플랩핵산가수분해효소

Flap endonuclease

플랩 핵산 분해효소(FENs, 이전 참조에서는 5' 핵산 분해효소라고도 함)는 DNA 복제, DNA 복구 및 DNA 재조합의 생물학적 과정 동안 발생하는 특수 DNA 구조에서 5'-3' 엑소핵산 분해효소 및 구조 특이적 엔도핵산 분해 효소의 한 종류이다.플랩 핵산가수분해효소는 진핵생물, 원핵생물, 고세균, 그리고 일부 바이러스에서 확인되었다.유기체는 둘 이상의 FEN 호몰로그를 가질 수 있다. 이러한 중복성은 이러한 효소의 중요성을 나타낼 수 있다.원핵생물에서, FEN 효소는 DNA 중합효소 I의 N 말단 도메인으로 발견되지만, 일부 원핵생물들은 제2의 상동성을 [1][2][3]코드하는 것으로 보인다.

FENs의 핵산내 분해효소 활성은 처음에 가닥[4] 중 하나에 단가닥 5' 돌출부가 있는 DNA 이중체에 작용하는 것으로 확인되었다("5' 플랩, 따라서 플랩 엔도핵산가수분해효소[5]"라는 명칭).FENs는 단일 가닥 DNA와 이중 가닥 [6]DNA의 접합부에서 포스포디에스테르 결합의 가수 분해 분열을 촉매한다.또한 일부 FEN은 플랩 가닥의 5' 말단 및 '니크' DNA 기질에 5'-3' 엑소핵산 분해효소 역할을 할 수 있다.

X선 결정학 데이터에 기초한 단백질 구조 모델은 FEN이 5' 플랩 구조의 단일 5' 가닥이 [7]통과할 수 있는 두 개의 α-헬리에 의해 생성된 유연한 아치를 가지고 있음을 시사한다.

플랩 엔도핵산가수분해효소는 돌연변이 및 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP) [9][10]검출을 위해 Taqman PCR 분석 및 Invader 분석과 같은 생명공학에서 사용되어 왔다.

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레퍼런스

  1. ^ Sayers, Jon R. (1994). "Computer Aided Identification of a Potential 5′-3′ Exonuclease Gene Encoded by Escherichia coli". Journal of Theoretical Biology. 170 (4): 415–21. doi:10.1006/jtbi.1994.1202. PMID 7996866.
  2. ^ Liu, Yuan; Kao, Hui-I; Bambara, Robert A. (2004). "FLAP ENDONUCLEASE 1: A Central Component of DNA Metabolism". Annual Review of Biochemistry. 73: 589–615. doi:10.1146/annurev.biochem.73.012803.092453. PMID 15189154.
  3. ^ Ceska, T; Sayers, JR (1998). "Structure-specific DNA cleavage by 5′ nucleases". Trends in Biochemical Sciences. 23 (9): 331–6. doi:10.1016/S0968-0004(98)01259-6. PMID 9787638.
  4. ^ Lyamichev, Victor; Brow, Mary Ann D.; Dahlberg, James E. (1993). "Structure-specific endonucleolytic cleavage of nucleic acids by eubacterial DNA polymerases". Science. 260 (5109): 778–783. Bibcode:1993Sci...260..778L. doi:10.1126/science.7683443. PMID 7683443.
  5. ^ Harrington, John J.; Lieber, Michael R. (1994). "The characterization of a mammalian DNA structure-specific endonuclease". The EMBO Journal. 13 (5): 1235–46. doi:10.1002/j.1460-2075.1994.tb06373.x. PMC 394933. PMID 8131753.
  6. ^ Kaiser, Michael W.; Lyamicheva, N.; Ma, W.; Miller, C.; Neri, B.; Fors, L.; Lyamichev, V. (1999). "A Comparison of Eubacterial and Archaeal Structure-specific 5′-Exonucleases". Journal of Biological Chemistry. 274 (30): 21387–21394. doi:10.1074/jbc.274.30.21387. PMID 10409700.
  7. ^ Ceska, T. A.; Sayers, J. R.; Stier, G.; Suck, D. (1996). "A helical arch allowing single-stranded DNA to thread through T5 5'-exonuclease". Nature. 382 (6586): 90–3. Bibcode:1996Natur.382...90C. doi:10.1038/382090a0. PMID 8657312. S2CID 11159640.
  8. ^ http://www.med.unc.edu/anclinic/Tm.htm[인용필수]
  9. ^ Lyamichev, V.; Mast, A.L.; Hall, J.G.; Prudent, J.R.; Kaiser, M.W.; Takova, T.; Kwiatkowski, R.; Sander, T.; deArruda, M.; Arco, D.; Neri, B.P.; Brow, M.A. (1999). "Polymorphism identification and quantitative detection of genomic DNA by invasive cleavage of oligonucleotide probes". Nature Biotechnology. 17 (3): 292–296. doi:10.1038/7044. PMID 10096299. S2CID 37888925.
  10. ^ Olivier, Michael (2005). "The Invader® assay for SNP genotyping". Mutation Research/Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis. 573 (1–2): 103–10. doi:10.1016/j.mrfmmm.2004.08.016. PMC 2771639. PMID 15829241.

외부 링크

외연 플랩핵산가수분해효소, 5'-3' 엑소핵산가수분해효소 및 5' 핵산가수분해효소