염기서열 분석, micrococcal nuclease에 의한 항체 표적 절단 제어, 전사체 프로파일링.
- 조세포가 없는 추출물 중 핵산의 가수분해.
- RNA의 염기서열 분석.
- 토끼 망상 적혈구 용해물의 제조.
- 염색질 구조에 대한 연구.
- 단백질 접힘 및 구조 기능 연구를 가능하게 하는 실험실 단백질 제제에서 핵산 제거.
- 단백질 접힘 메커니즘에 관한 연구.
레퍼런스
- ^ Heins JN, Suriano JR, Taniuchi H, Anfinsen CB (1967). "Characterization of a nuclease produced by Staphylococcus aureus". J. Biol. Chem. 242 (5): 1016–20. doi:10.1016/S0021-9258(18)96225-3. PMID 6020427.
- ^ Cusumano CL, Taniuchi H, Anfinsen CB (1968). "Staphylococcal nuclease (Foggi strain). I. Order of cyanogen bromide fragments and a "fourth" histidine residue". J. Biol. Chem. 243 (18): 4769–77. doi:10.1016/S0021-9258(18)93185-6. PMID 5687719.
- ^ Arnone A, Bier J, et al. (1971). "A High Resolution Structure of an Inhibitor Complex of the Extracellular Nuclease of Staphylococcus aureus: I. Experimental Procedures and Chain Tracing". J. Biol. Chem. 246 (7): 2303–2316. doi:10.1016/S0021-9258(19)77221-4. PMID 5555571.
- http://www.thermoscientificbio.com/dna-and-rna-modifying-enzymes/micrococcal-nuclease/
- http://www.worthington-biochem.com/NFCP/default.html
- http://www.thermoscientificbio.com/uploadedFiles/Resources/en0181-usa-msds.pdf - 제품의 재료 및 안전 데이터 시트
- http://www.thermoscientificbio.com/uploadedFiles/Resources/en018-product-information.pdf - 제품 정보 시트
외부 링크
- 미국 국립 의학 도서관 의학 주제 제목(MeSH)의 Micrococcal+Nuclease
- EC 3.1.31.1
